核酸定量检测试验应用于HIV-1感染实验室诊断的探讨

目的:探讨核酸定量检测在HIV-1感染实验室诊断中的应用。方法:选取145例第四代抗原/抗体联合诊断筛查试验为阳性反应的血浆样本,分别用Western印迹和HIV-1核酸定量方法进行检测,综合对比分析2种方法检测结果。结果:Western印迹检出阳性样本120例,不确定样本17例,阴性样本8例;HIV-1核酸定量试验检出结果大于检测限样本131例,其中包括12例Western印迹不确定样本、2例Western印迹阴性样本;有3例Western印迹阳性样本用HIV-1核酸定量检测试验未能检出。结论:核酸定量检测试验对于HIV-1感染阳性样本是一种有效的实验室诊断方法;对HIV-1核酸定量检测结果为"TND"的样本,建议加做Western印迹或结合其他补充试验结果进行综合诊断。     

构建一种新型腮腺炎病毒核酸检测阳性对照品

为快速鉴定腮腺炎病毒核酸检测中由阳性对照引起的交叉污染问题,本研究建立了一种新型腮腺炎病毒核酸检测阳性对照。该阳性对照为合成的RNA转录产物,在使用相同的引物和反应条件下,该阳性对照在RT-PCR和巢式PCR试验中产生的PCR产物和正常腮腺炎病毒核酸阳性标本的PCR产物片段长度不同,通过比较PCR产物的大小可快速鉴定由阳性对照引起实验室交叉污染。这种新型腮腺炎病毒RNA阳性对照可广泛应用于腮腺炎病毒实验室诊断和基因定型中,对腮腺炎病毒核酸检测可进行良好的实验室质量控制。     

肠道病毒71型实验室诊断研究进展

肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)为手足口病(Handf,oot and mouth disease,HFMD)和相关疾病的主要病原体,多感染婴幼儿,少数病例可以并发呼吸道感染和心肌炎、无菌性脑膜炎、脑炎、急性弛缓性麻痹等严重疾病,可致残、致死。因此EV71实验室诊断对EV71引起疾病的治疗和防控具有重要意义。本文将从核酸检测、抗体检测及其他检测等三部分对EV71的实验室诊断方法研究进展进行了综述。     

核酸试纸条检测方法研究进展*

凝胶电泳、实时荧光PCR等常规核酸检测方法存在操作繁琐、设备昂贵、反应时间长等局限性。随着核酸检测市场规模的大幅提升,常规检测方法已无法满足临床诊断、检验检疫的需求。核酸试纸条(nucleic acid detection strip,NADS)是一种新兴的核酸检测方法,具有灵敏度高、操作便捷、结果可视化、成本低且耗时短等优势,在基础研究与临床诊断等领域受到广泛关注。综述近年来NADS的检测方法及研究进展,系统总结该技术的原理、应用及临床潜在转化价值,以期为NADS的进一步开发、利用提供借鉴。     

医院公用电话病原菌污染调查及消毒模式

目的:调查医院公用电话污染情况,比较两种不同消毒液对公用电话的消毒效果。方法:分别对公用电话听筒、话筒及手柄(打接电话时手握部位)在未消毒和A组用复方新洁灵、B组用"84"消毒液消毒后分别涂抹采样做细菌培养。结果:未消毒前电话听筒、话筒及手柄细菌污染率A组为96.7%、B组为93.3%,A组用复方新洁灵、B组用"84"消毒液消毒后做细菌培养均符合卫生学标准要求,经x2检验,P<0.01,差异具有统计学意义。结论:未消毒前电话听筒、话筒及手柄细菌污染率90%以上,而复方新洁灵和"84"消毒液对医院公用电话均可以用来消毒,两种消毒剂的消毒效果无明显差异,临床可根据具体情况选用。     

呼吸道病毒感染核酸检测技术及其应用进展

急性呼吸道感染是全球范围内人类疾病和死亡的主要原因之一,其绝大部分是由呼吸道病毒所引起的。建立切实有效的实验室诊断技术,对于呼吸道病毒的防御和控制至关重要。以核酸为检测目的的分子诊断法,因其快速、简便、高通量、高灵敏度及高特异性,成为新一代呼吸道病毒检测的金标准。简要综述了呼吸道病毒感染核酸检测技术及其应用进展。     

化学修饰寡核苷酸在核酸配基扩增技术中的应用

核酸酸基扩增技术（SELEX)可从极大容量的随机寡核苷酸文库中筛选得到与靶分子高特异性和高亲和力结合的核酸配基。对寡核苷酸进行化学修饰,可以提高核酸配基的稳定性,增加其功能多样性及生物利用度。SELEX在基础研究、诊断和治疗试剂的研制及药物筛选等领域有广泛用途。     

金属硫蛋白清除自由基及其对自由基引起的核酸损伤保护作用的研究

通过化学反应体系产生ＯＨ－和Ｏ自由基,采用荧光和化学发光检测体系,比较研究了不同亚型及不同结合金属的金属硫蛋白（ＭＴ）清除自由基能力的大小。结果表明,对于同一亚型,Ｚｎ结合ＭＴ清除自由基的能力大于Ｃｄ结合ＭＴ同一结合金属的ＭＴ,ＭＴ１清除自由基的能力大于ＭＴ２。通过比较ＺｎＭＴ１与谷胱甘肽（ＧＳＨ）及超氧化物歧化酶（ＳＯＤ）清除自由基的能力大小发现,ＺｎＭＴ１清除ＯＨ的能力是ＧＳＨ的１００倍,清除Ｏ自由基的能力分别是ＧＳＨ和ＳＯＤ的２５和０．０１倍。即ＭＴ是一种很好的ＯＨ自由基清除剂。以ＯＨ对核酸（ＤＮＡ）的损伤为例,研究了ＭＴ对核酸损伤的保护作用,其变化规律与上述结果相一致。     

南昌地区婴幼儿腹泻轮状病毒核酸电泳分析

应用核酸凝胶电泳法对49份婴幼儿急性腹泻粪便标本进行了分析研究。试验结果表明,其中34份呈现轮状病毒核酸电泳型。包括长型和短型两个亚群。在长型中有两种不同的电泳图型,并且对轮状病毒的实验诊断与电镜检测做了比较,结果证实二者的敏感性和特异性相似,而核酸电泳法具有更多的优点,便于推广应用。     

新型冠状病毒抗体检测试剂的临床性能评估方案

新型冠状病毒肺炎(COVID-19)已在全球形成大流行,目前其确诊主要依靠病毒核酸检测,但核酸检测存在漏诊及对检测条件要求较高等不足。与核酸检测相比,抗体检测通常具有普及面广、样品采集便捷、容易实现高通量、成本低等优点,与核酸检测联合应用可有效弥补核酸检测的缺陷。本研究设计了评价新型冠状病毒(SARS-CoV-2)抗体检测试剂盒的详细方案,包括对研究对象、样本量评估、纳入及排除标准、盲法设计、实验标本、伦理、研究管理及质量控制、数据管理与统计分析、结果报告的具体内容和考量,旨在帮助使用者在大规模应用抗体检测试剂前系统地评估抗体检测试剂的灵敏度、特异度等关键临床性能,以根据各自的检测目的在不同抗体检测试剂中做出合理的选择提供参考。     

Interactive Fluorophore and Quencher Pairs for Labeling Fluorescent Nucleic Acid Hybridization Probes

The use of fluorescent nucleic acid hybridization probes that generate a fluorescence signal only when they bind to their target enables real-time monitoring of nucleic acid amplification assays. Real-time nucleic acid amplification assays markedly improves the ability to obtain qualitative and quantitative results. Furthermore, these assays can be carried out in sealed tubes, eliminating carryover contamination. Fluorescent nucleic acid hybridization probes are available in a wide range of different fluorophore and quencher pairs. Multiple hybridization probes, each designed for the detection of a different nucleic acid sequence and each labeled with a differently colored fluorophore, can be added to the same nucleic acid amplification reaction, enabling the development of high-throughput multiplex assays. In order to develop robust, highly sensitive and specific real-time nucleic acid amplification assays it is important to carefully select the fluorophore and quencher labels of hybridization probes. Selection criteria are based on the type of hybridization probe used in the assay, the number of targets to be detected, and the type of apparatus available to perform the assay. This article provides an overview of different aspects of choosing appropriate labels for the different types of fluorescent hybridization probes used with different types of spectrofluorometric thermal cyclers currently available.     

核酸探针中放射性同位素的快速检测

利用尼龙膜作为介质,以0．4mol／L的NaOH为层析液,进行膜上层析,分离经放射性同位素标记的核酸探针和未掺入的放射性游离单核苷酸,再经放射性强度测定即可计算出标记后的核酸探针的放射性比活。方法简单快捷,产生的放射性废物少,完全可以替代经典的三氯乙酸沉淀法及滤膜吸附法。     

基于CRISPR/Cas系统的核酸生物传感器

近年来,CRISPR/Cas系统已经成为转录调控和基因组编辑的重要工具。除了在基因编辑领域的贡献,CRISPR/Cas系统独特的靶核酸顺式切割和非特异性单链核酸反式切割能力,在开发核酸检测的新型生物传感器方面展现出巨大潜力。构建基于CRISPR/Cas系统高灵敏度生物传感器的关键通常依赖其与不同信号扩增策略,诸如核酸扩增技术或特定信号转导方法的结合。基于此,本文旨在通过介绍不同类型的CRISPR/Cas系统,全面概述基于该系统的核酸检测生物传感器的研究进展,并重点对结合核酸扩增技术（PCR、LAMP、RCA、RPA和EXPAR）、灵敏的信号转导方法（电化学和表面增强拉曼光谱）和特殊结构设计生物传感的三大类型信号放大策略的CRISPR/Cas生物传感器进行总结和评论。最后,本文对目前的挑战以及未来的前景进行展望。     

Novel nucleic acid detection strategies based on CRISPR-Cas systems: From construction to application

Beyond their widespread application as genome-editing and regulatory tools, clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-CRISPR-associated (Cas) systems also play a critical role in nucleic acid detection due to their high sensitivity and specificity. Recently developed Cas family effectors have opened the door to the development of new strategies for detecting different types of nucleic acids for a variety of purposes. Precise and efficient nucleic acid detection using CRISPR-Cas systems has the potential to advance both basic and applied biological research. In this review, we summarize the CRISPR-Cas systems used for the recognition and detection of specific nucleic acids for different purposes, including the detection of genomic DNA, nongenomic DNA, RNA, and pathogenic microbe genomes. Current challenges and further applications of CRISPR-based detection methods will be discussed according to the most recent developments.     

Proteins involved in binding and cellular uptake of nucleic acids

The study of mechanisms of nucleic acid transport across the cell membrane is valuable both for understanding the biological function of extracellular nucleic acids and the practical use of nucleic acids in gene therapy. It has been clearly demonstrated that cell surface proteins are necessary for transport of nucleic acids into cells. A large amount of data has now been accumulated about the proteins that participate in nucleic acid transport. The methods for revealing and identification of these proteins, possible mechanisms of protein-mediated transport of nucleic acids, and cellular functions of these proteins are described.     

基于CRISPR/Cas体系的生物传感器在病原体核酸检测方面的应用

成簇规律间隔短回文重复序列/成簇规律间隔短回文重复序列相关蛋白 (Clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein,CRISPR/Cas) 因高效的靶向结合和可编程性,已被开发为一种精准、高效、低价和高灵敏度的核酸检测工具。目前基于CRISPR-Cas体系的生物传感器在病原体核酸检测方面显示出了优良的性能,受到了人们的广泛关注,这种新型的病原体核酸检测有望替代传统的病原体检测方法。文中就基于CRISPR/Cas体系的生物传感器在病原体核酸检测中的最新研究进展进行综述。     

简化核酸提取过程在病原体核酸检测中的应用现状和发展趋势

简化核酸提取过程相较于经典的试剂盒法和全自动核酸提取技术,凭借其简便的操作步骤、便携易用的仪器设备和简单的人员培训等优势在病原体核酸检测中得到广泛应用,为实现病原体核酸的快速检测和现场检测(Point-of-care testing,POCT)奠定了良好的基础。本文比较了不同的核酸提取方法,对简化核酸提取过程的方法学进行综述,讨论其在病原体核酸检测领域中的应用现状,并展望其发展趋势。     

HPV核酸检测标准物质研究进展

2018年全球癌症统计数据显示,我国宫颈癌发病率已高居世界第二位,且有发病年轻化的趋势,严重威胁着女性的身体健康。已有研究表明：高危型人类乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)的感染与宫颈癌的发生密切相关。针对HPV的检测对于宫颈癌的预防和诊断具有重要的意义,目前常见的检测方法是基于PCR技术,对HPV的核酸进行定性和定量分析。然而在缺乏统一标准的情况下,难以保证测量结果准确可比。标准物质作为计量校准的有力工具,可以应用于测量过程的质量控制。讨论了针对HPV的常见检测方法与检测过程中的影响因素,分析了不同形式核酸标准物质和参考品的特点,以期为HPV核酸检测标准物质的研制和使用提供参考,以用于宫颈癌的科学诊断。     

中温淡盐法制备低核酸酵母抽提物的工艺研究

通过建立一种新的酵母核酸中温淡盐去除法,成功研制出品质优良的低核酸酵母抽提物。工艺简单,处理时间短,温度不超过70℃,可避免高温对酵母营养物质的破坏;该法氯化钠用量少,无需脱盐处理,易产业化及应用推广;研究制备的酵母抽提物,核酸去除量达70%以上,色浅、肉香味鲜,适合食品加工。同时,附加得到高提取率、高纯度的核酸。中温淡盐法去除酵母核酸的技术,扩展了酵母制品的应用领域,更为尿酸偏高及痛风人群食用安全营养的酵母食品提供了解决方案。     

基于CRISPR/Cas技术的核酸检测研究进展

由成簇、规则间隔的短回文重复序列（Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR）和CRISPR相关蛋白（CRISPR-associated protein,Cas）组成的CRISPR/Cas系统是广泛存在于多数细菌和古细菌中的一种适应性免疫系统。CRISPR/Cas系统可识别并结合外源入侵的核酸分子,之后Cas蛋白的切割活性被激活,能够对入侵的核酸分子进行切割使其降解。利用CRISPR/Cas系统特异的序列识别及切割活性,将其应用于核酸检测中,为提高检测灵敏度及特异性等性能指标提供了一种新思路。本文介绍了CRISPR/Cas系统的发展、作用机制等,对多样化的Cas蛋白在核酸检测中的代表性应用研究进行总结,进一步讨论了CRISPR/Cas技术应用于核酸检测中存在的优缺点,并对未来研究进行了展望,为基于CRISPR/Cas技术的核酸检测方法在病原微生物的检测中提供参考和依据。