两种泥鳅中Sox基因的检出(英文)

性别决定基因ＳＲＹ都具有一个高度保守的基因序列──ＨＭＧ－ｂｏｘ,编码Ｓｏｘ蛋白,在胚胎发育过程中起重要作用。本文利用两种引物检测了泥鳅和大鳞副泥鳅的Ｓｏｘ基因。第一对引物特异扩增人类ＳＲＹ基因的保守区。在扩增泥鳅的基因组ＤＮＡ时可见长度分别为２００、５５０、９４０和１０００ｂｐ的四条扩增带。在大鳞副泥鳅中可以扩增出２００、５５０、９００ｂｐ三条带（Ｆｉｇ．１）。Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交表明２００和５５０ｂｐ两条带可以和ＳＲＹ基因探针杂交（Ｆｉｇ．２）。第二对引物是兼并引物,可以特异扩增Ｓｏｘ基因的ＨＭＧ－ｂｏｘ区域。以基因组ＤＮＡ为模板可以在大鳞副泥鳅中扩增出２２０、５５０、７００和１５００ｂｐ四条带（Ｆｉｇ．３）;而在泥鳅中则为２２０、５３０、５７０和１５００ｂｐ四条带（Ｆｉｇ．４）。ＰＣＲ产物的长度差异被认为是由于部分Ｓｏｘ基因的ＨＭＧ－ｂｏｘ区域中存在着内含子。没有发现性别特异扩增带。以上结果说明哺乳动物与性决定有关的组分在脊椎动物中是广泛存在的。但这些组分在鱼类中是否与性决定有关,或仅是哺乳动物性决定因子的进化前体尚不得而知。无论如何广泛深入研究鱼类的Ｓｏｘ基因对于揭示性决定系统和因子的进化方式是十分     

大鳞副泥鳅中Sox 9基因保守区的序列分析

应用特异于ＨＭＧ－ｂｏｘ区域的兼并引物,扩增了大鳞副泥鳅的Ｓｏｘ基因。在扩增产物中发现３条大小分别为２２０ｂｐ、５５０ｂｐ和１５００ｂｐ的扩增带。经克隆和ＤＮＡ序列分析,从片段５５０ｂｐ扩增带中得到一个新的基因片段,其可能编码的蛋白质氨基酸序列与人、鸡、小鼠的Ｓｏｘ９基因相似性最高,达到９４％;其与ＨＳＯＸ１０、ＭＳｏｘ１０、ＨＳＲＹ、ＭＳｒｙ的相似性分别为８７％、５５％、４０％和４７％。     

精子发生特异表达的SOX蛋白

ＳＯＸ蛋白是与ＳＲＹ相关的蛋白家族,它们的ＨＭＧｂｏｘ与Ｓｒｙ编码蛋白ＳＲＹ的ＨＭＧｂｏｘ不同程度的同源,通过ＨＭＧｂｏｘ结合于特定的ＤＮＡ序列上,使ＤＮＡ构象发生改变,或直接通过ＨＭＧｂｏｘ两侧的氨基酸序更调节靶基因转录活性,部分ＳＯＸ蛋白在精子发生中特异表达,并表现出与不同分化时期生精细胞盯关的转录形式和表达量的改变。     

马铃薯HMGR基因的克隆,序列分析及其表达特征

采用ＲＴ－ＰＣＲ技术,从马铃薯（Ｓｏｌａｎｕｍ ｔｕｂｅｒｏｓｕｍ Ｌ．）幼叶中克隆了一个约１．０ｋｂ的ｃＤＮＡ片段,序列分析结果表明,该ｃＤＮＡ与忆报道的马铃薯ＨＭＧＲ基因家族的三种类型基因具有较高核酸序列同源性,与ＨＭＧＲⅠ基因同源性为７７．０％,ＨＭＧＲⅡ基因为９３．２％,ＨＭＧＲⅢ基因为７７．１％。其中３’端非翻译区序列与ＨＭＧＲⅠ、ＨＭＧＲⅡ、ＨＭＧＲⅢ三种基因同源性分别为５０．２％,８     

具有内含子的大鳞副泥鳅Sox8基因(英文)

鱼类在脊椎动物系统进化过程中起着承先启后的作用,其性别决定具有原始性、多样性和可塑性。深入研究鱼类的性别决定和分化具有重大的理论意义。Ｓｏｘ基因家族是九十年代发现的一个新的基因家族,其中的许多成员都与性别决定和分化具有直接的关系。大鳞副泥鳅是一种常见的小型鱼类,属于鲤形目鳅科,是少数具有异形性染色体中的一种。本文根据已发表的Ｓｏｘ蛋白质的序列资料,选择在不同物种中保守程度最高的区段设计兼并引物。该组引物可以特异扩增 Ｓｏｘ基因的 ＨＭＧ盒区。以大鳞副泥鳅基因组 ＤＮＡ为模板,在扩增产物中有三条主带,其大小分别为２２０ｂｐ,５５０ｂｐ和１５００ｂｐ,另有一条相当弱的带,大小为７００ｂｐ（Ｆｉｇ．１）。雌雄个体中扩增结果一致。经克隆和ＤＮＡ序列分析,从５５０ｂｐ扩增带中得到一新的基因片段,长５００ｂｐ,编码５３个氨基酸;其余部分长３４０ｂｐ,可能为一内含子,且符合“ＧＴ…ＡＧ”规律（Ｆｉｇ．２）。其可能编码的蛋白质氨基酸序列与小鼠的 Ｓｏｘ８, ９, １０,ＳＲＹ基因的相似性分别为 ９６％, ９４％, ９０％和 ４７％;与人类 Ｓｏｘ ８, ９, １０, ＳＲＹ基因的相似性分别为６４％, ９４％, ５８％和４０％（Ｆｉｇ．３）。     

一个新的水稻MADS—box基因的克隆及表达分析

根据ＭＡＤＳ－ｂｏｘ基因保守区结构,设计简并性引物,利用３＇ＲＡＣＥ从水稻（Ｏｒｙｚａ ｓａｔｉｖａ Ｌ．）中克隆了１个新的水稻ＭＡＤＳ－ｂｏｘ基因的ｃＤＮＡ片段,同时利用５＆ＲＡＣＥ获得了全长ｃＤｎＡ命名为ＦＤＲＭＡＤＳＳ。序列分析表明,该ｃＤＮＡ全长１４０６ｂｐ,开放阅读框共编码２３３个到,具有典型的植物ＭＡＤＳ－ｂｏｘ基因的结构。推测的氨基酸序列与拟南芥的ＭＡＤＳ－ｂｏｘ基因,ＡＧＬ１４同     

两个猪瘟病毒野毒株gp55基因抗原编码序列的分析及比较

利用反转录－ＰＣＲ方法扩增了吉林省猪瘟病毒（ＨＣＶ）两个野毒株ｇｐ５５基因的主要保护性抗原编码区,并将其克隆到ＰＧＥＭ＿Ｔ载体中,然后用Ｓａｎｇｅｒ双地测定了其核苷酸序列,并推导了其氨基酸序徇。将测定的这两个ＨＣＶ野毒株的部分序更与国内外已知的ＨＣＶ序列进行比较,结果表明：这两个野毒株的核苷酸序理的同生为９４．９％,氨基酸序列同源性为９７．４％,与１９８５－１９９２年意大利中部分离４个野毒的同源性     

葡萄扇叶病毒外壳蛋白基因的克隆,序列分析及其在大肠杆菌中…

通过ＲＴ－ＰＣＲ方法把葡萄扇叶病毒（ＧＦＬＶ）外壳蛋白基因（ＣＰ ｇｅｎｅ）分成两部分扩增,扩增产物克隆入ｐｇＥＭ－５Ｚｆ（＋）载体,并通过ＢｇｌⅡ位点连接成一完整的外壳蛋白基因,通过序列分析测得全长外壳蛋白基因为１５１２ｂｐ,编码５０４个ＡＡ＇ｓ与国外株系ＧＦＬＶ－Ｆ１３相比,核苷酸同源性为８８．４％,氨基酸同源性为９５．８％。并且这一外壳蛋白基因在大肠杆菌Ｅ． ｃｏｌｉＤＨ－５α中得到了表达。     

小麦HMW-GS1Dx5基因的克隆及其特异性表达

显微切割了普通小麦钢８２－１２２（Ｔｒｉｔｉｃｕｍａｅｓｔｉｖｕｍ２ｎ＝４２）具有１Ｄｘ５＋１Ｄｙ１０亚基的１Ｄ染色体长臂端,利用ＰＣＲ扩增得到了ＨＭＷ－ＧＳ１Ｄｘ５亚基的５（端４００ｂｐ序列片段．以此作为探针从基因的组织特异性和特定发育阶段的表达两个方面研究了ＨＭＷ－ＧＳ１Ｄｘ５基因表达的规律．结果表明,干种子及萌发种子中存在此基因,而在发育的幼苗中此基因未表达．ＨＭＷ－ＧＳ１Ｄｘ５基因可能从开花初期开始表达．ＨＭＷ－ＧＳ１Ｄｘ５基因在籽粒成熟期表达,然而在营养器官如叶片中未表达,其表达存在组织特异性．ＨＭＷ－ＧＳ１Ｄｘ５基因在蜡熟期籽粒表达水平最高,其次是乳熟期籽粒．从开花１５ｄ至蜡熟期籽粒,表达趋于增加．开花１５ｄ其ｍＲＮＡ水平是蜡熟期籽粒ｍＲＮＡ的２８％,灌浆期为４０％、乳熟期为７２％、完熟期为５４％．这为进一步研究其表达调控和改善小麦品质打下基础     

黄瓜AGAMOUS同源基因的分离和表达(英文)

黄瓜花发育的早期均有雌蕊和雄蕊原基的分化,但在发育过程中,由于雌蕊或雄蕊的发育受到阻滞,导致雄花和雌花的形成。近年来在拟南芥和金鱼草等植物中遗传学的研究表明,花器官的特征是由同源异形基因决定的。在拟南芥中,由于ＡＧ在决定雄蕊和雌蕊特征方面起重要作用,本研究利用 ＲＴ－ＰＣＲ技术,从黄瓜的雌、雄蕊中分离出 ＡＧ的同源基因,并对其在花发育过程中的表达和可能作用进行了分析。首先,根据ＡＧ同源基因的保守区域设计５’简并引物５’－ＧＡ（Ａ／Ｇ）ＡＴ（Ｔ／Ｃ／Ａ）ＡＡ（Ｔ／Ｃ／Ａ）ＡＡ（Ｇ／Ａ）（Ａ／Ｃ）Ｇ（Ｇ／Ｔ／Ｃ）ＡＴＣＧＡ（Ｃ／Ａ）ＡＡＣ－３’,然后进行３’,ＲＡ ＣＥ ＰＣＲ,扩增出约１ｋｂ大小的片段,序列分析表明该片段含有非常保守的ＭＡＤＳ ｂｏｘ。进而,利用５’ ＲＡＣＥ ＰＣＲ得到全长度的ｃＤＮＡ。该ｃＤＮＡ的核苷酸序列与ＣＵＭ１（黄瓜 ＭＡＤＳ ｂｏｘ ｇｅｎｅ１）同源性高达９７％。 ＣＵＭ１在接牵牛中过量表达可引起花萼变为心皮状和花瓣变为雄蕊,说明ＣＵＭ１为ＡＧ的同源基因。基于该基因与ＣＵＭ１序列上的高度同源,我们认为其为黄瓜的ＡＧ同源基因。该基因命名为ＣＭＢ１,基因银行登记号为ＡＦ２８６６４９。Ｓｏｕｔｈｅｒ     

赤链蛇Sox基因的克隆及序列分析

参照人SRY基因HMG-box保守区的序列,设计一对兼并引物,采用PCR技术扩增了赤链蛇的Sox基因,并对扩增产物进行了克隆和测序,结果在雌雄个体中共筛选出三个Sox基因,其中有一个为雌雄共有,显示出性别差异性;三个Sox基因编码的氨基酸序列与人相应SOX3,SOX4,SOX22基因的相似性分别为96%,98%,96%。显示出Sox基因在进化上的高度保守性,本文为赤链蛇的性别决定机制研究提供了分子资料。     

水稻10kDa富硫醇溶蛋白基因家族中一个假基因拷贝的核苷酸序列分析

本研究以中花１０号水稻为材料,利用ＰＣＲ技术扩增并克隆１０ｋＤａ富硫醇溶蛋白基因的成熟肽编码区。对扩增产物的核苷酸序列分析表明：本扩增产物长３８０ｂｐ;与Ｍａｓｕｍｕｒａ等人［１］发表的序列相比,有９４．５％的同源性,与我们以前发表的中花１０号水稻１０ｋＤａ富硫醇溶蛋白基因的序列相比,有９９．５％的同源性。本扩增片段第１５０位与１５１位间的单碱基（Ｔ）插入导致了该片段编码区的移码突变,并在其后的第１６２至１６４位处形成了一琥珀终止子（ＴＡＧ）。这表明水稻１０ｋＤａ富硫酸蛋白基因家族中确实存在不正常的假基因拷贝。     

大肠杆菌ubiA基因的克隆及序列测定

以E.coli JM83染色体DNA为模板PCR扩增ubiA的结构基因,将PCR产物克隆于pUCm-T Vector,对PCR产物进行测序鉴定。与已发表的大肠杆菌ubiA基因序列比较,同源性达99％。     

鳄龟科和平胸龟科线粒体控制区序列分析和结构比较

本文参照龟类近缘种的线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)控制区(control region,CR)及邻接序列,设计了二对特异引物,采用PCR和测序技术,获得了大鳄龟(Macroclemys temminckii)、小鳄龟(Chelydra serpentina)和平胸龟(Platysternon megacephalum)mtDNA CR区序列,其长度分别为1062bp、1124bp和1119bp;A T的含量分别为68.93%、69.34%和69.44%。序列分析显示,三种龟CR区3'末端均存在丰富的微卫星序列,其中大鳄龟和小鳄龟各有一段2bp的TA序列分别重复20和15次;小鳄龟另有一段5bp的TATAT序列重复13次;平胸龟则是一段10bp的AGTATGTTAT序列重复4次和一段17bp的GTTGTTATATAACATAT序列重复13次。本文还结合GenBank中已发表的其他6种龟鳖类动物的控制区序列,探讨了龟鳖类动物微卫星序列的类型及分布,结果表明:9种龟鳖类动物都存在丰富的微卫星序列,且微卫星所在位置及序列存在很大差异。     

牛SRY同源基因的PCR扩增和克隆

本文采用人SRY基因的一对引物,通过PCR扩增获得了雄性牛(Bos taurus)SRY同源基因片段。进一步证实牛存在与人SRY基因同源的相应基因。将PCR产物与载体pUC—Eco—T连接后,用以转化JM109菌,经过与人SRY基因探针菌落杂交,筛选获得了牛SRY同源基因克隆pBosY O.6后者的插入片段为相应于人SRY基因保守区在内的一段约609bp DNA。此外还比较分析了人和牛SRY同源基因片段限制酶图谱。     

Isolation and identification by sequence homology of a putative cytosine methyltransferase from Arabidopsis thaliana.

A plant cytosine methyltransferase cDNA was isolated using degenerate oligonucleotides, based on homology between prokaryote and mouse methyltransferases, and PCR to amplify a short fragment of a methyltransferase gene. A fragment of the predicted size was amplified from genomic DNA from Arabidopsis thaliana. Overlapping cDNA clones, some with homology to the PCR amplified fragment, were identified and sequenced. The assembled nucleic acid sequence is 4720 bp and encodes a protein of 1534 amino acids which has significant homology to prokaryote and mammalian cytosine methyltransferases. Like mammalian methylases, this enzyme has a C terminal methyltransferase domain linked to a second larger domain. The Arabidopsis methylase has eight of the ten conserved sequence motifs found in prokaryote cytosine-5 methyltransferases and shows 50% homology to the murine enzyme in the methyltransferase domain. The amino terminal domain is only 24% homologous to the murine enzyme and lacks the zinc binding region that has been found in methyltransferases from both mouse and man. In contrast to mouse where a single methyltransferase gene has been identified, a small multigene family with homology to the region amplified in PCR has been identified in Arabidopsis thaliana.     

大熊猫SRY基因的PCR扩增和克隆

本文采用人ＳＲＹ基因的一对引物,通过ＰＣＲ扩增获得了雄性大熊猫ＳＲＹ基因片段。表明大熊猫存在与人ＳＲＹ基因同源的相应基因,将ＰＣＲ产物与载体ｐＵＣ－Ｅｃｏ－Ｔ连接后,用以转化ＪＭ１０９菌,经过与人ＳＲＹ基因探针菌落杂交筛选获得了大熊猫ＳＲＹ苈在克隆,命名为ｐＡＭＹ０．６,其插入片段为相应于人ＳＲＹ基因保守区在内的一段约６０９ｂｐＤＮＡ。此外,还制作和比较分析了人和大熊猫基因片段的限制酶图谱。     

水牛SRY基因的克隆及序列分析

根据荷斯坦牛SRY基因设计一对引物,采用聚合酶链式反应（PCR）技术,以中国沼泽型水牛（Swamp Buffalo）基因组DNA为模板,扩增得到SRY（Sex Deterimation region of Y chromosome）全序列约2005bp,其中1-504bp为5’启动子区,1196-2005bp为3’侧翼序列,在505-1195bp为SRY的外显子,编码229个氨基酸。在SRY HMG box区域设计探针,用地高辛标记后分别与雄性、雌性水牛基因组DNA进行Southern 杂交,结果显示该段序列只在雄性DNA样本中有杂交信号,证明SRY基因为雄性特异。BLAST比对结果显示与牛属动物SRY基因的同源性为96％,其中SRY基因HMG box区域同源性高达99%,说明SRY基因具有高度的进化保守性     

鼠伤寒沙门菌spvBC基因编辑株的构建

利用λRed重组系统和pBAD原核表达载体构建鼠伤寒沙门菌spvBC质粒毒力基因修饰菌株,为深入探究沙门菌毒力基因spv的功能和致病机制及宿主抗感染免疫提供工具菌。以pKD4为模板,PCR扩增含spvBC同源臂的卡那霉素抗性基因以构建同源打靶片段,再将其电转入含有质粒pKD46的鼠伤寒沙门菌中进行同源重组,随后将质粒pCP20电转导入阳性转化子,消除卡那霉素抗性基因,PCR鉴定敲除株的构建。PCR扩增含酶切位点的spvBC基因片段,扩增产物与原核表达载体pBAD/gⅢ分别双酶切后连接构建pBAD-spvBC重组质粒,PCR筛选阳性菌落并测序鉴定。将构建成功的pBAD-spvBC重组质粒电转导入spvBC敲除株中,Western blot测定不同浓度L-阿拉伯糖诱导SpvB和SpvC蛋白表达情况。PCR结果表明鼠伤寒沙门菌spvBC基因敲除成功;PCR及测序结果表明pBAD-spvBC重组质粒构建成功,Western blot结果表明13 mmol/L L-阿拉伯糖可诱导SpvB和SpvC蛋白正常表达。λRed重组系统可用于沙门菌质粒上大片段基因的敲除,pBAD原核表达载体可用于沙门菌质粒上大片段基因的回补,丰富了细菌质粒的基因修饰和编辑策略。