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共有20条相似文献,以下是第1-20项 搜索用时 406 毫秒

1.  生物信息学在昆虫学研究中的应用  
   张赞  刘金定  黄水清  李飞《昆虫知识》,2012年第49卷第1期
   随着深度测序和基因芯片技术的不断发展,基因组、转录组、表达谱数据大量积累。目前,至少有10多个昆虫的基因组已被测序,30多个昆虫的转录组数据被报道。显然,传统的生物统计学方法无法处理如此海量的生物数据。量变引发质变,生物数据的大量积累催生了一门新兴学科,生物信息学。生物信息学融合了统计学、信息科学和生物学等各学科的理论和研究内容,在医学、基础生物学、农业科学以及昆虫学等方面获得了广泛的应用。生物信息学的目标是存储数据、管理数据和数据挖掘。因此,建立维护生物学数据库、设计开发基于模式识别、机器学习、数据挖掘等方法的生物软件,以及运用上述工具进行深度的数据挖掘,是生物信息学的重要研究内容。本文首先简要介绍了生物信息学的历史、研究现状及其在昆虫学科中的应用,然后综述了昆虫基因组学和转录组学的研究进展,最后对生物信息学在昆虫学研究中的应用前景进行了展望。    

2.  基因组学时代的真菌分类学:机遇与挑战  
   杨祝良《菌物学报》,2013年第32卷第6期
   真菌物种的形态特征有限,加之形态滞后和形态可塑性,仅靠外部形态、内部结构及生理生化指标,很难把握真菌的系统亲缘。应用DNA测序、基因组测序、比较基因组学及生物信息学等技术,研究人员可以快速识别真菌演化中出现的数量众多的单系支系,为建立各分类等级的新分类单元提供有力证据,为真菌分类学研究带来了新的希望和活力。自2000年以来,在真菌界至少发表了1新亚界、4新门、7新亚门、19新纲、9新亚纲、40余新目等高级分类单元。近3年来,我国发表了20余个真菌新属,其中绝大多数属的建立都有分子证据支持。可以预见,大量的新种、新属、新科乃至更高级分类单元将会在今后10年内持续发现和建立。这必将大大促进真菌分类学的发展,完善现有的真菌分类系统。我们应该顺势而上,利用我国丰富的真菌资源,为真菌分类学的发展做出应有贡献。与此同时,真菌分类学也面临着十分严峻的挑战。挑战主要来自3个方面,一是研究变得越来越综合,不但需要有相应的研究经费支持,而且要求从事该领域的研究人员技术更全面、知识更广博及知识更新速度更快捷;二是新物种描述进度偏慢,远远不能满足人们对物种认识和利用的日益增长的需要;三是研究人员亟需创新研究模式,以新技术、新思路、新机制来构建新的真菌分类学,加速新物种的发现和描述进度,最终为社会进步和科学发展服务。    

3.  基因组学相关概念及其研究进展  被引次数:29
   李伟  印莉萍《生物学通报》,2000年第35卷第11期
   20世纪以来,生命科学得到了空前的发展,大量新的概念不断涌现并相应产生了许多新兴学科,本文试图对当今研究的热点领域-基因组学,包括结构基因组学,比较基因组学,功能基因组学和较新兴的蛋白质组学、功能蛋白质组学及其相关概念、营养基因组学、生物信息学及其相关概念和近期进展做一介绍。    

4.  蛋白质组与蛋白质组学  被引次数:4
   王大东《国外医学:分子生物学分册》,2000年第22卷第3期
   1994年澳大利有针对后基因组时代研究趋势,提出了蛋白质组和蛋白质组学的新概念。即把基因组所编码的所有蛋白为研究对象,直接探讨基因、蛋白的功能。其核心技术包括双向电泳、质谱分析、生物信息学等。该技术在探索疾病发生,寻找新药等方面取得越来越广泛的应用。    

5.  生物信息学及其在环境微生物研究中的应用  
   郑永良  李平  刘德立《中国生物工程杂志》,2005年第25卷第12期
   生物信息学的快速发展,推动了微生物信息学的建立。模式微生物基因组学的研究,极大地丰富了生物信息学的内容。微生物结构基因组学和功能基因组学研究试图揭示基因结构与功能的内在联系,绘制出基因调控网络图。基因组功能注释是功能基因组学研究的主要目的。基因芯片技术的运用,成为环境微生物生态研究和功能酶基因定位的有力工具。生物信息学为环境微生物的研究和发展提供了一个崭新的信息平台和技术手段。介绍了一些相关数据库和专业网站。    

6.  生物多样性信息学研究进展  被引次数:3
   王利松  陈彬  纪力强  马克平《生物多样性》,2010年第18卷第5期
   生物多样性信息学足一门蓬勃发展的新学科.它将现代的信息技术带入生物多样性及其相关学科的研究领域.它在生物多样性基础数据的数字化、模型工具和各种工具软件的开发、数据整合,以及全球、地区和国家尺度生物多样性信息网络等多个方面的发展,向我们展示了未来在全球范围内自由、免费共享生物多样性数据和信息,以及人们行动起来共同关注、调查与监测野外生物多样性的前景.目前,已有大量数字化的物种编目、标本馆标本、多媒体影像、研究文献等生物多样性基础信息可以通过互联网检索和利用.其中,最值得关注的是一些成功的国际性研究项目,如物种2000、全球生物多样性信息网络、生命条形码以及网络生命大百科全书.这些项目的成功不仅体现在对大量基础信息和数据的发布.而且它们通过与生物多样性信息标准TDWG(Biodiversity In-formation Standards:TDWG)的合作,推动了达尔文核心标准(Darwin Core)等一些重要的生物多样性信息标准的应用,以及地区和国家性生物多样性信息节点的建立,这些都为将来全球范围生物多样性信息的共享和数据交换奠定了重要基础.在数字化信息的基础上,研究人员也开发了一些在特定研究领域应用的数据挖掘和模型工具,例如基于数字化标本的地理分布预测工具MAXENT,分类学专家知识管理的LifeDesk.公民科学理念的发展则向我们展示了公众和科学爱好者广泛参与以互联网为基础的生物多样性信息学研究活动.因此,生物多样性信息学的发展前景广阔,它将为我们实现全球保护战略目标,应对生物多样性危机,解决全球气候变化条件下生物多样性资源管理和利用建立坚实的信息基础.    

7.  利用生物信息学技术研究蛋白功能的几种方法  
   王剑利 杨章民 等《国外医学:分子生物学分册》,2001年第23卷第4期
   阐明基因的功能是后基因组计划的主要任务。生物信息学为解决这一难题提供了有力手段,生物信息学是用数理和信息学的观点,理论,方法研究生命现象,组织和分析呈指数增长的生物学数据的一门新型学科,本文介绍4种应用生物信息学技术研究蛋白功能的方法。    

8.  功能基因组学研究概述  被引次数:2
   庄金秋 杨丽梅 贾杏林《中国生物工程杂志》,2005年第25卷第B04期
   21世纪是生物时代和信息时代,基因组学的研究已从结构基因组学转向功能基因组学,功能基因组学时代对于基因功能的研究也由单一基因转向大规模、批量分析。对功能基因组学及相关学科的概念作了概述,综述了功能基因组学的研究内容与方法,主要包括应用差异显示反转录PCR、基因表达序列分析(SAGE)、微点阵、蛋白质组学和生物信息学等方法来研究基因组表达概况、基因组多样性和模式生物学等。    

9.  逆向疫苗学及其应用  
   梁昊宇  曾明  陈翠萍《微生物学免疫学进展》,2006年第34卷第3期
   逆向疫苗学是一种新兴的疫苗研制方法,区别于传统的疫苗研制方法,逆向疫苗学运用了基因组学、生物信息学以及蛋白质组学等多种新型技术,建立抗原筛选库,筛选保护性抗原,制备常规方法很难或不可能生产的疫苗。该方法无需在体外培养微生物。目前,逆向疫苗学已经在多种疫苗的研制过程中取得了很大的进展。    

10.  宏蛋白质组学信息分析的基本策略及其挑战  
   徐洪凯  闫克强  何燕斌  闻博  杨焕明  刘斯奇《生物化学与生物物理进展》,2018年第45卷第1期
   宏蛋白质组学是一门新型科学,它运用质谱技术规模化地采集自然界微生物种群的蛋白质信息,并结合多种组学数据,开展微生物种群的遗传特征及其生物功能的研究.宏蛋白质组学的信息分析与传统蛋白质组学方法有较大的不同,亟需拓展新的分析思路.由于宏蛋白质组的研究对象是复杂度极高的微生物样品,因此,需要构建尽可能囊括样本中所含微生物的基因组信息的物种数据库.面对庞大的数据库,必须考虑到分析过程中所消耗的计算资源和鉴定结果的质控标准,因此,需要高度优化库容量、搜库、假阳性控制等参数.鉴于宏蛋白质组数据中广泛存在复杂的同源蛋白质序列,因此,需要充分利用NCBI数据库中的分类信息进行匹配,并运用LCA算法过滤处理才能将蛋白质有效地归组到物种.本文立足于宏蛋白质组学信息分析,从宏蛋白质组的数据库建立、蛋白质归并、生物学意义发掘等几个方面着手,对该领域的发展现状、面临挑战以及未来研究方向进行了评述.    

11.  化学工业出版社新书  
   《中国生物工程杂志》,2006年第26卷第7期
   生物信息学与功能基因组学[美]乔纳森·佩夫斯纳著(JONATHAN PEVSNER)编ISBN 7-5025-8383-1定价95.00元出版时间2006年6月本书内容全面,将生物信息学与功能基因组学的理论和实践应用结合,重视生物信息学的具体应用技巧。本书作者是霍普金斯医学院教授,在国际上有很高的声誉和权威性。每一章都有问题集、与生物信息学有关的web操作训练以及相应    

12.  功能基因组学技术在慢性疼痛研究中的应用  
   褚光跃  安建雄  王萍  汤义《现代生物医学进展》,2008年第8卷第9期
   慢性疼痛是一个世界性难题,其治疗效果不佳,与其机制不明有很大关系。解决机制问题,探索有效的治疗方法已经成为研究的焦点。伴随着后基因时代的到来,以及分子生物学,生物信息学等多门生物相关学科的发展,RNA干扰技术,反义寡核苷酸技术,基因芯片等这些功能基因组学中常用的实验手段,通过在基因组或系统水平上全面分析基因的功能,为研究慢性疼痛发生机制,发现新的疼痛调节相关基因以及探索疼痛治疗的新途径开辟了更加广阔的空间。    

13.  植物基因富集研究进展  
   曾少华  刘迪  王瑛《遗传》,2009年第31卷第8期
   高等植物的基因组大小差异十分巨大, 在大基因组植物的基因组中, 各种重复序列占据了基因组中相当大一部分, 而低拷贝或单拷贝的基因序列仅占了很少一部分。对于大基因组物种而言, 大量的重复序列给基因组的研究工作带来很大困难, 使得大规模获得基因信息成为一项很有挑战性的工作。目前, 在基因组范围内富集基因的方法有cDNA文库、甲基化过滤文库、高Cot值文库、转座子标签富集法等。文章综述了这几种方法的技术原理和特性, 结合近年来国内外运用甲基化过滤技术的研究进展, 探讨了根据不同研究材料和研究目标, 如何高效选择适合的方法或者方法的组合。    

14.  成年核移植山羊生长相关基因的表达分析  
   邢宝松  徐银学  成勇  刘红林  杜淼《遗传学报》,2007年第34卷第8期
   体细胞核移植过程有可能影响克隆动物生长相关基因尤其是印迹基因的表达水平。本研究运用同源引物 PCR 扩增、RACE 技术并结合同源克隆策略, 克隆了 7 个山羊生长相关基因包括 3 个印迹基因(H19、IGF2 和 IGF2R)和 4 个非印迹基因(IGF1、IGF1R、GHR 和 GHSR)的完全 CDS 或者部分 cDNA 序列, 经生物信息学技术确认后, 用荧光实时定量 PCR 对 8只成年克隆山羊中这些基因的表达水平进行分析, 结果表明 3 个印迹基因中 IGF2R 基因表达水平极显著高于对照组的自然繁殖山羊(P<0.01), 而 H19 和 IGF2 的表达则没有很大区别; 4 个非印迹基因中只有 IGF1R 的表达水平极显著高于对照组(P<0.01), IGF1、GHR 和 GHSR 的表达与对照组相似。表明即使在表型正常的成年克隆动物也存在一定的表观遗传异常。通过对获得完全 CDS 和 3′UTR 的 IGF2 基因经过生物信息学分析表明, 山羊 IGF2 基因包含一个 540 bp 的开放阅读框 (ORF)编码 179 个氨基酸。IGF2 基因 cDNA 序列和氨基酸序列以及其它基因部分序列比较分析表明, 山羊所有这些基因与绵羊的同源性要高于同牛的同源性。    

15.  食线虫真菌基因组测序和分析研究进展  
   马妮  杨雪伟  甄政毅  郑雅情  杨乐  李青  张克勤  杨金奎《微生物学通报》,2018年第45卷第4期
   食线虫真菌作为线虫的天敌,是一种潜在的线虫病害的生防制剂。食线虫真菌通过形成特殊的捕食器官或产生粘性孢子和毒素等方式捕捉和侵染线虫。近年来,随着测序技术的进步和生物信息学的应用,越来越多真菌基因组已经被测定和报道。目前,已经有7种食线虫真菌的基因组被报道,包括捕食线虫真菌寡孢节丛孢(Arthrobotrys oligospora)、线虫卵寄生真菌厚垣普可尼亚菌(Pochonia chlamydosporia)和内寄生真菌明尼苏达被毛孢(Hirsutella minnesotensis)等。本文对食线虫真菌的基因组特点、毒力相关基因家族的扩张、捕食器官形成调控和进化机制进行了系统地总结,对组学时代食线虫真菌研究面临的关键问题进行了评述。    

16.  蛋白质组学相关概念与技术及其研究进展  被引次数:14
   卫功宏  印莉萍《生物学杂志》,2002年第18卷第4期
   随着后基因组时代的到来,蛋白质组学得到了空前的发展。包括蛋白质组、蛋白质组学、功能蛋白质组学和结构基因组学等新的概念和学科不断涌现,并相应改进和发燕尾服了许多新的技术和研究手段,如双向凝胶电泳、生物质谱、生物传感芯片质谱、蛋白质芯片、和生物信息学等。    

17.  生物样本库及其伦理问题简介  
   刘闵《生命科学》,2012年第11期
   随着分子和基因组信息对流行病学影响的增加,无数遗传流行病学研究和后人类基因组计划的研究都越来越依赖人类生物样本库的使用。生物样本库的范围也已横跨学术或者医院环境下的小数量收集到大规模的全国性储藏。尽管生物样本库的概念并不新,但是在基因组研究和后人类基因组计划的背景下,伴随它们十几年极大发展的是无数待解决的伦理挑战。从生物样本库的概念着手,介绍了其与一般遗传数据库的区别以及建立生物样本库的意义;然后介绍并比较国际上已有的生物样本库,以及其伦理问题和伦理法律框架的发展趋势。    

18.  中国基因组生物信息学回顾与展望  被引次数:1
   顾坚磊  周雁《中国科学C辑》,2008年第38卷第10期
   基因组生物信息学是随着大规模基因组测序而兴起的一门交叉学科, 其研究对象是基因组数据. 因此, 对基因组数据的各方面的深入了解, 有助于把握基因组生物信息学的来龙去脉. 本文从基因组数据展开, 围绕着这些数据的收集、储存、分析和比较, 分别列举了相关的数据库、算法和软件包. 今天, 由新一代测序技术所带来的对数据处理、算法设计和功能信息挖掘等技术和研究方面的挑战, 应该及时得到充分的重视.    

19.  生物系统学面临的难题  被引次数:2
   黄大卫《动物学报》,2001年第47卷第5期
   随着对生物多样性和可持续发展的全球性关注,对生物系统学的需求愈来愈大。但许多决策者认为生物系统学是一门古老的学科,谁都可以成为分类学家。这严重地影响了生物系统学的发展。论述生物系统学面临的重大科学问题。包括概念、目标和技术等问题,有利于澄清对生物系统学的一些误解,推进学科的发展,为发挥生物系统学的基础与支撑作用营造一个健康的环境。本文提出了生物系统学的六个科学难题:物种定义是概念难题,物种数量和物种间的相互关系是跨世纪的目标难题,信息管理和鉴定手段是两上技术问题,生物系统学家逐渐减少是一个社会性难题。    

20.  荷花玉兰叶绿体全基因组高通量测序及结构解析  
   李西文  高欢欢  王一涛  宋经元  Henry Robert  吴和珍  胡志刚  姚辉  罗红梅  罗焜  潘宏林  陈士林《中国科学:生命科学》,2012年第12期
   荷花玉兰是重要的药用、观赏及园林绿化植物.应用454高通量测序技术对荷花玉兰叶绿体全基因组进行测序,解析了其基因组结构,并与近缘物种基因组进行了比较分析.荷花玉兰叶绿体基因组全长为159623bp,两个反向互补重复区(IRs)长26563bp,被分隔的大单拷贝区(LSC)和小单拷贝区(SSC)长度分别为87757和18740bp.成功注释129个叶绿体基因,其中18个基因含有内含子.基因的种类、数目以及GC含量等与其他木兰科物种相类似.生物信息学分析获得218个SSR位点,大多位点富含A-T,具有碱基偏好性.木兰科物种的重复基序类型和丰度相对保守,有利于开发叶绿体基因组载体.木兰亚纲植物叶绿体基因组的大小及IR区边界的变化与ycf1的长度密切相关.采用30个物种叶绿体基因组的66个共有蛋白编码基因构建系统发育树,对木兰属在被子植物中的进化位置进行了探讨.荷花玉兰叶绿体全基因组序列的获得和结构解析对优良品种培育、叶绿体基因组工程、木兰科物种分子标记开发及系统发育关系的研究具有重要价值.    

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