汉防己甲素及克矽平时矽肺大鼠I型和Ⅲ型胶原mRNA的影响

汉防己甲素（汉甲）及克矽平是目前较为有效的抑制矽肺纤维化的药物,本文研究了其对胶原ｍＲＮＡ水平的影响。斑点杂交实验表明大鼠接尘６０天和１２０天后α１（Ⅲ）ｍＲＮＡ水平明显上升。经汉甲或克矽平治疗１个月域３个月后,胶原ｍＲＮＡ水平明显下降,原位杂交结果表明胶原ｍＲ－ＮＡ银颗粒与细胞性结节和增厚的肺泡壁的成纤维细胞分重事,汉甲或克矽平治疗后银颗粒数下降。提示汉甲及克矽平对矽肺进程中的胶原基因表达增强有     

抑郁症易感基因和抗抑郁药物靶点相关[]神经细胞类型及相互作用网络分析

基于抑郁症的全基因组关联分析研究(GWAS),对于获得的单核苷酸多态性位点(SNP)使用Haploreg软件进行基因注释,得到SNP注释的102个易感基因.。使用MAGMA软件对GWAS的汇总统计数据做基因水平的分析,获得了270个校正之后显著的基因,两者合并共得到320个抑郁症易感基因。通过药物数据库Drugbank获取133个抗抑郁药物靶点基因。使用EWCE包对抑郁症易感基因和抗抑郁药物靶点在三套脑组织单细胞测序数据中,分别进行神经细胞类型富集分析。结果发现大脑皮质的GABA神经元(抑制性神经元)和谷氨酸能神经元(兴奋性神经元)是抑郁症易感基因和抗抑郁药物靶点共同的神经元。这两种类型的神经细胞可能是抗抑郁药物与抑郁症易感基因相互作用的神经细胞,另外少突胶质前体细胞可能是抑郁症特有的易感神经细胞。使用Network Calculator软件构建网络并进行进行网络拓扑学参数分析。结果表明抑郁症易感基因与抗抑郁药物靶点组成了一个具有显著的相互连接的网络。本研究从单细胞层面揭示抑郁症的遗传机制,在网络层面为寻找新的抗抑郁药物靶点提供了一定的启示。     

DLGCN:基于图卷积网络的药物-lncRNA[]关联预测

为实现高通量识别新的药物-长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)关联,本文提出了一种基于图卷积网络模型来识别潜在药物-lncRNA关联的方法DLGCN(Drug-LncRNA graph convolution network)。首先,基于药物的结构信息和lncRNA的序列信息分别构建了药物-药物和lncRNA-lncRNA相似性网络,并整合实验证实的药物-lncRNA关联构建了药物-lncRNA异质性网络。然后,将注意力机制和图卷积运算应用于该网络中,学习药物和lncRNA的低维特征,基于整合的低维特征预测新的药物-lncRNA关联。通过效能评估,DLGCN的受试者工作特性曲线下面积(Area under receiver operating characteristic, AUROC)达到0.843 1,优于经典的机器学习方法和常见的深度学习方法。此外,DLGCN预测到姜黄素能够调控lncRNA MALAT1的表达,已被最近的研究证实。DLGCN能够有效预测药物-lncRNA关联,为肿瘤治疗新靶点的识别和抗癌药物的筛选提供了重要参考。     

基因组规模代谢网络模型构建及其应用

微生物制造产业的发展迫切需要进一步提高认识、设计和改造微生物细胞代谢的能力,以推动工业生物技术快速发展。随着微生物全基因组序列等高通量数据的不断积聚和生物信息学策略的持续涌现,使全局性、系统化地解析、设计、调控微生物生理代谢功能成为可能。而基于基因组序列注释和详细生化信息整合的基因组规模代谢网络模型(GSMM)构建为全局理解和理性调控微生物生理代谢功能提供了最佳平台。以下在详述GSMM的应用基础上,描述了如何构建一个高精确度的GSMM,并展望了未来的发展方向。     

组织胚胎学网络教学平台建设

随着医学的快速发展,对医学教学提出了越来越高的要求,医学基础课程教学则面临更加严峻的挑战。网络教学随着网络的飞速发展已逐渐成为一种重要的教学方式。网络教学具有传统教学不可比拟的许多优点,尤其是网络技术为培养学生自主探究学习提供了全面的支持,它可以通过网络为学生提供大量的学习资料包括文字、图片、声音、电影片断等,为学生的“自主探究”创设良好的环境。面且使教与学的时间与空间不再受到限制,可以弥补基础学科课时减少所带来的负面影响。     

拟南芥花模式建成多阶段遗传机制

花是被子植物的繁殖器官,探究花模式建成对植物进化、形态发育和作物育种等领域的研究均具有十分重要的科学意义。本文所用数据来源于拟南芥(Arabidopsis thaliana)信息资源数据库,包括79个样本的261个基因芯片数据;采用支持向量机算法构建了拟南芥花发育三阶段的蛋白质相互作用网络;利用功能富集分析、网络拓扑结构分析和聚类分析,挖掘出一批与拟南芥花形态发育和花器官形成相关的潜在重要功能基因;基于完善花发育经典的ABCD理论模式,初步阐释了拟南芥花发育的多阶段网络遗传机制。     

孤啡肽——新发现的内阿片肽及其受体

孤啡肽是最近发现的一个１７肽,其结构与已知的内阿片肽,尤其是强啡肽Ａ类似;但具有明显不同的药理学特性;与经典的阿片受体结合能力很弱,而与阿片受体家族中的一个新成员－－“孤儿受体”结合能力很强,因而认为是该受体的天然配基,孤啡肽脑室注射可使小鼠痛觉过敏,运动减少。孤啡肽受体是阿片受体家族中的新成员,属于Ｇ蛋白偶联受体,与经典的阿片受体配基亲和力均很弱,该受体激活后介导对腺苷酸环化酶活力的抑制。     

泸州医学院心肌电生理学研究室简介

泸州医学院心肌电生理学研究室成立于1983年,是学院的重点科室,西南地区唯一的专业研究机构,泸州医学院首批硕士学位点。拥有高、中级专业技术人员多名,其中专职研究人员12人,兼职人员10人,外国客座教授1人,人员结构合理、仪器设备先进、研究手段齐全、研究成绩显。     

医学图书馆的网络信息资源利用

网络信息日益深入我们的生活,为我们获取知识提供了极大的便利,现实表明医学图书馆网络信息资源的开发与利用,图书资源与网络信息资源结合的优势组合,已极大地拓展广大医务工作者及相关人员的知识领域.如何借助信息技术,依托网络环境,转变单一的馆藏发展模式,选取网上信息资源拓展馆藏,更深入地开发网上信息资源供读者利用是本文论述的目的.     

武汉城市圈生态网络鲁棒性模拟及稳定性分析

生态网络在不同破坏程度或干扰强度下呈现出不同的鲁棒性,势必造成区域生态系统的稳定性风险。基于武汉城市圈生态网络的构建与识别,建立节点和廊道的重要性评价体系,运用鲁棒模型模拟随机干扰情景下的鲁棒性变化评价生态网络的稳定性特征。结果表明:基于复杂网络理论对武汉城市圈生态网络进行拓扑网络提取,共生成117个节点和189条连接线,重要性等级较高的节点占23.9%,主要分布在研究区中北部区域,重要性较低的节点占节点总数的51.3%,主要分布在研究区的西北和东南地区;采用重力模型判别生态廊道重要性,得到17条重要廊道,28条一般廊道,重要廊道对生态网络的连通性和稳定性具有极大影响;节点数量和重要度对网络的稳定性具有显著影响,当节点失效率低于50%时,生态网络稳定性变化较小,整体处于较高的稳定性;当节点失效率在50%—85%时,生态网络极其不稳定;当节点失效比率达到85%时,生态网络开始瘫痪;依据生态节点和廊道的重要性以及模拟结果,分别提出生态节点保护和廊道建设的差异化管理策略。