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相似文献
 共查询到19条相似文献,搜索用时 203 毫秒
1.
筛选差异表达基因方法的新进展   总被引:3,自引:0,他引:3  
了解不同细胞或同类细胞在不同发育阶段、不同生理状态下的基因表达状况,可以为研究生命活动过程提供重要信息。以差别筛选、削减杂交等基本方法为出发点,研究基因表达差异的方法不断完善,先后出现了DDRT—PCR、RDA、SSH、cDNA微阵列(基因芯片)、基因表达的系统分析(SAGE)等技术。本着重对这些方法的优缺点及改进进行论述和评介,并对技术的发展趋势进行了分析。  相似文献   

2.
基因表达系列分析(SAGE)技术不仅能够全面地分析特定组织或细胞内表达的基因,还可以比较不同组织在不同时间、空间条件下基因表达的差异,从而发现新基因.SAGE技术在肿瘤研究中的应用发展很快.本文综述了SAGE技术的原理、应用及其近年来的发近几年展与演变.  相似文献   

3.
田勇  卢立志 《生命科学》2012,(10):1211-1215
基因表达系列分析(serialanalysisofgeneexpression,SAGE)是一种快速分析特定组织或细胞内基因表达信息的技术,不但可以比较不同组织细胞在不同时间、空间条件下基因表达的差异,还能发现新基因。近几年来,SAGE技术在动物基因表达研究中的应用取得了飞速发展。就SAGE技术的原理、实验路线、优缺点和改进以及SAGE在动物科学研究中的研究现状及应用前景作一简要介绍。  相似文献   

4.
 肝再生过程中立即早期反应基因的表达在成熟肝细胞由G0 期向G1期的转变中起着关键作用 .为探讨肝再生早期基因表达的变化 ,利用表达性差异显示分析 (RDA)技术研究了 2 3肝部分切除后 1h再生肝选择性基因表达 ,发现一株TEC酪氨酸激酶同源序列存在于差减产物中 ,RNA狭缝杂交证实确为差异表达基因 .从大鼠肝cDNA文库中分离其全长cDNA ,序列分析结果表明 ,该基因为小鼠 人TEC酪氨酸激酶的同源体 ,进而以该cDNA为探针 ,用Northern杂交证实 2 3肝部分切除后TEC酪氨酸激酶基因在 1h内呈现瞬间表达增加 ,其表达水平较基础水平增高 2 5倍 ;在原代培养大鼠肝细胞体系中 ,EGF可迅速诱导TEC基因表达 ,且不被蛋白合成抑制剂阻断 .结果表明 ,TEC基因是一种与肝再生调控密切相关的早期反应基因 .  相似文献   

5.
吴志革  邹方东 《四川动物》2006,25(3):653-657
基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)是一项强大的数字化分析基因组整体表达模式的技术。它的诞生为定量、全局性地分析特定细胞内的基因表达情况提供了可能。本文介绍了SAGE技术的基本原理、最新进展和应用。  相似文献   

6.
运用cDNA代表性差异分析法(cDNA representational difference analysis,cDNA RDA),以正常人鼻咽上皮细胞及鼻咽癌HNE1细胞作为比较的样品来源,分离了四个在鼻咽癌中缺失的cDNA片段.以此四个片段作探针,分别进行DNA杂交、RNA杂交,结果显示,这些差异性的cDNA序列确实来自正常人鼻咽上皮且只在其中表达和/或在鼻咽癌HNE1中表达降低,并在鼻咽癌病人中存在不同程度的缺失.序列分析结果表明这些差异性表达的基因为具有相当抑癌基因功能的已知基因和可能与鼻咽癌相关的抑癌基因的新基因.从而说明cDNA RDA是一种高效、敏感、假阳性低的克隆抑癌基因的有效方法.  相似文献   

7.
用cDNA差式分析法克隆受GA抑制的豌豆基因   总被引:3,自引:0,他引:3       下载免费PDF全文
采用新兴的cDNA差式分析法(representational difference analysis,RDA)比较了经过赤霉素(GA)处理和未经过处理G2豌豆基因表达的差异,发现该豌豆细胞内有数个被GA特异性抑制的mRNA.克隆其中分子量较大的片段PGAS1~3(PeaGA suppressed cDNA 1~3),经Northern杂交证实这些基因只在未经GA处理的豌豆细胞内表达.比较现行核DNA(或 cDNA)减法及差式显示(Differential display)等技术,认为本方法不仅操作简单、易于推广,而且重复性好,假阳性少,是分子克隆技术的重要进步.  相似文献   

8.
基因表达系列分析   总被引:4,自引:0,他引:4  
黄骥  张红生  王东  曹雅君  杨金水 《遗传》2002,24(2):203-206
  相似文献   

9.
基因表达系列分析(SAGE)技术在肿瘤研究中的应用   总被引:1,自引:0,他引:1  
基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)是一项高效、快捷、低成本的研究生物基因表达水平的方法,广泛用于各种肿瘤的分析研究。SAGE技术对于全面分析肿瘤组织基因表达谱、寻找肿瘤特异性表达新基因、发现肿瘤组织特异标志物和揭示肿瘤发病的分子机制发挥重要的作用。随着“肿瘤基因组解剖工程”(CGAP)的进行,CGAP SAGE可以通过网站分析和展示SAGE数据,并自动的将基因名称和SAGE转录物水平联系起来。因此,这为SAGE技术深入和广泛研究肿瘤提供了方便。  相似文献   

10.
苏洪全  朱义胜  姜玉梅 《生物信息学》2010,8(4):356-358,363
基因表达系列分析(Serial analysis of gene expression,SAGE)是一种基因表达数据,反映了细胞内的动态变化。模式识别和可视化方法是分析SAGE数据的基本工具,但是由于缺乏描述数据的统计特性,传统的聚类分析技术不适用于SAGE数据的分析。本文提出了一种基于多分类和支持向量机的SAGE数据的分析法。经过对模拟数据和人类癌症SAGE数据的分析,基于径向基核函数的多分类支持向量机算法"一对一"(one-against-one,OAO)算法提供了比PoissonC和PoissonS更好的分类结果。  相似文献   

11.
几种差别表达基因显示技术及其在植物方面的应用   总被引:5,自引:0,他引:5  
宁顺斌  王玲 《生命科学》1999,11(3):140-143,144
90年代以来,先后出现了DD,RDA,cDNA-RDA,SAGE,GEF,RFD,SSH以及ATAC-PCR等数种未知产物的差别表达基因显示技术,本文对这些技术的异同。各自的优缺点以及它们在植物方面的应用现状和前景作了简单综述。  相似文献   

12.
13.
We have developed a new and simple method for quantitatively analyzing global gene expression profiles from cells or tissues. The process, called TALEST, or tandem arrayed ligation of expressed sequence tags, employs an oligonucleotide adapter containing a type IIs restriction enzyme site to facilitate the generation of short (16 bp) ESTs of fixed position in the mRNA. These ESTs are flanked by GC-clamped punctuation sequences which render them resistant to thermal denaturation, allowing their concatenation into long arrays and subsequent recognition and analysis by high-throughput DNA sequencing. A major advantage of the TALEST technique is the avoidance of PCR in all stages of the process and hence the attendant sequence-specific amplification biases that are inherent in other gene expression profiling methods such as SAGE, Differential Display, AFLP, etc. which rely on PCR.  相似文献   

14.
基于PCR的基因差异表达分析技术   总被引:2,自引:0,他引:2  
基因差异表达分析是研究许多生物学过程的分子基础的一条直接、有效的途径。自DDRT-PCR技术建立以来,一系列基于PCR的基因差异表达分析技术,如SAGE、SSH、RDA和DNA微阵列等相继发展起来,为分析和克隆差异表达的基因提供了更为快速、灵敏的工具。本对这几种方法进行了简要综述,比较了不同方法的优缺点,并展望了今后基因差异表达研究技术的发展方向。  相似文献   

15.
应用代表性差异分析 (cDNARDA)技术 ,对类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏组织基因差异表达进行筛查 ,初步探讨类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏损害发病的分子机制 .首先以类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏组织作为实验组 (Tester) ,正常大鼠肾脏作为对照组或驱动组 (Driver)通过cDNARDA进行基因差异表达筛查 ;最终的差异产物亚克隆到Puc 18载体 ,测序及并进行生物信息学分析 ;半定量RT PCR对筛查到新的基因进行初步的鉴定 .结果发现 9个新ESTs ,2个新基因 .这 2个新基因分别与人及小鼠的丝氨酸蛋白酶抑制因子F ,及真核细胞转录启动因子 3亚单位 5 (EIF 3epsilon)基因有高度的相似性 (>90 % )并在类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏组织表达上调 .推测 2个新基因分别是大鼠的丝氨酸蛋白酶抑制因子F及真核细胞转录启动因子 3亚单位 5 .两个新基因在类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏组织表达上调 ,可能与类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏损害相关 .同时 ,对新基因RS91进行了全长cDNA克隆  相似文献   

16.
17.
Until recently, the approach to understanding the molecular basis of complex syndromes such as cancer, coronary artery disease, and diabetes was to study the behavior of individual genes. However, it is generally recognized that expression of a number of genes is coordinated both spatially and temporally and that this coordination changes during the development and progression of diseases. Newly developed functional genomic approaches, such as serial analysis of gene expression (SAGE) and DNA microarrays have enabled researchers to determine the expression pattern of thousands of genes simultaneously. One attractive feature of SAGE compared to microarrays is its ability to quantify gene expression without prior sequence information or information about genes that are thought to be expressed. SAGE has been successfully applied to the gene expression profiling of a number of human diseases. In this review, we will first discuss SAGE technique and contrast it to microarray. We will then highlight new biological insights that have emerged from its application to the study of human diseases.  相似文献   

18.
19.
一个血清抑制基因的克隆   总被引:4,自引:0,他引:4       下载免费PDF全文
比较血清培养细胞和血清饥饿细胞的基因表达差异,获得了一段血清饥饿细胞中特异表达的cDNA序列,以此序列出发,通过搜索表达序列标签(EST),拼接出完整的基因序列,通过PCR分段克隆获得全长cDNA序列.该基因全长5 429 bp,编码框预测有791个氨基酸残基.GenBank搜索,该基因与已有的细胞周期调控基因没有同源性.所以,该基因是一个新的与细胞周期有关的基因(GenBank接受号:AY050169).由于该基因最初发现在无血清培养条件下表达,故叫血清抑制基因(serum inhibit gene,Si-1基因).  相似文献   

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