Shotgun法测序制备高纯度水稻基因组DNA的方法探讨(英)

在用散弹 (shotgun)法测定水稻 (OryzasativaL .ssp .indica)基因组全序列的过程中 ,叶绿体和线粒体DNA的污染问题非常严峻 .应用脉冲场电泳 (PFGE)技术对水稻基因组DNA进行纯化 ,结果表明它能够有效去除叶绿体和线粒体DNA ,使其污染率从 3%降低到 0 2 % .同时 ,比较了水稻绿苗和黄化苗的DNA得率 ,以及HB法和NIB法制备大分子质量(HMW)DNA的异同 .最后提出一套制备水稻基因组DNA的方法 ,包括黄化苗培养 ;细胞核的分离、包埋和裂解 ;脉冲场电泳纯化、回收聚集在低熔点 (LMP)胶中的水稻HMWDNA .用该方法所得的水稻基因组DNA ,纯度高 (无叶绿体和线粒体DNA污染 )、基因组完整 (机械剪切和降解少 )、回收率高 (操作过程中DNA损失少 ) .另外 ,首次报道在融化的低熔点(LMP)胶中对水稻HMWDNA于 38℃进行超声波处理 ,能够获得用于shotgun文库和梯度文库构建所需要的各种DNA片段(1 5～ 3kb ,3～ 12kb) ,并且效果优于在TE中进行操作     

杜梨对盐碱胁迫的生理响应及耐盐碱性评价

为探究不同杜梨资源对盐碱胁迫的生理响应及筛选耐盐碱资源,以甘肃、山西、辽宁等地收集的17份杜梨资源3000余株幼苗为试验材料,采用中性盐和碱性盐混合胁迫处理,测定盐碱抗性相关的生理指标,基于主成分分析法、热图及聚类分析法和抗逆系数法进行抗性评价.研究发现,抗性强的资源抗氧化酶活性和脯氨酸含量在受到胁迫后显著上升,300...     

云南石林石炭纪古盘虫类有孔虫及其沉积环境初探

本文报道云南石林地区石炭纪中间界线附近地层的有孔虫动物群古盘虫类4属8种。分析数据显示,这类具有独特壳壁类型和形态特征的小有孔虫类群分布,与碳酸盐岩中的亮晶、团块、海百合茎以及双壳瓣类等成分的相关系数较大。综合分析结果认为,该区古盘虫类有孔虫分布与较浅水、具中等搅动、温暖及盐度正常的潮间带环境关系密切。     

循环酶法同型半胱氨酸检测关键酶CBS和CBL的开发及试剂盒研制初探

以酿酒酵母基因组为模板通过PCR分别扩增胱硫醚β合成酶(cystathionine β-synthase,CBS)和胱硫醚β-裂解酶(cystathionine β-lyase,CBL)目的基因片段,经无缝克隆构建表达质粒并转化大肠杆菌菌株E.coli BL21(DE3)。经诱导表达和纯化后,重组蛋白的纯度均达到90%,回收率均达到80%,可溶表达量分别为26 mg/L和332 mg/L。经催化活性测定,CBS的单位酶活为15 U/mg,CBL的单位酶活为72 U/mg。在此基础上初步开发了循环酶法同型半胱氨酸(homocysteine,Hcy)检测试剂盒,实验结果证明该试剂盒的有效性和稳定性均符合体外诊断检测的要求,其检测性能与市售进口同类试剂盒基本一致。     

啤酒酵母融合子QSB-Ⅺ_6遗传学和生理学特征的研究

利用生物工程技术获得了一株QSB－Ⅺ6啤酒酵母融合子,其发酵力、凝絮性均较双亲有提高,口味也明显改善,小试、中试、生产试验效果很好。为全面开发和利用该工程菌株,以啤酒酵母融合子QSB－Ⅺ6及其亲本LQ16和QSB7为对象,进行细胞体积测定,生物量测定,遗传型鉴定和DNA含量等测定,确定其主要遗传学和生理学特征,从而证实菌株QSB－Ⅺ6是融合子．     

NT-pro BNP 及D-二聚体水平变化对急性缺血性脑卒中患者预后的影响

目的:探讨急性缺血性脑卒中患者血浆B型脑钠肽前体(NT-proBNP)和D-二聚体水平与病情严重程度的关系。方法:选取2013年6月-2015年6月在我院接受治疗的急性缺血性脑卒中患者81例作为研究对象,另选取同期在我院接受健康体检的志愿者53例作为对照组。检测并比较两组血浆NT-proBNP及D-二聚体水平。结果:急性脑卒中患者血浆NT-proBNP与D-二聚体水平均显著高于对照组,差异具有统计学意义(P0.05)。大面积梗死的缺血性脑卒中患者血浆NT-proBNP及D-二聚体水平显著高于非大面积梗死患者,差异具有统计学意义(P0.05);NIHSS评分10的缺血性脑卒中患者血浆NT-proBNP及D-二聚体水平显著高于NIHSS评分≤10的患者,差异具有统计学意义(P0.05);有意识障碍的缺血性脑卒中患者血浆NT-proBNP及D-二聚体水平显著高于无意识障碍者,差异具有统计学意义(P0.05);随访结局为死亡的缺血性脑卒中患者血浆NT-proBNP及D-二聚体水平显著高于存活者,差异具有统计学意义(P0.05)。结论:NT-proBNP及D-二聚体水平可以反映急性缺血性脑卒中患者的病情,对脑卒中患者的病情评估及预后判断具有参考价值。     

基于文献计量学的直链藻属的研究进展

基于1975—2014年Web of Science数据库中有关直链藻的学术论文,进行了文献计量学分析。研究发现,每年发表论文数呈明显上升趋势,但增幅不大;单篇论文的作者数增长缓慢,近5年每篇论文的作者数开始大于4名;发表论文的学术杂志的影响因子中等偏下,学术影响力不大;以上也映射出此研究方向的冷门性。欧美发达国家对直链藻学术论文的贡献最大,在国际合作方面也处于领先地位。有关直链藻的研究内容仍偏重于基础性研究,分类、多样性和种群生态学方面的研究仍保持一定的热度。淡水湖泊和江河流域是开展直链藻研究的主要区域。     

油樟内生溶磷菌的筛选及其生物学特性

筛选具有溶磷能力的植物内生细菌,并探索该类菌的促生和抗逆性能,有助于扩大溶磷微生物来源、研发微生物肥料、改善土壤磷素营养和提高农业产量。该研究以从油樟组织中分离得到的50株内生细菌为材料,通过溶磷圈法初筛得到24株具有溶磷潜能的菌株,利用钼蓝比色法测定它们的溶磷能力和培养液的pH值,并研究溶磷能力较强菌株产生吲哚乙酸( IAA)、铁载体、1-氨基环丙烷-1-羧酸( ACC)脱氨酶、几丁质酶等促生和抗逆性能。结果表明：24株油樟内生细菌都能从磷酸钙中释放出有效磷(溶磷量为51.26~237.08μg·mL-1),其中,YG60、YG43、YG36、YG25、YG49、YG44株菌的溶磷量较高,均大于150μg·mL-1。接种油樟内生菌后,培养液的pH值均有一定程度的降低,但菌株溶磷量与培养液pH值间不存在显著相关性。6株溶磷量大于150μg · mL-1的菌株大部分具有分泌IAA、产铁载体、ACC脱氨酶活性和几丁质酶活性的能力;其中YG43、YG60和YG25分泌IAA的能力较强(IAA分泌量分别为22.55、18.75和16.41μg·mL-1),YG43和YG60产铁载体的能力较强(As/Ar小于0.6),YG43、YG60和YG25的ACC脱氨酶活性(分别为0.194、0.224、0.208 U·mg-1)较高,YG43和YG60的几丁质酶活性(分别为2.968 U和2.502 U)较高。综合菌株的溶磷、促生和抗逆性能,认为YG43、YG60和YG25菌株在促进植物生长、提高植物抗性及生物防治方面具有较好的应用前景。     

清宫止带汤联合利普刀治疗中重度宫颈糜烂湿热下注证的临床研究

摘要 目的：探讨清宫止带汤联合利普刀治疗中重度宫颈糜烂湿热下注证的疗效以及对血清肿瘤坏死因子-α（TNF-α）、白细胞介素-1（IL-1）以及白细胞介素-6（IL-6）水平的影响,以期为中重度宫颈糜烂的治疗提供可借鉴临床方案。方法：纳入2020年5月至2022年5月于山东省立第三医院收治的宫颈糜烂患者120例,根据随机数字表法分入对照组与观察组,各60例。对照组患者单纯行利普刀及术后常规治疗;观察组在对照组基础上加服清宫止带汤,两组连续观察14d。比较两组临床疗效,症状改善时间,药物不良反应发生情况及血清TNF-α、IL-1、IL-6水平。结果：观察组的总有效率（98.33％）较对照组（86.67％）显著增加（P＜0.05）。观察组的阴道出血及阴道排液持续时间较对照组显著降低（P＜0.01）。观察组的不良反应率（1.67%）较对照组（15.00%）显著降低（P＜0.05）。治疗后,两组血清TNF-α、IL-1、IL-6水平显著降低,但观察组降低更显著（P＜0.01）。结论：清宫止带汤联合利普刀治疗中重度宫颈糜烂湿热下注证的疗效确切,患者症状改善时间缩短、炎症反应降低,且安全性更好,值得临床应用与借鉴。     

厦门文昌鱼——白氏鳃口鱼

五十年前,在厦门文昌鱼渔场,曾开展了一整年的自然生态调查工作。到五十年代初期《生物学通报》报道了中国厦门的文昌鱼。从1932年到1956年渔场面积共有22平方公里,年产量在57吨左右。 1956年厦门海堤通车,切断了环岛的海流,破坏了过去的生态平衡,使文昌鱼渔场和厦门内港软泥淤积。1965年我们从集美经鳄鱼屿到刘五店进行一次海底断面的测量,明确原来沙质海底变为泥质,水深变浅。渔场被细泥覆盖一半左右,年产量仅为35吨,1970年减到1吨左右。1975年左右原有的文昌鱼渔场,已经没有人去捕捞了,只在集美东侧还有一块小沙底,有一些文昌鱼,已经不能称为渔业了。