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相似文献
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1.
SRAP标记是基于选择性扩增开放性阅读框的新型分子标记,具有简便、高效、重复性好、高共显性等优点,在植物育种中已经得到广泛应用.本文介绍了SRAP标记基本原理和特点,对SRAP标记在遗传多样性研究、遗传连锁图谱构建、比较基因组以及分子标记辅助选择育种等方面的应用进行了综述.  相似文献   

2.
SRAP与TRAP标记及其在园艺植物研究中的应用   总被引:16,自引:1,他引:15  
SRAP与TRAP是最近发展的新型分子标记系统,具有简便、高效、重复性好等优点,已在园艺植物遗传育种和种质资源研究的各个方面得到广泛应用.本文介绍了SRAP和TRAP标记的原理、特点,综述了这两种新型分子标记在园艺植物遗传图谱构建、遗传多样性分析以及比较基因组学研究等方面的应用,并对其应用前景进行了展望.  相似文献   

3.
利用SRAP和SCoT两种分子标记相结合对中国22个番木瓜主要栽培品种(系)进行遗传多样性研究。SCoT标记检测获得的遗传多样性参数值和遗传相似系数范围均高于SRAP标记检测的结果,表明SCoT标记检测多态性的能力高于SRAP标记。基于两种标记数据合并后的UPGMA聚类结果显示,番木瓜种质间的遗传相似系数为0.65~0.90,种质间遗传多样性水平较低;在遗传相似系数为0.82时,将所有参试材料划分为3个类群。应用Mantel检测对SRAP和SCoT及两种标记合并进行相关性分析,表明三者之间具有显著的相关性,且相关性很高。聚类结果从分子水平反映出中国番木瓜主要栽培品种(系)的遗传基础狭窄。  相似文献   

4.
相关序列扩增多态性(SRAP)标记及其应用研究进展   总被引:1,自引:0,他引:1  
SRAP是一项基于PCR技术的分子标记技术,利用其独特的引物设计对基因组的开放阅读框(ORFs)进行特异扩增,利用个体以及物种的内含子、启动子和间隔序列的不同,产生基于内含子和外显子的SRAP多态性。阐述了SRAP的原理和流程,详细论述了SRAP标记目前在植物遗传多样性、作物品种鉴定、遗传图谱构建等方面的研究进展及应用前景。  相似文献   

5.
介绍了几种常用分子标记RAPD、AFLP、SSR、ISSR和SRAP的原理和特点,着重论述了分子标记在大黄属植物遗传多样性、亲缘关系和种质鉴定等方面的应用,分析了大黄种质资源研究中存在的问题和提出了今后研究工作的重点。  相似文献   

6.
RSAP、SSR和SRAP分析马铃薯遗传多样性的应用比较   总被引:1,自引:0,他引:1  
本研究分别利用RSAP、SSR和SRAP对15份马铃薯种质进行遗传多样性分析,比较3种分子标记的分析效力。结果表明,平均每对引物扩增出的多态性位点RSAP(5.75个)SSR(6.33个)SRAP(7.75个);RSAP+SSR+SRAP联合聚类的结果与SRAP和RSAP聚类结果基本一致,相关性分别达到极显著和显著水平,与SSR的聚类结果基本相似,呈显著相关性。在分析马铃薯遗传多样性中,SRAP标记的效果最优,SSR标记效果略优于RSAP标记。RSAP分子标记能较好地分析马铃薯的遗传多样性,而以RSAP+SSR+SRAP联合分析,则能更好地评估种质的遗传多样性和亲缘关系。  相似文献   

7.
棉花遗传多样性SCoT和SRAP标记的研究及比较分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
利用SCoT和SRAP两种分子标记技术对30份彩色棉与白色棉种质资源,进行遗传多样性研究。用29对SRAP引物组合和26个SCoT引物分别对供试棉花的基因组DNA进行扩增。SCoT引物共扩增出163条带,多态性比率为61.96%,遗传相似系数GS值变化范围为0.5405~0.9972。SRAP引物组合共扩增条带1067条,多态性比率仅为14.1%,遗传相似系数GS值变化范围为0.5415~0.9109。两种标记系统得到了相似但并不完全相同的聚类图,2种标记方法间存在显著相关性(r=0.5518,P<0.05)。结果表明,SRAP与SCoT标记均适用于棉花种质的遗传多样性分析,且SCoT的标记指数MI高于SRAP标记,为SCoT这种新兴的标记技术在棉花育种中的应用提供了重要的依据。  相似文献   

8.
SRAP分子标记在园林植物遗传育种中的应用   总被引:1,自引:0,他引:1  
相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记作为一种新型的分子标记技术,以其多态性高、稳定性高、重复性好、操作简便、效率高及成本低等优点,已经在园林植物中广泛应用.简单介绍SRAP标记的原理和特点,综述其目前在遗传多样性评析、亲缘关系分析、遗传图谱构建、种质资源鉴定及基因克隆与基因定位等方面的研究进展,并对该标记在园林植物的遗传育种的应用前景进行了展望.  相似文献   

9.
SRAP技术在遗传的研究进展   总被引:5,自引:0,他引:5  
SRAP是一种新型的DNA分子标记,具有简便、稳定、中等产率和容易得到选择条带序列的特点。SRAP利用独特的引物设计对开放读码框(ORFs)进行扩增,上游引物长17bp,对外显子进行特异扩增,下游引物长18bp,对内含子区域、启动子区域进行特异扩增,因个体不同及其物种的内含子、启动子与间隔长度不等而产生多态性。本文阐述SRAP的原理和操作流程,综述了SRAP标记目前在植物遗传图谱构建、遗传多样性、基因定位、基因克隆、杂种优势利用等方面的研究进展及应用前景。  相似文献   

10.
虎杖种质资源的分子标记研究   总被引:2,自引:0,他引:2  
本文应用RAPD、ISSR和SRAP标记对26份虎杖种质资源遗传多样性进行检测.在22个引物中有17个引物(77.3%)扩增产物具多态性,多态性水平相对较高.22个引物共得到98条扩增DNA片段,其中90.8%具有多态性.每个多态性引物平均可扩增出5.24个多态性片段.聚类分析表明,利用BAPD、ISSR和SRAP技术相结合可将全部供试材料区分开,26份材料在Gs值0.54水平上全部聚为一类,以所有材料间的平均遗传相似遗传系数0.71为阈值,将其分为11类.虎杖种质资源在分子水平上确实存在较大遗传差异,RAPD、ISSR和SRAP标记可作为构建虎杖DNA指纹图谱的有效工具.  相似文献   

11.
真菌与植物共生是一种非常普遍、复杂和重要的生物学现象。真菌与植物共生部位、共生类型和共生结构的多样性,以及参入共生的真菌和植物多样性奠定真菌与植物共生的生物学基础。真菌与植物首先通过分子"对话"的生化机制相互识别构建共生体,进而由真菌和植物双方生理机制调控共生体发育及其生理功能,以构建稳定有效的共生体。真菌与植物的空间、营养和功能生态位很多是相近的,双方均面临相同的生态选择压力,需要共同抵抗不良生境,以适应更多环境。因此,真菌和植物通过两者共生的生态学机制增强植物抗逆性,减轻有害生物危害,提高其竞争力和生境的适应能力。真菌和植物长期的协同演化过程中,种群间的基因交流及其差异导致不同的基因组合,奠定了共生体多样化的基础与资源。此遗传学机制形成的多种遗传组合的共生体不仅使真菌和植物在各环境压力下共存,还可以不断进化发展。真菌和植物共生研究方面已形成较为完善的体系,加强真菌与植物共生理论的研究,特别是该类共生体遗传背景、基因与环境互作效应及其机制的阐明,将有助于诠释真菌与植物共生的生物学机制。  相似文献   

12.
桂西南早熟荔枝实生资源遗传多样性的ISSR分析   总被引:2,自引:1,他引:1       下载免费PDF全文
利用ISSR标记技术对83份早熟荔枝(品种)单株遗传多样性进行分析。筛选出多态性高的10条IS-SR引物,共扩增出128条DNA条带,其中多态性带107条,多态性百分率为83.59%,表明桂西南早熟荔枝实生资源遗传多样性较丰富;用NTSYS软件计算出这83份材料的DICE相似系数在0.64~0.95之间,遗传亲缘关系较近;用UPGMA方法构建分子树状图,在相似系数0.75时,可将栽培品种与桂西南早熟实生单株区分开。各地区资源混杂聚类在一起,不能按地区单独聚类。  相似文献   

13.
康菊清 《植物学报》2016,51(5):659-666
对模式植物的研究不仅能揭示众多具有普遍规律的生物现象,而且能为其它植物物种,特别是与人类生活紧密相关的经济植物提供具有借鉴与参考意义的研究方法。QTL遗传作图是寻找那些影响不同地域植物自然变异等位基因的传统且有效的工作方法。对不同分化时长和不同遗传背景的植物种群,有针对性地开发特异的分子标记,一直是QTL遗传作图工作的重要内容。该研究利用二代测序技术得到的全基因组重测序结果,根据其中鉴定到的结构变异(SV)多态性设计引物,开发了针对分化时间短、多态性位点少的中国长江流域野生拟南芥(Arabidopsis thaliana)种群的QTL作图分子标记平台,得到了有效适用的结果,该方法不仅在模式植物拟南芥中适用,而且也适用于其它植物。  相似文献   

14.
食(药)用真菌在经济和生态方面都具有重要意义,其遗传多样性研究是资源可持续利用和生物保护学研究的基础,有利于食(药)用真菌种质资源的收集、保存、评价和利用,也有助于其分类学、系统学及进化等的研究。遗传多样性的研究方法很多,分子标记是目前最常用最有效的方法之一。综合分析了分子标记在食(药)用真菌遗传多样性研究中的应用,比较了各种标记的应用范围、优缺点,探讨了分子标记用于食(药)用真菌遗传多样性评价的前景及问题。  相似文献   

15.
相对于单个参考基因组仅聚焦于个体遗传信息的挖掘,泛基因组研究则能够反映整个物种或类群全部的遗传信息。随着基因组测序和分析技术的不断发展,泛基因组学逐渐成为新的研究热点,并已在植物、动物和微生物多个物种中获得了广泛应用,为全面解析物种或类群水平的遗传变异和多样性、功能基因组和系统进化重建等研究提供了强有力的工具,取得了很多显著的研究成果。尽管如此,由于泛基因组学研究尚处于发展阶段,测序费用和分析成本仍然较高,难以广泛普及; 且存在分析标准不一、数据挖掘不够全面深入、理论难以应用于生产实际等尚待解决的问题,仍有较大的发展空间。该文系统总结了泛基因组在生物遗传多样性挖掘和功能基因组学中的研究进展,主要包括其在泛基因组图谱的构建、基因组变异和有利基因的发掘、功能基因的多态性、群体遗传多样性和系统进化等多个领域中的应用和研究,探讨了其在不同领域的应用潜力。同时,讨论了目前泛基因组研究中存在的局限性和可能的解决方法,并对其将来的发展前景进行了展望。  相似文献   

16.
1ChromosomalkaryotypesofChinesefresh-waterfishesThevastresourcesofnaturalwaterbodiesinChinaharboravarietyoffishesthathaveevolvedthroughalonghistoryofdiversification.BaseontheestimationmadebyLi(1981),therearemorethan800speciesandsubspeciesoffresh-waterfishesinChina.Mostofthembelongto32familiesin13forms.Theremaining(about60)speciesaremigratoryfishes,be-longingto21familiesin9forms.Approximatelyhalfofallthefishesarethecyprinids--thelargestdistributioncomparingtoothergeographicregionsintheworld.…  相似文献   

17.
Thirty-five grape varieties were evaluated for their molecular diversities based on inter-primer binding site (iPBS) markers. Fifteen selected iPBS primers generated a total of 99 polymorphic DNA bands with 86.3% polymorphism. The effectiveness of iPBS marker is comparable to or even more efficient than other retrotransposon-based markers in grape. The differentiation between cultivated and wild grape varieties were clearly showed by both UPGMA cluster analysis and PCoA analysis revealing that Chinese cultivated and wild grape germplasm are highly divergent and possess abundant genetic diversities. This study also confirmed that the iPBS marker is a simple, informative, reproducible and suitable method for grape genetic diversity evaluation.  相似文献   

18.
Climate change is inducing changes in the phenological timings of organisms. Genetic diversity could influence phenological responses to climate change, but empirical evidence is very limited. We estimated the regional variation across Japan in flowering and leaf budburst dates of plants based on a dataset of phenological timings from 1953 to 2005. The observed plants' genetic diversities varied according to human cultivation. The within-species variations of phenological response to temperature as well as regional variations were less in the plant populations with lower genetic diversity. Thus, genetic diversity influences the variation in phenological responses of plant populations. Under increased temperatures, low variation in phenological responses may allow drastic changes in the phenology of plant populations with synchronized phenological timings. Our findings indicate that we should pay attention to maintaining genetic diversity of populations to alleviate changes in phenology due to future climate change.  相似文献   

19.
The relationships of plant and insect diversities in succession   总被引:11,自引:0,他引:11  
The basic features of an intensive study on the various stages of a secondary succession, from fallow Held to birch woodland, are described. The α-β diversities of the green plants, and two orders of insects, Hetcroptera and adult Coleoptera, are described. For the vegetation, in addition to taxonotnic diversity, structural diversity, with both spatial and architectural components, was recognized. It was found that up to a successional age of 16 months, the taxonomic diversities of plants and insects rose; thereafter the diversity of the plant species declined far more than the insect species diversity. It was concluded that in the later successional stages the maintenance of a high level of taxonomic diversity of these orders of insects is correlated with the rising structural diversity of the green plants, which virtually compensates for their falling taxonomic diversity. The larger fungi appear to show a similar trend to the insects.  相似文献   

20.
Bryophytes are a group of early land plants, whose specific ecophysiological and biological features, including poikilohydry, sensitivity to moderately high temperature and high dispersal ability, make them ideal candidates for investigating the impact of climate changes. Employing a combined approach of species distribution modelling (SDM) and molecular phylogeography in the temperate moss Homalothecium sericeum, we explore the significance of the Mediterranean refugia, contrasting the southern and northern refugia hypotheses, determine the extent to which recolonization of previously glaciated areas has been facilitated by the high dispersal ability of the species and make predictions on the extent to which it will be impacted by ongoing climate change. The Mediterranean areas exhibit the highest nucleotidic diversities and host a mixture of ancestral, endemic and more recently derived haplotypes. Extra‐Mediterranean areas exhibit low genetic diversities and Euro‐Siberian populations display a significant signal of expansion that is identified to be of Euro‐Siberian origin, pointing to the northern refugia hypothesis. The SDMs predict a global net increase in range size owing to ongoing climate change, but substantial range reductions in southern areas. Presence of a significant phylogeographical signal at different spatial scales suggests, however, that dispersal limitations might constitute, as opposed to the traditional view of spore‐producing plants as efficient dispersers, a constraint for migration. This casts doubts about the ability of the species to face the massive extinctions predicted in the southern areas, threatening their status of reservoir of genetic diversity.  相似文献   

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