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1.  桂花SRAP—PCR体系的确立及验证  被引次数:8
   李梅  侯喜林  郝日明《植物资源与环境学报》,2009年第18卷第2期
   以桂花[Osmanthus fragrans (Thunb. ) Lour. ]品种'早银桂'的总DNA为模板,对SRAP-PCR扩增体系中的模板DNA用量,Mg2+、 dNTPs和引物浓度以及Taq DNA聚合酶用量进行单因子实验, 确立了适合桂花总DNA的 SRAP-PCR反应体系:反应体系总体积10 μL,包括30 ng模板DNA、 2.5 mmol·L-1 Mg2+ 、 0.20 mmol·L-1dNTPs、 0.4 μmol·L-1上下游引物和0.75 U Taq DNA聚合酶及1×PCR buffer.采用SRAP引物组合pm21-em8,以78个桂花品种的总DNA为样品,对优化的SRAP-PCR反应体系进行初步验证,共扩增出632条带,多态性条带百分率75.32%;扩增位点15个,多态性位点百分率为86.67%.运用优化的SRAP-PCR体系,使用筛选出的18对SRAP引物组合对88个桂花品种、1个桂花野生种以及2个外类群[柊树O. heterophyllus (G. Don) P. S. Green和华东木犀O. cooperi Hemsl. ]的总DNA进行扩增,共扩增出296个位点,其中多态性位点248个,多态性位点百分率为83.78%.实验结果显示,运用优化的SRAP-PCR反应体系获得的DNA条带清晰、扩增结果稳定、多态性较丰富;SRAP分子标记可用于桂花遗传多样性、品种资源鉴定、亲缘关系以及系统进化等方面的研究.    

2.  SRAP分子标记分析西瓜遗传多态性  被引次数:16
   李晓慧  田朝阳  王从彦《生物技术》,2007年第17卷第3期
   目的:探讨西瓜遗传多样性和遗传基础。方法:采用SRAP分子标记对西瓜品种D1、D2、D3、H1、H2、H3、M1、M2、M3、m1、m2、m3的多态性进行了分析。结果:每对引物组合产生13~25对比较清晰的扩增带.8对引物组合共产生131条扩增带。平均每对引物组合产生16.375条。8对引物组合共产生多态性带37条,每对引物组合产生3~7条,平均4.625条。每对引物组合产生的多态性带的比例为16.666%~38.464%,平均为28.675%。另外,对银染过程进行了优化。结论:SRAP标记多态性还是较高的,可以适于分析西瓜等遗传差异小的作物。    

3.  用RAPD标记评估我国棉花品种遗传多样性  被引次数:12
   左开井  孙济中  张金发  聂以春  刘金兰《遗传学报》,2000年第27卷第9期
   利用RAPD标记对17个不同来源的我国棉花品种(系)进行遗传多样性评估。200个随机引物扩增出113条多态性片段。17个品种(系)依据染色体组的不同可以分为3大类。它们之间遗传相似性系数从0.2000到0.8451。3个大面积推广品种鄂荆1号,中棉所12号和苏棉3号遗传基础十分相近。陆地棉与阔叶棉杂交产生的野生种质系7581,与其他陆地棉品种(系)遗传差异显著。不同育种单位在育种过程中种质使用具有    

4.  棉花2个多标记基因系及其杂交后代AFLP分析  被引次数:1
   孙志栋  王学德  倪西源《生物技术通报》,2006年第Z1期
   应用AFLP分子标记技术,对陆地棉两个多标记基因系T582和T586及其杂交后代F1等进行了DNA多态性分析。结果表明:在58对EcoRI/MseI引物组合中,筛选出41对引物组合具有多态性,多态性的引物组合占筛选总组合的70.69%。AFLP分子标记具有高度的多态性,非常适于基因组差异较小的(棉花)材料之间的多态性筛选。采用聚丙烯酰胺银染法显带技术,AFLP进行PCR扩增能看到30~80条DNA亮带,且检测灵敏度高,可区别只相差十几个bp甚至几个bp大小的DNA片段。但AFLP标记以显性标记占绝对优势,共显性标记比率极少,故而难以区分种质的杂合和纯合,这是它的惟一不足之处。    

5.  29个香蕉基因型遗传多样性的SRAP分析  
   谢子四  刘德兵  魏守兴  陈业渊  谢建吉  魏军亚《西北植物学报》,2012年第32卷第8期
   采用SRAP分子标记技术对29个香蕉品种(系)的多样性进行研究,结果显示,64对SRAP引物中筛选出25个多态性较高的引物组合,共扩增出324条条带;UPGAM聚类图显示所有供试的29个香蕉品种(系)可分为2个类群且与基因型相一致;实验结果与形态、农艺性状标记分类基本一致。研究表明,SRAP技术可有效运用于香蕉基因型的遗传和育种研究。    

6.  利用SRAP标记分析河南小麦栽培品种的遗传多样性  
   王凤涛  蔺瑞明  欧阳宏雨  徐世昌《植物遗传资源学报》,2010年第11卷第10期
   利用小麦SRAP标记对22个河南省小麦品种进行了遗传多样性分析,10对引物组合扩增获得169个条带,其中70个条带具有多态性,多态条带百分率为41.42%,每对引物平均产生7个多态性条带。22个供试材料的带型按照条带的有,无分别记录为1,0后,采用Nei 72方法计算不同品种的遗传距离,利用NTSYS软件进行非加权成组法(UPGMA)进行了聚类分析。结果表明SRAP标记技术能较真实地反映小麦品种间的亲缘关系,可以用于小麦品种遗传多样性的研究。    

7.  利用SRAP标记分析河南小麦栽培品种的遗传多样性  被引次数:7
   王凤涛  蔺瑞明  欧阳宏雨  徐世昌《植物遗传资源学报》,2009年第10卷第4期
   利用小麦SRAP标记对22个河南省小麦品种进行了遗传多样性分析,10对引物组合扩增获得169个条带,其中70个条带具有多态性,多态条带百分率为41.42%,每对引物平均产生7个多态性条带。22个供试材料的带型按照条带的有、无分别记录为1、0后,采用Nei72方法计算不同品种的遗传距离,利用NTSYS软件进行非加权组法(UPGMA)聚类分析。结果表明SRAP标记技术能较真实地反映小麦品种间的亲缘关系,可以用于小麦品种遗传多样性研究。    

8.  萝卜品种指纹图谱SRAP与AFLP分析  被引次数:6
   赵丽萍  柳李旺  龚义勤  王明霞  郁樊敏  汪隆植《植物研究》,2007年第27卷第6期
   应用SRAP与AFLP两种分子标记技术进行了萝卜品种鉴定分析。对萝卜基因组DNA的SRAP-PCR反应体系中引物、Mg2 、dNTPs浓度进行优化,确定最优体系为引物0.3μmol.L-1,dNTP 0.2 mmo.lL-1,Mg2 3.0 mmo.lL-1。对SRAP-PCR中的退火温度(50℃)设置了12个梯度处理,以em2-me2为引物时带型无明显差异。7个供试萝卜材料的SRAP和AFLP指纹图谱分析表明,供试材料均可被SRAP和14个AFLP引物准确鉴定,每对引物组合都产生独特的指纹图谱。11个SRAP引物组合共产生155条带,多态性条带84条。聚类分析与相对遗传距离(GD)表明,供试材料聚为4类,CB-03-2与SHCB-02-1亲缘关系最近(GD=0.054 9);齐虹大连和Heiseng的亲缘关系最远(GD=0.203 4)。基于16个AFLP标记引物组合分析结果表明,供试材料聚为3类,CB-03-2和SHCB-02-1的亲缘关系最近。SRAP与AFLP综合分析结果表明,供试材料可聚为3类,其中CB-03-2与SHCB-02-1亲缘关系最近(GD=0.047 6)。    

9.  红掌品种亲缘关系SRAP分析  被引次数:1
   王呈丹《植物遗传资源学报》,2013年第14卷第4期
   利用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记,从100对引物组合中筛选出 26对多态性高、条带清晰的SRAP引物,对33个红掌品种进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果如下:(1)26对引物共扩增出366条条带,其中有314条多态性条带,多态性比率为85.79%。引物组合产生的条带数在9~23之间,平均每对引物组合扩增出14.1条和12.1条多态性条带。(2)根据SRAP扩增结果,利用UPGMA法进行聚类分析,33份材料的遗传相似系数在0.55~0.94之间,在遗传相似系数0.786处可将33个红掌品种分为5个类群。结果表明,供试品种遗传多样性丰富,本研究为品种鉴定和杂交育种提供了参考信息。    

10.  辣椒31个优良自交系的亲本类群分析  被引次数:2
   任羽  张银东  尹俊梅  王得元《遗传》,2008年第30卷第2期
   以包含我国重要尖椒品种的亲本材料在内的31份优良自交系为材料, 利用SRAP标记和基因型值分析技术开展了辣椒自交系间遗传差异的分析与类群划分研究。结果表明: 在30个引物组合中, 27个引物组合可以 在自交系间扩增出多态性条带, 共扩增出310个多态性条带, 平均每个引物组合产生11.5个多态性条带, 显示出SRAP技术具有较强的分析效率; 基于SRAP标记和Yule相似系数对这些自交系进行的聚类分析中, 可以基本区分辣椒的2个变种(C. annuum var. grossum和C. annuum var. longum), 而且可以反映出自交系间的亲缘及系谱关系; 在相似系数为0.67处, 可将这31个自交系分为4个类群; 基于基因型值和标准Euclidean距离对这些自交系进行的聚类分析可成功地将辣椒的两个变种完全区分; 在遗传距离约4.5处, 可将这31个自交系分为4个类群; 自交系间基于SRAP标记与基因型值的遗传距离存在一定的相关性。    

11.  棉花遗传多样性SCoT和SRAP标记的研究及比较分析  被引次数:1
   李正鹏  李廷春  樊洪泓  胡能兵  凌磊  林毅  蔡永萍《激光生物学报》,2011年第20卷第2期
   利用SCoT和SRAP两种分子标记技术对30份彩色棉与白色棉种质资源,进行遗传多样性研究。用29对SRAP引物组合和26个SCoT引物分别对供试棉花的基因组DNA进行扩增。SCoT引物共扩增出163条带,多态性比率为61.96%,遗传相似系数GS值变化范围为0.5405~0.9972。SRAP引物组合共扩增条带1067条,多态性比率仅为14.1%,遗传相似系数GS值变化范围为0.5415~0.9109。两种标记系统得到了相似但并不完全相同的聚类图,2种标记方法间存在显著相关性(r=0.5518,P<0.05)。结果表明,SRAP与SCoT标记均适用于棉花种质的遗传多样性分析,且SCoT的标记指数MI高于SRAP标记,为SCoT这种新兴的标记技术在棉花育种中的应用提供了重要的依据。    

12.  基于SRAP标记的山药种质资源遗传多样性分析  
   黄玉仙  黄姗  梁康迳  马红勃  雷伏贵  华树妹  许旭明《中国野生植物资源》,2011年第30卷第6期
   目的:研究我国山药种质资源遗传多样性,为合理利用资源和开展选育种工作提供理论依据。方法:以国内94份山药种质资源为材料,采用SRAP标记并通过NTSYS2.10软件进行SHAN聚类分析、PROJECTION主成分分析;利用POPGENE软件估算遗传多样性参数。结果:从49对SRAP引物中筛选出30对能产生稳定清晰可辨的扩增产物的引物,共扩增出754条DNA带,其中多态性条带616条,占总条带的81.7%。聚类结果表明:当遗传相似系数(GS)为0.822时,可将94份资源分为5类:第Ⅰ类20份、第Ⅱ类43份、第Ⅲ类7份、第Ⅳ类3份、第Ⅴ类21份。第Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅴ类分别为薯蓣、褐苞薯蓣、山薯和参薯。主成分分析结果显示:第一与第二主成分可解释88.34%(82.10%和6.24%)的遗传总变异。遗传多样性参数分析表明:比较5个遗传多样性参数值,5个群体的遗传多样性水平表现为Ⅰ>Ⅴ>Ⅲ>Ⅱ>Ⅳ,第Ⅰ类(薯蓣)遗传多样性水平高;山药遗传群体间遗传分化系数为51.88%,大部分差异存在于群体之间,群体间遗传分化高。结论:山药种质资源丰富且群体遗传分化高,有利于山药新品种的选育。SRAP标记可有效应用于山药种质资源的鉴别和遗传多样性分析。通过DNA指纹鉴定技术鉴别山药品种具有重要性与紧迫性。    

13.  利用SRAP标记分析海南旱稻地方品种的遗传多样性及其分子身份证的构建  被引次数:1
   姚宇飞  王英  庄南生  高和琼《生物技术通报》,2014年第11期
   利用SRAP标记对来自海南省的28份旱稻种质进行了亲缘关系分析。从255对引物组合中筛选出46对扩增条带清晰、多态性高的引物组合,并选用其中的18对引物组合对28份材料进行SRAP扩增,共扩增出180个条带,其中多态性条带160条,多态性比率为87.75%,平均每对引物组合产生10个条带和8.9个多态性条带。并且,运用UPMGA方法进行的聚类分析结果表明,供试旱稻种质的遗传相似系数范围为0.6870-0.9212,在遗传相似系数0.6870处分为两大类群,第I类群全部为海南山栏稻种质,第Ⅱ类群为海南地方旱稻坡压和本研究组自育旱稻品种。对海南旱稻地方品种的划分表明,山栏稻种质间亲缘关系较近,海南地方旱稻坡压可能与籼型水稻种质具有一定的遗传相似性。此外,还构建了28份海南省旱稻种质的SRAP标记分子身份证,可为山栏稻种质的遗传亲缘关系,种质鉴定及新品种选育等方面提供依据。    

14.  新疆石榴种质资源遗传多样性的SRAP分析  
   陈 芸  王继莲  丁晓丽  马刘峰《西北植物学报》,2016年第36卷第5期
   采用SRAP分子标记技术,对21份新疆石榴品种的遗传多样性与亲缘关系进行分析。从36对引物组合中筛选出16对扩增条带清晰、多态性高的引物组合分析供试材料,共检测出271个位点,其中194个为多态性位点,多态性比率达71.59% ,平均每对引物组合产生16.94个位点和12.13个多态性位点。21份石榴样品间的相似性系数为0.63~0.89,平均为0.77。UPGMA聚类结果显示,在相似性系数为0.776时,21份材料可被分为5个类群。新疆石榴品种间平均观察等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Neis基因多样性指数(H)及Shannons 信息指数(I)分别为1.712 2、1.352 8、0.199 9及0.310 5。研究表明,新疆喀什地区石榴品种的遗传多样性最为丰富;SRAP聚类结果与石榴的表型特征存在一致性,且SRAP分子标记技术是研究石榴遗传多样性简单而有效的手段。    

15.  SRAP体系中苔藓植物遗传多样性分析中的正交优化及初步应用  
   张安世  张为民  邢智峰  刘永英  辛泽华《广西植物》,2010年第30卷第3期
   以黄灰藓为材料,通过正交法优化SRAP-PCR反应条件,并在此基础上对11种苔藓植物进行遗传多样性分析。结果表明:苔藓植物SRAP反应(25μL体系)的最佳条件为:40 ng DNA模板,2.5 mmol/LMg~(2+),0.3 mmol/L dNTP,15 pmol引物,1.5 U Taq酶。用30对引物组合进行筛选,有5对引物组合扩增条带清晰,重复性好,共扩增出65条带,其中多态性条带63条,多态性比率为96.9%。通过SPSS11.5分析软件对扩增结果进行聚类分析,结果与形态学分类基本一致,说明SRAP技术可用于苔藓植物的遗传多样性研究。    

16.  草鱼种质相关SRAP及SCAR的分子标记  被引次数:5
   丁炜东  曹丽萍  曹哲明《动物学报》,2008年第54卷第3期
   采用相关序列扩增多态性(Sequence-realted Amplified Polymorphism, SRAP)技术分析野生草鱼和家养草鱼,筛选与草鱼种质退化相关的分子遗传标记.共进行88对引物组合的检测, 产生标记数目共计905个.依据标记在群体中出现的频率和变化规律,共筛选出2 1个可能与种质相关的特异性标记,对这些特异性标记进行测序并将测序结果进行BLAST分析 .发现测得片段中有8个片段在GenBank中找到同源性较高的序列,而其他片段与数据库中序列的相似性较低.根据序列信息分别设计了3对引物.用这3对引物分别对草鱼三个群体进行 PCR扩增,分别产生了SCAR1(308 bp)、SCAR2(66 bp)、SCAR3(114 bp)3个扩增带.采用大样本对这3个标记进行验证,发现其中SCAR1在家养群体中呈现阳性,在野生群体中为阴性,可区分出这两种群体.以SCAR3为引物在174条家养群体中得到目的片段,在26个家养群体没有扩增出条带,分布频率为87%;在100个野生群体中有6个个体检测到该条带,分布频率为6%.以SCAR2为引物在野生群体中完全扩增出目的条带,淡水中心群体中有7条扩增到条带,前洲群体中没有扩增出条带,标记在家养种群中的分布频率为96.50%.因此SCAR1可作为草鱼家养群体的一个重要的分子遗传特征指标,为进一步进行分子标记辅助育种奠定了基础 [动物学报 54(3):475-481,2008].    

17. 

萝卜品种指纹图谱SRAP与AFLP分析

 被引次数:1
   赵丽萍  柳李旺  龚义勤  王明霞  郁樊敏  汪隆植《植物研究》,2007年第27卷第6期
   应用SRAP与AFLP两种分子标记技术进行了萝卜品种鉴定分析。对萝卜基因组DNA的SRAP-PCR反应体系中引物、Mg2+、dNTPs浓度进行优化,确定最优体系为引物0.3 μmol·L-1,dNTP 0.2 mmol·L-1,Mg2+ 3.0 mmol·L-1。对SRAP-PCR中的退火温度(50℃)设置了12个梯度处理,以em2-me2为引物时带型无明显差异。7个供试萝卜材料的SRAP和AFLP指纹图谱分析表明,供试材料均可被SRAP和14个AFLP引物准确鉴定,每对引物组合都产生独特的指纹图谱。11个SRAP引物组合共产生155条带,多态性条带84条。聚类分析与相对遗传距离(GD)表明,供试材料聚为4类,CB-03-2与SHCB-02-1亲缘关系最近(GD=0.054 9);齐虹大连和Heiseng的亲缘关系最远(GD=0.203 4)。基于16个AFLP标记引物组合分析结果表明,供试材料聚为3类, CB-03-2和SHCB-02-1的亲缘关系最近。SRAP与AFLP综合分析结果表明,供试材料可聚为3类,其中CB-03-2与SHCB-02-1亲缘关系最近(GD=0.047 6)。    

18.  甘蓝型油菜温敏不育系417S育性遗传及RAPD分析  被引次数:1
   董军刚  刘创社  何蓓如《西北植物学报》,2008年第28卷第7期
   通过对新选育的甘蓝型油菜高温敏感生态型不育系417S与30份中外品种(系)进行测交、杂交和回交,研究其温敏不育性的遗传特点.结果表明:(1)30份品种(系)可不同程度的恢复417S的育性,其中24个品种(系)可完全恢复417S育性,占所配组合的80.0%;5个品种(系)可高度恢复417S的不育性,占所配组合的17.2%.(2)自然条件下同一组合正反交F2群体育性分离结果不同,人工控温条件下不同组合F2分离群体中可育与不育呈现15∶1分离,回交群体中出现3∶1分离,表明417S温敏不育性受细胞质和2对隐性重叠核基因共同控制.(3)以417S与1521C构成的回交一代群体为试材,采用分离群体分组分析法(BSA法)对回交一代群体构成的不育集团和可育集团筛选育性基因的RAPD标记,从247个供试引物中筛选出2个引物BA392(5′-AGTCACTCCC-3′)、S113(5′-GACGCCACAC-3′)在不育群体和可育群体间扩增出多态性产物.经进一步对F2分离群体的单株检测,引物BA392扩增出了得到重复验证和可靠的多态性扩增产物,其产生的特异条带BA392-400bp与417S温敏雄性不育的恢复基因连锁,遗传图距为6.0cM,可作为417S温敏不育恢复基因的连锁标记.    

19.  应用SRAP标记分析新疆地区主要杨属树种的遗传多样性  被引次数:5
   刘艳萍  郭志富  刘玉东  姜树坤  张丽《植物生理学通讯》,2008年第44卷第2期
   用30对SRAP引物对15个采集于新疆不同地区的杨属树种进行了遗传多样性分析,共扩增出881条具多态性的条带,平均多态性信息量为0.958,平均多态性比率为96.8%.通过聚类分析将15个杨树材料分为4个群.这一聚类结果与传统的分类基本上一致。这表明SRAP标记适用于研究杨属树种遗传多样性。    

20.  麻栎SRAP-PCR体系优化与遗传多样性分析  被引次数:2
   叶青雷  曾宪云《生物技术》,2009年第19卷第3期
   对麻栎基因组DNA的SRAP-PCR体系中dNTP、Taq酶、Mg2+、引物、模板DNA进行正 交试验优化,结果表明最佳反应体系为dNTP浓度为0.3 mmol*L-1,Taq酶1.5U, Mg 2+浓度为2mmol*L-1,引物浓度0.2ìmol*L-1,模板DNA 40ng(20ìL反 应体系).运用优化体系,从110对SRAP引物组合中,筛选出多态性较好的8对SRAP引物,对8 个不同地区麻栎进行SRAP标记分析.共检测到45个多态性位点,多态性条带百分比为51.72% .应用NTSYS-pc软件进行聚类分析(UPGMA),建立了麻栎亲缘关系树状图,表明SRAP可有效用于麻栎种质资源鉴定与遗传多样性分析.    

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