长链非编码RNA HIT在肝癌中的表达及意义

目的:探讨长链非编码RNA HIT(lncRNA-HIT)在原发性肝癌中的表达及其与患者临床病理特征的相关性,寻找肝癌治疗的新靶点。方法:收集并筛选2015年1月至2018年1月在空军军医大学第一附属医院行手术治疗的80例经病理证实的肝细胞癌患者的肝癌组织和癌旁组织。采用实时定量聚合酶连反应(q RT-PCR)法检测患者手术切除的肝癌组织及相应的癌旁组织中lncRNA-HIT的表达,并分析HIT与患者临床病理参数之间的关系。结果:原发性肝癌组织中lncRNA-HIT的表达(6.17±4.38)明显高于癌旁组织(2.81±2.58),约为癌旁组织的2.20倍(P0.05),肝癌组织中HIT的表达与肝癌TNM分期、肿瘤大小和数量显著相关(P0.05),而与性别、年龄、肝硬化、HBV、AFP无显著相关性(P0.05)。结论:lncRNA-HIT在肝癌组织中呈高表达,可能在肝癌发生发展过程起重要作用,并可能作为肝癌治疗的新靶点。     

长链非编码RNA PVT1在肝癌组织中的表达与临床意义

目的:探讨长链非编码RNA PVT1 (lncRNA-PVT1)在肝癌组织中的表达以及在肝癌诊治中的临床意义。方法:采用qRT-PCR法检测肝癌组织和癌旁肝组织中lncRNA-PVT1的表达情况,通过x2检验分析lncRNA-PVT1的表达水平与肝癌患者临床病理指标之间的相关性,采用Kaplan-Meier法绘制患者术后生存曲线,Log-rank检验比较生存率的差异,单因素和多因素分析评估影响肝癌患者预后的独立危险因素。结果:肝癌组织中lncRNA-PVT1的表达水平显著高于癌旁肝组织(P0.05)。肝癌组织lncRNA-PVT1的表达水平与其Edmondson分级、TNM分期、分化程度和是否发生血管转移具有显著相关性(P0.05),而与患者的年龄、性别、血AFP水平、肿瘤直径、肿瘤数目以及是否有肝炎病史无关(P0.05)。lncRNA-PVT1高表达组患者的术后生存率明显低于lncRNA-PVT1低表达组患者,高表达水平的lncRNA-PVT1、Edmondson分级、TNM分期、分化程度和是否发生血管转移均是影响肝癌患者预后的独立危险因素。结论:lncRNA-PVT1在肝癌组织中呈高表达,高表达水平的lncRNA-PVT1与肝癌患者的临床预后不良密切相关,有望成为今后肝癌治疗的新靶点。     

与眼部疾病相关的长链非编码RNA的研究进展

长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)是一类长度大于200个核苷酸不具备编码蛋白质功能的转录子,在表观遗传、转录或转录后水平调节基因的表达,维持细胞稳态。研究表明多种LncRNA的表达失衡在肿瘤细胞的增殖、转移、干细胞的全能性、免疫细胞的发育及应答过程中发挥重要。新近的研究显示许多LncRNAs特异表达与眼部疾病发生密切相关。本文主要对目前报道的与眼部常见疾病如翼状胬肉、白内障、青光眼、糖尿病视网膜病变、眼部肿瘤等差异表达LncRNAs的功能和作用机制进行了综述,以期为LncRNAs作为眼部疾病的生物学标记和潜在治疗靶点的的应用提供参考资料。     

与眼部疾病相关的长链非编码RNA的研究进展

长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)是一类长度大于200个核苷酸不具备编码蛋白质功能的转录子,在表观遗传、转录或转录后水平调节基因的表达,维持细胞稳态。研究表明多种LncRNA的表达失衡在肿瘤细胞的增殖、转移、干细胞的全能性、免疫细胞的发育及应答过程中发挥重要。新近的研究显示许多LncRNAs特异表达与眼部疾病发生密切相关。本文主要对目前报道的与眼部常见疾病如翼状胬肉、白内障、青光眼、糖尿病视网膜病变、眼部肿瘤等差异表达LncRNAs的功能和作用机制进行了综述,以期为LncRNAs作为眼部疾病的生物学标记和潜在治疗靶点的的应用提供参考资料。     

长链非编码RNA HULC与消化系统肿瘤的相关性研究及作用机制*

随着全基因组测序技术的快速发展,越来越多的长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)分子被发现,逐渐成为新的研究热点。LncRNA HULC(highly up-regulated in liver cancer)是一种在肝癌中呈异常上调表达的长链非编码RNA,并参与调控了肝癌细胞增殖、抗凋亡、侵袭及上皮间质化等诸多肿瘤恶性生物学行为。随着研究的不断深入,发现HULC于其他消化系统肿瘤(胃癌、胰腺癌、结肠癌等)中同样呈现上调表达,可通过不同作用机制调控肿瘤的发生发展,并有望成为新型肿瘤诊断标志物和精准分子治疗的靶点。本文就近年来LncRNA HULC与消化系统肿瘤的相关性研究及其作用机制进行综述。     

综述: 长链非编码RNA对动脉粥样硬化等疾病影响的研究新进展

动脉粥样硬化是一种以胆固醇等脂质代谢紊乱为主要特征的病理过程,严重影响人类健康．随着遗传学和生物信息学研究的发展,曾被认为无作用的非编码基因序列逐步受到研究者的关注．长链非编码RNA(lncRNA)通过表观遗传调控、转录调控和转录后调控等途径参与剂量补偿效应、基因组印记、细胞发育分化等重要生物学过程,从而影响人类的生长发育、代谢、衰老及疾病等进程．最新研究发现,lncRNA可参与血管内皮细胞的损伤与修复、血管平滑肌细胞的增殖与迁移、巨噬细胞胆固醇的流出与炎症反应、脂质的沉积与斑块的形成等过程,从而影响动脉粥样硬化及其他心血管疾病的发生与发展．     

长链非编码RNA HOXA11-AS在胶质瘤中的表达及其临床意义的研究

目的:探讨长链非编码RNA HOXA11-AS在胶质瘤组织中的表达以及与胶质瘤患者临床预后的相关性。方法:首先,应用RT-PCR法检测人胶质瘤组织以及正常脑组织中HOXA11-AS的表达情况;其次,分析HOXA11-AS的表达水平与胶质瘤患者临床病理学特征之间的关系;最后,探讨HOXA11-AS的表达水平与胶质瘤患者预后之间的相关性。结果:RT-PCR显示,较之于正常脑组织(1.00±0.17),HOXA11-AS在胶质瘤组织(3.89±0.34)中的表达水平显著升高(P0.001),且随着肿瘤学分级的增高,HOXA11-AS的表达水平也随着升高(Grade Ⅰ-Ⅱ, 2.96±0.21 vs. Grade Ⅲ-Ⅳ, 4.83±0.50, p=0.003)。x~2检验提示HOXA11-AS表达水平与胶质瘤患者的肿瘤学分级、KPS评分以及患者的复发情况具有显著相关性,而与患者的年龄、性别、肿瘤大小等无相关性。Kaplan-Meier分析患者生存率,结果显示,HOXA11-AS低表达组患者的生存率明显高于HOXA11-AS高表达组患者,差异具有统计学意义(P0.001)。最后,我们的研究结果发现,HOXA11-AS的高表达水平、肿瘤学分级的增高、KPS评分80分均为影响胶质瘤患者预后的独立危险因素(P0.05)。结论:HOXA11-AS与胶质瘤患者预后密切相关,且为预测患者预后的独立因素。     

长链非编码RNAs与妇科肿瘤

长链非编码RNAs(long non-codiong RNAs,lncRNAs)是具有原始或是剪切转录本功能的RNA,并不符合小分子RNAs和结构RNAs的已知定义。它们分别在宫颈癌、卵巢癌、子宫内膜癌、乳腺癌等妇科肿瘤中出现异常表达的现象,使其有希望成为未来妇科肿瘤的新型标志物和治疗靶点,但其作用机制有待于进一步探索。     

长链非编码RNA UCA1与肿瘤耐药

作为针对恶性肿瘤的有效治疗方式,化疗已被广泛用于治疗各种恶性肿瘤。虽然化学治疗提高了患者的存活率及预后水平,但肿瘤迅速形成的多药耐药会导致治疗失败。近年发现,作为促多药耐药基因的lncRNA UCA1介导多种肿瘤形成耐药。该文回顾了UCA1在肿瘤耐药中的研究进展,并展望了该领域未来的发展及面临的挑战。     

长非编码RNA在基因调控和肿瘤形成中的作用

哺乳动物中,只有小部分基因转录成为编码蛋白质的RNA,大量的基因则转录为不能编码蛋白质的RNA,即ncRNA。长非编码RNA(lncRNAs)是分子长度在200-100000 nt 之间的一类ncRNA。lncRNAs 的数量超过蛋白质编码基因的数量。目前,对长非编码RNA(lncRNAs)的生物学特性,转录调控以及其在肿瘤发生发展中的作用机制的研究任然是RNA研究的热点。lncRNAs 通过控制染色质重塑,转录调控和录转录后调控而在基因的转录调节中发挥了重要作用。lncRNAs 与多种肿瘤相关,并且在抑制因素和促进因素中都具有重要的作用。众多文献报道的结果表明lncRNAs 参与调控基因表达,在正常细胞与肿瘤细胞的转换中起到至关重要的作用。     

长非编码RNA 的表达与前列腺癌的研究进展

前列腺癌是全球发病率第二的男性恶性肿瘤,近年来我国前列腺癌的发病率显著上升。最近,大量研究发现,长非编码RNA表达水平的改变与前列腺癌的发生、发展、诊断、治疗和预后密切相关。该文就长非编码RNA与前列腺癌的关系及相关机理进行综述,有助于读者了解长非编码RNA在前列腺癌发病过程中的重要性,为前列腺癌的综合防治提供线索。     

Identification of short-lived long non-coding RNAs as surrogate indicators for chemical stress response

Abiotic and biotic stressors in human cells are often a result of sudden and/or frequent changes in environmental factors. The molecular response to stress involves elaborate modulation of gene expression and is of homeostatic, ecological, and evolutionary importance. Although attention has primarily focused on signaling pathways and protein networks, long non-coding RNAs (ncRNAs) are increasingly involved in the molecular mechanisms associated with responses to cellular stresses. We identified six novel short-lived long ncRNAs (MIR22HG, GABPB-AS1, LINC00152, IDI2-AS1, SNHG15, and FLJ33630) that responded to chemical stressors (cisplatin, cycloheximide, and mercury (II) oxide) in HeLa Tet-off cells. Our results indicate that short-lived long ncRNAs respond to general and specific chemical stressors. The expression levels of the short-lived long ncRNAs were elevated because of prolonged decay rates in response to chemical stressors and interruption of RNA degradation pathways. We propose that these long ncRNAs have the potential to be surrogate indicators of cellular stress responses.     

植物长链非编码RNA的生物信息学预测与分析研究进展

长链非编码RNA(Long non-coding RNAs,lncRNAs)是一类广泛存在于真核生物中,长度大于200个核苷酸、无蛋白编码功能,具有调控基因转录后表达的RNA转录本。新近研究表明,lncRNA在多种生物途径中起着重要调节作用。生物信息学由生物、数学、计算机科学,统计学等多学科交叉产生,能从全局和系统水平对大数据信息进行深入挖掘与分析。采用生物信息学方法预测与分析lncRNA是当前发现和鉴定植物lncRNA的重要策略之一。本文梳理和总结了近年来采用生物信息学预测植物lncRNA及其靶基因的方法策略,以期为今后深入认知植物lncRNA在植物的生长发育过程、抗逆境胁迫及系统进化等过程中的作用研究提供一定参考。     

Melatonin promotes Cashmere goat (Capra hircus) secondary hair follicle growth: a view from integrated analysis of long non-coding and coding RNAs

The role of melatonin in promoting the yield of Cashmere goat wool has been demonstrated for decades though there remains a lack of knowledge regarding melatonin mediated hair follicle growth. Recent studies have demonstrated that long non-coding RNAs (lncRNAs) are widely transcribed in the genome and play ubiquitous roles in regulating biological processes. However, the role of lncRNAs in regulating melatonin mediated hair follicle growth remains unclear. In this study, we established an in vitro Cashmere goat secondary hair follicle culture system, and demonstrated that 500 ng/L melatonin exposure promoted hair follicle fiber growth. Based on long intergenic RNA sequencing, we demonstrated that melatonin promoted hair follicle elongation via regulating genes involved in focal adhesion and extracellular matrix receptor pathways and further cis predicting of lncRNAs targeted genes indicated that melatonin mediated lncRNAs mainly targeted vascular smooth muscle contraction and signaling pathways regulating the pluripotency of stem cells. We proposed that melatonin exposure not only perturbed key signals secreted from hair follicle stem cells to regulate hair follicle development, but also mediated lncRNAs mainly targeted to pathways involved in the microvascular system and extracellular matrix, which constitute the highly orchestrated microenvironment for hair follicle stem cell. Taken together, our findings here provide a profound view of lncRNAs in regulating Cashmere goat hair follicle circadian rhythms and broaden our knowledge on melatonin mediated hair follicle morphological changes.