乙脑病毒持续感染株preM区序列分析

为了研究乙型脑炎病毒持续感染株preM区域基因序列变异及其意义,我们将两种乙脑病毒野生株(JaGAr-01株和Nakayama株)分别感染人肝癌KN73细胞,经过多次细胞传代后建立乙脑病毒持续感染模型,收集感染细胞经反复冻融获取变异病毒.利用preM区特异引物进行RT-PCR法得到两种病毒的preM区基因片段,应用基因测序反应进行序列分析,并对两种病毒株preM区序列进行比较.preM区基因测序结果显示,与JaGAr-01野生株比较,JaGAr-01持续感染变异株(JaG-per)有1个核苷酸上碱基发生变异(第26位U→G)并导致相应氨基酸发生置换(第9位亮氨酸→精氨酸);Nakayama持续感染变异株(Nak-per)与其野生株相比则有11个核苷酸上碱基存在差异(第26位U→G,第37位G→A,第39位C→U,第45位U→C,第51位U→C,第99位U→C,第126位U→C,第165位C→U,第189位C→U,第195位C→U,第198位U→C),但仅有其中第26位、第37位、第39位的碱基变异引起相应编码的氨基酸发生置换(第9位亮氨酸→精氨酸及第13位缬氨酸→异亮氨酸).对比还发现变异后的JaGAr-01持续感染株与Nakayama持续感染株的基因序列相同.认为乙脑病毒持续感染变异株preM区存在基因变异,这种变异可能与该区参与病毒持续感染及维持病毒生物学特性有关.     

《自然-遗传学》：七基因变异与前列腺癌相关

研究人员最近发现了与前列腺癌相关的基因变异，新成果发表在7月在线出版的《自然-遗传学》期刊上。与过去报告的易发性位点结合在一起。新发现有可能解释在前列腺癌的发生中占25％的家族性风险。     

PLoS Gene：研究表明囊性纤维化是两种类型疾病

一项由美国匹兹堡大学医学院多中心团队完成的新研究提示：囊性纤维化（CF）其实是两种不同的疾病。一种影响多个器官包括肺，一种不影响肺。这项研究发表在PLOS Genetics杂志上，揭示了与囊性纤维化相关基因变异中的9个可导致胰腺炎。鼻窦炎和男性不育症。但却不对肺部造成伤害。 CF患者继承分别来自父母各方的CFTR基因的一个严重突变拷贝，CFTR生成那些构成通道来转运氯化物分子进出细胞的蛋白质，研究员David Whitcomb医学博士表示：没有功能性CFTR通道会导致出现问题，例如CF有关的慢性肺阻塞。     

《PLoS生物学》：DNA断裂修复增基因突变风险

据美国物理学家组织网近日报道,美国印第安纳大学与普渡大学印第安纳波利斯联合分校（IUPUI）和瑞典优密欧大学（Urnea University）最近的一项联合研究显示,有一种细胞用于修复自身DNA断裂的方法（称为断裂诱导复制）,比正常合DNA产生的基因变异要高出2800倍。相关论文在线发表于《公共科学图书馆·生物学》（PLoSBiology）。     

科研快讯

《科学》:两基因变异与少突胶质细胞瘤相关美国研究人员报告说,他们发现了两个与少突胶质细胞瘤相关的基因变异,这一成果或许有助于开发治疗这种肿瘤的新方法。这项研究成果5日发表在新一期美国《科学》杂志上。少突胶质细胞瘤是常见的恶性脑瘤之一,医学界多年来一直在寻找少突胶质细胞瘤的主要致病基因变异,尽管已有研究确定了相关变异发     

干细胞研究进展消息

干细胞是人体及其各种组织细胞的最初来源,具有高度自我复制、高度增殖和多向分化的潜能。干细胞研究正在向现代生命科学和医学的各个领域交叉渗透,干细胞技术也从一种实验室概念逐渐转变成能够看得见的现实。干细胞研究已成为生命科学中的热点。介于此,本刊将就干细胞的最新研究进展情况设立专栏,为广大读者提供了解干细胞研究的平台。     

Molecular Epidemiological Investigation of Infectious Hypodermal and Hematopoietic Necrosis Virus and Taura Syndrome Virus in Penaeus Vannamei Cultured in China

The Infectious hypodermal and hematopoietic necrosis virus(IHHNV) and Taura syndrome virus(TSV) are two important shrimp viruses in cultured shrimp in America.These two viruses were transmitted to China at the beginning of the 21st century.In this study,214 shrimp samples of Penaeus vannamei were collected from seven different areas of China and tested by PCR for IHHNV and TSV infection.The results showed that there were a high prevalence of IHHNV(65.42%) and low prevalence of TSV(3.27%) in the tested samples.Several samples were found to be co-infected with these two viruses.A 3 kb fragment of 7 positive IHHNV samples and a structure protein region(ORF2) of three TSV positive samples were amplified and sequenced.The sequence comparison indicated that both IHHNV and TSV sequenced in China have a low genetic variations compared with the prototype IHHNV and TSV from Hawaii.Phylogenetic analysis showed that TSV isolates were clustered into two groups,Asia and America group,which was genetically correlated to geographic distribution.     

《PLoS综合》：研究发现青光眼与基因变异有关

京都府立大学一个研究小组日前表示,他们发现了与视神经衰弱所引发青光眼有关的基因变异。这一成果发表在美国网上科学杂志《公共科学图书馆-综合》上。     

丙型肝炎病毒基因突变与免疫逃逸

免疫逃逸（Immune evasion）是指病原体逃避机体免疫监控的现象。在宿主和病毒的长期共同进化过程中,病毒形成了各种逃选机制以逃避宿主的免疫监控,其中病毒基因变异是最主要机制。丙型肝炎病毒（Hepatitis C virus,HCV）在感染个体中表现出极高的基因异质性,能有效地逃逸机体免疫识剐和破坏宿主免疫应答的能力,HCV还可侵袭免疫细胞来抑制机体的免疫功能,而建立HCV持续性感染。了解HCV病毒突变与免疫逃逸机制将会为预防和控制丙型肝炎提供依据。     

AM真菌遗传多样性研究进展

丛枝菌根（arbuscular mycorrhiza,AM）真菌是一类专性共生多核生物,至今尚未获得纯培养,与植物根系共生后才能完成其生活史。该类真菌无性繁殖,具有独特的遗传特性,属于真菌界球囊菌门（Glomeromycota）,共有200余种。研究发现AM真菌种群间以及种群内,甚至单一孢子内都存在大量基因变异,表明该类真菌具有丰富的遗传多样性。本文总结了近年来有关AM真菌遗传多样性方面的研究进展,并讨论了存在的问题。