鼠尾草属部分物种AFLP指纹图谱构建及遗传多样性分析

为了建立适用于鼠尾草属植物的AFLP技术体系,并对鼠尾草属部分物种遗传多样性进行分析。作者经筛选得到24对有效AFLP引物组合,共检测1616个有效扩增位点;其中22对AFLP引物组合针对不同材料可检测到特异性扩增位点,每对引物检测强度从1到16个位点不等;依据AFLP数据计算的22个鼠尾草属植物材料间231个配对遗传相似系数介于0.5677～0.9898,显示了丰富的遗传多样性;系统树显示AFLP分析可以将11个鼠尾草属植物准确区分,其中种内不同居群的材料可有效聚为亚组,说明本文所构建的AFLP技术体系能够有效应用于鼠尾草属植物种间及种内鉴定、遗传多样性分析及系统发育研究中。     

AFLP分子标记及其应用

扩增片段长度多态性(Amplified fragment length polymorphism,AFLP),是Zabeau等(1992)发展的一种新DNA指纹技术。该技术原理简单,引物设计巧妙,既具有RFLP技术的可靠性又具有RAPD技术的高效性,被称为“最有力的分子标记”。系统介绍了AFLP分子标记的基本原理、技术流程和优化措施,对AFLP标记在植物居群生物学、保护生物学、分子系统学等领域中的应用作了简要介绍,并对其应用前景进行了展望。     

AFLP标记在研究家蚕遗传多态性方面的应用

AFLP是一种多态检出效率很高的分子标记技术,在构建遗传图谱,遗传多态性研究,重建分子系统演化树,品种鉴定,基因克隆等众多研究领域有着其它分子标记技术不可比拟的优势。本文在前人用AFLP技术对植物多态性研究的基础上,将AFLP用于家蚕的遗传多态性研究,结果发现在家蚕中同样具有丰富的AFLP标记的多态性。由此暗示AFLP技术亦适合研究家蚕等昆虫类动物的遗传多态性,构建遗传图谱,或用于其分子生态学,分子进化和分类等方面的研究。此外本文还探讨了适合于家蚕等昆虫的AFLP分析的实验条件。     

南药益智AFLP-PCR体系的建立与优化

[目的]建立适合南药益智的扩增片段长度多态性(AFLP)扩增体系来研究不同地理居群益智遗传多样性。[方法]利用植物基因组试剂盒法提取高质量的益智基因组DNA,采用单因素和正交试验对AFLP过程中的酶切和PCR相关影响因素进行优化,并对适合益智AFLP分析的引物组合进行筛选。[结果]实验结果表明最佳酶切反应体系:模板DNA 0.6μg,酶量20 U,酶切时间2 h;最佳AFLP-PCR选择性扩增反应体系(总体积为25μL):10×PCR Buffer(不含Mg2+)2.5μL,d NTPs 2μL,Mg2+(25mmol/L)1.5μL,引物(10 pmol/μL)各2.0μL,Taq酶(5 U/ml)0.5μL,模板稀释25倍2μL。利用建立的最佳扩增体系从64对引物中筛选获得8对选择性引物适合益智AFLP分析。[结论]建立了稳定的AFLP-PCR体系,为研究益智遗传多样性的AFLP分析奠定了基础。     

扩增片段长度多态性( AFLP) ——一种新的分子标记技术

AFLP(扩增性片段长度多态性)是一种新的DNA分子标记。与RFLP、RAPD相比,AFLP具有在一次试验中可同时观察到大量的限制性片段的优点。本文阐述了AFLP的原理和方法,综述了AFLP目前在植物遗传育种研究中的应用进展,并对AFLP技术在植物遗传育种中的应用前景提出了初步设想。     

金钱槭属植物AFLP反应体系的建立与分析

本实验旨在建立金钱槭属植物的AFLP反应体系。并应用PstⅠ＋GAA／MseⅠ ＋CAC引物组合对金钱槭属植物进行了选择性扩增,获得了清晰稳定的扩增图谱,表明该反应体系对金钱槭属植物的AFLP分析是可行的。对影响金钱槭属植物基因组DNA的制备、酶切、连接以及扩增反应等因素进行了分析讨论。     

栽培沉香遗传多样性的ISSR和AFLP分析比较

探讨2种分子标记技术在沉香属药用植物遗传多样性研究中的应用。用ISSR和AFLP分子标记分析了海南、云南、广东、广西等地17份沉香属植物的遗传多样性。14个ISSR引物、8对AFLP引物分别检测到119、919个位点,多态位点百分率分别为73.95%、86.94%。由于AFLP标记具有较高的多态性位点检测效率,AFLP标记分析的遗传多样性参数高于ISSR。虽然基于Nei’s遗传距离的聚类分析结果存在着一定的差异,但用Mantel检测对两种方法检测的遗传一致度进行相关性分析表明,它们之间存在着明显的相关性（r=0.7705,P=0.0003）。ISSR标记与AFLP标记均能应用于沉香属植物的遗传多样性研究。两种标记的研究结果均揭示出沉香属植物具有较高的遗传多样水平。     

EBS公司推出了指甲基因分析试剂盒

在日本横滨Pacifico国际会展中心举办的“综合医疗展2006”上,EBS公司董事长福岗太英子展示了“瘦身支持”、“戒烟支持”、“节酒支持”3种指甲基因分析试剂盒（GENOTYPIST）．     

兰属14种植物遗传多样性RAPD及AFLP分析

用RAPD和AFLP技术分析了14种兰属植物的遗传多样性.RAPD筛选出12个随机引物和AFLP 3对选择性引物组合均扩增出了丰富的多态性片段.分析结果按UPGMA类平均法进行聚类,所得到的RAPD和AFLP聚类结果基本一致,显示建兰与墨兰,寒兰与峨眉春蕙以及大雪兰与独占春之间的亲缘关系最近.     

3小时诊断SARS

美国捷纳生物医学制剂有限公司最近在世界卫生组织主办的SARS大会上宣布 ,一种新型快速的SARS鉴别诊断试剂盒问世。采用该“急性呼吸道感染多重分析系统”新型试剂盒 ,3小时之内 ,即可用病人的一个样本同时进行SARS病毒和其他 9种常见呼吸道病毒的检测。据悉 ,在北京开展的临床研究业已顺利完成。 5月初 ,美国捷纳公司已代表国内合作伙伴为此发明 ,提出了国际专利申请3小时诊断SARS     

几种常用分子标记遗传多样性参数的统计分析

对235篇文献中314种野生种子植物的遗传多样性参数进行了统计分析.结果表明,目前常用的五种分子标记中,ISSR、等位酶和SSR的参数值间差异显著,彼此不宜直接比较,且与RAPD和AFLP的参数也不宜直接比较;显性标记RAPD和AFLP的参数之间可以直接比较.基于Hardy-Weinberg平衡的遗传分化指数GR值明显低于基于AMOVA分析的ΦR值,两者亦不宜直接比较.对基于RAPD和AFLP标记的179种植物的遗传多样性参数进行联合分析,结果表明:在种群水平上,裸子植物的遗传多样性比双子叶植物和单子叶植物都要高,而其遗传分化值较低;乔木的遗传多样性比草本和灌木高,而分化值更低;克隆植物具有比有性生殖更高的遗传多样性,在有性生殖植物中,异交植物最高,而自交植物最低;广布种的遗传多样性明显高于濒危和狭域分布种.     

荧光标记DNA扩增片段长度多态性方法的改进

采用常规PCR试剂和合成的接头和引物,其中MseⅠ引物为荧光标记物FAM标记,并对扩增片段长度多态性(AFLP)程序进行了改进,优化了PCR反应和电泳条件,建立了一个新的、有效的反应体系,降低了实验费用,经比较实验结果与AFLP荧光标记试剂盒的实验效果一致.     

用AFLP标记快速构建遗传连锁图谱并定位一个新基因tms5

报导了一个分子标记连锁图的快速构建方法。通过对水稻(Oryza sativa L．)“安农S-1”和“南京11”的F2分离群体的AFLP分析找到了142个AFLP标记,用这142个AFLP标记以及已定位的25个SSR标记和5个RFIP标记构建了水稻12个染色体的分子标记连锁图,该图覆盖水稻基因组的1537．4cM,相邻标记间的平均间距为9．0cM,这是在国内建立的第一张AFLP标记连锁图。在建立连锁图谱的同时把一个新基因tms5(水稻温敏核不育基因)定位在第2染色体上。     

诊断草皮草真菌病害的新方法

美国DNA Plant Technology公司和Koppers 公司联营的Agri-Diagnostics Associa-tes公司已开始出售用于草皮草(turf grass)真菌病害的诊断试剂盒。该公司说,这是第一个诊断植物真菌病的单克隆抗体检测技术。试剂盒可在病症出现之前同时检查腐霉枯萎病、钱斑病(dollar spot)和褐区病(brown patch)。开始买这种试剂盒的是纽约和芝加哥郊区的900个高尔夫球场。公司计划晚些时候把诊断试剂盒推广到美国东北部、中西部和南方地区。还计划为专门的草坪管理商行和在零售草坪和花园商店中的诊断中心实施一项试验     

兰属14种植物遗传多样性RAPD及AFLP分析

用RAPD和AFIJP技术分析了14种兰属植物的遗传多样性。RAPD筛选出12个随机引物和AFLP3对选择性引物组合均扩增出了丰富的多态性片段。分析结果按UPGMA类平均法进行聚类,所得到的RAPD和AFLP聚类结果基本一致,显示建兰与墨兰,寒兰与峨眉春蕙以及大雪兰与独占春之间的亲缘关系最近。     

日本制纸公司将向植物导入多种基因技术在海外的独占权转让给英Zeneca公司

《日经生物技术》１９９９年６月７日第１５页报道：日本制纸公司６月３日宣布,将该公司开发的向无标记型植物导入多种基因的技术“ＭＡＴ载体系统”转让给英国Ｚｅｎｅｃａ公司。转让给英国Ｚｅｎｅｃａ公司的权利是不包括树木和水稻的,除日本以外其他地区植物的独立实...     

定性检测重组大豆试剂盒在日销售

《日经生物技术》2 0 0 0年 2月 14日号 ,第 14页报道 :Ａｄｚｅｍｕｃｋｓ(マツマ ツ クス )公司开始在国内销售能简便地定性检测是否含基因重组大豆的美国ＳｔｒａｔｅｇｉｃＤｉｇｎｏｓｔｉｃｓ公司 (ＳＤＩ公司 )开发的试剂盒———“Ｔｒａｉｔ大豆ｂｕｌｋｔｅｓｔ”。Ａｄｚｅｍｕｃｋｓ公司虽然还不清楚简易定性检测试剂盒的国内需要量有多少 ,但想知道食品制造厂对经过确认不含重组大豆的需求量。用简易检测试剂盒在 10分钟以内 (含前处理 )就能检测出10 0 0粒大豆中是否含 1个以上的重组大豆。简易定性试剂盒因其检测精度的不同 …     

国外动态

全基因组扩增试剂盒BioscienceTechnology 2 0 0 3年 7月 31页报道 :美国AmershamBiosciences公司最近推出GenomiPhiTM DNA扩增试剂盒。利用这种试剂盒可从有限的生物材料制备高质量的DNA。这是一种简单的等温扩增技术 ,它不需要使用热循环器。原材料可以是来自全血、颊面拭子、细胞印迹纸、植物组织和微生物的纯化的DNA ,也可是这些材料中的溶解的细胞。扩增的DNA保持了原始单核苷酸多态性 (SNP)信息 ,可供各种目的使用。细菌RNA分离试剂盒BioscienceTechnology 2 0 0 3年 6月 2 6页报道 :美国Ambion公司最近推出MICROBEEnr…     

26种冬青属植物遗传多样性分析

以26种冬青属植物种质资源为研究材料,利用RAPD和AFLP技术对基因组DNA进行扩增,以研究其物种间遗传多样性以及亲缘关系.结果表明:在RAPD分析中,从400条10个碱基的寡核苷酸引物中筛选出反应稳定、扩增性强、重复性好的引物20个,共扩增出312条多态性条带,多态率为95.41%;聚类分析显示26种冬青属植物间,布利奥特夫人枸骨叶冬青和黄果在AFLP分析中,10对选择性引物组合均扩增出了丰富的多态性片段,共扩增出350条谱带,其中336条具有多态性,占95.96%.综合RAPD和AFLP聚类结果,枸骨、无刺枸骨和日拉斯纳尔逊枸骨的亲缘关系较近,钝齿冬青、金宝石钝齿冬青和龟甲冬青三者的亲缘关系较近,可为冬青属植物的杂交育种与种质创新提供理论依据.     

AFLP引物组合数量对准确研究竹子系统关系的影响

利用AFLP技术对26个竹子种类进行了多样性分析,以探索引物组合数量对准确研究竹子类群系统关系的影响。实验共随机选取10对AFLP引物,并对所得10组AFLP标记数据随机组合后进行Nei氏遗传距离/UPGMA聚类分析。每对AFLP引物扩增数据为一组,随着用于聚类统计的AFLP标记数据随机组合数量的增加,26个竹子种类的聚类关系趋向一致。这提示我们,在系统学研究中,足够数量的引物组合是获得供试材料间准确聚类关系的基础,应采用对各AFLP引物组合数据随机累加后进行聚类分析的方法,以聚类关系为标准来确定用于分析供试品种的最少引物组合数量。