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相似文献
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1.
基因芯片数据分析方法研究进展   总被引:2,自引:0,他引:2  
基因芯片技术的出现改变了生物医学研究的前景,其产生的海量数据是限制其发展的瓶颈问题。为提取其中所隐含的有价值的信息,在基因芯片数据分析的复杂计算工具和方法方面近年来有很多尝试。本文对近5年来基因芯片表达数据的分类分析方法进行综述,既分类比较了以聚类分析为基础的分类方法,也吸收了当前应用数据挖掘、信息融合等系统生物学思路的研究技术,并对数据的分析结果进行评价。  相似文献   

2.
吴文菁  陈佳颖  叶润宇  李杨帆 《生态学报》2019,39(19):7079-7086
2016年莫兰蒂台风对厦门城市社会-生态系统造成重创,该系统在灾害影响下的脆弱性成为亟待研究的重要问题。基于新浪微博平台进行大数据挖掘,结合统计年鉴及空间基础数据,建立台风灾害影响下基于暴露-敏感-应对-恢复力体系的海岸带城市社会-生态系统脆弱性指标体系,评估灾前灾后台风对厦门不同地区的影响;同时根据微博大数据的定位信息,对不同受灾信息进行灾情跟踪及分析,结果表明,在本次台风灾害中思明、湖里区表现出的脆弱性较低,而海沧、集美区表现出的脆弱性较高,主要是由于思明、湖里区的应对能力明显高于其他各区,从大数据显示的恢复情况来看,除海沧区外,其他三区在电力方面的恢复速度都较为迅速。研究成果能够为台风灾害背景下的城市脆弱性评价提供新的方法与技术,为灾前防治、灾后恢复提供决策参考。  相似文献   

3.
随着高通量测序技术的迅速发展和食品微生物研究的逐步深入,产生了大量的数据和知识,且以不同的数据格式分布在各种数据库中。为了更好地支持食品微生物的相关研究,从各种分布式、异构的数据和知识中,进行数据提取与转换,并形成一个整合的数据平台显得尤为重要。FoodMicrobes数据库利用语义网技术,建立了一个食品微生物的整合型数据平台。该平台从各种开放的公共数据库,提取了与食品微生物相关的基因、基因组、基因功能、蛋白质序列与结构、代谢途径、文献、专利等信息,利用RDF的方法,对数据进行转换,并建立了数据之间的关联,实现了数据整合,是目前在食品微生物领域以语义网方式建立的第一个数据库。在该平台中,实现了将食品微生物的物种、菌株层面的宏观信息与基因组、蛋白质、代谢与功能等微观层面信息的贯通,并通过友好的数据检索界面,为用户进行食品微生物研究提供了重要的工具。  相似文献   

4.
目的探究医院官方微博宣传中存在的诸多问题,进而为优化医院官方微博宣传提供思考。方法以网民使用较多的新浪微博和腾讯微博为采样媒介,以小组分工调查的方式完成微博数量、信息内容及其网友互动等情况的统计分析。采用EPIdata3.1进行数据库录入,运用SPSS13.0进行数据分析,结合excel等软件进行系统的数据分析。结果?四川省三甲、三乙、二甲三类医院的官方微博普及率不高,微博内容更新率低,健康知识的信息传播不能满足受众需求,微博粉丝活跃度低,互动性不够。结论我省医院官方微博宣传机制还存在诸多问题,需要进一步优化。  相似文献   

5.
MATLAB 7.X生物信息工具箱为广大用户提供了一个用于系统发生分析的综合环境,它能利用数据库资源,方便获取DNA/蛋白质序列数据,所有操作简单高效,结果可视化程度高。在工具箱提供的开放环境里,用户还可以根据自己的目标来设计和利用分析工具。本文介绍MATLAB7.X生物信息工具箱在构建系统发生树方面的应用,以人科线粒体基因序列作为分子标记构建一株人科系统发生树为例,说明在MATLAB环境下对系统发生树的分析和处理。  相似文献   

6.
基于Barista软件的高分辨率遥感影像中建筑物3D信息的提取   总被引:4,自引:2,他引:2  
城市建筑物空间信息的获取对城市规划、环境保护等社会各行业越来越重要,高分辨率商业卫星的出现为提取建筑物3D信息提供了可能性.本文基于Barista软件,利用Quick-Bird数据提取了建筑物的3D信息并进行了精度验证.结果表明:基于Barista软件从高分辨率卫星影像中提取建筑物3D信息,具有专业水平要求低、普适性强、操作简单、精度高等优点;当数字高程模型(DEM)和传感器定位模型精度较高、影像偏天底角较理想时,3D信息提取的水平定位精度和高度测量精度可达到1个像素水平.  相似文献   

7.
基因芯片数据分析与处理   总被引:7,自引:1,他引:6  
基因芯片技术在基因表达分析等应用过程中产生大量的数据,如何处理和分析这些数据并从中提取出有价值的生物学信息是一个极为重要的问题.其过程包括原始数据的获取及处理、标准化数据的统计学分析、以及数据的存储和交流等.  相似文献   

8.
文本挖掘技术在整合蛋白与疾病关系资源中的应用   总被引:3,自引:0,他引:3  
为了整合文献中大量的人类蛋白质与疾病相互关系的信息,通过文本挖掘和通路分析的方法从PubMed中的摘要提取出对应关系后,利用KEGG中的通路信息构建出人类蛋白质和疾病相互的一个网络效应,并构建了查询数据库,用户可以根据蛋白质名称、疾病名称、通路名称来进行多方面的查询。  相似文献   

9.
生物信息学的发展产生了越来越多的数据库和生物学软件,研究人员在应用这些生物学工具处理实验数据时需要大量的时间解决数据格式转换和管理等问题。本文介绍了一种交互式的基于网络的新一代生物信息学分析平台—Swami,它综合了主要的生物信息学数据库和软件,可以加速数据处理并帮助用户管理数据。因此它将推动生物信息学向更深层次发展。  相似文献   

10.
目的 调研上海市三甲医院官方微博的现状,为完善大型公立医院微博的规范化、标准化管理提供依据和方法。方法 以上海市三甲医院为调查对象,基于信息数据分析对其官方微博进行网络跟踪调查,从医院官方微博的活跃度、影响度、覆盖度三个核心指标进行数据统计分析。结果 上海市三甲医院官方微博拥有率为20%,活跃度、影响度、覆盖度医院之间差异较大,整体水平均偏低。结论 上海市三甲医院官方微博还处于起步阶段,如何发挥好微博的媒介平台需要引起管理者重视。  相似文献   

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