SPSS方差分析在生物统计的应用

方差分析是生物统计中常采用的一种方法。如何使用统计分析软件进行方差分析来实现对研究结果的快速和科学的处理,获得正确的结论,是生物学研究中重要的一环。本文通过实例介绍了如何使用SPSS(Statistical Package for the Social Science or Statistic Products and Service Solution)数据分析工具进行方差分析的方法;实现了数据分析和处理的快捷、准确和直观;与Excel相比,SPSS的统计分析功能更为强大,既有利于提高数据处理效率,又降低了实验成本。     

Excel和SAS在生物统计学的应用比较

对Excel和SAS在生物统计学的应用特点及存在问题进行了比较,指出Excel制作的统计图形美观Z函数可直接给出结果,公式编辑简便实用,具有“数据分析”功能,但也存在fx和“数据分析”结果不一致的地方,加载“数据分析”工具时需要插入“Microsoft Office”初始安装盘,不能进行平均数的多重比较以及高级试验统计的结果分析。SAS的生物统计功能齐全,操作界面直观,程序模式化;但与Excel相比,相对烦琐而复杂。因此,在生物统计教学和科研工作中,应针对所处理问题的性质和目的选用不同的统计分析软件。     

介绍用于数理统计的ST-l软件

数理统计方法是分析统计资料、处理实验数据、从偶然现象中揭示必然规律的科学方法,由于统计处理时数据多、计算繁、容易出错,目前已广泛采用电子计算机来解决数理统计领域的各类问题。 中国科学院遗传研究所技术室最近推出的ST-1软件就是为提供常用数理统计方法的程序而设计的,这些程序涉及了数据整理,常用分布函数的数值计算,参数的区间估计,统计检验(u 检验、t 检验、x~2 检验、F检验)、方差分析、回归分析等数理统计方法的主要内     

昆虫种群数据分析及在SPSS软件上的实现

选择合适的统计分析方法对昆虫种群分析至关重要。本文以昆虫种群数据常用的分析方法为基础,介绍了单因素方差分析、多因素方差分析、重复测量方差分析和回归分析等多种分析方法的基本原理,强调了各种分析方法的应用前提,避免误用方法导致结果判读产生偏差,并结合SPSS软件的使用,实现相应的分析,旨在为昆虫种群数据分析提供方法论的参考。     

土壤中微生物含量影响因素的统计方法分析

【目的】采用多元方差分析、多元线性回归分析、通径分析等统计方法,并利用多元统计方法对土壤中微生物含量进行分析。【方法】通过研究这3种常用统计方法的原理、应用条件、适用于解决的问题等,用不同的方法分析影响土壤中微生物含量的各种因素,利用SPSS软件求解。【结果】得出不同降雨量下土壤中的微生物含量存在差异性;铵态氮含量和海拔高度与变形菌门含量呈显著的线性关系,土壤中变形菌门含量随着铵态氮含量增多而增多,且铵态氮含量对变形菌门含量所起的直接作用最大;土壤中铵态氮含量、总氮量和海拔高度与放线菌门含量呈显著的线性关系,且均为负相关;其中总氮量对土壤中放线菌门含量的变化所起的负面作用最大,但铵态氮含量对放线菌门含量所起的直接作用最大。对比描述性统计方法与多元方差分析方法可知,应用描述性统计方法只能得出降雨量是影响土壤中不同细菌群落相对含量的因素之一,而不知降雨量对微生物含量变化的影响程度,6个梯度降雨量引起地显著差异究竟是由哪种微生物引起的,方差分析方法可以解决以上的问题。对比多元线性回归分析方法与通径分析方法可知,多元线性回归分析得出的相关系数只能表示铵态氮含量、总氮量和海拔与变形菌门含量(放线菌门含量)之间关系的密切程度,但无法解释和分析这种关系的构成和来源,通径分析方法可以解决这个问题。【结论】通径分析方法在分析相关问题时要优于多元线性回归分析方法,通径分析比多元线性回归分析方法更能体现因素对变形菌门含量(放线菌门含量)的直接影响和间接影响,分析结论更直观、更能说明问题。     

EXCEL在天然产物提取工艺中的应用

正交试验设计是天然产物研究中重要的方法之一,本文介绍了利用Microsoft EXCEL的内部统计函数编制天然产物提取工艺统计分析程序,并以实例说明了该程序的使用方法和应用技巧。结果表明,用户只需输入试验的原始数据,即可快速、准确地进行直观分析和方差分析,并可根据极差值得出最佳工艺条件,所得分析结果与专业统计分析软件DPS对数据进行正交分析相比,二者计算结果基本一致,且该方法不但快捷方便,操作简单,而且结果准确可靠,可大大提高天然产物提取工艺的效率。     

常用的生物统计方法及其R语言实现

统计分析是科学研究中一个极其重要的环节。本文以昆虫学研究为实例,利用模拟数据,总结了14种常用的生物统计方法及其R语言实现,重点强调了如何根据科学问题和样本数据的具体情形选取合适的统计方法。这些统计方法包括可用于均值比较分析的符号检验、Wilcoxon符号秩检验、t-检验、Wilcoxon秩和检验、Kruskal-Wallis检验、Nemenyi检验、Tukey检验、Friedman检验、单因素方差分析、重复测量方差分析和可用于相关性分析的卡方检验、Fisher精确检验、Spearman秩相关分析、Pearson相关分析,可为生物统计或R语言基础薄弱的昆虫学工作者提供参考。     

介绍用于数理统计的ST-1软件

数理绕计方法是分析统计资料、处理实验数据、从 偶然现象中揭示必然规律的科学方法，由于统计处理 时数据多、计算繁、容易出错，目前巳广泛采用电子计 算机来解决数理统计领域的各类问题。 中国科学院遗传研究所技术室最近推出的ST-1 软件就是为提供常用数理统计方法的程序而设计的， 这些程序涉及了数据整理，常用分布函数的数值计算， 参数的区间估计，统计检验（“检验、，检验、x=检验、r 检验）、方差分析、回归分析等数理绕计方法的主要内 容，共计31个，全部采用BASIC语言编写。使用时只需 从软盘上调出所用程序，按照有关提示输人相应的数 据，即可得到处理结果。     

基于Median函数的分段回归模型及其在生物学上的应用

在生物学科研工作中,经常会遇到因变量和自变量之间存在着多种不同的趋势,分段回归模型可以很好的拟合变量间这种非线性趋势.本文介绍了基于Median函数的分段回归模型,可以同时对各项回归参数和转折点进行估计,最后,本文结合生物学上的实例运用SAS统计软件进行了分段回归模型的拟合.     

青光眼患者住院费用及影响因素分析

目的 了解青光眼患者住院费用情况及其主要影响因素,为控制住院费用的不断增长提供合理化建议。方法 收集黑龙江省某三甲医院2010—2014年的青光眼患者共828例,采用描述性分析、t检验、单因素方差分析和多元线性回归方法进行分析。结果 青光眼患者的平均住院费用是19 660.58元,住院费用的主要影响因素是住院天数、是否手术、入院时间。结论 合理用药减少药品费用,缩短住院天数提高有效住院时长是控制青光眼患者住院费用的有效途径,同时要提高医务人员劳动价格以提高其积极性。     

Excel在微生物培养条件优化中的应用

根据正交试验设计的原理,采用Microsoft Excel软件编制优化微生物培养条件的程序,并以实例说明了该程序的使用方法。结果表明,用户只需输入试验的原始数据,即可快速、准确地进行直观分析和方差分析,并可根据极差值得出最佳工艺条件,从而大大提高微生物发酵的效率。     

ArraySolver: an algorithm for colour-coded graphical display and Wilcoxon signed-rank statistics for comparing microarray gene expression data

The massive surge in the production of microarray data poses a great challenge for proper analysis and interpretation. In recent years numerous computational tools have been developed to extract meaningful interpretation of microarray gene expression data. However, a convenient tool for two-groups comparison of microarray data is still lacking and users have to rely on commercial statistical packages that might be costly and require special skills, in addition to extra time and effort for transferring data from one platform to other. Various statistical methods, including the t-test, analysis of variance, Pearson test and Mann-Whitney U test, have been reported for comparing microarray data, whereas the utilization of the Wilcoxon signed-rank test, which is an appropriate test for two-groups comparison of gene expression data, has largely been neglected in microarray studies. The aim of this investigation was to build an integrated tool, ArraySolver, for colour-coded graphical display and comparison of gene expression data using the Wilcoxon signed-rank test. The results of software validation showed similar outputs with ArraySolver and SPSS for large datasets. Whereas the former program appeared to be more accurate for 25 or fewer pairs (n 相似文献   

MapDraw，在Excel中绘制遗传连锁图的宏

MAPMAKER是现今广泛使用的遗传连锁数据分析软件,然而其广泛使用的DOS版本却不具有连锁图绘制功能,给连锁作图工作带来了相当大的麻烦。为了解决这一问题,我们以大家广泛使用的数据处理软件Microsoft Excel为平台,编写了一个Excel宏——MapDraw来在轻松的操作中实现遗传连锁图的绘制。 Abstract:MAPMAKER is one of the most widely used computer software package for constructing genetic linkage maps.However,the PC version,MAPMAKER 3.0 for PC,could not draw the genetic linkage maps that its Macintosh version,MAPMAKER 3.0 for Macintosh,was able to do.Especially in recent years,Macintosh computer is much less popular than PC.Most of the geneticists use PC to analyze their genetic linkage data.So a new computer software to draw the same genetic linkage maps on PC as the MAPMAKER for Macintosh to do on Macintosh has been crying for.Microsoft Excel,one component of Microsoft Office package,is one of the most popular software in laboratory data processing.Microsoft Visual Basic for Applications (VBA) is one of the most powerful functions of Microsoft Excel.Using this program language,we can take creative control of Excel,including genetic linkage map construction,automatic data processing and more.In this paper,a Microsoft Excel macro called MapDraw is constructed to draw genetic linkage maps on PC computer based on given genetic linkage data.Use this software,you can freely construct beautiful genetic linkage map in Excel and freely edit and copy it to Word or other application.This software is just an Excel format file.You can freely copy it from ftp://211.69.140.177 or ftp://brassica.hzau.edu.cn and the source code can be found in Excel′s Visual Basic Editor.     

动物栖息地选择评估的常用统计方法

利用合适的统计学方法能够更准确地理解动物的栖息地选择。本文通过对2003~2012年期间,10个国际期刊所发表的177篇关于鸟类和兽类栖息地选择论文的30种统计学方法进行分析,简要概述了目前流行的栖息地选择统计学分析方法及特点,同时对同时期的中文文献也进行了简要分析。目前关于动物栖息地选择较为流行的分析方法主要有逻辑斯蒂回归、资源选择函数、成分分析、广义线性模型、多元方差分析、基于欧几里德距离的方法、广义线性混合模型、生态位因子分析、基于个体模型、典型相关分析、物种分布模型等。广义线性模型、逻辑斯蒂回归、多元方差分析和基于欧几里德距离这些方法可以很灵活地用来分析数据,但是缺乏一个有生态学意义的理论框架。资源选择函数和生态位因子分析各自为栖息地选择研究提供了一个统一的理论框架。基于个体的模型是一个自下而上的过程,很难在系统水平形成理论。232篇国内文章中使用较多的方法是主成分分析、Mann-Whitney U检验、t检验、卡方检验、判别分析、方差分析、Vanderloeg选择系数和Scavia选择指数、逻辑斯蒂回归、Kruskal-Wallis H检验和多元回归分析等。在实际研究中,应根据所要解决的研究问题,选择切实可行的分析方法。     

利用Excel的VBA语言自动分析大量共聚焦线扫描图像数据的方法

目的：Microsoft Excel的内置控制语言是VBA(visual basic for application)。它可以极大地增强Excel的数据处理能力。本文通过一个简单的例子说明如何利用VBA自动分析大量共聚焦线扫描图像数据并图示分析结果。方法与结果：文中首先描述了取自共聚焦线扫描图像的实验数据的结构及处理要求。然后具体说明宏程序(用VBA编写)的录制、修改和使用的详细方法。宏程序代码很接近自然语言,较好理解,而且在大多数情况下可通过“录制宏”功能自动生成,把编程的工作减至最少。结论：与手工使用Excel一步步进行数据处理相比,使用Excel中的VBA处理数据可少花时间、少犯错误、减少大量单调重复的劳动．．这些可极大地提高数据处理效率,使研究者可把更多的时间用于数据处理方案的设计和完善上。特别在处理量大而复杂的实验数据时更需要如此。这样,数据中蕴含的有用信息才能更好地被有效而准确地提取出来并加以显示。     

A modern tool for classical plant growth analysis

We present an all-inclusive software tool for dealing with the essential core of mathematical and statistical calculations in plant growth analysis. The tool calculates up to six of the most fundamental growth parameters according to a purely 'classical' approach across one harvest-interval. All of the estimates carry standard errors and 95 % confidence limits. The tool is written in Microsoft Excel 2000 and is available free of charge for use in teaching and research from www.aob.oupjournals.org article supplementary data.     

Kgtests: a simple Excel Macro program to detect signatures of population expansion using microsatellites

A simple Microsoft Excel Macro application (kgtests) that performs the k and g tests for detecting population expansion is described. The application, being an Excel Macro, facilitates the ease of preparation of the input file and makes it possible to use the application in any machine that can run Excel.     

DNA array analysis in a Microsoft Windows environment.

Microsoft Windows-based computers have evolved to the point that they provide sufficient computational and visualization power for robust analysis of DNA array data. In fact, smaller laboratories might prefer to carry out some or all of their analyses and visualization in a Windows environment, rather than alternative platforms such as UNIX. We have developed a series of manually executed macros written in Visual Basic for Microsoft Excel spreadsheets, that allows for rapid and comprehensive gene expression data analysis. The first macro assigns gene names to spots on the DNA array and normalizes individual hybridizations by expressing the signal intensity for each gene as a percentage of the sum of all gene intensities. The second macro streamlines statistical consideration of the confidence in individual gene measurements for sets of experimental replicates by calculating probability values with the Student's t test. The third macro introduces a threshold value, calculates expression ratios between experimental conditions, and calculates the standard deviation of the mean of the log ratio values. Selected columns of data are copied by a fourth macro to create a processed data set suitable for entry into a Microsoft Access database. An Access database structure is described that allows simple queries across multiple experiments and export of data into third-party data visualization software packages. These analysis tools can be used in their present form by others working with commercial E. coli membrane arrays, or they may be adapted for use with other systems. The Excel spreadsheets with embedded Visual Basic macros and detailed instructions for their use are available at http://www.ou.edu/microarray.