Visual BASIC编程在核酸序列分析中的应用研究初探

利用可视化的编程语言VisualBASIC编写了一个简易实用的核酸序列分析程序 ,能够自动实现对已知核酸序列的分子质量、Tm值、碱基组成的测定、各种核酸序列的转换和氨基酸序列的推导。同时也详细描述了核酸序列自动分析各功能实现的VisualBASIC语言编程过程。     

利用Authorware5.0制作动物课多媒体软件

Ａｕｔｈｏｒｗａｒｅ(简称ＡＷ ,下同 )是美国Ｍａｃｒｏｍｅｄｉａ公司开发的 ,一种基于图标和流程线 (类似于程序的流程图 ) ,支持图像、文本、动画、数字影像、声音及外部数据库调用的多媒体动画制作软件。该软件具有易学易用的特点 ,利用它 ,能够做出满足教学要求的多媒体交互式软件。笔者用此制作了一堂初一《生物》下册中哺乳动物的多样性一节的教学软件。对本课程内容在教学过程中应运用的教学手段分析知道 ,此课程可使用交互式内容中的语言交互等。以下是具体制作过程。1　准备及项目文件的建立1 1　准备工作　制作多媒体文件需要…     

泛函连接网络计算软件及其在生物多样性研究中的应用

针对农田生物多样性分析的需要,研制出泛函连接网络（FLANN）计算软件。该软件由7个Java类和1个HTML文件组成,是一种Internet在线计算工具,可运行于多种操作系统和Web浏览器上,并在各种类型的PC及工作站上使用,可读取多种类型的数据库文件。对水稻田昆虫生物多样性的两组取样调查数据Zmar18和Zapr15,用生物多样性工具软件LUMP和非监督分类－离差平方和聚类法进行统计归纳及分类,分别划分为21个和20个功能群,各包含60个样本。以FLANN计算软件对昆虫生物多样性进行了模式分类分析。结果表明,泛函连接网络的模式分类及预测与实际测查结果吻合良好。泛函连接网络Internet在线计算软件的应用可促进生物多样性数据采集和分析的规范化,有利于数据和信息共享,也为形成高度的生物多样性智能分析系统提供了一种工具。     

序列同源性分析软件Blast的WEB界面构建及其应用

基于局域网(Intranet)内的PC/Linux服务器, 构建了序列同源性分析软件Blast的WEB界面. 局域网内的所有计算机均可通过WEB方式访问该服务器进行公共数据库和自建数据库的查询,具有保密、高效、免费的优点,能够满足实验室和研究院所的大规模、快速数据分析任务.     

基于城市微气候模拟软件的城市道路绿化带对PM2.5消减作用的研究

随着经济的快速发展及机动车保有量的持续增长，车辆造成的道路污染问题日益严重。广州作为中国重要的经济发展城市，交通源排放问题高度集中，机动车排放是城市PM2.5的主要来源之一，开展减缓城市道路污染危害的研究具有重要意义。本研究为调查绿化带对广州城市道路PM2.5的影响，运用实测与城市微气候模拟软件（ENVI-met）模拟结合的研究方法，实测并分析城市道路空间PM2.5的浓度分布及其影响因素，使用实测数据对模拟软件进行验证分析，模拟研究理想道路模型下不同高宽比、风向等因素及绿化带植配类型对PM2.5的消减作用。研究表明：（1）城市道路空间PM2.5浓度分布受污染源、街道高宽比、风速风向、绿化带等综合影响，自然消减情况下，其主要受风速风向和高宽比双因素影响；（2）通常街道高宽比越大，越有利于道路空间PM2.5的扩散；（3）城市道路空间PM2.5自然沉降最小距离为12 m，0-12 m范围内应保持无障碍物的开敞环境，PM2.5消减的关键范围是12-24 m，此范围内可以利用生态手段沉降颗粒物；（4） PM2.5消减率受绿化带和风向的双控制，应根据主导风向选择绿化带植配方式。在主导风平行面和垂直迎风面绿化带对PM2.5有正消减效应，建议植配类型为"乔-乔+灌+草"；在主导风垂直背风面绿化带对PM2.5呈负消减效应，植配类型为"乔-灌"绿化带消减率接近于自然消减率，而植配类型为"乔-灌+草"和"乔-乔+灌+草"的绿化带加重了颗粒物在该区域的积聚。     

上海嘉龙教仪厂

SMUP型生物信号处理系统（复旦大学上海医学院生理学教研究研制） 系统能在80586、P2、P3等微机上使用。功能多，实时处理能力强，可对血压、心电、脑电、细胞放电、脉搏、呼吸等生物信号进行多种处理，适用于循环、神经、呼吸、感官等系统的联机实验和资料处理。系统硬件系列化，A／D转换器及信号调理器可选配不同档次（A／D转换器分8位／20微秒和12位／10微秒两档；信号调理器分4路／8倍／手调、4路／10000倍／手调和4路／8000倍／程控三档）。程控刺激器最大输出5V，选配刺激电压输出器，可将最大输出幅度提升到40V。最近推出的并口传送接口，使系统与计算机的连接更加方便。实验软件在WINDOWS9x下运行，软件内容多，包括教学和科研的常用实验程序。     

新版Tilia软件:中文指南和使用技巧*

Tilia软件一直是微体古生物学特别是孢粉学科使用最为普遍的一款专业计算机程序。该软件主要将样品数据经统计计算分析,将每个样品化石科属类型含量以图谱的形式依据地层深度或时间顺序排列显示,使化石数据转换为地层图式。基于各科属特别是优势或建群类型含量上下层位变化特点和规律,划分生物组合带,以图的形式直观解读生物群落的地史演替和环境变化等科学问题。由于此软件一直在英文语境下运行,功能多样,操作较为复杂,往往令国内初学者难以入手和深入。本文将以新版Tilia 2.0.45软件为对象,基于先期积累的使用经验,结合我国学者的思维方式,通过简单的孢粉数据实例,图解步骤和过程,力求通俗易懂。为此,推出"基础版"和"高阶版"两种使用说明以满足不同层次的人员需求,前者针对初学者旨在短时间内快速入门掌握孢粉百分比图谱制作的基本技巧,后者面向有一定操作经验学者力求在浓度图谱、通量图谱及"深度-年代"模型和Neotoma全球生态数据库等方面拓展提高。     

用于多重PCR甲基化靶向测序的比对软件性能评估

多重PCR甲基化靶向测序数据尚缺乏针对性的比对软件。本研究评估了9种比对方案在处理多重PCR甲基化靶向测序数据时的性能,包括平均CPU运行时间、平均最大内存、平均比对率、 F1分数、平均比对速率、比对未通过率和差异甲基化位点,以及比对率受亚硫酸氢盐转化率和测序错误率的影响。本研究建立了打分系统以综合评价比对方案的优劣,结果显示,排名前三的方案依次为Bismarkbwt2(8.098分)、 BWA-meth(7.846分)和Bismarkbwt1(7.840分)。这三个方案的F1分数均为1.000,且在不同亚硫酸氢盐转化率和测序错误率下的比对率表现最优。此外,Bismarkbwt2还对应最多的差异甲基化位点和最低的比对未通过率,并在平均最大内存和平均比对率两项指标上表现良好。因此,本研究推荐Bowtie2模式下的Bismark作为后续搭建多重PCR甲基化靶向测序生物信息学分析流程的比对软件。     

MS4000U生物信号定量记录分析系统（MS4000U）简介

我公司1995年推出了MS302生物信号记录分析系统,在国内拥有众多用户,受到用户的好评。经过近年的努力,MS4000U终于以崭新的面貌问世了!MS4000U的设计站在了一个全新的高度,其基本设计思想是硬件集成度高、图形质量好、分析结果准确、软件功能齐全而且操作简单。为科研提供高性能产品是MS4000U的定位,突出做好信号的定量分析是MS4000U不同其他产品的重要标志!     

MS4000U生物信号定量记录分析系统（MS4000U）简介

我公司1995年推出了MS302生物信号记录分析系统,在国内拥有众多用户,受到用户的好评。经过近年的努力,MS4000U终于以崭新的面貌问世了！MS4000U的设计站在了一个全新的高度,其基本设计思想是硬件集成度高、图形质量好、分析结果准确、软件功能齐全而且操作简单。为科研提供高性能产品是MS4000U的定位,突出做好信号的定量分析是MS4000U不同其他产品的重要标志！