海洋滩涂沉积物环境中几类主要细菌的动态分布

目的研究宁波市宁海县贝类养殖滩涂中异养细菌、反硝化细菌、氨化细菌和硫酸还原菌等几类细菌的动态分布及异养细菌的菌群组成。方法异养细菌的计数采用平板菌落计数法;反硝化细菌、氨化细菌和硫酸还原菌的计数采用MPN法;并参照Oliver提供的海洋细菌鉴定检索图、《海洋调查规范》和《一般细菌常用鉴定方法》提供的图式将分离到的细菌鉴定至属。结果滩涂沉积物环境中异养细菌的数量波动在8.00×103~7.60×104CFU/g(湿重),反硝化细菌的数量变动在5.00×102~5.00×104个/g(湿重),氨化细菌的数量变动在3.00×105~5.00×107个/g(湿重),硫酸还原菌的数量分布在9.00×104~9.00×106个/g(湿重),温度的变化对这几类细菌的数量分布没有直接的影响。所分离的细菌经过鉴定,可归于15个属与肠杆菌科的部分属,其中肠杆菌科(Enterobacteriaceae)的部分属、梭状芽胞杆菌属(Clostridium)、芽胞杆菌属(Bacillus)、棒状杆菌属(Corynebacterium)、发光杆菌属(Photobacterium)、假单胞菌属(Pseudomonas)等为优势菌属。沉积物中氨化细菌、反硝化细菌和硫酸还原菌的检出率均为100%,且含量很高。结论经过多年不间歇的养殖后,宁海贝类养殖滩涂已经不同程度地受到了污染,应尽快调整养殖容量并对养殖环境进行重新布局。     

象山港网箱养殖区水体和沉积物的细菌生态分布

2006年1月和10月对象山港网箱养殖区细菌数量分布及群落结构进行研究,并与周边非养殖海域进行了比较。结果显示水体和沉积物细菌数量均呈现10月份1月份、网箱养殖区网箱外侧对照区近湾顶对照区近湾口对照区的分布特点,其中网箱养殖区水体异养细菌、弧菌数量分别在1.0×106—7.2×107CFU/L和1.6×105—1.3×106CFU/L之间,沉积物异养细菌、弧菌数量分别在5.9×102—6.1×105CFU/g和8.0×101—7.4×104CFU/g之间。网箱养殖区水体分离细菌89株,归属于12个属,其中不动杆菌属(Acinetobacter)、假单胞菌属(Pseudomonas)、弧菌属(Vibrio)等为优势菌属;沉积物分离细菌136株,归属于10个属,其中假单胞菌属(Pseudomonas)、弧菌属(Vibrio)、芽孢杆菌属(Bacillus)、不动杆菌属(Acinetobacter)等为优势菌属。由于长期受到高营养盐、高有机质等外界条件的选择作用,网箱区及网箱外侧对照区海域的细菌群落多样性较低,某些特定的细菌类群富集。研究表明网箱养殖区的细菌分布和菌属组成特征与养殖自身污染密切相关,并且养殖过程对细菌群落产生的影响已扩展至网箱外侧的邻近海域。     

长江口低氧区异养细菌及氮磷细菌分布

2009年8月15-28日,对长江口低氧高发海域的异养细菌、无机磷细菌、有机磷细菌、反硝化细菌和氨化细菌的空间分布特征进行初步研究.结果表明:氨化细菌数量最高,表层水、底层水和表层沉积物的数量均值分别为307.52×104个·L-1、184.50×104个·L-1和199.97×102个·g-1;其次为异养细菌,数量均值分别为87.35×104 cfu·L-1、86.85×104cfu·L-1和64.26×102cfu·g-1;再次为有机磷细菌,数量均值分别为19.26×104 cfu·L-1、18.82×104cfu·L-1和19.56×102cfu·g-1;无机磷细菌只分布在长江口内和河口南槽至舟山海域,数量均值分别为18.50×104cfu·L-1、31.00×104cfu·L-1和7.17×102cfu·g-1;反硝化细菌分布广,但数量较低,均值分别为3.94×104个·L-1、23.08×104个·L-1和6.22×102个·g-1.相关性分析结果说明:盐度、硝酸盐、磷酸盐、硅酸盐和pH是影响水体和表层沉积物异养细菌、磷细菌和反硝化细菌分布的主要因子;底层水和表层沉积物异养细菌、磷细菌与水温呈显著正相关;底层水异养细菌和有机磷细菌与溶解氧(DO)呈显著正相关;表层沉积物无机磷细菌与DO呈显著正相关,氨化细菌与DO呈显著负相关.聚类分析结果说明:低氧对表层沉积物的细菌群落结构产生影响.     

油茶内生拮抗细菌Y13的定殖能力及其对土著细菌的影响

采用抗利福平标记法,定期取样、平板稀释法回收等方法,检测拮抗菌株Y13在油茶叶片内的定殖能力;以平板培养及16S rDNA法分析菌株Y13对油茶叶片内土著细菌种群的影响,为油茶炭疽病的生态治理提供理论依据。结果表明,菌株Y13在油茶健株和病株叶内均能稳定定殖,接种30 d时仍分别能检测到6.60×103CFU/g和3.56×103 CFU/g的标记菌株;油茶叶片内可培养内生细菌主要属于5个属的7个已知种,分别为芽孢杆菌属(Bacillus)、赖氨酸芽孢杆菌属(Lysinibacillus)、克雷伯菌属(Klebsiella)、鞘氨醇菌属(Sphingomonas)和假单胞菌属(Pseudomonas),以芽孢杆菌属和赖氨酸芽孢杆菌属为优势属。菌株Y13对不同处理油茶叶片内的群落结构和数量有明显的影响,能促进土著细菌群体的多样性,同时能够显著提高油茶叶片内的枯草芽孢杆菌数量,有利于抑制油茶炭疽病病原菌的增长。     

养殖泥螺体内细菌菌群组成及分析

养殖泥螺样品体内需氧平板菌落数为 7 3× 1 0 5～ 2 8× 1 0 6 个 /g。从泥螺体内共分离获得 2 1 7株细菌 ,88 5 %是革兰氏阴性杆菌。优势菌属是肠杆菌科 (Enterobacteriaceae) 61株、气单胞菌属 (Aeromonas) 58株、弧菌属 (Vibrio) 2 7株和假单胞菌属 (Pseudomonas) 2 1株。结果表明 ,每批泥螺样品的细菌总数均超出卫生标准 1～ 2个数量级 ,7月和 9月样品的大肠菌群数超出了规定的指标 ,应重视泥螺收捕后的消毒处理环节。泥螺体内细菌菌群由 1 0个菌属组成 ,涂泥中占优势的芽孢杆菌属细菌在泥螺体内却是少量的 ,反映泥螺对体内微生物组成与数量有一定调节控制作用。     

草鱼肠道黏膜厌氧细菌的分离与鉴定

研究以草鱼(Ctenopharyngodon idellus)为实验对象, 运用厌氧培养的方法, 研究了饥饿状态下草鱼肠道黏膜固有微生物的类群及其在不同肠段的分布。实验结果显示草鱼前肠、中肠与后肠中细菌的数量分别是3.17×103、1.63×104和1.79×107 cfu/g。研究共分离到274株单菌落, 经16S rRNA鉴定, 分别属于拟杆菌属(Bacteroides spp.)、鲸杆菌属(Cetobacterium spp.)、梭形杆菌属(Fusobacterium spp.)、气单胞菌属(Aeromonas spp.)、希瓦氏菌属(Shewanella spp.)、芽孢杆菌属(Bacillus spp.)、泛菌属(Pantoea spp.)和柠檬酸杆菌属(Citrobacter spp.)8个种类, 其中专性厌氧细菌的数量占9.1%, 兼性厌氧细菌的数量占90.9%。进一步分析发现, 前肠中只分离到兼性厌氧细菌, 中肠与后肠专性厌氧细菌和兼性厌氧细菌都有分布。专性厌氧细菌Bacteroides paurosaccharolyticus和Bacteroides luti在中肠与后肠都有分布, 而Cetobacterium somerae和Fusobacterium ulcerans只在后肠有发现。兼性厌氧细菌是草鱼肠道黏膜的优势菌群, 其中嗜水气单胞菌Aeromonas hydrophila占73.7%。草鱼肠道不同部位固有厌氧微生物组成存在差异, 细菌数量也明显不同, 后肠中具有更高的细菌丰度和多样性。     

浓香型白酒窖泥中兼性厌氧细菌的分离鉴定

为探讨浓香型白酒窖泥中微生物区系的构成,采用传统微生物分类鉴定法,对泸州老窖不同窖龄窖底和窖壁泥样的可培养兼性厌氧细菌进行了分类计数,并初步鉴定到属。平板涂布法计数得出,老窖底样的菌落总数最多,达3.98×103cfu/g泥,新窖壁样菌落数最少,只有0.24×103cfu/g泥;经生理生化鉴定,参照伯杰氏细菌鉴定手册等将划线单离后的菌株归为8个属,其大部分属于芽孢杆菌属(Bacillus)和芽孢乳杆菌属(Sporolac-tobacillus),也存在假单胞菌属(Pseudomonas)、梭菌属(Clostridium)等。     

象山港海域硝化细菌与反硝化细菌的时空分布特征及其与环境因子的关系

分别于2007年的7月(夏季)、11月(秋季)与2008年的1月(冬季)、4月(春季)采用高保真、无扰动重力柱状取样器替代常规抓斗式采样,研究了象山港海域表层海水、上覆水及沉积物中N素转化细菌(硝化细菌与反硝化细菌)丰度的时空分布特征,并采用主成分分析及多元逐步回归分析方法研究了影响该海域N素转化细菌时空分布的主要因素.调查期间,象山港海域水样和沉积物样品中N素转化细菌数量的变化范围分别为30×104～2.4×104 cells·ml-1和30×104～2.4×104 cells·g-1.表层海水、上覆水和沉积物中的硝化细菌数量均值分别2.24×103cells·ml-1、3.61×103 cells·ml-1和6.45×103 cells·g-1,表层海水、上覆水和沉积物中的反硝化细菌数量均值分别为4.84×103 cells·ml-1、5.31×103 cells·ml-1和3.12×103 cells·g-1.表层海水和上覆水硝化细菌数量均值冬季明显高于其他季节,而沉积物中硝化细菌数量均值为秋季、冬季高于其他季节;冬季、春季的反硝化细菌数量高于秋季、夏季.调查期间,象山港海域的硝化细菌及反硝化细菌的空间分布特征明显:垂直分布特征,反硝化细菌表现为表层海水高于上覆水及沉积物,而硝化细菌则表现为沉积物及上覆水高于表层海水;平面分布特征,象山港中部及支港与主港交汇处的站点N素转化细菌数量较高,近岸工农业活动造成的陆源污染及海水增养殖活动造成的养殖污染是造成此空间分布特征的主要因为.多元统计分析表明,N、P营养盐、DO、水温、盐度、有机质污染及初级生产力等是影响象山港海域N素转化细菌分布的主要因素.     

甘草内生细菌的分离及拮抗菌株鉴定

从乌拉尔甘草健康植株的根茎叶中共分离到内生细菌98株,经初步鉴定芽孢杆菌属(Bacillus sp.)为优势种群,约占30%;从不同生长年份甘草的根、茎、叶组织中分离内生细菌种群密度从5.0×104cfu/g~2.9×107cfu/g鲜重不等。采用平板对峙方法筛选出6株对植物病原菌有明显体外拮抗活性的菌株,通过菌落、菌体形态观察、生理生化反应及16S rDNA序列分析,同时结合Biolog细菌自动鉴定系统验证,鉴定这6株拮抗菌分属萎缩芽孢杆菌(Bacillus atrophaeus)、多粘类芽孢杆菌(Paenibacillus polymyxa)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、Paenibacillus ehimensis。     

海水养殖场沉积物中硝酸盐还原菌种群分析

通过对福建省沿海海水养殖场沉积物中参与氮循环的各生理群细菌数量分析 ,发现氨化和硝酸盐还原细菌是优势生理菌群 ,同时 ,表层泥样中的硝酸盐还原菌数量明显高于深层泥样。从该环境中分离获得 106株细菌 ,其中 58株具有硝酸盐还原能力 ,初步鉴定表明它们主要为芽孢杆菌属 (Bacillus)、盐芽孢杆菌属 (Halobacillus)、短芽孢杆菌属 (Brevibacil lus)、动性球菌属 (Planococcus)和动性杆菌属 (Plano     

荧光原位杂交在喀斯特山地土壤硫酸盐还原菌检测中的应用

采用荧光原位杂交(Florescence in situ Hybridization,FISH)技术分析了喀斯特山地土壤硫酸盐还原菌(SRB)的数量和空间分布状况.运用16S rRNA特异性探针,结合DAPI全细胞染色和样品稀释,FISH技术准确、高效地原位检测出土壤剖面中SRB的数量和分布状况.结果显示,在所研究的土壤剖面各层均有SRB检出,最低为(0.8±0.4)×107个/g,最高为(6.2±1.3)×107个/g,平均为(2.7±1.2)×107个/g.FISH能同时对土壤中的SRB进行定性和定量分析,是研究环境中SRB时空分布的快速有效的检测技术.     

红树植物老鼠簕内生细菌数量的时空动态变化

【目的】了解红树植物老鼠簕内生细菌数量的时空动态变化。【方法】分别用荧光显微计数法和平板计数法对老鼠簕内生细菌总量和可培养内生细菌总量进行周年动态测定。【结果】老鼠簕根、茎、叶部内生细菌总量年平均分别为12.25×107、7.59×107和5.72×107 ind./g(FW);而可培养内生细菌总量年平均分别为3.98×103、3.70×103和2.18×103 CFU/g(FW)。【结论】老鼠簕植株体内含有大量的内生细菌,根部含量最高,茎部次之,叶部最少。但分离的可培养内生细菌占比极少(仅为0.000 2%-0.146 8%)。老鼠簕内生细菌总量及可培养内生细菌总量均随采样季节不同而呈现波动性变化,内生细菌总量最大值出现在夏季(7月),可培养内生细菌总量最大值出现在春季(3月)。     

泥螺养殖滩涂异养菌群和弧菌的检测

1　引　　言泥螺 (Ｂｕｌｌａｃｔａｅｘａｒａｔａ)隶属腹足纲软体动物 ,肉质鲜嫩、营养丰富 ,是浙江沿海重要的滩涂养殖品种 .至 2 0 0 0年浙江省养殖面积已达 1.13× 10 4ｈｍ2 ,由于实行生态养殖 ,本轻利厚 ,广受养农的青睐 .随着泥螺养殖生产的发展 ,养殖业的自身污染和陆源排污水的大量入海 ,养殖生态环境越趋恶化 ,使生物病原大量滋生 ,自 1995年以来常诱发养殖泥螺的暴发性死亡 .有关海洋滩涂环境细菌的研究至今未见报道 .为探明泥螺养殖周期内暴发性死亡与滩涂环境的关系 ,对养殖滩涂的细菌菌群组成及其生态特性进行了检测分析 .2…     

缢蛏滩涂养殖环境的细菌群落组成及分析

1引言滩涂贝类养殖由于实行生态养殖,目前已成为宁波市海水养殖业的一大热点.近几年来,随着沿海经济的高速发展,滩涂环境污染问题日趋严重,养殖贝类大规模死亡的现象时有发生,给海洋水产经济造成了严重损失.而微生物数量及种群分布与区域环境有着密切联系,它可直接或间接地反映区域环境的营养水平、污染程度及底质状况等.目前有关养殖环境微生物学的研究主要是针对水体及养殖池底泥中的细菌[1,4,7～10],而对养殖滩涂环境细菌的研究很少[15,18,19].为此,本文以宁波市昆亭缢蛏滩涂养殖区为研究对象,从细菌生态学角度对滩涂缢蛏养殖环境进行研…     

小麦土霉素抗性内生细菌分离、鉴定及分布

研究通过培养的方法研究了小麦根际土壤、根、茎、叶各部位的土霉素抗性内生菌数量、种类和分布特征.结果表明,小麦内生菌数目在1×104cfu g-1～1.95×106 cfu g-1 之间,土霉素抗性内生菌数目介于6.9×103cfu g-1和5.67×105 cfu g-1,从中分离出22株土霉素抗性内生菌,包括15株G+和7株G-,经16s rRNA基因序列分析,它们与Bacillaceae,Alphaproteobacteria 和Gammaproteobacteria 三大类微生物聚在一起,其中Bacillaceae类细菌最多,占59.1%.土霉素抗性的Bacillus licheniformis在小麦根际土壤、根、茎等器官中都分离得到表明该抗性菌种在小麦内生系统中具有较高的传播性;具有土霉素抗性的人类机会致病菌Bacillus cereus和Stenotrophomonas属的细菌在小麦的根际土壤、根以及叶子中也均分离到,但是在小麦种子中没有分离到任何土霉素抗性的内生菌.     

Growth of Escherichia coli O157 in poorly fermented laboratory silage: a possible environmental dimension in the epidemiology of E. coli O157

Laboratory silages, inoculated with either c. 1000 cfu g-1, an atoxigenic Escherichia coli O157 or a toxigenic E. coli O157 isolate, were made in plastic bags which permitted limited aerobic spoilage. Replicate bags of each treatment were opened at weekly intervals after incubation at 20 degrees C. In all silages the fermentation was slow and aerobic spoilage with visible moulding ocurred at the tie ends after 7 d. In all the aerobically spoiled silages Enterobacteriaceae reached over 107 cfu g-1 within 1 week. The E. coli in control silages increased from barely detectable levels to 104 cfu g-1 within 13 d; over the same period both strains of E. coli O157 increased from 103 to 107 cfu g-1. The increases in the poorly fermented interior of the silage bags were initially similar but declined slightly as the pH fell. It is suggested that faecal contamination of grass followed by poor silage management may be a factor in the persistence of E. coli O157 carriage in ruminants.     

The populations, characterization and activity of suspended bacteria in the Welsh River Dee

In a 29 month study of bacterial populations at three sites on the Welsh River Dee, the aerobic heterotrophic bacteria increased from an average basal level of about 1.2 times 10⁴ colony-forming units (cfu)/ml near the source of the river, to 2 times 10⁵ cfu/ml in the lower reaches. The ratio, total bacterial cell count: viable count, decreased from 70 in the upland reaches to 10 in the lower parts of the river. There was no apparent seasonal variation in bacterial numbers but on occasions the bacterial populations in both upland and lowland reaches of the river increased simultaneously. Fluctuations in bacterial numbers over a 50-fold range were observed in this study. Bacterial isolates from both upland and lowland sites were predominated by two groupings of bacteria, the Pseudomonas—Agrobacterium—Alcaligenes group and the Flavobacterium—Cytophaga—Flexibacter group. Results suggested that the latter group may have been part of the autochthonous population. Seasonal variation in heterotrophic potential ( V _max) for acetate uptake was shown to occur over a 30-fold range in the lowland reaches of the River Dee. Peaks in activity at the lowland site occurred during the summer months, the range of V _max values for acetate ranged from 0.2 to 30 μg/1/h. Fluctuations in V _max values from the upland site were not seasonal but were instead linked to faecal pollution, V _max values from this site range from 0.04 to 3 μg/1/h.     

Sulfate Reduction Dynamics and Enumeration of Sulfate-Reducing Bacteria in Hypersaline Sediments of the Great Salt Lake (Utah, USA)

Bacterial sulfate reduction activity (SRA) was measured in surface sediments and slurries from three sites in the Great Salt Lake (Utah, USA) using radiolabeled 35S-sulfate. High rates of sulfate reduction (363 ± 103 and 6,131 ± 835 nmol cm-3 d-1) were measured at two sites in the moderately hypersaline southern arm of the lake, whereas significantly lower rates (32 ± 9 nmol cm-3 d-1) were measured in the extremely hypersaline northern arm. Bacterial sulfate reduction was strongly affected by salinity and showed an optimum around 5-6% NaCl in the southern arm and an optimum of around 12% NaCl in the more hypersaline northern arm of the lake. High densities of sulfate-reducing bacteria (SRB) ranging from 2.2 × 107 to 6.7 × 108 cells cm-3 were determined by a newly developed tracer MPN-technique (T-MPN) employing sediment media and 35S-sulfate. Calculation of specific sulfate reduction rates yielded values comparable to those obtained in pure cultures of SRB. However, when using a conventional MPN technique with synthetic media containing high amounts of Fe(II), the numbers of SRB were underestimated by 1-4 orders of magnitude as compared to the T-MPN method. Our results suggest that high densities of slightly to moderately halophilic and extremely halotolerant SRB are responsible for the high rates of sulfate reduction measured in Great Salt Lake sediments.     

Distribution Pattern of Photosynthetic Picoplankton and Heterotrophic Bacteria in the Northern South China Sea

The environmental regulation of plcoplankton distribution in the northern South China Sea was examined In winter and summer of 2004. The average abundance of Synechococcus, Prochlorococcus, and heterotrophlc bacteria was lower In winter （30, 21, and 780×10^3 cells/cm^3, respectively） than In summer （53, 85, and 1 090×10^3 cells/cm^3, respectively）, but the seasonal pattern was opposite for plcoeukaryotlc phytoplankton （4 500 and 3 200 cells/cm^3 In winter and summer, respectively）. Synechococcus, picoeukaryotes, and bacteria were most abundant in the nutrient-rich coastal zone and continental shelf, but Prochlorococcus was most abundant In the continental slope and open ocean. The vertical distribution of each photosynthetic group and heterotrophlc bacteria changed between the two seasons. Synechococcus populations with apparently different phycoerythrobilin content occurred at many stations In the summer. In addition, two different populations of Prochlorococcus were found： （i） small, weakly fluorescing cells in the surface layer; and （ii） larger, strongly fluorescent cells In the deep layer. The distribution pattern of photosynthetic plcoplankton and heterotrophlc bacteria depends on environmental effects and their ecophyslologlcal differences. The distribution of Synechococcus appeared to be related to nutrient availability, whereas the distribution of Prochlorococcus appeared to be limited by temperature. Synechococcus was the only plcophytoplankton with a consistent strong relationship with bacteria.