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相似文献
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1.
利用聚合酶链式反应(PCR)进行的核酸体外扩增是1983年开始发展起来的一项革命性技术,目前已被广泛运用于现代化的农业和医学以及食品工业等领域,特别是在人类认知基因和基因组的过程中,体外核酸扩增技术做出了卓越的贡献。最初,体外核酸扩增技术主要是利用耐高温的DNA聚合酶(Taq酶),这样就使核酸的体外扩增反应可以在热循环中进行。但因需要使用昂贵的设备和消耗大量的电力,其成本和应用范围都受到一定的限制。之后,恒温体外核酸扩增悄然兴起,这改变了传统扩增技术的局限性,使核酸的体外扩增更加简单和方便。重组酶介导扩增(RAA)法是一种最新型的恒温体外核酸扩增技术,该系统的显著优点在于它在常温下就能实现DNA解链并快速扩增(15~30min完成),反应快速、专一性好、灵敏度高,还可用于定时定量的结果分析。  相似文献   

2.
用重组酶介导扩增技术快速扩增核酸   总被引:2,自引:0,他引:2  
体外核酸快速扩增技术是一种可使微量核酸在体外高效快速扩增的技术, 自问世以来, 被广泛应用于分子生物学、医学和法理鉴定等领域, 并被不断改进, 以使其功能和适应性更为广泛. 重组酶介导扩增法是在现有体外核酸扩增原理的基础上发展起来的恒温体外快速扩增核酸技术. RAA法利用重组酶、单链结合蛋白和DNA聚合酶代替了传统PCR的热循环解链过程, 实现了在37℃恒温下的核酸快速扩增, 无需特殊的辅助仪器, 对操作人员的要求也不高, 具备简单、节能、便携、快速等特点, 有望在不远的将来取代传统的热循环PCR反应.  相似文献   

3.
核酸恒温扩增技术研究进展   总被引:2,自引:0,他引:2  
核酸恒温扩增技术在生命科学研究及相关诸多领域已经得到了广泛应用。我们对核酸恒温扩增技术的最新进展作一简要综述,包括环介导恒温扩增、链替代扩增、依赖核酸序列的扩增、滚环扩增、切口酶核酸恒温扩增、依赖解旋酶的恒温扩增、转录依赖的扩增、杂交捕获法、转录介导的扩增等的原理、优缺点及应用。  相似文献   

4.
滚环扩增(rollingcircleamplification,RCA)技术是一种新的分子生物学检测方法。该方法不仅可以在体外等温条件下对核酸进行高度特异性的检测,而且还可通过线性或指数扩增来进行信号级联放大,其灵敏度能达到1个拷贝的核酸分子,因此,可用于痕量分子的检测。目前,滚环扩增技术广泛应用于全基因组DNA检测、核酸测序、单核苷酸多态性、DNA芯片及蛋白质芯片分析等领域。  相似文献   

5.
转基因植物核酸成分检测技术研究进展   总被引:6,自引:0,他引:6  
首先对转基因核酸成分检测的靶序列特征进行了阐述,对转基因植物核酸成分的定性、定量检测技术研究进展进行了综述,包括基于PCR的检测技术、基于等温核酸扩增的检测技术、基因芯片检测技术、基于高通量测序和新型转基因核酸检测技术(如生物传感器技术、毛细管电泳技术和纳米刻度技术等),重点介绍了各种检测技术的原理、特点、研究现状和发展动态,并对各种方法的优缺点进行了比较。  相似文献   

6.
连接酶链反应(LCR)是继PCR后新发展的一些较有前景的体外核酸扩增技术。四条寡核苷酸引物在耐热连接酶作用下通过变性、复性、连接完成核酸的体外扩增,可准确地检测靶基因上的单个或几个碱基的突变,在遗传性疾病、肿瘤和病原微生物的快速、准确检测上有着广泛的应用前景。本综述了该技术的原理、方法及近年来的初步应用。  相似文献   

7.
食源性病毒核酸恒温检测技术研究进展   总被引:3,自引:0,他引:3       下载免费PDF全文
食源性病毒已成为全球引发食品安全事件的重要病原,对新型检测技术的不断发展提出了严峻的挑战。早期PCR技术在病原检测领域中的应用,推动了对食源性病毒的全面认识。近年来核酸恒温检测技术发展迅速,包括环介导等温扩增技术、重组酶聚合酶扩增技术、核酸序列依赖性扩增技术、链置换扩增技术、滚环扩增技术等,在抗复杂基质干扰、装备要求低以及可现场实时检测等方面具有明显的技术优势,已成为食源性病毒检测领域的热点研究方向。因此,本文对近年来食源性病毒核酸恒温检测技术的原理、应用、优缺点等方面进行综述,并对未来发展方向进行了展望。  相似文献   

8.
NASBA(依赖核酸序列的扩增)及其在病毒检测中的应用   总被引:2,自引:0,他引:2  
NASBA(nucleic acid sequence based amplification)即依赖核酸序列的扩增技术,是一种扩增RNA的新技术,是由一对引物介导的、连续均一的、体外特异核苷酸序列等温扩增的酶促反应过程。反应在42℃进行,可以在2h左右将模板RNA扩增约109~12倍,不需特殊的仪器。NASBA已经广泛应用于细菌、病毒等多种病原微生物的检测,就NASBA的技术原理及其在病毒检测中的应用作一综述。  相似文献   

9.
核酸等温扩增技术是一种在恒温体系内对核酸进行高效扩增的分子扩增技术,它能够在短时间内实现目的基因的指数增长。微流控芯片(microfluidic chip)技术是把研究样品制备、核酸富集、纯化和检测等多个操作步骤集成到一块"微型化"的芯片上,经自动化处理,得出实验结果,即"样品进,结果出"。将核酸等温扩增技术与微流控芯片相结合,不仅可以实现核酸快速扩增,还可以降低对实验器材的依赖。在床边即时诊断、病原体快速筛查中具有广阔的应用前景。综合国内外相关研究报道,综述了各种等温扩增技术原理,以及基于微流控芯片的核酸等温扩增技术应用,展望了集成化微流控芯片的发展趋势和应用前景。  相似文献   

10.
在各种高致病性病原体、禽流感病毒、食源性微生物等引起的疾病随时大规模流行的背景下,利用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术对第一例或第一波病例的快速实验室诊断显得尤为重要,同时发展出多种以PCR技术为基础的检测技术以便更加快速、高通量、敏感地对疾病进行诊断、预防或预测。然而,在实际病原体检测中,常常出现灵敏度低、准确性差的结果。PCR增强剂是在PCR及PCR衍生技术中添加的一类物质,其可从产率、特异性、灵敏度等方面提高核酸扩增性能,从而优化核酸检测,解决病原体检测的应用瓶颈,为第一例病原体检出节约宝贵的时间。结合以PCR为基础的核酸体外扩增检测技术对PCR增强剂在其中的应用、优缺点、作用机理进行介绍,以期为病原体核酸检测的实际应用提供一些参考。  相似文献   

11.
针对SARS冠状病毒的分子生物学检测是控制SARS流行的关键环节。为评价全基因组扩增对SARS微量样本检测的影响 ,采用 6 mer随机引物反转录 ,用加接头的随机引物合成第二链 ,再以接头序列为引物扩增并掺入荧光标记 ,最后与带有 70 mer探针的基因芯片杂交。此非特异方法基本覆盖了样本中的全部DNA ,结果发现SARS冠状病毒全基因组的扩增效果对基因芯片杂交结果的均匀性有较大影响 ,PCR循环次数增多会导致扩增均匀性的降低。分析了不同的引物对全基因组扩增均匀性的影响 ,探讨了全基因组扩增策略的缺陷。  相似文献   

12.

Background

The polymerase chain reaction amplifies and quantifies small amounts of DNA. It is a cyclic process, during each cycle of which each strand of template DNA is copied with probability approaching one: the amount of DNA approximately doubles and this amount can be estimated fluorimetrically each cycle, producing a set of fluorescence values hereafter referred to as the amplification curve. Commonly the biological question of relevance is one of the ratio of DNA concentrations in two samples: a ratio that is deduced by comparing the two amplification curves, usually by way of a plot of fluorescence against cycle number. Central to this analysis is measuring the extent to which one amplification curve is shifted relative to the other, a measurement often accomplished by defining a threshold or quantification cycle, Cq, for each curve: the fractional cycle number at which fluorescence reaches some threshold or at which some other criterion (maximum slope, maximum rate of change of slope) is satisfied.We propose an alternative where position is measured relative to a reference curve; position equates to the cycle shift which maximizes the correlation between the reference and the observed fluorescence sequence. A key parameter of the reference curve is obtained by fixed-point convergence.

Results

We consider the analysis of dilution series constructed for the estimation of qPCR amplification efficiency. The estimate of amplification efficiency is based on the slope of the regression line when the Cq is plotted against the logarithm of dilution. We compare the approach to three commonly used methods for determining Cq; each is applied to publicly accessible calibration data sets, and to ten from our own laboratory. As in the established literature we judge their relative merits both from the standard deviation of the slope of the calibration curve, and from the variance in Cq for replicate fluorescence curves.

Conclusions

The approach does not require modification of experimental protocols, and can be applied retrospectively to existing data. We recommend that it be added to the methodological toolkit with which laboratories interpret their real-time PCR data.

Electronic supplementary material

The online version of this article (doi:10.1186/s12859-014-0372-4) contains supplementary material, which is available to authorized users.  相似文献   

13.
Summary In situ hybridization of ribosomal RNA withParacentrotus lividus ovaries suggests that ribosomal DNA undergoes amplification in the mononucleolate oocytes of this sea urchin.  相似文献   

14.
Summary In Drosophila melanogaster a partial loss of ribosomal genes leads to the bobbed phenotype. Magnification is a heritable increase in rDNA that may occur in males carrying a deleted X chromosome with a strong bobbed phenotype. The restriction patterns of X chromosome total rDNA, insertions and spacers from magnified bobbed strains were compared with those of the original bobbed mutations. It was found that magnification modifies restriction patterns and differentially affects gene types, increasing specific genes lacking insertions (INS-). Increases in copy number of genes with type I insertions are generally lower than the total number of INS- genes, while type II insertion genes are not perceptibly increased. The recovery of homogeneous progeny from a single premagnified male indicates that the magnification event might take place and become stable very early in the germ line, arguing against magnification being due to extrachromosomal amplification. Additionally, some gene types increase 3.5-fold while others are eliminated, indicating that they could not result from a single unequal cross-over. These results are in good agreement with the existence of partial clustering of rDNA genes according to type, and suggest that magnification could result from local amplification of genes.  相似文献   

15.
本文从两例临床确诊为乙型肝炎患者的2mg肝穿刺标本中利用基因扩增方法,设计扩增出缺失羧基端34个氨基酸的乙型肝炎病毒C抗原(HBcAg)基因的0.45kb基因片段,将此片段克隆入表达载体,导入大肠杆菌中表达,结果获得每毫升培养液含有100万酶联反应单位的HBgAg,也存在1万酶联反应单位的HBcAg。SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳显示,其表达产物占菌体总蛋白的30~37%,分子量为155kD。HBeAg基因结构及表达形式有待进一步研究和探讨。  相似文献   

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18.
目的从佳木斯大学健康学生体内分离出1株双歧杆菌。方法利用引物设计软件设计双歧杆菌的引物,通过PCR进行扩增,进行序列分析和鉴定。结果通过BLAST序列比对分析,与GenBank中相应基因同源性为99%。结论确定此菌株为青春双歧杆菌。  相似文献   

19.
扩增条件对茶类植物RAPD带的影响   总被引:15,自引:0,他引:15       下载免费PDF全文
采用梯度分析的方法试验了模板DNA、引物、镁离子、dNTP和Taq酶的浓度对茶类植物进行RAPD分析中DNA扩增结果的影响。实验表明这些条件的变化对扩增出来的RAPD带的数目和强弱会产生影响。经过比较分析,筛选出对于茶类植物进行RAPD分析较理想的扩增条件:2.0mmol/LMgCl2,200umol/LdNTP,15ng引物/20ul反应体积,4ng模板DNA/ul反应体积,1UTaq酶/20ul反应体积。  相似文献   

20.
孓遗植物桫椤RAPD分析中主要反应参数的影响   总被引:3,自引:0,他引:3  
李雪雁  王艇  苏应娟 《生态科学》2003,22(2):120-123
为得到桫椤RAPD扩增的最佳条件,对影响桫椤RAPD扩增的模板纯化方法、模板含量、酶浓度、Mg~(2+)浓度、dNTP浓度和引物浓度及扩增程序等多种因素进行了探讨。结果表明,用玻璃奶和蛋白酶K纯化后获得的DNA作为模板进行RAPD反应,其扩增带比用未纯化的和仅用无水乙醇再沉淀的DNA为模板更亮,更清晰,重复性更好;模板浓度、酶浓度、Mg~(2+)及dNIT浓度、引物浓度及退火温度这些因素都会对RAPD产生影响。经过本实验的探索,发现桫椤RAPD扩增的最佳体系是(2.5×10~(-2)mL反应体积):模板浓度为70ng,Mg~(2+)浓度为2.5mmol·L~(-1),dNTP为0.2mmol·L~(-1),引物3×10~(-4)mL;最佳扩增程序为:94℃200s,一个循环;94℃60s,36℃60s,72℃120s,40个循环:72℃600s,一个循环:4℃保存。  相似文献   

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