siRNA表达载体对SW480细胞原癌基因Pokemon的抑制

观察siRNA表达载体对SW480细胞中Pokemon原癌基因的抑制效应,为进一步研究该基因的功能奠定基础。构建针对Pokemon基因的RNAi质粒表达载体,脂质体法转染人结直肠癌SW480细胞系,观察转染效率及细胞表型变化。稳定转染后,实时荧光定量PCR和Western blot检测SW480细胞中Pokemon mRNA及蛋白质的表达情况;MTT法检测siRNA对SW480细胞恶性增殖的影响;流式细胞仪分析细胞凋亡改变。镜下观察阳性转染率约36%,转染表达载体后细胞形态发生了显著变化;Pokemon mRNA及蛋白质的表达受到明显抑制：与阴性对照组相比,表达质粒产生的siRNA对Pokemon mRNA的抑制率在转染后24 h和48 h分别为34.2%和67.7%;对蛋白的抑制率在48 h和72 h分别为48.3%和73.6%。MTT法检测细胞生长曲线表明Pokemon抑制可使SW480细胞生长速度明显减慢;流式细胞仪分析显示转染Pokemon siRNA表达质粒后SW480细胞凋亡增加。构建的RNAi表达载体可以有效抑制SW480细胞中Pokemon基因的表达,并对SW480细胞的生长具有明显抑制及诱导凋亡作用。     

人结肠癌SW480细胞裸鼠皮下移植瘤DcR3基因的RNA干扰及其作用

目的:观察DcR3基因小干扰RNA(siRNA)对人结肠癌SW480细胞裸鼠皮下移植瘤DcR3基因表达的影响。方法:建立结肠癌SW480细胞裸鼠皮下移植瘤模型,瘤体注射脂质体与DcR3siRNA混合物,转染DcR3siRNA,免疫组织化学及RT-PCR检测观察DcR3基因的表达。结果:建立了结肠癌SW480细胞裸鼠皮下移植瘤模型;治疗后,治疗组移植瘤明显减小,空白对照组、阴性对照组肿瘤体积显著大于治疗组(P<0.01);各组肿瘤组织中DcR3基因均有不同程度的表达,治疗组表达程度明显低于阴性对照组及空白对照组(RT-PCRP<0.05,免疫组化P<0.01)。结论:人结肠癌SW480细胞在裸鼠皮下有良好的成瘤性;脂质体与DcR3siRNA混合物可特异性抑制结肠癌裸鼠皮下移植瘤内DcR3基因的表达。     

靶向诱骗受体3的小干扰RNA抑制人结肠癌裸鼠皮下移植瘤的实验研究

目的：以脂质体为载体,探讨靶向诱骗受体3（DcR3）的小干扰RNA（siRNA）对人结肠癌SW480细胞裸鼠皮下移植瘤生长的抑制作用。方法：裸鼠背部皮下种植结肠癌SW480细胞,建立结肠癌SW480细胞裸鼠皮下移植瘤模型;针对靶标DcR3基因,利用Dharmacon公司的软件设计合成siRNA序列,通过瘤体局部多点注射脂质体与DcR3siRNA混合物,将DcR3siRNA转染到裸鼠背部皮下移植瘤内,同时设立阴性对照组和空白对照组;观察肿瘤治疗前后体积变化,评价DcR3siRNA对肿瘤的抑制作用;比较肿瘤治疗前后的细胞形态学改变;免疫组织化学及RT-PCR检测DcR3基因表达;原位细胞凋亡检测肿瘤的凋亡。结果：治疗组肿瘤体积明显小于对照组,肿瘤组织内坏死面积增大,细胞凋亡率显著增高,DcR3蛋白表达水平降低;治疗过程中裸鼠生长良好,无明显毒性反应。结论：脂质体介导的DcR3siRNA对裸鼠皮下结肠癌SW480细胞移植瘤有明显的抑制、杀伤作用,细胞凋亡是DcR3siRNA致肿瘤细胞死亡的重要形式。     

沉默c2orf68基因对结直肠癌细胞增殖的影响

目的:通过RNA干扰技术抑制人结直肠癌SW480、SW620及LS174T细胞株中c2orf68基因的表达,进一步观察其生物学特性的改变,以阐明c2orf68基因对结直肠癌细胞增殖的影响。方法:利用siRNA在线设计软件设计合成干扰片段,并将2个干扰片段转入所试细胞株中。应用RT-PCR法检测细胞mRNA的表达;利用MTT实验观察细胞增殖情况;应用流式细胞技术检测细胞凋亡。结果:转染siRNA片段后,SW480、SW620及LS174T细胞株的mRNA表达都下降,其抑制率分别为:50.05%、44.79%;49.69%、30.00%;50.15%、45.79%。随后,选取干扰效率高的siRNA1干扰片段做后续实验。MTT实验发现,siRNA转染LS174T细胞后,细胞的增殖能力明显下降,细胞的增殖抑制率为21.2%(P0.05)。同时,采用流式细胞仪检测细胞的凋亡,实验表明,实验组细胞凋亡率为18.13%(P0.05)。结论:成功筛选了抑制结直肠癌c2orf68基因的特异性干扰片段,该片段可以下调人结直肠癌细胞株中c2orf68的mRNA,抑制人结直肠癌细胞的生长,促进细胞凋亡,说明该基因可能与结直肠癌的细胞增殖有关,进一步调控相应生物学特性的改变,引起结直肠癌的发生。     

STAT3-siRNA对人结直肠癌细胞的干涉作用

目的:研究STAT3-siRNA对STAT3基因表达阳性的结直肠癌细胞凋亡的影响。方法:应用脂质体转染试剂将STAT3-siRNA表达盒(STAT3-siRNA expression cassettes,STAT3-SECs)体外转染至人结直肠癌SW480细胞及人成纤维细胞中,同时分别设立人成纤维对照组、SW480对照组、SW480错配链-SECs组和SW480空转染试剂组。于48h后收集细胞,先经荧光染色方法观察细胞表象变化,再通过流式细胞仪检测人结直肠癌SW480细胞凋亡情况,后分别提取细胞总RNA,用RT-PCR测定STAT3基因在mRNA水平的表达。结果:SW480STAT3-SECs组的细胞可见凋亡小体,出现明显的凋亡现象,而人成纤维对照组、人成纤维STAT3-SECs组、SW480对照组、SW480错配链-SECs组和SW480空转染试剂组未出现明显的凋亡现象。SW480STAT3-SECs组细胞的凋亡比率较SW480对照组、SW480错配链-SECs组和SW480空转染试剂组有明显的增高。RT-PCR所得数据经统计学处理得出:SW480STAT3-SECs组细胞的STAT3基因表达在mRNA水平上显著低于SW480对照组(P0.01);而人成纤维对照组与人成纤维STAT3-SECs组,SW480细胞对照组与SW480错配链-SECs组、SW480空转染试剂组之间无明显差异(P0.05)。结论:应用RNAi技术沉默STAT3基因可以降低人结直肠癌SW480细胞中STAT3的表达,诱导细胞的凋亡。     

鞘氨醇激酶1参与依托泊苷抑制人乳腺癌MDA-MB-231细胞增殖、迁移的研究

目的利用抑制乳腺癌MDA-MB-231细胞中SK-1基因表达,结合依托泊苷对细胞增殖的影响,研究乳腺癌的治疗新方法。方法将依托泊苷分别处理野生型及SK-1敲除型MDA-MB-231细胞,^3H-TdR掺入法分析细胞增殖,Transwell法分析细胞迁移,Western印迹检测SK-1蛋白表达及细胞周期检验点相关信号因子的蛋白表达,RT-PCR检测细胞内SK-1的mRNA表达量。结果依托泊苷在较高剂量时,MDA-MB-231细胞存活率明显下降,但依托泊苷却呈浓度依赖性促进乳腺癌细胞SK-1 mRNA及蛋白水平表达,将SK-1敲除,细胞迁移率下降,而且可以增强G1期各抑癌基因的激活或高表达,使细胞周期阻滞。结论SK-1基因敲除有效增强肿瘤细胞对化疗药物的敏感性。     

靶向FBXL20基因的siRNA片段的筛选及其验证

在人结肠腺癌SW480细胞株及口腔鳞癌HSC3细胞株中,筛选有效干扰fbxl 20的siRNA片段.设计合成3对靶向fbxl 20 mRNA的小干扰RNA片段,通过阳离子脂质体介导转染SW480细胞和HSC3细胞. 结果发现siRNA-1, siRNA-2, siRNA-3均能抑制SW480细胞和HSC3细胞fbxl20 mRNA的表达,siRNA-2抑制作用最明显,抑制率分别为86.8％和100%. MTT试验显示：siRNA-2转染SW480细胞和HSC3细胞后,细胞增殖能力明显降低,细胞增殖抑制率分别为29.5%和43.4%. Transwell小室迁移实验表明,HSC3细胞在转染24 h后,细胞迁移能力明显减弱,迁移抑制率高达72.4%. 流式细胞术检测细胞凋亡结果显示：转染36 h后,SW480细胞实验组细胞凋亡率为21.9%;转染24 h后,HSC3细胞实验组细胞凋亡率为44.7%. 本实验成功的筛选出了特异性的抑制fbxl 20基因的siRNA片段,并初步鉴定了fbxl 20基因的功能.     

S100A9参与介导具核梭杆菌促结肠癌细胞的增殖与迁移的作用

目的:探讨S100A9在具核梭杆菌(Fusobacterium nucleatum,Fn)促结肠癌HCT116和SW480细胞增殖与迁移中的作用。方法:Fn感染HCT116和SW480细胞后,分别采用CCK8实验及Transwell实验检测结肠癌细胞的增殖及迁移能力的变化,采用Real time PCR及Western blot分别检测S100A9基因及蛋白质水平的变化;用S100A9 siRNA转染HCT116和SW480细胞后感染Fn,采用CCK8实验及Transwell实验分别检测两株细胞增殖及迁移能力的变化;利用NF-κB抑制剂BAY 11-7082预处理HCT116和SW480细胞后再感染Fn,采用Real time PCR及Western blot分别检测S100A9基因及蛋白质水平的变化。结果:(1) Fn可促进HCT116和SW480细胞增殖及迁移(P 0.001);(2) Fn感染的HCT116和SW480细胞中S100A9基因及蛋白质水平均较相应对照组明显升高,差异均具有高度显著性(P 0. 01或P 0. 001),即Fn上调S100A9的表达;(3)用S100A9 siRNA下调HCT116和SW480细胞中S100A9表达后,Fn促进这两株细胞增殖及迁移的作用则明显减弱,差异均具有高度显著性(P 0. 001),表明S100A9参与介导Fn的促HCT116和SW480细胞增殖及迁移的作用;(4)在NF-κB通路抑制剂BAY 11-7082预处理的HCT116和SW480细胞组,Fn上调S100A9基因及蛋白质水平的作用明显被逆转,差异均具有高度显著性(P 0. 01或P 0. 001),表明激活NF-κB转录活性是Fn上调S100A9的机制之一。结论:Fn可上调S100A9表达且与NF-κB活化有关,上调S100A9是Fn促结肠癌细胞增殖及迁移的机制之一。     

雷公藤甲素对结肠癌细胞SW480 的基因表达谱的影响

目的:探讨雷公藤甲素对结肠癌SW480细胞的基因表达谱的影响。方法:雷公藤甲素处理结肠癌SW480细胞24h后,分别提取给药组和空白对照组SW480细胞总RNA,纯化并逆转录成用Cy3和Cy5标记的cDNA探针,经全基因芯片杂交,洗涤,通过生物信息学方法分析雷公藤甲素处理组和空白对照组SW480细胞基因表达谱的差异。结果:与空白对照组比较,共发现了902个差异基因,雷公藤甲素处理组有196个基因上调,706个基因下调。上调基因主要涉及细胞代谢。下调基因主要涉及wnt通路、细胞周期通路、Toll样受体通路以及MAPK等通路。结论:雷公藤甲素能导致结肠癌细胞基因表达谱的改变,这些基因改变可能参与了细胞增殖、分化、凋亡等过程。这些信息可能为探讨雷公藤抗结肠癌作用机制提供线索。     

cDNA微阵列技术分析NAG7基因对鼻咽癌细胞基因表达谱的影响

运用cDNA微阵列技术分析NAG7基因重表达对HNE1细胞基因表达谱的影响.抽提HNE1细胞和pcDNA3.1(+)/NAG7/HNE1细胞总RNA,分离polyA mRNA,将mRNA逆转录为cDNA,并在逆转录过程中用³³P-dATP进行标记,与含有16 150个基因和表达序列标签(EST)的cDNA表达阵列膜杂交,获得基因表达图谱.Array Gauge软件分析NAG7基因的重表达所导致的鼻咽癌细胞HNE1基因表达谱改变,并用RNA印迹对微阵列杂交结果进行验证.结果分析表明,2倍以上的差异表达基因或EST 179个,其中表达上调的91个,表达下调的88个;已明确基因表达产物的上调基因29个,下调基因37个.在差异表达基因中,涉及基因转录调控、信号转导、细胞生长、细胞代谢和细胞凋亡等基因.RNA印迹证实生长阻滞特异蛋白1（gas 1）基因表达上调.特别值得关注的是, 先前的蛋白质组研究结果亦发现NAG7基因可导致生长阻滞特异蛋白1表达上调,说明gas 1基因在NAG7重表达的HNE1细胞中具有重要作用,这为深入研究NAG7基因的作用环节和机理提供了重要的线索.     

敲低HSP60 对结肠癌SW480 细胞增殖能力的影响及其机制探究

目的:研究热休克蛋白60(HSP60)敲低对结肠癌SW480细胞增殖的影响,并进一步探究其作用机制。方法:通过含HSP60sh RNA载体的慢病毒感染加上流式细胞仪无菌分选的方法构建结肠SW480 HSP60基因稳定RNA干扰(RNAi)单克隆细胞系,利用Western blot和q-PCR验证结肠癌细胞中HSP60的敲低效率;使用CCK-8试剂检测结肠癌细胞增殖能力,并用流式细胞仪检测其HSP60敲低对细胞周期的影响。结果:Western blot和q-PCR结果验证了HSP60在结肠癌细胞中的敲低效率,与对照组细胞相比,实验组细胞HSP60的m RNA水平和蛋白水平均降低了60%以上。CCK-8实验结果表明,敲低HSP60后SW480细胞的增殖能力下降了约70%;流式细胞周期实验显示敲低HSP60后SW480细胞中G0/G1期、S期、G2/M期的分布比例变化不大。结论:敲低HSP60能够显著抑制SW480细胞的增殖能力,而SW480细胞周期并没有发生明显变化,推测HSP60的敲低引起的线粒体损伤导致细胞生长速度变慢。     

EphA2对神经胶质瘤细胞系U251的凋亡﹑增殖﹑迁移和侵袭的研究

为了研究EphA2对神经胶质瘤细胞系U251在增殖、凋亡、迁移和侵袭方面所起的作用,用RT-PCR方法检测正常脑组织标本与两种恶性胶质瘤细胞系中EphA2 mRNA表达水平,然后用化学合成的针对EphA2基因的小干扰RNA(siRNA)下调该基因的表达,以检测其在U251中的生物学功能．证实了EphA2基因在正常脑组织标本中的表达水平远低于两种恶性胶质瘤细胞系．把体外化学合成针对EphA2基因的小干扰RNA(siRNA- EphA2)转染入U251细胞后,Western blot, 实时定量 RT-PCR检测到U251细胞中EphA2蛋白及mRNA表达水平都明显降低,并且细胞增殖受到显著抑制,同时出现了明显的细胞凋亡．伤口愈合实验(检测细胞迁移能力),Transwell小室实验(检测细胞侵袭能力)均表明,下调EphA2的表达后,细胞的迁移和侵袭能力较阴性对照组显著减弱．上述结果表明,在神经胶质瘤U251细胞中,EphA2与其恶性增殖及高度侵染性相关,可作为分子治疗的有效靶点．     

抑癌基因DLC-1在结肠癌细胞sw480中表达的研究

目的:初步探讨DLC-1基因在结肠癌细胞sw480中的表达改变及其可能机制;方法:采用RT-PCR和Western blot分析结肠癌细胞CaCo2、sw480的DLC-1表达情况;应用去甲基化药物5—氮杂胞苷处理DLC-1基因阴性表达的细胞株,观察用药前后该细胞DLC-1基因的表达水平、细胞周期、细胞增殖力和侵袭力的影响。结果:CaCo2细胞高表达DLC-1 mRNA,而sw480则呈现表达缺失。经去甲基化药物5—氮杂胞苷处理sw480后,DLC-1 mRNA恢复表达,比较用药前后sw480细胞增殖力下降、细胞周期被阻滞在G2期、细胞侵袭力减弱。结论:DLC-1基因可影响结肠癌细胞sw480的增殖能力和侵袭力,并使结肠癌细胞sw480细胞周期阻滞于G2期,DNA甲基化可能是导致DLC-1在sw480细胞中的失活的一个重要原因。     

Knockdown of both mitochondrial isocitrate dehydrogenase enzymes in pancreatic beta cells inhibits insulin secretion

Background

There are three isocitrate dehydrogenases (IDHs) in the pancreatic insulin cell; IDH1 (cytosolic) and IDH2 (mitochondrial) use NADP(H). IDH3 is mitochondrial, uses NAD(H) and was believed to be the IDH that supports the citric acid cycle.

Methods

With shRNAs targeting mRNAs for these enzymes we generated cell lines from INS-1 832/13 cells with severe (80%–90%) knockdown of the mitochondrial IDHs separately and together in the same cell line.

Results

With knockdown of both mitochondrial IDH's mRNA, enzyme activity and protein level, (but not with knockdown of only one mitochondrial IDH) glucose- and BCH (an allosteric activator of glutamate dehydrogenase)-plus-glutamine-stimulated insulin release were inhibited. Cellular levels of citrate, α-ketoglutarate, malate and ATP were altered in patterns consistent with blockage at the mitochondrial IDH reactions. We were able to generate only 50% knockdown of Idh1 mRNA in multiple cell lines (without inhibition of insulin release) possibly because greater knockdown of IDH1 was not compatible with cell line survival.

Conclusions

The mitochondrial IDHs are redundant for insulin secretion. When both enzymes are severely knocked down, their low activities (possibly assisted by transport of IDH products and other metabolic intermediates from the cytosol into mitochondria) are sufficient for cell growth, but inadequate for insulin secretion when the requirement for intermediates is certainly more rapid. The results also indicate that IDH2 can support the citric acid cycle.

General significance

As almost all mammalian cells possess substantial amounts of all three IDH enzymes, the biological principles suggested by these results are probably extrapolatable to many tissues.     

抑制VEGF基因表达对乳腺癌细胞细胞周期的影响

目的：研究针对VEGF基因的siRNA（small interferenceRNA）对乳腺癌MCF-7细胞细胞周期的影响。方法：依据Promega公司在网上提供的设计软件,设计针对VEGF基因的siRNA,合成DNA模板,体外转录合成siRNA。脂质体转染法将合成的siRNA转染入MCF-7细胞,以未转染细胞以及错义序列siRNAscr转染细胞为对照。用细胞计数法检测siRNA对MCF-7细胞增殖的影响：流式细胞法检测细胞周期变化,RT—PCR法比较转染前后p21、CyclinDl表达水平的变化,Westemblot检测转染前后磷酸化ERK的表达。结果：细胞计数法结果显示,转染24h后siRNA明显抑制MCF-7细胞增殖,转染48h后,抑制效率稳定。siRNA转染后能有效地抑制MCF-7细胞的增殖,阻滞细胞周期于G0／G1期,S期细胞明显减少,G0／G1期细胞比例逐渐增多;p21mRNA表达显著上调,抑制CyclinD1mRNA及磷酸化ERK蛋白的表达。结论：体外转录合成的siRNA可能通过上调细胞周期蚤白激酶抑制剂p21的表达,下调CyclinDl及磷酸化ERK的表达,将细胞周期阻滞于G0／G1期,从而显著抑制MCF-7细胞的增殖。     

Nicotinamide Phosphoribosyl Transferase (Nampt) Is a Target of MicroRNA-26b in Colorectal Cancer Cells

A number of cancers show increased expression of Nicotinamide phosphoribosyl transferase (Nampt). However, the mechanism through which Nampt is upregulated is unclear. In our study, we found that the Nampt-specific chemical inhibitor FK866 significantly inhibited cell survival and reduced nicotinamide adenine dinucleotide (NAD) levels in LoVo and SW480 cell lines. Bioinformatics analyses suggested that miR-26b targets Nampt mRNA. We identified Nampt as a new target of miR-26b and demonstrated that miR-26b inhibits Nampt expression at the protein and mRNA levels by binding to the Nampt 3′-UTR. Moreover, we found that miR-26b was down regulated in cancer tissues relative to that in adjacent normal tissues in 18 colorectal cancer patients. A statistically significant inverse correlation between miR-26b and Nampt expression was observed in samples from colorectal cancer patients and in 5 colorectal cell lines (HT-29, SW480, SW1116, LoVo, and HCT116). In addition, over expression of miR-26b strongly inhibited LoVo cell survival and invasion, an effect partially abrogated by the addition of NAD. In conclusion, this study demonstrated that the NAD-salvaging biosynthesis pathway involving Nampt might play a role in colorectal cancer cell survival. MiR-26b may serve as a tumor suppressor by targeting Nampt.