吉富罗非鱼两种生长激素受体基因的分离及与增重相关的SNPs位点

实验分离了吉富罗非鱼(Oreochromis niloticus)两种生长激素受体基因GHR1和GHR2的全长cDNA以及GHR1阅读框中外显子2～9、GHR2阅读框外显子2～8的DNA序列.在GHR1和GHR2分别找到6个和16个SNPs位点,其中只有2个位点在外显子部分.使用PCR-RFLP方法检测了5个家系共12...     

建鲤IGFBP 3 基因多态性对生长的影响

胰岛素样生长因子结合蛋白3(insulin-like growth factor binding protein,IGFBP3)是调节动物生长和代谢的重要基因.本实验查找了建鲤(Cyprinus carpio var.jian)IGFBP3s基因上的SNP位点.使用PCRRFLP检测了其中5个位点(IGFBP3a-I3...     

吉富罗非鱼leptin基因的克隆及其表达

Leptin为肥胖基因编码产物,是脂肪细胞分泌的蛋白质类激素,在能量平衡、摄食行为调节方面起着重要作用。采用RT-PCR法分离出了吉富罗非鱼(Oreochromis niloticus)leptin基因的部分序列,其cDNA长度为364 bp,编码96个氨基酸。同源性分析显示:鱼类leptin保守性较低。吉富罗非鱼leptin氨基酸序列与斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)的相似性较高,为80.6%,但与虹鳟(Oncorhynchusmykiss)、青鳉(Oryzias latipes)、斑马鱼(Danio rerio)等其他鱼的相似性非常低,均在40%以下。使用realtime PCR法检测leptin在各种组织中的表达量,结果发现,leptin在肝中相对表达量最为丰富,是肌肉中相对表达量的3 000倍,其次为性腺和脑,分别是肌肉中相对表达量的1 250倍和450倍,而肾、肠和肌肉中表达量较少。     

建鲤GHR基因多态性及与增重相关的SNP位点的筛选

生长激素是调控动物生长的关键因子,它通过与膜蛋白生长激素受体结合后发挥作用,因此生长激素受体基因的变异对动物生长有着重要的影响。实验根据已分离的4个建鲤jlGHRs基因,通过测定来自6尾建鲤的序列,共找到38个SNP位点。使用PCR-RFLP方法检测了353尾建鲤在其中5个SNP位点(1a内含子3 A43G、1a外显子8 A361G、1b外显子8 C12T、2a外显子8 A555G和2b外显子8 A315G)的基因型,分析了不同基因型与生长性状的相关性。结果表明5个位点均与增重显性相关;1a内含子3 A43G还与体高/体长和体厚/体长显性相关;1b外显子8 C12T与体高/体长和尾柄高/尾柄长显性相关;1a外显子8 A361G和2a外显子8 A555G也与尾柄高/尾柄长显性相关。数据分析还显示增重标记个数富集4个以上的个体明显比标记少的个体生长快,在选育群中增重标记数有2个的个体最多占30%,而增重标记数4个以上的只占14%,说明存在着较大的选育空间。实验筛选的5个位点可以作为建鲤分子育种的有效标记。       

胰岛素受体基因多态性与2 型糖尿病的相关性

目的：探讨胰岛素受体基因（INSR）的第8外显子NaiⅠ多态性与湖北汉族人群2型糖尿痛的相关性;方法：采用同胞对（家系内对照）和随机病例-对照两种实验设计,并结合聚合酶链反应-限制性片断长度多态性（PCR—RFLP）技术分析了224个样本的INSR基因第8外显子NsiⅠ多态性,并洲定了身高、体重、腰围、臀围、血压和空腹血糖等生理指标;结果：两种实验设计中对照组与病例组的基因型和基因频率均无显著差异;结论：INSR基因在湖北汉族人群2型糖屎病的发生发展中可能不起主要作用。     

hRFT2基因单核苷酸多态性的生物信息学分析

旨在筛选可能与人类疾病有关的hRFT2基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,nsSNPs)和突变位点,从SNP数据库中检索并筛选出395个有效的hRFT2基因SNPs,其中包括30个同义SNPs(synonymous SNPs,sSNPs)和31个非同义SNPs(non-synonymous single nucleotide polymorphisms,nsSNPs)。分别采用SIFT、SNPs3D和PolyPhen-2方法分析nsSNPs引起的氨基酸替换是否可能影响hRFT2的功能。结果表明,5个nsSNPs(rs11477762、rs146302587、rs146492942、rs76947760和rs145431028)可能严重影响hRFT2蛋白的功能,其中rs76947760和rs145431028的影响已得到临床证明,另外3个nsSNPs(rs148387972、rs140391358和rs3746802)也可能对hRFT2有较大的影响。     

白介素-18 基因多态性与黑龙江省汉族人群心房颤动相关性

目的:探讨白介素-18(IL-18)基因启动子区-137G/C(rs187238)位点和-607A/C(rs1946518)位点的等位基因、基因型、单体型与黑龙江省汉族人群心房颤动发病风险的相关性。方法:选取56例心房颤动患者和26例对照者,心房颤动患者按持续时间分为阵发房颤组和持续房颤组。采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序法(DS)对所选2个SNPs位点的基因型进行检测。结果:1黑龙江省地区汉族人群中IL-18基因启动子区-607A/C位点存在AA、AC、GG三种基因型,-137C/G位点存在CC、GC、GG三种基因型。2各心房颤动患者组与对照组间IL-18基因启动子区-137G/C(rs187238)位点和-607A/C(rs1946518)位点的基因型和等位基因频率比较均无显著性差异(P0.05)。3IL-18基因启动子区-137G/C(rs187238)位点和-607 A/C(rs1946518)位点有CA、CC、GA、GC四种单倍体型,各组单倍体型分布频率比较均无统计学差异(P0.05。4IL-18基因启动子区-137G/C(rs187238)位点和-607 A/C(rs1946518)位点的基因型和等位基因频率与AF患者的发病年龄均无统计学相关性(P0.05)。结论:IL-18基因启动子区-607A/C(rs1946518)位点和-137G/C(rs187238)位点不是黑龙江省汉族人群心房颤动的易感基因,可能与其心房颤动的发病风险无关。     

浙江地区汉族人群Toll样受体2基因Arg753Gln多态性和肺结核病相关性

应用聚合酶链反应-序列特异性引物方法(polymerase chain reaction with sequence specific primer,PCR-SSP),研究浙江地区汉族人群中Toll样受体2(Toll-like receptor2,TLR2)Arg753Gln(G2408A)单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)分布及其与肺结核病的易感性的关系。分析了170名肺结核病患者和199名正常献血者TLR2基因Arg753Gln位点的基因型分布频率。结果表明,在170名肺结核病患者和199名正常献血者中,TLR2 Arg753Gln位点G/G基因型频率分别为58.23%和84.2%,G/A基因型频率分别为41.77%和15.8%,两种基因型在两组中相比较,差异显著,P<0.001。两组人群中均未发现有A/A基因型存在。TLR2基因Arg753Gln位点在浙江地区汉族人群中有其独特的分布规律,这个位点的多态性分布对肺结核病的发展有潜在的危险影响。     

补体系统基因单核苷酸多态性及其与疾病的关系

天然免疫系统在病原微生物入侵的初始阶段发挥着重要的防御作用,其中补体系统可快速识别、杀伤和清除病原微生物,对疾病的发生、发展和转归起着重要的作用。文章综述了补体系统各成份单核苷酸多态性与疾病的关联研究进展,在DNA水平上揭示了补体系统遗传多态性对疾病发生、发展和转归的影响,对疾病的预防和个体化治疗具有重要的意义。     

尼罗罗非鱼ghrelin基因的多态性及其与生长性状相关SNP位点的筛选

为了研究尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)生长激素促分泌素基因(ghrelin)的多态性及其与生长的相关性, 研究以两个尼罗罗非鱼群体(快长群体和基础群体)的DNA样本各40份为模板, 通过PCR扩增和测序获得ghrelin基因序列。通过Dnasp v5和MEGA 5.0分析序列多态性、筛选有效SNP 位点; 采用Snapshot法对两个群体子代ghrelin基因中SNP位点进行基因分型, 然后分析SNP位点基因型与生长性状的相关性。结果表明, 快长群体ghrelin基因中的单核苷酸变异位点数(S)比基础群体要少, 而核苷酸多态性(Pi)和平均核苷酸差异数(K)要略高于基础群体。共筛得3个有效SNP 位点(S1、S2和S3), 均分布于第1个内含子中。遗传结构分析表明, 3个SNP 位点在两个群体的子代中均为低度多态性位点(PIC0.25), 但处于Hardy-Weinberg平衡(P0.05);快长群体子代中3个SNP 位点的观测杂合度、期望杂合度和多态信息含量等遗传多样性参数均小于基础群体子代的相应值, 3个SNP 位点的遗传多样性参数、基因型和基因频率在同一群体中高度一致, SNP 位点之间完全连锁。两个群体子代中3个SNP 位点处的优势基因型相同, 但快长群体子代中优势基因型频率要明显大于基础群体子代中相应基因型频率。对两个群体子代的生长性状与SNP基因型进行关联性分析的结果表明,尼罗罗非鱼个体的多项生长指标(体重、体长、体高、头长和尾柄高等)在不同基因型中存在显著差异(S1:GG AG, S2:TT AT, S3:AA AT)(P0.05)。D1双倍型(S1:GG, S2:TT, S3:AA)所对应的尼罗罗非鱼个体的多项生长指标(体重、体长、体高、头长和尾柄高等)显著高于D2双倍型(S1:AG, S2:AT, S3:AT)。以上结果表明, 尼罗罗非鱼ghrelin基因3个SNP 位点完全连锁, D1双倍型与快长性状密切相关, 可作为尼罗罗非鱼分子标记辅助育种的候选标记。     

我国新引进吉富品系尼罗罗非鱼群体的遗传多样性分析

选取罗非鱼(Oreochromis spp.)第二代遗传连锁图谱中的26个微卫星位点,对淡水渔业研究中心引进的、由60个家系组成的吉富品系尼罗罗非鱼(O.niloticus)群体进行遗传结构分析。结果显示,26个微卫星位点在吉富罗非鱼群体中共检测到124个等位基因,各位点的等位基因数为3～7个,平均4.8个。片段长度104～322 bp,平均杂合度观测值为0.622 1,平均杂合度期望值为0.642 3,平均多态信息含量(PIC)为0.633 4。所检测的26个位点中,有25个位点属于高度多态位点(PIC0.5),占所检测位点的96.15%;1个位点属于中度多态位点。结果表明,该吉富罗非鱼群体多态信息含量丰富,遗传多样性水平较高。因而该群体仍然具有较大的选育潜力,可以作为选育的基础群体开展进一步的选育工作。     

盐度对新吉富罗非鱼受精卵孵化和仔稚鱼活力的影响

研究了盐度梯度对新吉富罗非鱼(Oreochromis niloticus)受精卵孵化和仔鱼活力的影响。水温(28±0.5)℃下,观察比较了8个梯度的盐度(3‰、6‰、9‰、12‰、15‰、18‰、21‰、24‰)及纯净淡水(盐度为0)条件下,新吉富罗非鱼受精卵的孵化时间、孵化周期、孵化率和畸形率。同时在不同盐度条件下对4批初孵仔鱼进行耐饥饿实验,测定其不投饵存活系数(SAI)值。结果表明,新吉富罗非鱼受精卵在盐度6‰～15‰时,孵化率较高(89.0%～92.7%);盐度低于3‰和高于18‰时,孵化率较低。仔鱼生存适宜盐度3‰～15‰,最适盐度6‰～9‰。新吉富罗非鱼仔鱼在盐度0～3‰及18‰～24‰时,仔鱼的SAI值较低,不适宜仔鱼培育;盐度为6‰～15‰时,仔鱼的活力较高。仔鱼的SAI值与受精卵的孵化率呈正相关关系。     

Growth and IGF-I response of juvenile Nile tilapia (Oreochromis niloticus) to changes in water temperature and dietary protein level

Water temperature and dietary protein level play an important role in influencing the growth and insulin-like growth factor I (IGF-I) in Nile tilapia juveniles. The combined effect of temperature (20–34 °C) and dietary protein level (25–50%) on the specific growth rate (SGR), feed efficiency (FE), serum IGF-I level and hepatic IGF-I mRNA level was examined under laboratory conditions by employing central composite design and response surface method. Results showed that the linear effects of temperature and dietary protein level on the SGR, FE, serum IGF-I and hepatic IGF-I mRNA level were significant (P<0.05); the quadratic effects of temperature and dietary protein level on the FE and serum IGF-I were significant (P<0.05). The interaction of temperature and dietary protein level on the FE, serum IGF-I and hepatic IGF-I mRNA level all proved significant (P<0.05). The optimal temperature/dietary protein level combination was determined, i.e., 29.9 °C/40.3%, at which the greatest SGR (2.748%/d) and FE (0.775) were simultaneously arrived. Both SGR and FE were linearly correlated with serum IGF-I or hepatic IGF-I mRNA level. These results suggested that optimum combination of temperature and dietary protein level would enhance tilapia growth efficiency and IGF-I would regulate growth and FE.