美国公布癌症基因图谱绘制计划

美国政府近日公布了一项癌症基因图谱绘制计划,旨在找到所有致癌基因的微小变异,从而为治疗各类癌症开创新天地。     

研发动态

我国绘成转基因木瓜全基因组图谱;我国加入绘制癌症基因图谱计划;我国第一个杀蚊微生物全基因组测序完成;天津转基因育种取得重大进展;我国启动超级玉米研究     

人基因差别图谱

研究者早已知道,某些复杂的疾病,诸如癌症、心脏病,所含有的基因组成成分严重影响着疾病的发作、进展以及治疗反应.但是由于这些疾病涉及许多不同的基因的相互作用,以及基因与人的环境因子的相互作用,故而了解这些基因元件是很困难的.新的完整基因图谱测绘出人与人之间存在的小的基因差别.该基因图谱成为强有力的工具,来测定为何有些人会得某些疾病,甚至可以设计出常规的治疗方法.每个人的DNA都由A、T、G、C为碱基的无数核苷酸组成的.在所有人中,这些序列大多数是相同的,但是人与人之间有0·1%的差别,这种差别可能影响个人的疾病的危险率…     

轮状病毒RNA基因图谱变异分析

用聚丙烯酰胺凝胶电泳法对轮状病毒(RV)标准株进行RNA基因图谱分析,发现人轮状病毒(HRV)Wa株在MA104细胞上连续传5代后,其RNA基因图谱由原来的4:2:3:2模式变为4:3:3:2模式。继续分别在CV-1、MA104细胞上传代后,基因图谱进一步演变为4:3:4:2模式。经比较电泳、病毒空斑纯化,初步证实RVWa有变异林存在。目前尚未见RV标准株变异的报告,有待进一步研究。同时对多个RV标准株及1939年南京市区婴幼儿秋季腹泻的RV流行株进行基因图谱分析,发现不同的人RV及牛RV标准株有相同的基因图谱;不同实验室来源的同一标准株有不同的基因图谱。此外,尚证实HRV是1989年南京市区婴幼儿秋季腹泻的主要病源,总检出率45.1％,电泳长型为流行优势株89.2％。本文尚对RV RNA基因图谱变异的原因及意义进行了讨论。     

ISAAA信息.

运用RNAI技术抵抗水稻东格鲁病毒;Monsanto发布大豆胞囊线虫基因图谱;可选择性清除的转基因水稻;抗夜蛾的转基因西红柿     

很有希望的植物基因图谱

去年十二月,Sumitomo 公司从农林渔业部得到了一个关于购买一个玉米和番茄育种标记基因盒的订货,该部计划以1987年的补充预算购买。已经交付的订货阶值大大超过2亿日元,包括170个片段的玉米 DNA 探针和110个片段的番茄 DNA 探针以及它们的基因图谱。基因图谱是英国天然植物股分有限公司(NPI)最有希望的新技术之一,Sumitomo 是日本的独家代理人,建于六年以前。通过使用限制性片段长度多形(RFLP)分析,基因图谱可以帮助科学家鉴定出控制颜色、大小、味道和其它特征的植物基因的精确位置。基因图谱可以使种植者在新的杂交种成熟以前很快地确定基因是否保留在上面,可以使     

微卫星DNA标记技术及其在昆虫学上的应用

综述微卫星DNA标记技术在昆虫特定基因定位、种群遗传结构及分化、近缘物种的区分、昆虫生态特性的系统进化以及微卫星基因图谱的绘制等领域中的应用。     

科学家解码5300年冰尸

据《每日电讯报》报道,科学家近日提取出世界上最古老的木乃伊“冰人奥兹”的DNA,并对其进行解码。科学家希望通过现代科学技术找到“冰人奥兹”的后代并分析人类基因图谱的变化。     

研发动态

中英美宣布启动国际“千人基因组计划”;第四军医大学研发新型胃癌靶向纳米疫苗;美国绘出世界上首个合成生命基因图谱;美国能源部发布大豆基因组促进全球生物能源研究;美国确认影响血液胆固醇含量的基因;     

多基因模型在肝细胞癌预后中的应用

利用较少分子信息预测肝细胞癌类型对患者的个性化治疗十分关键。探索已知的与肝细胞癌预后相关的信号通路,共发现41个关键基因。随后,运用机器学习的方法对其构建风险预测模型,并在4个肝细胞癌数据集上进行验证。结果显示,该模型能将肝细胞癌患者分成两个预后差异显著的类型:癌症基因图谱(The cancer genome atlas,TCGA)数据集交叉验证的平均log rank P值为0.03;其他测试数据集的log rank P 值分别为0.000 38、0.002 1和0.01。生物信息学分析显示肝细胞癌的预后与细胞周期等信号通路显著相关,并筛选出12个潜在的肝细胞癌分子标志物。研究结果表明,基于41个基因构建的肝细胞癌预后模型具有较好的稳健性和准确的风险预测能力。     

研发动态

我国完成大熊猫基因组序列图谱,我国完成世界首例转基因克隆免实验,我国诞生世界首例带有抗猪瘟病毒基因的克隆猪,2008诺贝尔生理或医学奖颁布,科学家绘制出首幅小麦基因组物理图谱,澳大利亚首次批准克隆人体胚胎,美国科学家成功绘制出完整肿瘤基因图谱。     

PCR-SSCP技术的研究及应用进展

阐述了SSCP技术的建立与发展过程;概述了PCR-SSCP技术的原理、方法、优缺点及突变技术研究进展;总结了PCR-SSCP技术在多个领域中(动物育种、基因突变、基因诊断、基因图谱和连锁分析等)的应用情况;分析了PCR-SSCP技术在分子生物学研究领域中的作用。     

硫氧还蛋白-1减弱脂连蛋白对小鼠移植性肝癌生长的抑制作用

硫氧还蛋白-1 (thioredoxin 1, Trx1)是机体氧化还原调控的重要蛋白质。脂连蛋白(adiponectin, APN)是一种由脂肪组织分泌的细胞因子。二者在癌症特别是肝癌的发展中具有重要调控作用,但其在调控肝癌的进程中是否存在相关性,且改变这种相关性是否直接影响肝癌的发生发展,目前尚未见报道。本文通过分析癌症和肿瘤基因图谱 (The Cancer Genome Atlas, TCGA) 数据库中大量肝癌患者组织样本数据后,首次发现Trx1与APN在肝癌的进程中存在显著负相关表达。在荷瘤鼠中分别过量表达Trx1、APN和Trx1,采用Western 印迹、免疫组织化学染色及TUNEL等方法检测发现,过量表达的Trx1,缓解了APN引起的瘤内Trx1蛋白水平下降,减弱APN对肿瘤的抑制作用,同时增加Ki67阳性细胞数目,减少细胞凋亡和p-JNK阳性细胞数目。上述结果表明,改变Trx1与APN的负相关性后,APN对肝癌细胞成瘤的抑制作用明显减弱。提示在抑制肝癌细胞生长及肝癌治疗的过程中,调控Trx1及APN的相关性可能起到十分重要的作用,这为临床肝癌的治疗提供更为全面有效的理论机制。     

国家卫生署(NIH)的人类DNA探针资源库和资料库:美国标准培养物保藏中心(ATCC)对人类遗传学的新作用

在人类遗传疾病诊断和人类基因图谱中的酶切片段长度多态性(RELP_s,restriction fragmentlength polymerphisas) 重组DNA技术为人类遗传学提供新的机会。应用直接基因探针、寡核苷酸探针以及酶切片段长度多态性(RELP_s),推进了遗传疾病的出生前诊断和人类基因组的图谱分析。     

微卫星DNA的多态性及其应用

微卫星DNA是广泛存在于各种真核生物基因组中的短串联重复序列,具有突变速率快、多态性高等特点,本分析了微卫星的多态性及其形成机制,并简要介绍其在亲缘关系鉴定、种群遗传结构分析、基因图谱以及基因诊断等方面的应用。     

基因组测序新方案

人类基因组计划（ＨＧＰ）也许是本世纪末、下世纪初的最为宏伟及具有深远影响的分子生物学工程。该计划的主要目的是获得人类２４条不同染色体的物理图谱和基因图谱,以及核苷酸全序列。这项计划最初由美国国立卫生研究院（ＮＩＨ）和能源部于１９９０年发起,现已有中国...     

根据人遗传病的胎儿诊断制订人的基因图谱法的计划

马萨诸塞州列克星敦市的合作研究公司,最近发表了为进行已知人遗传病胎儿期诊断的人的全基因图谱法计划。 为此,在5年期间共投资研究经费4500万美元,其中伊里诺斯州埃文斯顿市的美国医院供给公司投资20％。在诊断方法的试验阶段,该公司签订了诊断试验销售合同。     

利用人工智能预测癌症的易感性、复发性和生存期

癌症具有较高的发病率和致死率,对人类健康具有重大威胁。癌症预后分析可以有效避免过度治疗及医疗资源的浪费,为医务人员及家属进行医疗决策提供科学依据,已成为癌症研究的必要条件。随着近年来人工智能技术的迅速发展,对癌症患者的预后情况进行自动化分析成为可能。此外,随着医疗信息化的发展,智慧医疗的理念受到广泛关注。癌症患者作为智慧医疗的重要组成部分,对其进行有效的智能预后分析十分必要。本文综述现有基于机器学习的癌症预后方法。首先,对机器学习与癌症预后进行概述,介绍癌症预后及相关的机器学习方法,分析机器学习在癌症预后中的应用;然后,对基于机器学习的癌症预后方法进行归纳,包括癌症易感性预测、癌症复发性预测、癌症生存期预测,梳理了它们的研究现状、涉及到的癌症类型与数据集、用到的机器学习方法及预后性能、特点、优势与不足;最后,对癌症预后方法进行总结与展望。     

美启动烟草基因组测序计划

AgBiotechReporter 2 0 0 3年 2 0卷 1期 10页报道 :据悉 ,美国PhilipMorris公司已同意给北卡罗来纳州立大学拨款 17.6百万美元 ,用于绘制烟草基因图谱。北卡罗来纳州立大学的农业和生命科学学院在得到这笔款项后 ,将用 4年半的时间来完成烟草基因组测序的创新计划。北卡罗来纳     

癌症相关microRNA与靶基因的生物信息学分析

MicroRNAs(miRNAs)是一类长度约为22nt的内源性非编码RNA,通过与靶基因转录本互补结合调控基因的表达。近年来,研究发现miRNA与癌症发生密切相关,miRNA可以直接充当癌基因或者抑癌基因而影响肿瘤的发生和生长。为更进一步揭示癌症相关miRNA的特征及靶基因的功能,文章通过数据库搜索及文献检索,在人类基因组中发现了475个癌症相关miRNA,系统地比较了癌症相关miRNA与非癌症miRNA以及基因内和基因间区癌症相关miRNA在保守性、SNP位点分布、癌谱及转录调控等特性。研究发现,癌症相关miRNA比非癌症miRNA保守性要强,发生SNP概率比较低,同时发现miRNA所涉及癌症数目与保守性成正相关。基因组定位分析发现,癌症相关miRNA比非癌症miRNA更倾向于成簇存在。进一步对宿主基因、癌症相关miRNA及作用的靶基因与癌症发生进行关联分析,发现一些非癌症miRNA的宿主基因倾向于被癌症miRNA作用。本研究结果为深入理解miRNA与癌症之间的关系,以及进一步为miRNA作为癌症诊断指示物提供理论依据。