蛋白质组学在疾病研究中的应用

蛋白质组学是在蛋白质水平定量、动态、整体地研究生物体的一门学科。双向电泳技术、质谱技术和生物信息学是蛋白质组学的三大支撑技术。近年来,蛋白质组学技术从整体水平出发,在更贴近生命本质的层次上去发现和理解并应用于许多疾病的早期预警、诊断和治疗。我们对蛋白质组学在心血管疾病、肝病、胰腺疾病和自身免疫性疾病等研究中的应用做了简单阐述,揭示了蛋白质组学技术在许多重大疾病研究方面具有十分诱人的发展前景。     

放线菌蛋白质组学研究进展

蛋白质是生理功能的执行者,是生命现象的直接体现者,蛋白质组学旨在阐明生物体全部或部分蛋白质在生命活动中的作用和功能。随着组学理论基础和技术方法的逐渐成熟,蛋白质组学的研究被提高到了前所未有的高度。放线菌与人类的生产和生活关系极为紧密,是产生抗生素和酶制剂的主要来源。近130多年的放线菌系统学研究和2001年模式菌株的全基因组测序,为功能基因组研究奠定了基础。与先前的基因组学和转录组学相比,放线菌蛋白质组学能更直接、更准确地解释生命现象,得到了快速发展,并受到研究者的高度关注。近年来放线菌蛋白质组学的研究主要包括复杂形态分化和发育过程、非凡的环境适应能力、与植物共生固氮、代谢机理及特殊功能、病原放线菌致病性和筛查天然产物等几个方向,为进一步促进放线菌蛋白质组学发展奠定了基础。     

中国蛋白质组学研究进展——以人类肝脏蛋白质组计划和蛋白质组学技术发展为主题

蛋白质组学是对细胞或生物体全部蛋白质的系统鉴定、定量并阐释其生物学功能的学科.自21世纪初期开始,随着高精度、高灵敏度和快速扫描质谱仪的出现和快速发展以及微量蛋白质组样品高效分离技术的进步,蛋白质组学获得了快速发展,并在生理过程与病理机制研究等几乎所有生命科学研究领域得到了广泛的应用.过去10年,中国蛋白质组学研究在政府的支持和广大蛋白质组学研究人员的努力下呈现出腾飞式的发展态势.本文综述了人类肝脏蛋白质组计划和2010~2013年中国蛋白质组学技术的发展.     

蛋白质组学技术及其在心血管疾病研究中的应用

蛋白质组学是旨在研究蛋白质表达谱和蛋白质与蛋白质之间相互作用的新的领域。蛋白质组学的研究必须依赖高通量、自动化程度很高的技术。双向电泳、液相色谱和生物质谱技术的发展推动了蛋白质组学的研究。蛋白质组学为疾病发病机制的研究提供了新的思路和方法 ,本文重点介绍了蛋白质组学技术在心血管疾病研究中的应用     

蛋白质组学分离检测技术研究进展

蛋白质组学是后基因组时代的新兴学科,是当今生命科学领域新的增长点,而其中的分离检测技术则是蛋白质组学得以迅速发展的重要基石。对蛋白质组学中的分离检测技术-双向凝胶电泳、色谱和质谱等技术近几年的发展现状及最新研究进展进行综述,并对本实验室在蛋白质组学方面的研究结合生物信息学的探索进行概述。     

磷酸化蛋白质组学在三阴性乳腺癌诊治研究中的进展

三阴性乳腺癌是乳腺癌中恶性程度最高的亚型,其治疗仍以化疗为主,但容易出现耐药,且患者预后较差。随着蛋白质组学技术的发展,磷酸化蛋白质组学研究取得了长足的进步,并在肿瘤发生发展机制和诊治研究中得到了广泛的应用。同样,磷酸化蛋白质组学在三阴性乳腺癌的发生发展、靶向治疗和耐药机制研究等方面也发挥着重要作用。本文主要对目前磷酸化蛋白质组学在三阴性乳腺癌中的研究进展进行综述,旨在为基于磷酸化蛋白质组学的三阴性乳腺癌发生发展机制和诊治研究提供指导和帮助。     

生态毒理基因组学和生态毒理蛋白质组学研究进展

将基因组学和蛋白质组学知识整合到生态毒理学中形成了生态毒理基因组学和生态毒理蛋白质组学.通过生态毒理基因组学和生态毒理蛋白质组学的研究能够在基因组和蛋白质组水平更深入理解毒物的作用机制,寻找更敏感、有效的生物标记物,形成潜在的强有力的生态风险评价工具.介绍了生态毒理基因组学和生态毒理蛋白质组学的研究进展,以及DNA芯片技术和2D-凝胶电泳技术在持久性有毒污染物的生态毒理学研究中的应用.     

蛋白质组学-引领后基因组时代

蛋白质组学是建立在高通量筛选技术的基础上发展的方法学,用于研究细胞功能网络模块中蛋白相互作用及在疾病或病变中蛋白和蛋白相互作用所发生的系统动态的差异变化;其研究技术奠基于双向凝胶电泳。及至世纪之交,随着质谱及蛋白质芯片的引进,蛋白质组学已广泛应用在生命科学上。其在医学上的应用,主要旨在发现疾病的特异性蛋白质分子或其蛋白质纹印,以揭示疾病的发生机制,也作为早期诊断、分子分型、疗效及预后判断的依据,并找出可能成为新药物设计的分子靶点,为疾病提供新的治疗方案。随着人类基因序列的完成,蛋白质组学热浪掀起了后基因组年代的序幕,人类将更深入地了解疾病和生命的本源。现就蛋白质组学10年来的发展历程、研究技术、在人类疾病中的应用及未来展望等作出精简的评述。     

基于蛋白质组学技术的新型冠状病毒肺炎研究进展

新型冠状病毒肺炎（coronavirus disease 2019，COVID-19）是一种由严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2，SARS-CoV-2）引发的传染病。此种病毒传染性强、传播速度快，对全球人民的身体健康和生命安全造成严重威胁。蛋白质组学技术以其高通量、高灵敏度的特点，在疾病生物标志物的发现、分子机制研究及治疗靶点研究中扮演着重要角色，并被广泛应用于COVID-19的研究中。本文介绍了SARS-CoV-2的基因组结构及病毒感染过程，总结了目前常用的基于质谱的蛋白质组学研究技术，重点综述了蛋白质组学技术在COVID-19生物标志物的发现、分子机制研究和药物治疗靶标研究中的应用进展，最后展望了蛋白质组学的未来发展方向，以期能够有助于推动蛋白质组学技术在COVID-19精准诊断和治疗中的发展。     

蛋白质组学研究中的对角线电泳

经典的蛋白质组学研究方法包括IEF/SDS-PAGE双向电泳和质谱技术的联用,但由于IEF的一些不足,限制了其应用范围。对角线电泳是蛋白质组学研究中的一项特殊分离技术,由于其原理与IEF/SDS-PAGE不同,正逐渐成为蛋白质组学中电泳分离技术的重要补充,特别是在膜蛋白和蛋白质相互关系的研究中将起到重要作用。本文综述了对角线双向电泳技术的特点、发展和在蛋白质组学研究中的最新进展,比较了双向电泳和对角线电泳的优缺点,展望了对角线电泳在蛋白质组学研究中的应用前景。     

Proteomics in China: Ready for prime time

Proteomics is a newborn science focusing on the comprehensive systematic analysis of all proteins in molecule machineries,organelles,cells,tissues,organs or intact organisms.It has been becoming one of the focuses in life sciences and cutting-edge techniques in biotechnologies in the 21st century.During the last decade,proteomics in China has developed much faster than other developing fields in the life sciences.This review article briefly retrospects the origin and development of proteomics in China,and p...     

Proteomics technologies and challenges

Proteomics is the study of proteins and their interactions in a cell. With the completion of the Human Genome Project, the emphasis is shifting to the protein compliment of the human organism. Because proteome reflects more accurately on the dynamic state of a cell, tissue, or organism, much is expected from proteomics to yield better disease markers for diagnosis and therapy monitoring. The advent of proteomics technologies for global detection and quantitation of proteins creates new opportunities and challenges for those seeking to gain greater understanding of diseases. High-throughput proteomics technologies combining with advanced bioinformatics are extensively used to identify molecular signatures of diseases based on protein pathways and signaling cascades. Mass spectrometry plays a vital role in proteomics and has become an indispensable tool for molecular and cellular biology. While the potential is great, many challenges and issues remain to be solved, such as mining low abundant proteins and integration of proteomics with genomics and metabolomics data. Nevertheless, proteomics is the foundation for constructing and extracting useful knowledge to biomedical research. In this review, a snapshot of contemporary issues in proteomics technologies is discussed.     

果蝇蛋白质组学研究进展

蛋白质组学旨在阐明基因组所表达的真正执行生命活动的全部蛋白质的表达规律和生物功能。随着人类基因组学计划的逐渐成熟,分子水平的实验技术不断发展,蛋白质组学的研究被提高到了前所未有的高度。果蝇是生命科学领域最为常用的一种模式生物,长期的系统研究也使果蝇的基因组成为至今注释最好的基因组之一,为功能基因组研究奠定了基础。但由于技术的限制,迄今有关果蝇蛋白质组学研究的报道尚不多见。近年来果蝇蛋白质组学的研究主要包括表达谱、修饰谱、比较蛋白质组学和疾病模型蛋白质组等四个方向,为进一步开展人类疾病临床蛋白质组学研究奠定了基础。     

水稻蛋白质组学研究进展

蛋白质组是一个基因组所表达蛋白质的总称,研究内容包括蛋白质基本氨基酸序列的鉴定到相关性状、修饰、功能及不同类型蛋白分子相互作用等等。本文简要介绍了蛋白质组学的产生背景,以及主要研究技术包括双向电泳(2D-PAGE)质谱、蛋白质芯片、酵母双杂交,并重点介绍了近期水稻蛋白质组学应用研究进展。     

血浆蛋白质组学的研究进展

血浆蛋白质组学是研究血浆蛋白质的功能和变化的一门科学。血浆中蕴藏着生命机体的所有信息,因此只有彻底了解血浆中存在哪些蛋白质,才能知道如何利用血浆来预测人体对疾病的易感性并监控疾病的进程,以期达到对疾病进行早诊断早治疗。由于血浆蛋白质组动态范围大,给研究带来了很大的困难。尤其是高丰度蛋白质的存在影响了低丰度蛋白质的检测率。而低丰度蛋白质都是有意义的具有临床诊断价值的蛋白质。因此去除高丰度蛋白质的干扰成了血浆蛋白质组学研究的关键。近年来,血浆蛋白质组学相关研究技术也得到了长足进展,为深入研究血浆蛋白质做出了重要贡献。血浆蛋白质组学作为一种无创性的研究方法,值得我们去探讨。本文就血浆蛋白质组学研究进展情况做一简要综述。     

蛋白质组学进展

在蛋白质水平上定量、动态、整体性研究生物体的蛋白质组学 ,将在后基因组时代大大增进我们对基因功能的理解。简要介绍了蛋白质组学的概念、研究手段 ,及最新进展     

The 8th International Conference of the Canadian Proteomics Initiative

The 8th International Conference of the Canadian Proteomics Initiative (CPI) was held at the Hilton Vancouver Metrotown Hotel in Burnaby, British Columbia from 3–5 May, 2008. With nearly 200 delegates, 32 speakers and more than 50 poster presentations, CPI 2008 covered a wide range of topics, including novel technologies, human and clinical proteomics, structural proteomics, bioinformatics, post-translational modifications, membrane and receptor proteomics, and plant and animal proteomics. This year’s conference was also highlighted by hands-on proteomics workshops at the University of Victoria Genome BC Proteomics Centre and the University of British Columbia, an inaugural meeting of the British Columbia Proteomics Network and focus meetings exploring opportunities for the formation of a nationwide association for Canadian proteomics and Genome British Columbia’s efforts towards large-scale global genomics and proteomics projects.     

Proteomics in cancer vaccine development

Proteomics is a new scientific field aimed at the large-scale characterization of the protein constituents of biologic systems. It facilitates comparisons between different protein preparations by searching for minute differences in their protein expression repertoires and the patterns of their post-translational modifications. These attributes make proteomics perfectly suited for searching for proteins and peptides expressed exclusively or preferentially in cancer cells as candidates for cancer vaccines. The main proteomics technologies include 2D polyacrylamide gel electrophoresis, multidimensional high-performance liquid chromatography, mass spectrometry and protein arrays. Proteomics technologies used to analyze cancer culture cells, fresh tumor specimens, human leukocyte antigen peptides, serum and serum antibodies (serologic proteomics) have successfully identified tumor markers. Turning the potential vaccine candidates identified by proteomics technologies into clinical treatments awaits demonstration.     

蛋白质组学的进展

蛋白质组学是在细胞的整体蛋白质水平上进行研究、从蛋白质整体活动的角度来认识生命活动规律的一门新学科.简要介绍蛋白质组学的科学背景及其最新发展.     

蛋白质组学研究相关技术及进展

蛋白质组学以蛋白质组为研究对象,应用相关研究技术,从整体水平上来认识蛋白的存在及活动方式。随着人类基因组计划的完成,蛋白质组学的研究也得到了快速发展,与蛋白质组学研究相关的一些技术也日益得到完善和提高。简要综述了近年来蛋白质组学研究中最为重要的样品制备、蛋白质分离、蛋白质鉴定等技术及研究进展。