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利用生物信息学方法分析脱发相关差异表达基因,有望帮助了解脱发发生发展的分子机制。本研究从NCBI的子数据库GEO中选择基因表达谱GSE45512和GSE45513数据集,利用R语言limma工具包,筛选出两个物种斑秃样本与正常样本的共同显著差异表达基因。对这部分基因进行功能注释和蛋白互作网络分析,同时对全部差异表达基因进行基因集富集分析。结果发现,人头皮斑秃样本共筛选出225个差异表达基因;C3H/HeJ小鼠自发斑秃皮肤样本共筛选出337个差异表达基因;两个物种的共同显著差异表达基因有23个。GO功能富集分析和蛋白互作网络分析显示,这部分差异基因显著富集于免疫相关功能,并且彼此间存在蛋白互作关系。基因集富集分析显示两个物种的差异基因都能显著富集到趋化因子信号通路、细胞因子受体相互作用、金葡菌感染及抗原加工与呈递通路;而且人的下调差异基因不仅映射到了人类表型数据库的脱发表型,也映射到皮肤附属物病理相关表型。综上所述,本研究通过生物信息方法分析脱发皮肤组织与正常皮肤组织的差异表达基因,最终筛选出23个在人和小鼠中共同存在的显著差异表达基因;此外,分析发现脱发与免疫过程及皮肤附属物病变密切相关,这些结果为脱发的诊断和治疗提供了新思路。 相似文献
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用RT-PCR技术从小立碗藓中(Physcomitrella patens)克隆了核编码的MinE基因,命名为PpMinE,并克隆了该基因的基因组DNA。序列比对显示该基因编码的蛋白质与真细菌和绿藻叶绿体编码的MinE蛋白具有较高的相似性。pMinE-EGFP融合蛋白在烟草中的瞬时表达证明该蛋白定位于叶绿体内。在大肠杆菌中过量表达PpMinE导致细胞不正常分裂,产生无染色体的小细胞,这表明MinE的功能在进化上是保守的。在系统发育树中,PpMinE和高等陆生植物有较近的亲缘关系。在已知的陆生植物的叶绿体基因组中没有找到MinE的同源蛋白,这暗示在进化过程中MinE从叶绿体到细胞核的水平转移可能发生在陆生植物发生以前。 相似文献
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为了解性传播疾病(SexuallyTransmittedDiseasesSTD)对家庭内传播的影响,用多聚酶链反应(PCR)等方法检测了94对夫妻和其中15户家庭中16名子女的STD病原体NG、CT、UU、HPV、梅毒螺旋体和白色念珠菌。结果表明:男性不洁性史为68.15%而女性为4.26%,两者间有显著差异(P<0.01),但其发病率无统计上显著差异(男76.60%、女73.40%)。STD感染以CT感染最高,达44.68%,NG感染为31.91%,HPV感染是15.96%,未检出梅毒和HSV感染。患者中两种及以上病原感染过35.11%。56.25%的子女STD感染系其患STD父母传染的。这提示如果夫妻任何一方检出有STD感染,另一方须做系统监测与咨询,以便及时采取治疗和预防措施并避免子女受到感染。 相似文献
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Na_2SeO_3不影响肌动蛋白(actin)的聚合,但它可通过与血影收缩蛋白(spectrin)作用而间接促进actin的聚合。Na_2SeO_3的作用具有浓度依赖性:低浓度(0.5-5.0ppm)可提高actin聚合过程的成核速度及延伸速度,高浓度则产生相反的效应。巯基试剂如N-乙基马来酰亚胺(NEM)可消除硒的效应。因此,推测适量的硒可能导致spectrin构象发生一定变化,增强spectrin与actin的结合,降低actin链解聚的倾向性,从而稳定红细胞膜骨架。 相似文献
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绿色荧光蛋白在植物细胞生物学中的应用 总被引:3,自引:0,他引:3
克隆于海洋动物水母 (Aequoreavictori a)的绿色荧光蛋白 (greenfluorescentprotein ,GFP)作为一种新型的非酶性报告基因具有检测简便 ,结果真实可靠 ,不需要任何外源底物或辅助因子的特点 ,自出现以来它已引起人们的广泛兴趣 ,目前已经应用于烟草、柑橘、拟南芥、玉米、水稻、大豆、苜蓿等多种植物材料的研究中。GFP含有特殊的六肽生色团结构 ,用蓝紫光激发即能发出肉眼清晰可见的绿色荧光 ,而无需任何底物或辅助因子。GFP能与多种不同蛋白质的N端或C端融合而保持与天然蛋白质相似的荧… 相似文献
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1 Source The sequence was isolated from nuclear genomic DNA of Nicotiana tabacum by polymerase chain reaction. 相似文献