环状RNA在人类疾病中的作用及研究进展

环状RNA（circular RNA,circRNA）是一类广泛表达于真核细胞的环形RNA,多起源于蛋白编码基因。近年来发现circRNAs可通过如miRNA“海绵”等作用模式在基因的表达中发挥重要的调控作用,存在器官组织特异性的表达谱,并且越来越多的证据表明circRNAs可能是一种潜在的疾病标志物和治疗靶点。本文将对circRNAs近年在疾病中的研究进展进行综述,具体分为以下几个方面：（1）circRNAs的基本特征;（2）circRNAs的合成调控;（3）环状RNA介导基因表达的调控机制;（4）circRNAs在肿瘤性疾病中的作用;（5）circRNAs在感染免疫相关性疾病中的作用;（6）circRNAs在心血管疾病中的作用;（7）研究展望。     

环状RNA在肺癌中的作用及研究进展

据统计,肺癌是世界范围内最常见的癌症之一,其主要特征为患者生存率低及预后差。虽然目前针对肺癌的诊断与治疗已取得显著效果,但肺癌的早期诊断和治疗仍然是临床亟待解决的重要问题。环状RNA (circular RNA, circRNA)是一类共价闭合的环形RNA分子,先前它被发现是一种具有稳定结构的内源性非编码RNA。然而,近期多项研究发现,有些circRNAs还具有蛋白编码功能。同时,circRNAs在肺癌发生与发展过程中具有重要作用,其有望成为肺癌的预测标志物和治疗靶点。该文将从circRNAs的发现史、生成机制、生物学功能及其在肺癌中的作用等方面作相关综述。     

环形RNA分子揭秘

环形RNA分子是一类不具有5'末端帽子和3'末端poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子。利用针对环形结构RNA分子的实验和计算方法,并结合新一代高通量测序,现已在多种细胞内发现了大量环形RNA分子的稳定存在。目前,尽管环形RNA分子的产生机制及其代谢仍然不清楚,但是已有的研究表明环形RNA分子具有调控基因表达的功能。对环形RNA分子的产生机制和功能等的进一步研究,将为人们深入理解生命活动在转录水平的复杂性调控提供重要的分子基础和研究依据。     

环形RNA 在疾病中的研究进展

环形RNA(circular RNA circRNA)是由前体RNA的3'末端和5'末端首尾相连形成的环状非编码RNA,可竞争内源性RNA,调节基因的表达。环形RNA在发现之初,被认为是由于错误剪接产生的,未引起重视,随着RNA测序和生物信息等技术的发展大量的环形RNA被发现,并逐渐成为非编码RNA的研究热点。虽然目前对其功能了解甚少,但已有的研究表明环形RNA可以对基因转录后进行调控。本文将从环形RNA的发现过程、形成机制、生物学功能、与疾病的关系以及研究中存在的问题进行综述,有助于进一步研究中心法则,同时为疾病诊治提供新的方向。     

外泌体环状RNA在肿瘤微环境中的研究进展

外泌体是细胞分泌的30~150 nm的细胞外囊泡,在肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)中介导细胞间通讯.环状RNA(circular RNA,circRNAs)是一类由前体mRNA(precursor mRNA,pre-mRNA)反向剪接生成的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),在外泌体中富集且表达稳定.本文主要讨论外泌体起源和circRNAs在外泌体中的分选调控机制,阐述外泌体circRNAs在肿瘤微环境各个阶段中的作用与机制,包括血管生成、EMT、耐药等.最后,本文探讨外泌体circRNAs作为肿瘤标志物和治疗靶点的临床应用前景与价值.     

环状RNA与人类疾病

环状RNA(circular RNAs, circRNAs)是一类广泛存在于各种生物细胞中具有调控基因表达功能的非编码RNA,具有结构稳定和组织特异性表达等特征. 有些circRNA分子富含微小RNA结合位点,可通过充当竞争性内源RNA的角色来发挥作用,如CDR1as对miR-7的海绵作用与肺癌、乳腺癌、胶质瘤及肌萎缩性脊髓侧索硬化等疾病发生相关. cANRIL可通过影响多梳家族参与动脉粥样硬化的发生. 大量circRNA的发现及其结构和功能的阐明不仅可以使我们更加深入地了解疾病的发生机制,而且为相关疾病的预防、诊断和治疗提供了新的方向.     

环状RNA及其在生态毒理学研究中的应用进展

环状RNA（circular RNAs,circRNAs）是一类共价闭合环状非编码RNA,具有进化上保守、结构上稳定、组织特异性表达等特点。CircRNAs可作为miRNAs海绵影响其对基因的调控,还可与RNA结合蛋白（RNA binding proteins,RBPs）相互作用,也有研究表明某些circRNAs还具有被翻译成蛋白质的潜能。CircRNAs已被证实对某些疾病具有特异性、稳定性和调节功能,如癌症、糖尿病、心血管疾病、神经退行性疾病等,其可作为潜在的诊断、预后生物标志物和治疗靶点。最近,有研究发现circRNAs参与了环境化学污染物诱导的毒性效应发生及发展的过程。目前,生态毒理学研究中评价环境化学污染物和毒效应之间关系的毒性终点通常会受遗传多态性和表观遗传学影响,考虑到经环境化学污染物暴露后生物体内circRNAs差异性表达的现象,或许在生态毒理学研究中circRNAs也有作为生物标志物的可能性。基于此,对circRNAs的生物合成与降解、生物学功能、分析方法及其目前在生态毒理学研究中的应用展开综述,并对其作为分子生物标志物在环境污染物暴露早期诊断和生态风险评价中的应用进行了展望,以期为生态毒理学研究和环境风险评价提供参考。     

竞争性内源RNA的研究进展及研究策略

竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ce RNA)通过结合同一种mi RNA参与其靶基因的表达调控。研究发现,假基因转录物、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)、编码蛋白质的m RNA、环形RNA(circular RNA,circ RNA)等都可以作为ce RNA参与基因表达的调控,并与肿瘤的发生发展有着重要的联系。本文在近年来ce RNA研究进展的基础上,从ce RNA研究的常用技术、研究策略、生物信息学分析、ce RNA表达一致性等方面进行综述,开展ce RNA研究需要采取的研究策略。     

circRNAs在植物中的研究进展

circular RNA(circRNA)是一类具有闭合环状结构的内源性非编码RNA,广泛存在于多种真核生物中,具有结构稳定、序列保守、表达特异性等特征。研究表明circRNAs可作为海绵(sponge)吸附microRNA(miRNA)并参与其表达调控过程,也可通过与蛋白互作调控基因表达等生物过程;发现circRNAs不仅参与植物激素信号转导等生理过程,而且还能在植物响应逆境胁迫中起到重要作用。该文主要对近年来国内外有关circRNAs的类型、形成机制、功能及其在植物生长发育过程中的研究进展进行了综述,并讨论了circRNAs的研究意义及存在的问题,为进一步研究circRNAs在植物中的作用机制及其基因调控网络提供参考。     

环状RNA作为潜在治疗靶点在子宫内膜异位症中的调控机制

环状RNA (circular RNAs, circRNAs)属结构稳定的非编码RNA,具有miRNA海绵、与蛋白质互作等生物学功能。近年,子宫内膜异位症(endometriosis, EMs;简称内异症)中的circRNAs逐渐得到广泛研究。诸多学者通过多种生物信息学方法预测分析出EMs中差异表达的circRNAs、miRNAs及相关信号通路,并对已知的差异表达的circRNA进行敲除或过表达来探究其在上皮-间质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)、雌激素介导细胞侵袭、细胞自噬与凋亡、缺氧等生物学过程中的具体调控作用。该文以差异表达的circRNAs为起点,从ceRNA轴出发,在circRNA-miRNA-mRNA网络中对参与EMs发病的相关信号通路进行全面综述,强调了circRNAs作为子宫内膜异位症潜在治疗靶点的作用,以期为内异症临床治疗提供新思路。     

Identification and Characterization of Circular RNAs As a New Class of Putative Biomarkers in Human Blood

Covalently closed circular RNA molecules (circRNAs) have recently emerged as a class of RNA isoforms with widespread and tissue specific expression across animals, oftentimes independent of the corresponding linear mRNAs. circRNAs are remarkably stable and sometimes highly expressed molecules. Here, we sequenced RNA in human peripheral whole blood to determine the potential of circRNAs as biomarkers in an easily accessible body fluid. We report the reproducible detection of thousands of circRNAs. Importantly, we observed that hundreds of circRNAs are much higher expressed than corresponding linear mRNAs. Thus, circRNA expression in human blood reveals and quantifies the activity of hundreds of coding genes not accessible by classical mRNA specific assays. Our findings suggest that circRNAs could be used as biomarker molecules in standard clinical blood samples.     

环状RNA：胃癌诊治的新星

环状RNA (circular RNA,circRNA)是一类闭合环状结构的RNA分子，广泛分布于各种组织中，它比线性RNA更稳定。circRNA分为外显子circRNA、外显子-内含子circRNA和内含子circRNA等3类。circRNA的主要功能为充当微RNA海绵、与RNA结合蛋白结合、翻译成蛋白质和调节转录等。近年来，大量研究表明，circRNA的异常表达在胃癌发生发展过程中起着至关重要的作用。circPTPN22、hsa＿circ＿0001772、circCYFIP2、hsa＿circ＿0017639和circPIP5K1A等的上调以及hsa＿circ＿002059、hsa＿circ＿0000190和circMTO1等的下调与胃癌的增殖和转移密切相关；而hsa＿circ＿0001313等影响胃癌细胞的顺铂耐药性。组织、血浆及外泌体中circPTPN22、hsa＿circ＿102958、hsa＿circ＿0141633、hsa＿circ＿0065149和hsa＿circ＿0026344等是胃癌新型诊断标志物；而hsa＿circ＿0005529、circ-RanGAP1、cir...     

环状RNA在肿瘤中的表达与功能

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类闭合环状的内源RNA分子,广泛存在于不同物种及多种人体细胞中,具有丰富性、稳定性和组织特异性等特点。人体细胞中的circRNA主要可分为外显子circRNA、环状内含子RNA和外显子-内含子circRNA等。与正常组织相比,circRNA在多种肿瘤组织中异常表达,并具有作为微小RNA(microRNA,miRNA)海绵调控miRNA、结合蛋白质、参与翻译等功能。虽然circRNA在肿瘤中异常表达的具体机制尚不明确,但其在食管鳞状细胞癌、胃癌、结直肠癌、肝细胞癌、神经胶质瘤等多种肿瘤发生、发展的分子通路中具有重要作用,并有望成为全新的肿瘤标志物和治疗靶点。circRNA领域的发展日新月异,本文根据最新研究报道,就circRNA的基本特征、异常表达机制、调控肿瘤的机制及其在多种肿瘤中发挥的作用作一综述。     

Insights into circular RNAs: Biogenesis,function and their regulatory roles in cardiovascular disease

As a distinctive member of the noncoding RNA family, circular RNAs (circRNAs) are generated from single-stranded, covalently closed structures and are ubiquitous in mammalian cells and tissues. Due to its atypical circular architecture, it was conventionally deemed insignificant dark matter for a prolonged duration. Nevertheless, studies conducted over the last decade have demonstrated that this abundant, structurally stable and tissue-specific RNA has been increasingly relevant in diverse diseases, including cancer, neurological disorders, diabetes mellitus and cardiovascular diseases (CVDs). Therefore, regulatory pathways controlled by circRNAs are widely involved in the occurrence and pathological processes of CVDs through their function as miRNA sponges, protein sponges and protein scaffolds. To better understand the role of circRNAs and their complex regulatory networks in CVDs, we summarize current knowledge of their biogenesis and function and the latest research on circRNAs in CVDs, with the hope of paving the way for the identification of promising biomarkers and therapeutic strategies for CVDs.     

环状RNA的生物学功能及其在肿瘤发生中的作用

近年来,随着RNA研究技术的进步,研究者们在多种生物中发现了数量众多的环状RNA,且发现它们具有重要的生物学功能。环状RNA来源于内含子或外显子,可以充当微小RNA海绵,还能与蛋白质相结合,从而参与基因表达调控并影响蛋白质的功能,此外,个别环状RNA甚至能编码蛋白质。更重要的是,环状RNA在肿瘤(如:胃癌、肝癌、结直肠癌、乳腺癌、宫颈癌和卵巢癌等)的发生和发展过程中起着重要的调控作用。因此,环状RNA有希望成为肿瘤诊断的标志物和治疗的新靶点。     

CircRNAs: a new target for the diagnosis and treatment of digestive system neoplasms

A circRNA is a type of endogenous noncoding RNA that consists of a closed circular RNA molecule formed by reverse splicing; these RNAs are widely distributed in a variety of biological cells. In contrast to linear RNAs, circRNAs have no 5′ cap or 3′ poly(A) tail. They have a stable structure, a high degree of conservation, and high stability, and they are richly and specifically expressed in certain tissues and developmental stages. CircRNAs play a very important role in the occurrence and progression of malignant tumors. According to their origins, circRNAs can be divided into four types: exon-derived circRNAs (ecRNAs), intron-derived circRNAs (ciRNAs), circRNAs containing both exons and introns (EIciRNAs) and intergenic circRNAs. A large number of studies have shown that circRNAs have a variety of biological functions, participate in the regulation of gene expression and play an important role in the occurrence and progression of tumors. In this paper, the structure and function of circRNAs are reviewed, along with their biological role in malignant tumors of the digestive tract, in order to provide a reference for the diagnosis and treatment of digestive system neoplasms.Subject terms: Tumour biomarkers, Non-coding RNAs     

Identification and Characterization of circRNAs in the Developing Stem Cambium of Poplar Seedlings

Molecular Biology - Non-coding RNAs are a class of RNAs with multiple roles in plant life. Covalently closed circular RNA molecules (circRNAs) have been recently shown to be a group of RNA isoforms...