文摘

010 0 2 4基因组研究中全长ｃＤＮＡ克隆的策略 [中 ]/张庆华… //生物工程进展 .- 2 0 0 0 ,2 0 (4) .- 3～ 5全长ｃＤＮＡ的克隆是目前人类基因组研究中的一个重要方面 ,与大规模基因组测序相比较 ,ｃＤＮＡ测序克隆用相对较少费用获得更多的功能基因信息 ,故也是符合我国国情的基因组研究的主要方向。如何更加高效地获得新的全长ｃＤＮＡ ,本文结合作者自己工作中的经验 ,对从全长文库的建立到全长ｃＤＮＡ的测序及克隆方法作了较为详细的介绍。(杨淑培 )0 10 0 2 5细胞培养中的程序性细胞死亡 [中 ]/高红亮… //生物工程进展 .- 2 0 0 0…     

基因组研究中全长cDNA克隆的策略

全长cDNA的克隆是目前人类基因组研究中的一个重要方面,与大规模基因组测序相比较,cDNA测序克隆用相对较少费用获得更多的功能基因信息,故也是符合我国国情的基因组研究的主要方向。如何更加高效地获得新的全长cDNA,本文结合作者自己工作中的经验,对从全长文库的建立到全长cDNA的测序及克隆方法作了较为详细的介绍。     

热休克后表达受抑基因的分子克隆及其表达特性

以人成骨肉瘤细胞株ＨＯＳ－８６０３为热休克模型,在利用ＤＤｍＲＮＡ方法筛选和克隆了一个热休克后表达受抑基因的ｃＤＮＡ片段的基础上,以该片段为探针,筛选ＨＯＳ－８６０３细胞的ｃＤＮＡ文库,获得该基因的全长ｃＤＮＡ克隆（ＨＳＳＧ－１）;ＤＮＡ序列测定表明该ｃＤＮＡ全长１４５６ｂｐ,编码２７６个氨基酸,经计算机辅助分析,该ｃＤＮＡ序列尚未被报道。经ＲＮＡ斑点杂交证实,该基因的表达于多种组织细胞之中,并且     

岸蟹（Carcinus maenas）金属硫蛋白cDNA及其基因的克隆

利用已知的Ｃ．ｍａｅｎａｓ金属硫蛋白氨基酸序列资料,用全简并的ＰＣＲ引物,从鳃组织总ＲＮＡ中扩增出两种金属硫蛋白ｃＤＮＡ片断,并将其克隆到ｐＧＥＭ－Ｔ载体中,序列测定表明,其中一种ｃＤＮＡ片断核苷酸序列和推知的Ｃ．ｍａｅｎａｓ金属硫蛋白核苷酸序列完全吻合;另一种ｃＤＮＡ片断则在３’端有较大变异。根据前者ｃＤＮＡ片段序列设计特异性引物,扩增并克隆了其编码区全长ｃＤＮＡ和其编码基因,测序结果表明,岸蟹     

PCR法在未知cDNA克隆与序列测定中的应用研究

 ＰＣＲ法在未知ｃＤＮＡ克隆与序列测定中的应用研究邢桂春,贺福初,杨晓明,吴祖泽（北京军事医学科学院放射医学研究所,北京１００８５０）目前,新型蛋白质克隆的最有效途径乃先构建ｃＤＮＡ文库,然后筛选、分离其ｃＤＮＡ再行亚克隆、测序。为克隆人新型肝细胞生长...     

人基因组表达图谱分析和疾病相关基因搜寻──现状与展望(续前)

人基因组表达图谱分析和疾病相关基因搜寻──现状与展望（续前）康毅滨,柴建华（复旦大学遗传学研究所上海２００４３３）二、ｃＤＮＡ随机部分ｆ三、测序及ＥＳＴ的建立以上所讨论的方法均是从基因组ＤＮＡ出发寻找表达序列,与之恰好相反的另一种构建表达图的思路是随机挑选ｃＤＮＡ文库中的克隆进行测序并在染色体上定位,即ｃＤＮＡ策略。人类基因组计划的一个重要目标是获得人基因组３０亿个碱基对的顺序,而以目前的测序技术要在近期内完成这一目标还略显力不从心。     

应用大规模测序技术和生物信息学研究造血干/祖细胞的基因表达及新基因的识别和克隆

从新生儿脐血和成人骨髓中分选出造血干／祖细胞（ＨＳＣ／ＨＰＣ）,构建成ｃＤＮＡ文库,对其进行大规模表达序列标签（ＥＳＴ）测序,通过生物信息学等手段分析基因表达谱,并进行新基因的全长ｃＤＮＡ克隆。在所测的１０５１２条可分析ＥＳＴ序列中,有９８６６条来自脐血ＣＤ３４＋细胞,其中４６９７条（４７６％）为已知基因,２６０３条（２６４％）为已知ＥＳＴ,１４１５条（１４３％）代表未知ＥＳＴ。在已知基因中,８２％基因与造血相关,２２７％涉及细胞代谢、结构和迁移,１３０％与细胞分裂和防御相关,２６２％与ＲＮＡ、蛋白质的合成相关,１０６％和细胞信号传递有关。对一些已知和未知的ＥＳＴ,综合测序、生物信息学等方法,进行全长克隆,已获得２３个新基因的全长ｃＤＮＡ。     

应用cDNA文库快速构建法克隆高粱肌动蛋白基因

取生长一周的高粱嫩叶为材料,按照ｃＤＮＡ库快速构建法,用λｇｔ１０为载体成功地获得了含有２×１０＾０６人重组噬菌体的ｃＤＮＡ库。以水稻ＲＡｃｌ ｃＤＮＡ为探针,经噬菌体原位杂交筛选出两个阳性克隆片段,并对其中一个进行了Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交鉴定。然后将重组体中含有的ｃＤＮＡ片段亚克隆至ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ ＳＫ－载体上测序。     

RT－cDNA克隆－PCR法获取犬瘟热病毒融合蛋白基因（F）

纯化鸡胚成纤维细胞培养的犬瘟热病毒（ＣａｎｉｎｅＤｉｓｔｅｍｐｅｒＶｉｒｕｓ,ＣＤＶ）,获得病毒基因组ＲＮＡ后,反转录合成双链病毒Ｆ基因ｃＤＮＡ。将此双链ｃＤＮＡ平端插入ＰＵＣ１９质粒ＳａｍⅠ位点构建重组质粒,进行ｃＤＮＡ克隆。以重组克隆质粒为模板ＰＣＲ扩增,获得ＣＤＶ全长Ｆ基因。将此Ｆ基因插入表达载体ＰＢＶ２２０,在大肠杆菌中表达,通过对表达产物的最终鉴定,可确认所获片段为ＣＤＶ全长Ｆ基因．     

重叠片段法克隆全长人肝细胞生长因子cDNA

通过重叠片段的ＲＴ－ＰＣＲ方法,从人胎盘组织克隆了人全长肝细胞生长因子ｃＤＮＡ片段（约２２００ｂｐ）,经酶切证实和测序分析都表明该片段确为人ＨＧＦｃＤＮＡ。本文所用方法解决了扩增较长目的基因片段时,由于ＲＮＡ酶及反转录酶的ＲＮＡ酶Ｈ活性和ｍＲＮＡ二级结构等多种因素的影响,使获取长片段ｃＤＮＡ难以成功的难点