乳腺癌转移相关基因的筛选与生物信息学分析

乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤,转移与复发是乳腺癌患者死亡的主要原因. 研究与乳腺癌细胞转移相关的分子靶点对预防乳腺癌术后复发、提高疗效有重要意义. 本研究以3组乳腺癌转移相关的基因表达谱数据(GSE2034, GSE2603, GSE12276)为分析材料,采用GeneSpring软件筛选乳腺癌原发瘤与转移瘤芯片数据的差异表达基因,结合生物信息学工具PATHER、STRING、pSTIING和文献挖掘工具iHOP对差异基因及其相互作用关系进行分析. 结果显示,共筛选出乳腺癌转移共同差异基因147个,其中表达上调93个,表达下调54个. 这些差异基因主要涉及细胞周期与增殖、细胞粘附、细胞迁移、血管形成及信号转导等生物通路和生物过程. 差异基因编码蛋白间的相互作用主要集中在14个蛋白,且在更为复杂的网络图谱中仍可见其中9个基因（CXCR4、MMP1、MMP2、MMP3、CTGF、COL1A1、MEF2C、PTGS2及SPARC）在重要的节点位置. 文献挖掘发现,COL1A1基因可能为新发现的乳腺癌转移候选基因,为乳腺癌转移的发病机制提供新的思路,也为转移性乳腺癌的分子诊断和个体化治疗奠定基础.     

副溶血弧菌LacZ报告基因融合实验方法的建立与应用

目的:建立副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus,VP)的LacZ报告基因融合实验方法。方法:PCR扩增靶基因的整个启动子区序列,并将其直接克隆入pHRP309质粒中,构建重组质粒;将重组质粒VPA1513转入VP野生株(WT)和opaR突变株(ΔopaR)中,而后通过比较两者β半乳糖苷酶活性的差异,确定OpaR对VPA1513的调控关系,以检验实验的稳定性。结果:构建出9个VP生物膜或毒力相关基因的LacZ重组质粒;OpaR对VPA1513的转录具有抑制作用。结论:建立了VP的LacZ报告基因融合实验方法,为后续转录调控机制的研究奠定了基础。     

大鵟消化系统蛋白水解酶种类和活性分析

采用蛋白水解酶复性电泳(G-PAGE)技术对大(Buteo hemilasius)消化系统5种器官腺胃、胰脏、十二指肠、空肠、大肠蛋白水解酶的种类和性质进行了研究,以期为研究野生鸟类的分类地位、系统演化提供基础资料,结果表明,①受pH值的影响和制约,大消化系统蛋白水解酶的活性在碱性、中性与酸性条件下递减;②在酸性条件下,45 ku蛋白水解酶存在于除腺胃外的各受检器官;③pH 7.0时,腺胃、胰脏酶谱相似,均含有683、5、342、0 ku的蛋白水解酶;④pH 8.0时,空肠和十二指肠的蛋白水解酶种类最多、活性最强,分别检出8种和7种蛋白水解酶。总之,pH值对蛋白水解酶的活性有明显的制约作用,46、41ku蛋白水解酶随着pH值的增高而失去活性,为酸性蛋白水解酶,250、2064、5 ku蛋白水解酶随着pH值的增高活性逐渐增强,为碱性蛋白水解酶。十二指肠和空肠的蛋白水解酶种类多、活性强,可能为蛋白质消化的主要场所。     

Cd2+结合肽的筛选及与重金属离子的亲和作用*

利用噬菌体随机十二肽库和亲和层析技术对重金属Cd进行亲和筛选,共获得两条Cd结合肽序列。将展示有Cd²⁺结合肽的噬菌体单克隆扩增物对不同重金属离子(Cd²⁺、Cr²⁺、Cu²⁺、Co²⁺、Zn²⁺、Ni²⁺)螯合的树脂进行亲和测定,结果表明Cu²⁺、Co²⁺、Zn²⁺、Ni^2+<     

中国西北地区树花属地衣研究

本文从形态学、解剖学、化学等方面对采自中国西北地区的树花属Ramalina地衣进行了研究,鉴定出该属地衣18种,其中簇树花R.chihuahuana和平树花R.complanata为中国新记录种,西北地区新记录种有12个。     

大豆诱导型启动子驱动类受体蛋白激酶GmSARK转基因植物分析

植物LRR型类受体蛋白激酶在植物生命活动中发挥着重要作用。前期研究发现,大豆（Glycine max）LRR型类受体蛋白激酶基因GmSARK可能参与调控大豆叶片的衰老过程。利用CaMV35S启动子驱动组成型过表达GmSARK基因可导致转基因植株出现致死表型,据此构建了可诱导型启动子GVG驱动GmSARK基因过表达的双元表达载体,转化野生型拟南芥（Arabidopsis thaliana）并获得了多株转基因植株。研究结果表明,外源施加诱导物地塞米松可引起GmSARK基因在转基因植株中过表达,并导致转基因植株出现叶片变黄下卷和生长受抑制等表型;外源细胞分裂素处理可以抑制GmSARK的表达,但是不能逆转GmSARK过表达所引起的上述变化。     

葡聚糖酶及其在植物中的发育调节和防卫反应

葡聚糖酶又称昆布多糖酶,胼胝质酶。它的底物葡聚糖在植物中广泛分布,葡聚糖酶的作用即与此类物质的分布相关,且常与植物许多发育过程有联系。从六十年代起,就对葡聚糖酶及其作用进了研究,时至九十年代,对它的研究已涉及到分类、生理、抗病、分子生物学、基因工程等方面。目前主要集中在它的分子生物学、抗病基因工程及雄性不育基因工程的实际应用。以下就这些方面的研究进展做一综述。     

硝酸盐对力复霉素SV和脂肪合成的调节作用

地中海诺卡氏菌菌体的脂肪分析指出十KNO3,菌体的中性脂比一KNO3菌体的含量低,但两种菌体的中性脂所含脂肪酸组分上无显著的差异。定量分析表明,在硝酸盐存在下力复霉紊sV产量的增加几乎相当于脂肪含量的减少。显然,在硝酸盐存在的情况下,用于合成脂肪的中间代谢物被用于力复霉素SV合成,从而使SV产量增高。     

四种蝽科昆虫酯酶同工酶的比较研究（半翅目∶蝽科）

采用聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳研究分析了半翅目Ｈｅｍｉｐｔｅｒａ蝽科Ｐｅｎｔａｔｏｍｉｄａｅ４种蝽象、赤条昃雌雄不同个体的酯酶同工酶。结果表明,４种蝽象酯酶同工酶酶谱有明显差异,每个种都有自己的特征谱型;赤条蝽不同个体酶谱差异较小,性别差异大于个体差异,但都小于种间差异。