Fast fourier transform-based support vector machine for prediction of G-protein coupled receptor subfamilies

Although the sequence information on G-protein coupled receptors （GPCRs） continues to grow, many GPCRs remain orphaned （i.e. ligand specificity unknown） or poorly characterized with little structural information available, so an automated and reliable method is badly needed to facilitate the identification of novel receptors. In this study, a method of fast Fourier transform-based support vector machine has been developed for predicting GPCR subfamilies according to protein＇s hydrophobicity. In classifying Class B, C, D and F subfamilies, the method achieved an overall Matthew＇s correlation coefficient and accuracy of 0.95 and 93.3%, respectively, when evaluated using the jackknife test. The method achieved an accuracy of 100% on the Class B independent dataset. The results show that this method can classify GPCR subfamilies as well as their functional classification with high accuracy. A web server implementing the prediction is available at http：//chem.scu.edu.cn/blast/Pred-GPCR.     

南水北调中线汉中市水源地生态脆弱性评价与特征分析

南水北调中线工程是为了缓解我国华北地区水资源严重短缺的一项大型调水工程,其水源地的生态环境质量,直接关系到中线工程的水质安全及其长效运行,对区域社会经济发展具有重要影响。以位于南水北调中线工程水源地的汉中市为研究对象,基于遥感和GIS技术,采用"压力—状态—响应"评价模型框架,利用空间主成分分析方法对汉中市生态脆弱性进行定量评价。结果表明:1)汉中市生态脆弱性整体处于中等偏高水平,其形成是人类活动与自然环境相互作用的结果,年均气温、年均降水量、人均GDP、土壤侵蚀强度和海拔为主要的驱动因子;2)不同海拔梯度上,中山区和高中山区生态脆弱性程度高,其次为高山区,低山区和丘陵区生态脆弱性程度相对较弱;3)不同行政区划上,西部和东部的略阳县、宁强县、佛坪县、西乡县和镇巴县5个县区脆弱性程度最高,中部的汉台区生态脆弱性程度最弱,其他各县区生态脆弱性程度居中;4)汉中市生态脆弱性指数具有强烈的空间自相关性特征,其空间异质性具有明显的各向异性特点,45°和135°方向上的空间变异最大。研究可为水源地生态建设与恢复、区域可持续发展规划提供理论基础和科学依据。     

背展恙螨亚科一新属(蜱螨亚纲：恙螨科)

1993年6月16日从西藏错那县贡日的锡金松田鼠（Pitymyssikimensis）体上采到1只背展恙螨亚科（Gahrliepiinae）的恙螨,其盾板近五角形,后缘钝圆,具2根后侧毛（2PL）,板上尚具很多副毛,有的副毛位于两感毛基之间,此特征与现有的各属均不同,经研究后认为系该亚科中的一新属。为了表示对吴厚永教授的敬意,特将此新属命名为吴氏恙螨属Wuella新属。属模标本保存于军事医学科学院微生物流行病研究所医学昆虫标本馆。吴氏恙螨属Wuella新居背展亚科的中小型螨类。盾板近五角形,后下角钝圆,具1对前侧毛AL和2对后侧毛PL。感毛叶片状。盾…     

疣鳞苔属在中国的一新记录种

线齿疣鳞苔 新拟 图1 Cololejeunea filidens Bx.Benedix,Feddes Reportorium Beiheft.134:49～51,T,14.1953. 植物体纤细,淡黄色。茎稀疏不规则分枝,长1.5～3 mm,直径0.075～0.1mm,茎中轴连叶片宽0.5～0.65mm。叶宽卵形,长0.6～0.68mm,宽0.48～0.53mm。叶细胞六角形,每个叶细胞背面具单个小疣。胞壁等厚,三角体及中部球状加厚明显,无油胞分化。腹瓣宽卵形,长0.35～0.37mm,宽 0.10～0.12mm,尖部具双齿,角齿线形,由3～4个单列细胞构成,向下弯曲,中齿长1～2个细胞,顶端细胞近球形。附体1～2个细胞。本种识别点在于角齿呈线形,长3～4个单列细胞,且明显向下弯曲。     

河南伏牛山缘脊叶蝉亚科种类记述：同翅目：叶蝉科

本文论述河南省伏牛山缘脊叶蝉亚科３属５种,其中包括１新属：管茎叶蝉属Ｆｉｓｔｕｌａｔｕｓ ｇｅｎ．ｎｏｖ．和３新种：中华管茎叶蝉Ｆｉｓｔｕｌａｔｕｓ ｓｉｎｅｎｓｉｓ ｓｐ．ｎｏｖ．河南胫槽叶蝉Ｄｒａｂｅｓｃｕｓ ｈｅｎａｎｅｎｓｉｓ ｓｐ．ｎｏｖ．细茎胫槽叶蝉Ｄｒａｂｅｓｃｕｓ ｍｉｎｉｐｅｎｉｓ ｓｐ．ｎｏｖ。此外还厘订新异２个。新种模式标本分别保存在中国农业大学,中国科学院动物研究所,中山大     

A NEW SUBFAMILY AND TWO NEW GENERA OF TENTHREDINIDAE(HY-MENOPTERA:TENTHREDINOMORPHA)

本文建立膜翅目叶蜂科１新亚科：巨基叶蜂亚科Ｍｅｇａｂｅｌｅｓｅｓｉｎａｅｓｕｂｆａｍ．ｎｏｖ．,该亚科包括２个族：巨基叶蜂族Ｍｅｇａｂｅｌｅｓｅｓｉｎｉｔｒｉｂ．ｎｏｖ．和枝膜叶蜂族ＣｌａｄｉｕｃｈｉｎｉＢｅｎ－ｓｏｎ,同时描述了２新属新种：白角横脊叶蜂Ｔｒｉｐｉｄｏｂｅｌｅｓｅｓａｌｂｉｃｏｒｎｉｓｇｅｎ．ｅｔｓｐ．ｎｏｖ．青蓝柄基叶蜂Ｃｏｎｏｂｅｌｅｓｅｓｍｅｔａｌｉｃｕｓｇｅｎ．ｅｔｓｐ．ｎｏｖ．;在枝膜叶蜂属下建立１个新亚属：Ａｃｌａｄｉｕｃｈａｓｕｂｇｅｎ．ｎｏｖ．,包括白唇木兰叶蜂ＣｌａｄｉｕｃｈａｍａｇｎｏｌｉａｅＸｉａｏ;并编制了巨基叶蜂亚科族属检索表。     

广西盲鱼一新种及其系统关系分析（鲤形目;鲤科：Ba亚科）

经鉴定,采自广西天峨县溶洞的盲鱼为金线Ｂａ属一新种,依形态特征命名为叉背金线Ｂａ Ｓｉｎｏｃｙｃｌｏｃｈｅｉｌｕｓ ｆｕｒｃｏｄｏｒｓａｌｉｓ ｓｐ．ｎｏｖ。根据主要特征分析认为：新种适应洞穴相关环境相关性特化程度大致与鸭嘴金线Ｂａ相当,新种及其若干近似种的物种形成,是营半穴居生活的类似生长须金线Ｂ的祖先适应辐射的结果。     

小腹茧蜂属一新种记述（膜翅目：茧蜂科：小腹茧蜂亚科）

本文记述采自广西的小腹茧蜂属ＭｉｃｒｏｇａｓｔｅｒＬａｔｒｅｉｌｌｅ一新种,黄褐小腹茧蜂Ｍｉｃｒｏｇａｓｔｅｒｒａｖｕｓｓｐ．ｎｏｖ。     

四川华绿螽属一新种记述(直翅目：螽斯科，露螽亚科)

四川华绿螽属一新种记述（直翅目：螽斯科,露螽亚科）石福明,郑哲民（山西师范大学生物系临汾０４１００４）（陕西师范大学动物研究所西安７１００６２）本文报道华绿螽属一新种,细沟华绿螽Ｓｉｎｏｃｈｌｏｒａｇｒａｃｉｌｉｓｕｌｃｕｌａｓｐ．ｎｏｖ,模式标本保...     

截线法对西藏盘羊种群数量的估计

１９８７～１９９０年间,采用截线抽样法对西藏盘羊的种群数量及分布进行了全面调查。结果在１５５０ｋｍ样线上遇见９９头盘羊。由此资料,以傅立叶级数表达其探测函数,估计出了盘羊在西藏分布区内的平均分布密度为０．０８２０±０．００９７头／ｋｍ２,即每１２ｋｍ２约有１头,而波动在０．０１２１～０．３６７１头／ｋｍ２之间。并依此确定的１０．５万ｋｍ２的栖息面积计算、西藏盘羊的种群数量为８６３０±１０２１头。目前,盘羊群平均数下降为５～６头／群,亟待保护。