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糖单孢菌16S rDNA的PCR-RFLP分析 总被引:5,自引:0,他引:5
PCR-RFLP分析适用于种和种间水平的多相分类研究。文章对PCR-RFLP方法应用于糖单孢菌属分类有具体方法进行了探讨;报道了一组适于糖单孢菌属PCR-PFLP分析的限制性内切酶,并用这组酶对6株糖单孢菌属分离株进行了研究,进一步探讨了实验菌株在该属的分类地位。同时指出了PCR-RFLP方法应用中应注意的问题。 相似文献
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线粒体ATP酶(mtATPase)复合体在高等植物生命活动中起重要作用。从栽培大豆(Glycine max(L.)Merr.)中分离鉴定了一个新的mtATPase第六亚基(EC3.6.1.34)基因(atp6),它编码具223个氨基酸的ATP6亚基,是所有已克隆的atp6基因中最短的一个,并把它命名为atp6copy3(atp6-3)。通过对9种栽培大豆的PCR分析及序列分析表明atp6-3广泛在于栽培大豆中,以atp6-3为探针对大豆重组近交系的RFLP分析初步表明栽培大豆线粒体有父性遗传的可能性。水杨酸处理明显抑制atp6的表达,并对其可能作用进行了鉴定。 相似文献
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用RFLP和PCR—RFLP技术研究东北虎和华南虎线粒体DNA多态性 总被引:5,自引:0,他引:5
采用mtDNARFLP和PCRRFLP技术研究了东北虎和华南虎的mtDNA的多态性。在mtDNARFLP研究中,分离纯化了东北虎和华南虎肝、肾和心脏组织的mtDNA,用20种识别6碱基对的限制性内切酶消化,结果只有1种限制性内切酶(XbaⅠ)检测到多态性片段,其余19种限制性内切酶消化产生的限制性格局在东北虎和华南虎完全一致。在PCRRFLP研究中,用PCR技术分别扩增了东北虎和华南虎mtDNA的控制区(controlregion),用8种识别4碱基对的限制性内切酶分别对扩增产物进行消化,结果只有1种限制性内切酶(RsaⅠ)检测到多态性片段。mtDNARFLP及PCRRFLP的结果均提示东北虎和华南虎之间的遗传距离极小。这可能与下列因素有关:两者分布区间无天然隔离屏障;具有强扩散能力;近几百年才被相互隔离。 相似文献
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AFLP分子标记及其在植物育种上的应用 总被引:64,自引:0,他引:64
扩增酶切片段多态性(AmplifiedRstricitonfragmentpolymorphism,简称AFLP)是由Zabeau等1992年发明的一项新的DNA指纹技术,它结合了RFLP和PCR技术的特点,具有RFLP技术的可靠性和PCR技术高效性,其基本原理是对基因组DNA酶切片段的选择性扩增,AFLP扩增片段的谱带数取决于采用的内切酶及引物3′端选择碱基的种类数目和所研究基因组的复杂性,实验 相似文献
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扩增片段长度多态性(AFLP)——一种新的分子标记技术 总被引:40,自引:0,他引:40
AFLP(扩增性片段长度多态性)是一种新的DNA分子标记。与RFLP、RAPD相比,AFLP具有在一次试验中可同时观察到大量的限制性片段的优点。本文阐述了AFLP的原理和方法,综述了AFLP目前在植物遗传育种研究中的应用进展,并对AFLP技术在植物遗传育种中的应用前景提出了初步设想。 相似文献
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利用RFLP,SSR,AFLP和RAPD标记分析玉米自效系遗传多样性的比较研究 总被引:45,自引:0,他引:45
利用RFLP、SSR、AFLP和RAPD4种分子标记方法研究了15个玉米(Zea mays L.)自交系的遗传多样性,同时对4种标记系统进行比较。在供试材料中筛选到具多态性的RFLP探针酶组合56个,676对SSR引物,20个RAPD引物和9个AFLP引物组合,分别检测到多态性带167、201、87和108条。SSR标记位点的平均多态性检测效率(Ai,32.2)。4种分子标记所得遗传相似自交系划分 相似文献
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利用RFLP、SSR、AFLP和RAPD标记分析玉米自交系遗传多样性的比较研究 总被引:115,自引:3,他引:112
利用 RFLP、SSR.AFLP和RAPD 4种分子标记方法研究了 15个玉米(Zea mays L.)自交系的遗传多样性,同时对4种标记系统进行比较。在供试材料中筛选到具多态性的RFLP探针酶组合56个,66对SSR引物,20个RAPD引物和9个AFLP引物组合,分别检测到多态性带167、201、87和108条。SSR标记位点的平均多态性信息量(PIC)最大(0.54),AFLP标记位点最小(0.36),但AFLP标记具有最高的多态性检测效率(Ai,32.2)。4种分子标记所得遗传相似系数相关性显著,比较相关系数表明 RAPD可靠性较低。依据 4种分子标记结果将 15个供试自交系划分为塘四平头、旅大红骨、兰卡斯特、瑞德和PN共5个类群,与系谱分析基本一致。认为SSR和RFLP两种分子标记方法适合进行玉米种质遗传多样性的研究。 相似文献
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用PCR—RFLP方法研究藏族HLA0—DQA1和—DQB1基因多态性 总被引:4,自引:1,他引:3
应用目前HLA研究领域中成熟的、有效的PCR-RFLP基因分型技术,从DNA水平对藏族健康群体进行了HLA-DQA1(49人)和-DQB1(49人)基因分型,这在国内外属首次。所采用的PCR-RFLP基因分型技术是在HLA-DQA1和-DQB1各等位基因全部序列已知的情况下,对其第2个外显子碱基序列扩增进而进行RFLP分析的方法。这种方法得到的RFLP的所有片段都是已知序列,因而精确度很高,同时为 相似文献
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微卫星DNA和AFLP标记在水稻分子标记连锁图上的分布 总被引:31,自引:0,他引:31
以一个栽培稻(OryzasativaL.sp.indica)和野生稻(O.rufipogonGrif)杂交的F2作图群体以及由该群体构建的RFLP标记连锁图,分析了微卫星DNA和AFLP标记的多态性、遗传行为及其在染色体上的分布。共定位了28个微卫星DNA标记和172个AFLP标记。28个微卫星DNA标记中有6个为华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室根据数据库中序列而设计,其余22个来自美国Cornel大学已发表的结果。172个AFLP标记出自25对引物扩增得到的228个多态性带的片段。这些标记分布于水稻的12条染色体。将此200个PCR标记与华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室构建的RFLP连锁图整合,得到一张含612个分子标记位点的遗传连锁图。 相似文献
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水稻的AFLP研究初报——反应条件的优化及对温敏核不育等位突变系的分析 总被引:4,自引:0,他引:4
通过对5460S和5460F这一对水稻等位突变系的AFLP分析,比较了AFLP与RAPD及RFLP检测DNA多态性的相对效率。结果表明,这3种分子标记的DNA多态性检出效率依次为AFLP>RAPD>RFLP;找出了水稻AFLP分析的最适反应条件;在这对等位突变系之间找到了一些多态性AFLP产物,已完成了对4个多态性AFLP产物的克隆,其中3个为单拷贝顺序;用这3个单拷贝克隆的混合物为探针,对作者自己构建的5460S水稻的BAC库进行了筛选,获得了12个阳性克隆,为今后BAC库的筛选打下了基础。此外,对上述3种分子标记各自的优缺点及它们在DNA多态性检测中的适用之处进行了分析探讨。 相似文献
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AFLP标记及在植物中的应用 总被引:9,自引:0,他引:9
AFLP是 1 992年由荷兰Keygene公司Zabeau、Vos在PCR和RFLP的基础上发展起来的一种检测DNA多态性的新方法[1] ,并于1 993年获得欧洲专利局专利。与RFLP类似 ,AFLP也是通过限制性内切酶片段的不同长度检测DNA多态性的一种DNA分子标记技术。由于RFLP是以传统的Southern杂交为基础的 ,操作繁琐 ,对DNA多态性的检出的灵敏度不高 ,在连锁图上有很多大的空间区。随着PCR技术广泛应用 ,对分子标记技术的发展产生了巨大的推动作用。除了RFLP(限制性内切酶酶切片段长度多态性标记 … 相似文献
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玉米CMS材料线粒体DNA遗传多型性的研究 总被引:19,自引:0,他引:19
选用11×4=44个探针/酶组合,50个(10mer)随机序列引物对25种不同胞质来源的CMS玉米,5种正常胞质玉米线粒体DNA进行RFLP和RAPD研究。研究结果表明:(1)45%的探针/酶组合可检测到玉米线粒体DNA的多型性,共表现15种RFLP类型,其中S组CMS材料内有7种,正常胞质材料内有2种;80%的随机引物可检测到RAPD。(2)基于RFLP资料的聚类分析结果,可将30种胞质明确地划分为T、C、S、N4组,其结果与恢复专效性测定结果一致。其中pHJ2-7-1/BamHI的RFLP类型可成为利用RFLP技术进行胞质分组的鉴定体系。(3)“双”型胞质线粒体DNA常表现S+C胞质的RFLP图谱。 相似文献
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用RT-PCR方法获取了禽传染性支气管病毒标准毒株M41,H52,A5968和国内分离株D41,F,G的S1基因,对它们做RFLF分析,发现D41,F株属于马萨诸塞血清型,G株为变异株。对用RT-PCR和RFLP来区分IBV的分型方法的应用理论和前景进行了论述。 相似文献
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昆虫核酸分子系统学研究进展 总被引:6,自引:0,他引:6
本文从研究对象、方法、类群、内容等方面综述了近十年来昆虫核酸分子系统学研究进展概况。文中首先介绍了RFLPA、探针杂交及DNA指纹、PCR与RAPD-PCR、顺序分析方法及应用情况,列举了在双翅目、膜翅目、同翅目、直翅目等目昆虫中的研究进展,并从居群遗传结构、分类学研究、系统发育和分子进化4个方面总结了昆虫核酸分子系统学的研究内容和主要成果,最后指出RAPD-PCR与RFLP联合用于测序是近期昆虫分子系统学上最有应用价值的方法。 相似文献
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AFLP标记在果树遗传育种研究中的应用 总被引:8,自引:0,他引:8
1993年 ,Zabeau等发明了一项专利技术 ,扩增片段长度多态性 (amplifiedfragmentlengthpolymorphism ,AFLP) ,该技术结合了RFLP技术和PCR技术的优点 ,以其高效性和高重复性等特点 ,被广泛应用于多种植物的遗传育种研究。1 .AFLP技术的原理和特点AFLP技术是基于对限制性片段的选择性扩增 ,基因组DNA被限制性内切酶切割后 ,将限制性片段末端连上双链接头 ,根据接头序列和相邻的限制性位点序列设计引物对限制性片段进行扩增。扩增产物经电泳检测后再比较其谱带的差异。AFLP… 相似文献
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一个新的水稻迟熟性基因的遗传分析和分子标记定位 总被引:9,自引:1,他引:8
中籼迟熟水稻品系8987含未知的长生育期基因,在杂交水稻育种中有重要的利用价值,应用该品系与4个不同生态类型的水稻品种杂交,对其F1和F2群体进行生育期调查和遗传分析,确认8987的长生育期受1对隐性主效基因控制。以(8987X地谷)F2群体为基础,应用RFLP和微卫星标记结合群分法,发现第7染色体的RFLP标记C213与该基因连锁;进一步应用F2分离群体将该基因定位于第7染色体上,暂定名为lf-3。此基因的发现和定位将有助于分子标记辅助选择和杂交水稻的改良。 相似文献
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利用RAPD技术进行植物性状标记及辅助选择 总被引:22,自引:0,他引:22
近等基因系、混合分离群体法是RAPD 标记的主要策略。目前,RAPD标记广泛用于抗线虫、抗病、雄性不育等辅助选择的研究中,取得了可喜的成绩。由于遗传距离的不同,使RAPD 标记具有基因型的差异。寻找无重组的RAPD 标记或将RAPD标记转化为RFLP标记,可以解决这一问题。随着连锁程度的降低选择效率也随着降低。相斥相的RAPD标注可提高选择效率将RAPD标记转化为SCARs、APSPs 标记,可以解决RAPD 标记稳定性差的问题。来源于RAPD 标记的SCARs 标记将在辅助选择中发挥巨大的作用。 相似文献