不同微生物大鼠腹腔注射模型尿液蛋白组学的比较

不同的微生物都可以引起腹腔感染,文中尝试利用尿液来区分不同的微生物感染。通过在大鼠腹腔内分别注射大肠杆菌、金黄色葡萄球菌和白色念球菌建立3种模型,收集感染后0、12、36、72 h的尿液,并使用液相色谱串联质谱技术 (LC-MS/MS) 对尿蛋白进行分析。与感染前相比,在大肠杆菌腹腔注射模型中共鉴定到69个差异蛋白,在金黄色葡萄球菌腹腔注射模型中共鉴定到31个差异蛋白,在白色念球菌腹腔注射模型中共鉴定到38个差异蛋白。结果表明,腹腔注射不同的微生物时尿蛋白质组不同,提示尿液可能对不同的腹腔感染有鉴别诊断的潜能。     

间斑寇蛛卵粒毒素-Ⅵ的基因克隆、异源表达与活性鉴定

间斑寇蛛Latrodectus tredecimguttatus的一个显著特点是其毒腺外组织甚至卵粒中也存在毒性成分。研究毒腺外的毒素不但可以加深对蜘蛛毒素的了解,而且可以发现具有重要应用前景的新型毒素分子。为了探究间斑寇蛛卵粒中低丰度表达的蛋白质类毒素,利用生物信息学方法从间斑寇蛛卵粒转录组中挖掘出一条编码多肽毒素的基因序列,利用基于3′-RACE和巢式PCR的策略成功克隆并异源表达了该基因。表达的多肽毒素命名为间斑寇蛛卵粒毒素-Ⅵ(Latroeggtoxin-Ⅵ,LETX-Ⅵ)。生物学活性鉴定结果表明,LETX-Ⅵ能抑制ND7/23细胞膜上的钠离子通道电流和促进PC12细胞多巴胺的释放,但对美洲蜚蠊Periplaneta americana和金黄色葡萄球菌及白色念珠菌等细菌和真菌不显示明显的毒性,说明LETX-Ⅵ是一种哺乳动物特异的神经毒素,在神经生物学研究工具试剂和相关疾病治疗药物的研发等方面具有潜在的应用前景。     

引入非天然氨基酸胶原蛋白表达及交联成键的优化

微生物重组表达胶原蛋白来源清洁,同时具有序列设计灵活和高产量高纯度等优点,作为生物材料在组织工程等领域具有广泛的应用前景。然而如何促进重组胶原分子交联,使其形成更加稳定的空间结构是设计重组胶原纳米材料需要克服的难点。文中通过双质粒系统将非天然氨基酸O-(2-溴乙基)-酪氨酸引入细菌胶原蛋白序列中,并对其发酵条件进行优化,结果表明在25 ℃下,以终浓度为0.5 mmol/L的IPTG和0.06%的阿拉伯糖诱导24 h可以获得高纯度含非天然氨基酸的胶原蛋白。将含非天然氨基酸的胶原蛋白与含半胱氨酸的胶原蛋白在pH为9.0的NH4HCO3缓冲液中进行交联,形成了最大分子粒径可达1 μm的聚集体,为重组胶原蛋白生物材料的设计提供了新思路。     

Impact of genetic variants in IL-2RA and IL-2RB on breast cancer risk in Chinese Han women

The expression of IL-2RA and IL-2RB was correlated with breast cancer (BC) progression. However, there is no literature investigating the association of IL-2RA and IL-2RB polymorphisms with BC predisposition among Chinese Han Women. Seven SNPs in IL-2RA and IL-2RB were genotyped by Agena MassARRAY platform among 553 BC patients and 550 healthy controls. Odds ratios (OR) and 95% confidence interval (CI) adjusted for age were calculated for the effect of IL-2RA and IL-2RB variants on BC susceptibility. IL-2RA rs12722498 was a protective factor for BC occurrence (OR?=?0.70, p?=?0.019), especially in subjects with age?≤?52 years (OR?=?0.55, p?=?0.004). IL-2RA rs12569923 (OR?=?9.07, p?=?0.033), IL-2RB rs2281089 (OR?=?0.67, p?=?0.043) and rs9607418 (OR?=?0.59, p?=?0.012) were related to the incidence of estrogen receptor positive (ER?+) BC. IL-2RB rs3218264 (OR?=?1.38, p?=?0.010) and rs9607418 (OR?=?0.56, p?=?0.009) were associated with the risk of developing progesterone receptor positive (PR?+) BC. Rs2281089 (OR?=?1.54, p?=?0.012) and rs1573673 (OR?=?0.72, p?=?0.035) were correlated to Ki-67 level. Moreover, IL-2RB rs2281089 (OR?=?0.72, p?=?0.022) showed a reduced risk of BC metastasis, and IL-2RA rs12722498 (OR?=?0.54, p?=?0.030) had a lower frequency in BC patients with tumor size?>?2 cm. Our study identified the potential effect of genetic variations in IL-2RA and IL-2RB on BC susceptibility and/or BC clinicopathologic indicators among Chinese Han Women.

     

Intein-Mediated Protein trans-Splicing of the Recombinant Streptavidin on Magnetosomes

Molecular Biology - When expressing streptavidin recombinant polypeptide on magnetosomes (called bacterial magnetic nanoparticles, or BMPs), the presence of endogenous bacterial biotin might be...     

Female cuckoo calls elicit anti-predatory behavior in birds

Journal of Ethology - Imperfect Batesian mimicry is common in nature. Female common cuckoos (Cuculus canorus), for instance, seem to be imperfect mimics of hawks (Accipiter spp.) in both appearance...     

ArfGAP1 inhibits mTORC1 lysosomal localization and activation

The mammalian target of rapamycin complex 1 (mTORC1) integrates nutrients, growth factors, stress, and energy status to regulate cell growth and metabolism. Amino acids promote mTORC1 lysosomal localization and subsequent activation. However, the subcellular location or interacting proteins of mTORC1 under amino acid‐deficient conditions is not completely understood. Here, we identify ADP‐ribosylation factor GTPase‐activating protein 1 (ArfGAP1) as a crucial regulator of mTORC1. ArfGAP1 interacts with mTORC1 in the absence of amino acids and inhibits mTORC1 lysosomal localization and activation. Mechanistically, the membrane curvature‐sensing amphipathic lipid packing sensor (ALPS) motifs that bind to vesicle membranes are crucial for ArfGAP1 to interact with and regulate mTORC1 activity. Importantly, ArfGAP1 represses cell growth through mTORC1 and is an independent prognostic factor for the overall survival of pancreatic cancer patients. Our study identifies ArfGAP1 as a critical regulator of mTORC1 that functions by preventing the lysosomal transport and activation of mTORC1, with potential for cancer therapeutics.     

不同生育期土壤基质势调控对棉花生长和土壤水盐分布的影响

针对南疆地区水资源短缺和棉田土壤盐碱化问题,研究不同生育期土壤基质势调控对棉花生长和土壤水盐的影响,为棉田节水控盐和高效生产提供理论依据。通过大田膜下滴灌试验,以棉花灌水时期滴头下方20 cm处土壤基质势下限控制水平-50 kPa为对照(CK),在棉花的苗期(A)、苗期+蕾期(B)、苗期+蕾期+花铃期(C)设置3个基于土壤基质势下限的灌溉水平:W₁(-20 kPa)、W₂(-30 kPa)和W₃(-40 kPa),测定棉花生长、地上干物质量、产量和土壤水盐分布等指标。结果表明:不同生育期土壤基质势调控时,株高、叶面积指数和地上干物质量均表现为:WC>WB>WA>CK;不同土壤基质势水平调控时,随着土壤基质势下限的提高,株高、叶面积指数和地上干物质量也随之增加,其中,W₁C和W₂C处理显著高于其他处理。有效铃数、单铃重和衣分等产量构成要素均随着土壤基质势下限的升高而增加。W₁C和W₂C处理棉花的产量基本一致且显著高于其他处理,W₂C的水分利用效率显著高于W₁C处理。不同生育期土壤基质势均控制在-20或-30 kPa可以改善棉花主根区水分状况。各处理在收获期均表现为浅层积盐(0～40 cm),且膜外大于膜内;土壤基质势越高,膜内主根区(0～40 cm)积盐越少,其中W₁C和W₂C较其他处理减少24%。综合考虑高效生产和节水控盐,建议将当地休作期未淋洗棉田灌水时期土壤基质势控制在-30 kPa为宜。     

土壤水分对土壤产生气态氮的厌氧微生物过程的影响

气态氮[一氧化氮(NO)、氧化亚氮(N₂O)和氮气(N₂)]的释放是土壤氮损失的一种重要途径。硝化和反硝化作用是土壤气态氮损失的主要微生物过程,但是异养硝化作用、共反硝化作用和厌氧氨氧化过程对土壤气态氮损失的贡献尚不清楚。本研究利用¹⁵N标记和配对法,结合硝化抑制剂双氰胺(DCD),通过土壤培养试验来量化厌氧条件下各种微生物过程对NO、N₂O和N₂产生的贡献。结果表明: 在厌氧条件下培养24 h后,土壤孔隙含水率为65%时,3种气体总的¹⁵N回收率最高,占加入¹⁵N总量的20.0%。反硝化过程对NO、N₂O和N₂产生的贡献率分别为49.9%～94.1%、29.0%～84.7%和58.2%～85.8%,是产生3种气体的主要过程。异养硝化过程也是产生NO和N₂O的重要过程,特别是在土壤孔隙含水率很低时(10%)对两种气体产生的贡献率分别为50.1%和42.8%。,共反硝化过程对N₂O产生的贡献率为10.6%～30.7%,共反硝化和厌氧氨氧化过程对N₂产生的总贡献率为14.2%～41.8%,表明共反硝化过程在N₂O和N₂产生中的作用不可忽视。¹⁵N标记和配对法是区分气态氮损失的各种微生物过程的有效手段。     

西藏色季拉山垂直植被带土壤细菌群落组成及功能潜势

研究青藏高原土壤微生物群落组成和功能的空间分布特征有助于深入理解典型高寒生态系统中土壤微生物的重要生态功能。本研究采用16S rDNA高通量测序方法,分析了西藏色季拉山4个不同海拔土壤细菌群落物种组成和功能潜势的变化特征及其驱动因子。结果表明: 随着海拔的升高,土壤细菌的丰富度和Shannon多样性指数显著降低;酸杆菌门、绿弯菌门、芽单胞菌门和硝化螺旋菌门的相对丰度显著增加,而变形菌门、放线菌门和拟杆菌门的相对丰度则显著降低。KEGG二级代谢通路中,膜运输及氨基酸、脂类、萜类和聚酮类化合物代谢相关基因的相对丰度在高海拔显著降低,而碳水化合物代谢、信号转导、复制与修复、酶家族等基因丰度则显著升高。不同海拔土壤细菌群落组成和功能潜势的变化受到植被和土壤因子的显著影响,并且pH值是关键驱动因子。群落功能潜势与放线菌门、拟杆菌门、纤维杆菌门等种群丰度显著相关。不同海拔下群落KEGG代谢通路基因组成的差异(β多样性)与土壤细菌群落结构的差异呈显著正相关,说明微生物群落组成与功能潜势之间可能存在紧密关联。