球状绿藻的隐性生物多样性及其分类学进展

球状绿藻主要指绿藻门中多为单细胞, 形状为球形、近球形, 或由球形衍生出来的其他形状的藻类。球状绿藻分布广泛, 遍布全球, 生活于淡水、海水和亚气生等生境中, 其相似的简单形态下隐藏着复杂的物种多样性。球状绿藻分类学上主要位于绿藻门的两纲四目及其一些独立支系的类群。球状绿藻分类学正由传统的基于形态特征向基于分子信息的复合分类方法转变。球状绿藻隐性的物种多样性涉及约40属, 其中15属是依据新标本材料而建立的新属, 12个属是依据新证据建立的新组合。本文重点介绍了1998年以后在共球藻纲和绿藻纲中新发现和命名的单细胞球状绿藻, 介绍了它们的形态特征、分类学迁移及理由, 特别对常见的小球藻属和栅藻属的分类学概念变迁作了详细介绍, 对一些尚没有中文名的拉丁学名给出了中文命名。另外, 本文讨论了基于DNA的分类学方法在球状绿藻分类学中的应用, 目前系统发育位置的不同已经成为球状绿藻分类的主要依据。目前球状绿藻分类面临的问题是大多分类位置未用分子系统发育方法的验证。 未来, 球状绿藻分类学家应用系统发育研究结合形态学研究探索单细胞球状绿藻的生物多样性。     

糖多孢菌属的多相分类

在糖多孢菌属的分类学研究中,最初是根据形态特征、培养特征及生理生化特征等表观分类学指征进行研究。随着“多相分类”方法的广泛应用,化学分类和分子分类在糖多孢菌属的分类学研究中起到越来越重要的作用。糖多孢菌是寻找新的生物活性物质的重要菌源,某些种能产生重要的生物活性物质,如抗生素、酶类、维生素、藻类促生长因子、纤维素降解促进因子、免疫抑制剂等。     

基因组分析方法在微生物分类学中的应用

细菌分类学始于19世纪后半叶,当时主要是以表型标记和生理生化特性为基础的简单分类,之后DNA-DNA分子杂交、16S rRNA基因序列分析方法的出现给微生物分类带来了极大的便利。尽管如此,这些分类学方法仍然存在一些局限性,而基因组时代的到来,为微生物分类带来了新思路。本文主要介绍了5种基于全基因组数据的微生物分类方法,包括平均核苷酸同源性分析、核心基因组分析、最大唯一匹配指数分析、K串组分矢量法和基因流动性分析,并论述了这些方法在微生物分类学中的应用。     

数值分类学

近年来,细菌分类学发展迅速,《伯杰氏系统细菌学手册》第九版第一卷于1984年问世后,受到广大读者关注。显示其新版特色之一的是,在“细菌分类”一章中,专题论述了近代发展起来的一些新的分类方法,如数值分类,核酸在细菌分类中的应用、遗传学方法、血清学和化学分类等。这些方法的建立使细菌分类学能更好地阐明其亲缘关系,为建立细菌分类的自然系统探索出可行的途径。现约请有关专家摘译了九版一卷中的上述方法部分,以期促进我国细菌分类学工作的发展。我刊将在资料栏目中连续刊出,以飨读者。     

应用于细菌分类学中的DNA-DNA杂交方法

自六十年代以来,由于分子生物学不断向细菌分类学领域渗透,使人们有可能在分子水平上研究种间关系,把以表型特征为主要依据的细菌分类学引向深入。由于碱基对的线性序列决定着生物的“遗传密码”,控制着生物的表型特征,因此碱基线性序列和表型特征之间有     

从腹泻分离鉴定气单胞菌和邻单胞菌的实验室方法

本文联系著者等近几年来时常从腹泻病人的粪便中检出嗜水气单胞菌和类志贺邻单胞菌的事实,介绍气单胞菌属和邻单胞菌属细菌的分布与分类学位置,提出在一个中小型的细菌学实验室,如何进行分离培养,按照它们的生化特性进行初步鉴定和最后鉴定的方法,指出了与近似细菌的鉴别要点和工作中应当注意的问题。     

国家自然科学基金委员会生命科学部2004年度资助自由申请科学基金项目一览表

项　目　名　称申请者姓名单　位　名　称1　微生物学学科 (104项)粘细菌的种属分子分类及菌株分子鉴别技术吴志红山东大学野生稻内生固氮菌系统发育及分子遗传研究谭志远华南农业大学中国鸡皮衣科地衣分类学研究赵遵田山东师范大学拟盘多毛孢属及邻近属分子系统学研究徐　同浙江大学酵母菌种间和种内染色体和rRNA等基因序列的变异性或保守性白逢彦中国科学院微生物研究所　分析青藏高原丛枝菌根真菌分类研究郭良栋中国科学院微生物研究所中国三个生物多样性关键地区大型地衣区系比较研究郭守玉中国科学院微生物研究所口蘑科系统发育研究…     

含笑属植物研究进展

含笑属植物约有80种,分布于亚洲热带及亚热带,是木兰科中第二大属,为常绿乔木或灌木,也是重要的资源植物。该文主要对国内外学者在分类学、形态学、孢粉学、细胞学、植物化学、分子系统学、应用前景等方面的研究进展进行了综述。     

穿孔线虫属分类研究进展(综述)

穿孔线虫属Radopholus是一类多寄主寄生的危险性植物线虫,其中以世界性危害的相似穿孔线虫R. similis为典型代表。但穿孔线虫属的分类学研究迄今仍不完善,形态描述粗糙,分子序列匮乏。本文列出穿孔线虫属的最新种类名录,归纳了27种穿孔线虫（双卵巢类型）的主要形态分类特征,并综述该属分子亲缘进化关系研究进展,为穿孔线虫属的分类和相似穿孔线虫的准确鉴定提供形态学基础和技术支持,同时也为该属线虫分类学的研究方向提出建议。     

电泳技术在细菌分类学中的应用

近年来,电泳技术在细菌分类学中得到了广泛的应用,通过对各类细菌的各种细胞组分的电泳分析,得到了许多有用的分类结果,发展了多种适于各种水平的分类技术。细菌细胞中有很多组分可以采用电泳分析,如完整的细胞,脂多糖,肽聚糖,蛋白质(包括酶),及核酸等。这些组分的分子依其电荷性质和电荷的多少,分子的大小和形状诸因素的不同而在电场中表现出不同性质的迁移和不同的迁移速率,从而使组分中不同的     

近年来中国国产豆科的属级分类学变动

豆科是被子植物中仅次于菊科和兰科的第三大科, 包含约791属, 19,325-19,560种, 其中许多分类群具有重要的经济价值。自《中国植物志》出版以来, 随着分子系统学的不断发展, 不少豆科属的范畴发生了变动。本文结合国内外的多项研究成果, 以1998年完整出版的《中国植物志》豆科相关卷册中的属为基准, 对近年来国产豆科植物的属的分类学变动进行了整理和总结, 包括32个分类学处理以及4个新记录属, 以期为未来国产豆科植物的分类学研究工作提供参考。     

梧桐科分类学研究评述

梧桐科(Sterculiaceae)是锦葵目中的一个多型科,主要分布于热带和亚热带地区,只有少数种可分布到温带地区。由于该科植物的形态特征较为多样化,至今对于它的范围和所包含的属种数目在各国学者间仍没有达成共识。该文从梧桐科的分类地位和系统关系、属的分类地位和亲缘关系以及分类学新特征在梧桐科分类中的应用3个方面入手,分析了梧桐科分类学研究的历史、现状和存在的问题,特别是把来自分子资料的研究结果与传统分类进行了比较分析,试图为梧桐科的分类学研究提供更多的帮助。     

一属罕见的细菌——多孢子菌属

我们发现并鉴定了一属新的细菌,其主要特征是能够从无菌丝的营养细胞直接转变为孢囊,产生大量孢子进行繁殖,并以甲烷作为唯一碳源与能源而生长。它同其它已知细菌有较大的差别,因而暂建立一个新的属:多孢子菌属 Polysporobacterium。模式种为沙石多孢子菌Polysporobacterium arenarium。它们在分类学上的位置将另行讨论。     

睡莲目的数量分支分类学研究

本文应用数量分支分类学的Farris-Wagner方法,研究了睡莲目10个已知属的系统发育关系。结果表明,唾莲目可分为3个科:莲科、睡莲科和金鱼藻科。本文还讨论了数量分支分析在植物分类学中的应用问题。     

需氧芽孢杆菌分类学研究进展

随着细菌多相分类学技术的发展,需氧芽孢杆菌在分类及命名方面发生了很大的变化。本文总结了现有芽孢杆菌各属的确立依据及其模式种的特征。     

细菌分类学中的碱基对测定法介绍

近来在细菌分类学中广泛使用一种分子生物学指标来分析细菌种、属间的亲缘关系,即测定鸟便嘌呤(G)和胞嘧啶(C)在整个脱氧核糖核酸(DNA)碱基对中的克分子百分比,把它作为进行属以上分类单位划分时的依据。这是     

库特氏菌属细菌的研究进展

库特氏菌属归属于动性球菌科,属内细菌分布环境多样,在土壤、地表水、野生动物体表、昆虫肠道等处均有检出。近几年,研究者对库特氏菌属的关注度显著增加并且在多个领域发现了其新价值,包括良好的抗逆性和多重降解功能等,同时确定少数菌株具有致病性。目前,仍存在着对属内各降解机制研究均较浅显、从功能的发现到具体应用方案之间缺乏有效衔接等问题亟待解决。对库特氏菌属的建立、分类学特征、属内成员分布、致病性、功能研究与应用等方面进行介绍,以期为该属菌株的分离鉴定、资源开发以及实际应用提供参考。     

假丝酵母属的分类学研究进展

假丝酵母属（CandidaBerkhout）是酵母菌中最大的一个属,现包括200多种,约占目前已知酵母菌总种数的三分之一［1］。由于假丝酵母的经济重要性及其在整个酵母菌中所占的比重,对该属的分类研究作为其他各方面研究的基础,一直是一个颇为活跃的领域。研究手段不断改进,分类系统木断更新。近10多年来该属的定义已经过两次重大修订［2.3］,分子分类学方法在该属的分类学研究中已经由辅助手段变为常用指标。1假丝酵母属的建立及其定义的演变假丝酵母属是Berkhout于1923年建立的［4］。Yarrow和Meyet［2］把球似酵母属（TorutopsisBerlese…     

细菌分类学教学的几点体会

细菌分类学教学的几点体会杨文博（天津南开大学微生物学系,天津３０００７１）细菌分类学是微生物学一门重要的分支学科。在设置微生物学系或微生物学专业的一些高等院校按专业必修课开设这门课。笔者在多年从事细菌分类学的教学工作中,深得一些体会,草拟成文,愿与同...     

基于ITS1 DNA序列分析的几种酵母菌的分子分类

采用ITS1序列分析的手段。对来自Dekkera/Brettanomyces/Eeniella的15株菌株进行了分子分类学的研究。研究结果支持4个Dekkera/Brettanomyces种类的确认;D.anomala/B.anomalus,D.bruxellensis/B.bruxellensis,D.custersiana和D.naardenensis,以及把E.nana合并于Brettanomyces属的建议,此外,研究也揭示了ITS1在酵母分子分类学中的价值。