鸡的遗传多样性的研究方法及研究进展

遗传多样性是生物学研究中的一个重要领域,研究鸡的遗传多样性,不仅能加强生物多样性的保护。同时对起源进化、分类鉴定及遗传育种等都有重要的意义。本文对目前DNA水平鸡的遗传多样性的研究方法和研究进展进行了详细的阐述。重点介绍了DNA分子标记的特征;概括了在鸡遗传多样性分子标记的方法,包括微卫星分子标记(SSR)、扩增片段长度多态性(AFLP)、随机扩增多态性标记(RAPD)、限制性片段长度多态性标记(RFLP)和单核苷酸多态性标记(SNP)。本文综述了最近有关鸡DNA水平的遗传多样性的研究方法在系统学、遗传结构、生物地理等研究中的应用情况;提出在研究鸡遗传多样性时,可根据研究的目的,选择合适的方法。     

蝗虫分子系统学研究进展

本文从遗传多样性、近缘种鉴别以及分子进化和系统发育重建 3个方面综述了蝗虫分子系统学的研究进展。     

国家自然科学基金委员会生命科学部2002年度资助自由申请科学基金项目一览表

项 目 名称1 微生物学学科(80项)木本豆科植物根瘤菌分类和系统发育研究放线菌种分类单元及种内菌株的分子分类指征的评价我国酸性土壤中链霉菌的选择分离与快速鉴定稀有放线菌的系统分类中国西部荒漠地衣及其固沙生物学研究中国灵芝属分子系统学研究隔指孢属(D0c吲eff0 Grove)系统分类研究中国团毛菌目粘菌系统分类研究虫草属的遗传多样性与进化生物学研究滇黔桂喀斯特地区大型真菌区系调查与分类学研究拟青霉属真菌资源调查及其分类研究中国东部地区土壤中暗色丝孢菌属、种调查中国嗜热真菌分类研究北方保护地土壤真菌生物多样性的研究植…     

从知识创新展望21世纪生物多样性科学

首先简要介绍汤佩松(1983)创新植物学,随后根据其创新思想分析了生物多样性三个层次研究的现状和问题。提出了一个根据DNA 序列变异尺度为标准的新的遗传多样性等级制度。为了避免物种和其他分类群的随意性, 建议以DNA 序列变异作为可操作的分类单元(OTU)和国际上进化上显著单元(ESU)相呼应。下一世纪的分子系统学和分子生态学可能重点研究DNA 变异, 特别是重复序列的变化对生物生命活动的调控, 在分子水平上揭示结构和功能的进化和适应。第三部分讨论Diversitas五个核心课题, 说明分子水平研究和生物技术对生物多样性保护和持续利用的重要性和迫切性。最后评论了" 天人合一" 为代表的反科学主义思潮, 坚持科学进步。     

线粒体Cyt b基因与昆虫分子系统学研究

细胞色素b(cytochrorrle b,Cyt b)是线粒体13个蛋白质编码基因中结构和功能被研究得最为清楚的基因之一,该基因的进化速度适中,适合研究种内到种间甚至科间的系统发育关系,研究内容涉及种及种下阶元的分类鉴定、种上阶元的系统发育分析、种群的遗传变异和进化研究、分子进化研究等方面,本文对Cyt b基因的分子特点及其在昆虫系统学研究中的应用进行综述。     

直翅目昆虫分子系统学研究新进展

对1994年以来国内外在直翅目昆虫种群遗传变异及进化、种及种下阶元的分类鉴定、种上阶元的系统发育分析及分子进化等分子系统学方面的研究进展进行了综述。近年来,蝗亚目昆虫分子系统学方面的研究成果较为丰富,而有关螽亚目的分子系统学研究较少。线粒体基因和核基因序列联合分析、整个基因组全序列分析以及分子数据与形态学的密切结合将是分子系统学未来发展的主要研究手段。     

核基因在两栖爬行动物分子系统学中的研究进展

从DNA水平探索生物进化的理论、生物类群的演化历史具有重要的意义,应用DNA序列研究生物的系统发育和进化规律成为当前分子系统学研究的热点,与线粒体DNA相比,核基因由于包含有更加丰富的生物学信息,运用核基因序列或将核基因序列与线粒体基因序列相结合研究两栖爬行动物的系统发育,正成为分子系统学领域的新的发展趋势.Rag-1、Rag-2、tyrosinase、rhodopsin、C-mos等核基因已在两栖爬行动物分子系统学中得到了广泛的应用.由于目前的技术手段等诸多因素,限制了更多的核基因用于两栖爬行动物分子系统学研究.为此简要介绍了目前核基因在两栖爬行动物分子系统学方面的研究进展,并分析了核基因序列在分子系统学应用上面临的问题和应用前景.     

国家自然科学基金委员会生命科学部2004年度资助自由申请科学基金项目一览表

项　目　名　称申请者姓名单　位　名　称1　微生物学学科 (104项)粘细菌的种属分子分类及菌株分子鉴别技术吴志红山东大学野生稻内生固氮菌系统发育及分子遗传研究谭志远华南农业大学中国鸡皮衣科地衣分类学研究赵遵田山东师范大学拟盘多毛孢属及邻近属分子系统学研究徐　同浙江大学酵母菌种间和种内染色体和rRNA等基因序列的变异性或保守性白逢彦中国科学院微生物研究所　分析青藏高原丛枝菌根真菌分类研究郭良栋中国科学院微生物研究所中国三个生物多样性关键地区大型地衣区系比较研究郭守玉中国科学院微生物研究所口蘑科系统发育研究…     

纤毛虫分子系统发育学的研究进展

在回顾纤毛虫分子系统发育学产生发展历史的基础上,介绍了随着20年中RFLP、RAPD和DNA序列分析等分子生物学技术作为该学科的主要研究方法在种群遗传多样性与进化、种上阶元系统发育学两方面取得的研究成果和近期研究进展,最后在探讨纤毛虫分子系统发育学存在的一些问题和解决方法的同时,预测了纤毛虫分子系统发育学今后将极大地推动真核生物的起源与进化,内共生等重要生物进化问题的研究。     

COⅡ基因在昆虫分子系统学研究中的作用和地位

细胞色素氧化酶Ⅱ(cytochromeoxidaseⅡ,COⅡ)基因位于线粒体DNA(mtDNA)上,编码细胞色素氧化酶亚基Ⅱ,该亚基为细胞色素c提供重要的结合位点。COⅡ基因进化速率较快,是昆虫分子系统学研究中理想的分子标记。目前,已经利用该基因从各个分类水平对昆虫系统发育关系、物种形成与分化、种群遗传与变异及生物地理等方面做了广泛的研究。研究表明,利用该基因可以很好地解决昆虫属、种及种下分类单元的系统发育问题,但是在解决科、亚科等高级阶元的系统发育关系时仍存在一些局限,COⅡ基因与其他mtDNA及核基因的联合分析能够更好地解决昆虫的系统发育问题。     

分子生物学技术在昆虫系统学研究中的应用

分子生物学技术应用于昆虫系统学研究,是８０年代末新兴起来的,近几年来发展相当迅速。为了把握这个研究方向,并促进这个研究领域的发展,作者从研究方法、研究内容、研究对象等方面着手,对近１０年来分子生物学技术应用于昆虫系统学中的研究进展进行了概括和总结。介绍了ＤＮＡ序列测定、ＲＦＬＰ,分子杂交技术、ＲＦＰＬ、分子杂交技术、ＲＡＰＤ、ＳＳＣＰ及ＤＳＣＰ等几种主要方法及其应用情况,并从种及种下阶元的分类鉴定     

The progress of DNA analyzing techniques and its impact on plant molecular systematics

Recent advances in manipulating nucleic acids have opened a new research field called plant molecular systematics. This short review provides an overview of molecular techniques which have been used in the analysis of DNA molecules for the study of plant systematics, with a special emphasis on PCR. The early application of DNA analysis, DNA/DNA hybridization, has not become popular with plant systematists, because of several disadvantages inherent in the method. The survey of restriction fragment length polymorphisms (RFLPs), on the contrary, has become one of the preferred methods used by plant molecular systematists, since the method is relatively easy to perform. Although unambiguous data can be obtained by both long-range restriction mapping and nucleotide sequencing, these approaches may have limited use in plant molecular systematics because of their laborious experimental procedures relying on conventional molecular cloning techniques. To date, PCR based analyses of the DNA molecule seem to be the most suitable experimental approach for plant molecular systematics. Several advantages of the method have changed both the quality and quantity of the DNA data. Further application of PCR to plant molecular systematics will open up a new era in the field. The present paper is based on the contribution which was read in a symposium entitled “Organellar DNA Variations in Higher Plants and their Taxonomic Significance”, at the 50th Annual Meeting of the Botanical Society of Japan in Shizuoka on October 2, 1990, under the auspices of the Japan Society of Plant Taxonomists.     

叶蝉科昆虫分子系统发育的研究进展

从基因组DNA的提取、研究的基因片段、PCR引物选用、扩增条件以及叶蝉科不同阶元的分子系统发育分析等方面,综述叶蝉科(半翅目:叶蝉科)昆虫分子系统发育的研究进展。目前角顶叶蝉类的研究成果相对较多,大叶蝉亚科次之,其余类群的研究较少或无。线粒体基因与核基因序列联合分析以及线粒体全序列分析以及基因序列与形态数据相结合分析,分子鉴定叶蝉与共生菌之间的协同进化的研究,将是叶蝉分子系统学未来发展的主要研究手段。     

分子遗传标记技术在蜻蜓目昆虫研究中的应用

分子生物学技术应用于昆虫系统学研究在近些年发展相当迅速。目前已出现了几十种分子遗传标记。该文简述了酯酶同工酶电泳、核酸序列分析以及AFLP、RAPD、核酸探针等分子生物学技术在蜻蜓目昆虫研究中的应用情况。     

Gene trees and species trees – mutual influences and interdependences of population genetics and systematics

Both population genetics and systematics are core disciplines of evolutionary biology. While systematics deals with genealogical relationships among taxa, population genetics has mainly been based on allele frequencies and the distribution of genetic variants whose genealogical relations could for a long time, due mainly to methodological constraints, not be inferred. The advent of mitochondrial DNA analyses and modern sequencing techniques in the 1970s revolutionized evolutionary genetic studies and gave rise to molecular phylogenetics. In the wake of this new development systematic approaches and principles were incorporated into intraspecific studies at the population level, e.g. the concept of monophyly which is used to delineate evolutionarily significant units in conservation biology. A new discipline combining phylogenetic analyses of genetic lineages with their geographic distribution ('phylogeography') was introduced as an explicit synthesis of population genetics and systematics. On the other hand, it has increasingly become obvious that discordances between gene trees and species trees not only result from spurious data sets or methodological flaws in phylogenetic analyses, but that they often reflect real population genetic processes such as lineage sorting or hybridization. These processes have to be taken into account when evaluating the reliability of gene trees to avoid wrong phylogenetic conclusions. The present review focuses on the phenomenon of non-phylogenetic sorting of ancestral polymorphisms, its probability and its consequences for molecular systematics.     

哺乳动物系统发育基因组学研究进展

哺乳动物是一类最进化并在地球上占主导地位的动物类群,重建其系统发育关系一直是分子系统学的研究热点。随着越来越多物种全基因组测序的完成,在基因组水平上探讨该类动物的系统发育关系与进化成为研究的热点。本文从全基因组序列,稀有基因组变异及染色体涂染等几个方面简要介绍了当前系统发育基因组学在现生哺乳动物分子系统学中的应用,综合已有的研究归纳整理了胎盘亚纲的总目及目间的系统发育关系,给出了胎盘动物19 个目的系统发育树。本文还分析了哺乳动物系统发育基因组学目前所面临的主要问题及未来的发展前景。     

DNA分子标记技术在真菌系统学研究中的应用及影响

DNA分子标记技术为真菌系统进化研究提供了许多新的方法,真菌分子系统学已成为一门成熟的学科。简述了真菌分子系统学的发展简史和代表性的研究方法以及对真菌系统学的主要贡献,包括将广义的真菌划分为3个类群,粘菌和卵菌不再属于真菌界成员。真菌生命之树项目的研究结果对真菌界高阶分类系统作出重大调整,将先前的4个门(壶菌门、接合菌门、子囊菌门和担子菌门)变为7个门(微孢子虫门、壶菌门、新丽鞭毛菌门、芽枝霉门、球囊菌门、子囊菌门和担子菌门)和4个亚门,并对真菌各类群概念作出修订。此外,DNA分子标记技术对真菌种概念的认识、有性型-无性型关联及分子生态学等研究领域产生了重要影响。     

Relationships within the family Actiniidae (Cnidaria,Actiniaria) based on molecular characters

Current sea anemone systematics is based on relatively few morphological characters, and potentially could benefit from the use of molecular characters. In this paper, the phylogenetic relationships of 12 species from 6 genera in the family Actiniidae have been investigated using electrophoretically separated isozymes. A numerical cladistic analysis has produced an estimated phylogeny. The implications of this phylogeny for the taxonomic use of certain morphological characters are discussed.