首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
相似文献
 共查询到20条相似文献,搜索用时 140 毫秒
1.
随着监测工作的深入、监测资料类别增加、数据量不断扩充 ,传统的计算方法已不适应渔业资源状况分析 ,制约着监测工作的发展 ,因此必须将监测资料数据集中存储 ,通过计算机处理分析 ,动态反映目前长江渔业资源状况[1 ,2 ] 。本文就长江渔业资源监测网数据的管理进行探讨 ,旨在为监测网资料分析提供服务。1 数据库系统硬件及软件环境 本数据库计算机硬件系统配置为DELLGX1PⅡ 40 0 ,内存 96M ,硬盘 4GB。同时还与IBM、长城等多台计算机通过HUB组成局域网 ,局域网内传输速率达 1 0 0MB/s,最后通过ISDN接入互联网接收…  相似文献   

2.
在社会需要和科技进步的双重推动下,"3R"原则和动物试验替代方法正在从道德理念向实验技术转变。站在全球科技发展的高度,结合我国实验动物替代领域的现状和未来趋势,利用MSSQLServer2000构建中国替代方法研究评价中心共识平台,管理信息数据库,用WEB技术将数据库与internet WWW(WorldWideWeb)页面连接,构成动态的咨询平台和信息数据网络查询系统。该共识平台的建立为国内从事实验动物及替代方法研究应用的用户提供了便利,起到了国内外替代技术交流的桥梁作用。  相似文献   

3.
随着计算机和互联网技术的飞速发展,医院内外网连接更加紧密,通过双核心网络虚拟化建设、内外网连接安全措施、虚拟局域网划分、网管软件的应用、网管人才和使用人员安全意识培养等一系列安全管理措施的实施,形成了一套安全稳定的医院网络系统,提高了网络的可靠性和安全性,保障了医院信息系统不间断安全运行。  相似文献   

4.
碳水化合物活性酶数据库( CAZy)是关于能够合成或者分解复杂碳水化合物和糖复合物的酶类的一个数据库资源,其基于蛋白质结构域中的氨基酸序列相似性,将碳水化合物活性酶类归入不同蛋白质家族。 CAZy数据库中包含了碳水化合物酶类的物种来源、酶功能EC分类、基因序列、蛋白质序列及其结构等信息。而随着宏基因组学技术的快速发展,CAZy数据库中家族内序列数据量剧增,这为家族内进一步进行亚家族分类奠定了基础;而蛋白质家族内新一层精细分类的引入可提高亚家族中酶分子功能预测的准确度,进而可指导酶分子理性设计来提高特定功能酶组分设计的成功概率,从而推动生物质转化产业的发展。  相似文献   

5.
鞘内注射两性霉素 B 治疗隐球菌脑膜炎的 META 分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
目的 评价鞘内注射两性霉素B用于隐球菌脑膜炎患者治疗的有效性和安全性.方法 采用循证医学系统评价方法,检索Cochran图书馆注册临床对照试验数据库2012年第1期,PubMed、Ovid、Springer、外文生物医学期刊全文数据库,中国生物医学文献数据库、中文生物医学期刊文献数据库、中国知网、万方数据库、维普中文期刊数据库、中华医学会数字期刊数据库.文献检索时间从建库至2012年2月,纳入探讨鞘内注射两性霉素B治疗隐球菌脑膜炎的临床对照试验,并逐个进行质量评价和资料提取,运用RevMan 5.1.6软件进行统计分析.结果 共检出89篇文献,最终纳入6篇,涉及临床对照试验6项,纳入患者175例.Meta分析提示:鞘内注射给药组较对照组有效率高[OR =4.59,95%CI (2.19,9.64),P<0.0001].可使脑膜刺激征持续时间平均缩短8.56 d(95%CI-11.74~-5.38,P<0.000 01),但相应不良反应较多.结论 鞘内注射两性霉素B治疗隐球菌脑膜炎可以提高疗效,但较多的不良反应限制了其广泛应用,能否作为首选治疗手段有待于更大样本的高质量临床对照研究证实.  相似文献   

6.
WEB2基因参与酿酒酵母S期检查点调控机制,而RNR3基因位于该调控通路末端,DNA损伤或合成阻断时,S期检查点通路诱导RNR3过度表达。因此,通过确定WEB2在该检查点通路上是否参与调控RNR3基因的表达,将有助于进一步明确WEB2基因在检查点通路上的工作位点,了解WEB2基因如何发挥检查点调控功能。构建RNR3-LacZ基因融合质粒,用于检测酵母细胞内RNR3基因的诱导性。诱导性可以通过测定β-半乳糖苷酶的活性而得知。利用DNA损伤药物甲磺酸甲酯(MMS)及DNA合成阻断剂羟基脲(HU)处理酵母细胞,测定WEB2基因突变株和野生株细胞内RNR3基因的诱导性。结果,WEB2突变株细胞中诱导活性分别增加(8.27±0.38)倍和(9.55±0.24)倍,而野生株分别增加了(83.32±2.42)倍和(124.67±2.87)倍。反映RNR3基因在WEB2突变株中的诱导性低于野生株。同RAD53突变株相比,后者的RNR3基因的诱导性更低,仅为(2.37±0.18)倍和(2.91±0.13)倍。说明WEB2基因突变影响S期检查点通路的信号传递至RNR3基因,所以在酿酒酵母S期检查点通路上,WEB2工作在RNR3基因上游,参与调控RNR3的表达,但调控能力不如RAD53基因强。  相似文献   

7.
基因组数据库简介   总被引:1,自引:0,他引:1       下载免费PDF全文
方刚  陈蕴佳  高歌  刘翟  何坤  吴昕  顾孝诚  罗静初 《遗传》2003,25(4):440-444
本文以北京大学生物信息中心安装的3个国际著名基因组数据库GDB、GenoList和Ensembl为基础,介绍目前常用的基因组数据库,包括这些数据数据库的内容、数据格式、使用方法,以及用于构建上述数据库的数据库管理系统。 Abstract:A brief introduction to the genome databases GDB,GenoList and Ensembl is given.These databases,mirrored and maintained at the Centre of Bioinformatics,Peking University,provide useful information for genome research.  相似文献   

8.
敬告作者     
正1.《工业微生物》期刊为国内外公开发行的科技期刊,本刊报道应用微生物和生物工程领域内最新科技成果与研究进展,旨在推动科技成果实现产业化。2.经中国科学引文数据库的定量遴选、专家定性评估的评议,《工业微生物》成为2015-2016年度中国科学引文数据库来源期刊。为适应我国信息化建设需要,扩大作者学术交流渠道,本刊已加入"万方数据——数字化期刊群"、《中国学术期刊网络出版总库》及CNKI系列数据库、《中文科技期刊数据库》(维普网)和"超星期刊域出版平台"等多种数据库,作者著作  相似文献   

9.
敬告作者     
1.《工业微生物》期刊为国内外公开发行的科技期刊,本刊报道应用微生物和生物工程领域内最新科技成果与研究进展,旨在推动科技成果实现产业化。2.为适应我国信息化建设需要,扩大作者学术交流渠道,本刊已加入“万方数据——数字化期刊群”、《中国学术期刊网络出版总库》及CNKI系列数据库、《中文科技期刊数据库》(维普网)和“超星期刊域出版平台”等多种数据库,作者著作权使用费与本刊稿酬一次性给付。如作者不同意将文章编入数据库,请另投它刊,本刊将不予受理。  相似文献   

10.
敬告作者     
1.《工业微生物》期刊为国内外公开发行的科技期刊,本刊报道应用微生物和生物工程领域内最新科技成果与研究进展,旨在推动科技成果实现产业化。2.为适应我国信息化建设需要,扩大作者学术交流渠道,本刊已加入“万方数据——数字化期刊群”、《中国学术期刊网络出版总库》及CNKI系列数据库、《中文科技期刊数据库》(维普网)和“超星期刊域出版平台”等多种数据库,作者著作权使用费与本刊稿酬一次性给付。如作者不同意将文章编入数据库,请另投它刊,本刊将不予受理。  相似文献   

11.
Expressed sequence tags (ESTs) from the marine red alga Gracilaria gracilis   总被引:2,自引:0,他引:2  
Expressed sequence tags (ESTs) are partial sequences of cDNAs, and can be used to characterize gene expression in organisms or tissues. We have constructed a 200-sequence EST database from vegetative thalli of Gracilaria gracilis, the first ESTs reported from any alga. This database contains recognizable ESTs corresponding to genes of carbohydrate metabolism (seven), amino acid metabolism (three), photosynthesis (five), nucleic acid synthesis, repair and processing (three), protein synthesis (14), protein degradation (six), cellular maintenance and stress response (three), other identifiable protein-coding genes (13) and 146 sequences for which significant matches were not found in existing sequence databases. We have already used this EST database to recover genes of carbohydrate biosynthesis from G. gracilis. This revised version was published online in August 2006 with corrections to the Cover Date.  相似文献   

12.
Personal access to sequence databases on personal computers.   总被引:6,自引:0,他引:6       下载免费PDF全文
A comprehensive package of software has been developed to access nucleic acid and protein sequence databases on stand-alone IBM personal computers. The software combines keyword search on the annotation fields of the data with pattern matching algorithms on the biological sequences. Sequences containing complex sites like promoters or kink sites can be identified as well as sequences that are similar to a query sequence. Protein sequences with particular patterns of amino acids such as hydrophobic regions can be identified as well. Considering the relatively inexpensive hard disks now available, personal computers have become a cost-effective alternative to mainframe processing for sequence databases.  相似文献   

13.
Kang WY  Bi SL  Ding ZR  Tian BJ  Zhao ZX  Li H 《病毒学报》2011,27(3):215-217
对云南省参加健康体检人员中一份乙肝表面抗原阳性标本S区基因序列测定,以了解其分子生物学特点。利用巢式PCR扩增HBV S基因片段,并对扩增产物进行序列测定,将基因序列提交到GenBank上进行BLAST搜索,同时运用Mega软件进行同源性分析,并构建基因树,并将其核苷酸和氨基酸与已报道的A~I基因型参考株的同源性进行比较。核苷酸和氨基酸比较结果证明,此标本病毒基因型为HBV I基因型。本文所发现的I基因型标本为国内首次报道。  相似文献   

14.
15.
Two non-normalized cDNA libraries of uteri from Danish Landrace and Chinese Erhualian pigs were constructed, and 13,756 expressed sequence tags (ESTs) were randomly sequenced. The ESTs were clustered by Phrap software, and 6,139 distinct tentative consensus sequences were produced, including 2,730 contigs and 3,409 singlets. Using Blast tools, these 6,139 candidate genes were compared to the nr and nt databases; 5,210 of them were assigned putative functions, whereas 929 potentially represent new genes. Highly expressed genes appear to be associated with basic energy metabolism, transferase activity, localization, cellular physiological process, protein binding, and nucleic acid binding. Antileukoproteinase was the most highly expressed gene, corresponding to endometrial differentiation and conceptus or fetal development.  相似文献   

16.
一个基于Blast程序的多重序列对齐程序——Mblast   总被引:3,自引:0,他引:3  
核酸序列和蛋白质序列的相似性分析日益成为生物信息学研究的核心内容.NCBI的Blast程序是进行此类分析的最有力工具.虽然它提供了初步的将多条序列进行综合对齐的分析方案,但是实际效果却很不理想.在对Blast程序的输出结果进行仔细分析的基础上,基于“求同存异”的思想,我们编制了一个多重序列对齐程序Mblast.该程序与目前流行的序列多重对齐程序相比,更容易检出序列的同源区.  相似文献   

17.
Los Alamos sequence analysis package for nucleic acids and proteins.   总被引:58,自引:11,他引:47       下载免费PDF全文
An interactive system for computer analysis of nucleic acid and protein sequences has been developed for the Los Alamos DNA Sequence Database. It provides a convenient way to search or verify various sequence features, e.g., restriction enzyme sites, protein coding frames, and properties of coded proteins. Further, the comprehensive analysis package on a large-scale database can be used for comparative studies on sequence and structural homologies in order to find unnoted information stored in nucleic acid sequences.  相似文献   

18.
Verification of the PREFAB database containing golden standard protein alignments was performed. It has revealed a significant number of differences between the sequences from PREFAB and PDB databases. It was shown that, compared with the sequences given in the PDB, 575 alignments referred to a sequence with a gap; such alignments were excluded. Furthermore, compared with the PDB sequences, single substitutions or insertions were found for 440 amino acid sequences from PREFAB; these sequences were edited. SCOP domain analysis has shown that only 502 alignments in the resulting set contain sequences from the same family. Finally, eliminating duplicates, we have created a new golden standard alignment database PREFAB-P based on PREFAB; the PREFAB-P database contains 581 alignments.  相似文献   

19.
DAtA: database of Arabidopsis thaliana annotation   总被引:1,自引:0,他引:1       下载免费PDF全文
The Database of Arabidopsis thaliana Annotation (D At A) was created to enable easy access to and analysis of all the Arabidopsis genome project annotation. The database was constructed using the completed A.thaliana genomic sequence data currently in GenBank. An automated annotation process was used to predict coding sequences for GenBank records that do not include annotation. D At A also contains protein motifs and protein similarities derived from searches of the proteins in D At A with motif databases and the non-redundant protein database. The database is routinely updated to include new GenBank submissions for Arabidopsis genomic sequences and new Blast and protein motif search results. A web interface to D At A allows coding sequences to be searched by name, comment, blast similarity or motif field. In addition, browse options present lists of either all the protein names or identified motifs present in the sequenced A.thaliana genome. The database can be accessed at http://baggage. stanford.edu/group/arabprotein/  相似文献   

20.
利用Linux操作系统的文本过滤技术对通过关键词检索提取NCBI网络数据库的核酸序列和Medline论文摘要快速建立了5种主要植物即拟南芥菜、水稻、玉米、小麦、马铃薯的编码mRNA序列和论文摘要的MySQL数据库,提取的编码序列记录共达到48,900多条,摘要记录达24,000多条,初步分析了这些mRNA序列的主要类型,如包括编码酶蛋白、转录因子等的mRNA序列,并进一步就MySQL数据库数据挖掘可能用于建构基因调控网络进行了初探。  相似文献   

设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号