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相似文献
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1.
南宫自艳  高宝嘉  杨君 《生态学报》2009,29(4):1661-1667
采用等位酶聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对松毛虫属5个种和亚种的野生种群进行了亲缘关系和遗传变异的研究.8种等位酶系统(乳酸脱氢酶LDH、苹果酸脱氢酶MDH、苹果酸酶ME、乙醇脱氢酶ADH、甲酸脱氢酶FDH、谷氨酸脱氢酶GDH、过氧化物酶POD、过氧化氢酶CAT)共检测到12个基因位点,其中6个位点为多态位点,检测到15个等位基因.松毛虫属5个种和亚种的总体水平多态位点比率P=50%,平均有效基因数A = 1.917,平均期望杂合度He =0.267,平均遗传距离为0.0730~0.5701.遗传参数表明松毛虫属昆虫种间存在较高程度的遗传变异,聚类图和遗传距离数据表明赤松毛虫与马尾松毛虫亲缘关系最近,落叶松毛虫与思茅松毛虫亲缘关系最远.  相似文献   

2.
应用AFLP技术探讨半夏属五个种的亲缘关系   总被引:2,自引:0,他引:2  
利用扩增酶切片断多态性(AFLP)方法研究半夏属内5个种之间的亲缘关系。应用POPGENE及SPSS软件对所得“1”、“0”二元矩阵进行遗传距离,遗传相似性及聚类分析。实验发现鹞落坪半夏与虎掌之间的遗传差异小,鹞落坪半夏可能是虎掌的一个特化分支群体;虎掌和鹞落坪半夏组与本属其他种之间遗传差异较大,相似性较小;盾叶半夏和滴水珠是姐妹群关系,盾叶半夏虽然叶形与同属其他种有显著差异,但遗传距离及相似性分析对比不支持其独立于半夏属其他种,而作为完全独立进化类群的结论。为半夏属分类及系统进化关系提供了分子生物学证据。  相似文献   

3.
新疆石竹属野生种核糖体DNA的ITS序列与亲缘关系   总被引:15,自引:1,他引:15  
新疆是我国石竹属植物分布和分化中心,种质资源丰富。通过采用PCR直接测序法,对新疆石竹属(Dianthus)植物野生种共8个种及外类群(Lychnis coronata Thunb)rDNA的ITS区(包括ITS-1,5.8S,rDNA和ITS-2)进行序列测定。研究结果说明,新疆石生属植物的ITS序列总长度为617-621bp,长度变异较小,仅相差4bp,种间序列同源性很高,达97.6%-99.8%,外类群的序列同源性为80%左右。ITS区序列在石竹属内是相当保守的,石竹属物种间序列变异位点基本上是转移多于颠换,且转移率较高,转换/颠换率为1.0-3.0。系统地位和亲缘关系分析表明分布于中国的石竹属植物3个组即齿瓣组(sect.Barbulatum Williams)和石竹组(sect.Dianthus),遂瓣组(sect.Fimbriatum Williams)的亲缘关系较远,而sect.Dianthus与sect.Fimbriatum Williams的亲缘关系较近。ITS系统发育树揭示了石竹组起源早于遂瓣组和齿瓣组,其结果与传统形态学论述存在很大差异。  相似文献   

4.
RAPD重建的大豆属植物的亲缘关系   总被引:31,自引:1,他引:31  
惠东威  庄炳昌 《遗传学报》1996,23(6):460-468
利用8种RAPD引物(OPH-2、OPH-3、OPH-5、OPH-12、OPH-15、OPH-16、OPH-18和OPH-20)对大豆属的21份植物材料,其中包括Glycine亚属的10个种和Soja亚属的3个种,进行了基因组指纹图谱构建。通过对获得的基因组指纹图谱的量化分析,利用Unweightedpairgroupwithmathematicaverage(UPGMA)对大豆属中的各个种进行了亲缘关系重建。重建的亲缘关系表明:G.tomentella种中存在3种不同的进化类型,其分化距离已大于某些种种间的分化距离,它们可能是被形态遮蔽的3个种。Soja亚属内3个种的分化关系同前人的研究推断相同,其亲缘关系很近,这一结果支持将这3个种归并为一个种的观点。但是重建的亲缘关系未能显示出大豆属两个亚属的划分格局。  相似文献   

5.
采用高效液相色谱法建立不同产地的苍术属植物水提物不同极性部位的指纹图谱,并运用"中药色谱指纹图谱相似度评价系统"及SPSS软件对其进行相似度评价及综合聚类分析,以探讨苍术属7种植物的种间亲缘关系。结果显示:茅苍术与罗田苍术聚为一类,北苍术与朝鲜苍术、部分茅苍术聚为一类,关苍术与白术聚为一类,鄂西苍术单独聚为一类,该聚类分析结果与以挥发性成分为指标的聚类分析结果一致。苍术属植物水溶性成分HPLC指纹图谱的建立及聚类分析可为苍术属植物的分类,寻找苍术属植物亲缘关系提供可靠依据。  相似文献   

6.
中国石蒜属种间亲缘关系ITS序列分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
本文利用核糖体DNA内转录间隔区(ITS)序列对石蒜属13个种(含变种)的亲缘关系进行分析。结果表明,各样品的ITS1长度为259~260 bp,ITS2为230 bp,分别有多个特异性信息位点。以ITS序列为依据对石蒜属植物亲缘关系进行分析,表明石蒜属13个种可分为三大类,其中类Ⅰ包括中国石蒜、地笑、安徽石蒜和长筒石蒜,核型为M+T型;类Ⅱ包括矮小石蒜、换锦花、玫瑰石蒜和红蓝石蒜,核型为ST型;类Ⅲ包括稻草石蒜、乳白石蒜、短蕊石蒜和两种人工杂交种,核型为ST+M+T。系统进化树与核型分析结果相似,第Ⅲ类可能为自然杂交种。  相似文献   

7.
中国苎麻属植物亲缘关系研究进展   总被引:3,自引:4,他引:3       下载免费PDF全文
苎麻属植物亲缘关系的研究将为探讨苎麻起源、进化与分类以及苎麻种质资源的研究与育种利用提供科学依据.本文概述了苎麻属植物的起源中心以及植物形态学、染色体、同工酶与DNA分子标记等研究方法在苎麻属植物亲缘关系的研究进展,并对今后开展这方面研究提出了几个重要问题.  相似文献   

8.
用RAPD标记研究蚱属五个种间的亲缘关系   总被引:14,自引:6,他引:14       下载免费PDF全文
蒋国芳  陆敢  黄琨  黄日波 《昆虫学报》2002,45(4):499-502
用RAPD技术对蚱属5种蚱基因组DNA的多态性进行研究。在事先优化的反应条件下用12个随机引物扩增, 共得到84条清晰稳定的多态性片段,片段长度为200~2 000 bp。统计这些片段,根据扩增片段的共享度计算出相对遗传距离指数,然后用UPGMA和NJ聚类方法对其进行分析,构建系统树,确定了它们相互间的亲缘关系。  相似文献   

9.
用RAPD标记研究对虾属六个种间的亲缘关系   总被引:25,自引:2,他引:25  
宋林生  樊拥军 《动物学报》1998,44(3):353-359
用RAPD技术对对虾属中六种对虾基因组DNA的多态性进行研究。在事先优化的反应条件下用20个随机引物扩增,共得到364条清晰稳定的多态性片段,片段长度在230 ̄2800bp之间。统计这些片段,根据扩增片段的共享度计算出相对遗传距离指数,然后用UPGMA和NJ等聚类方法对其进行分析,构建系统树,确定了它们相互间的亲缘关系。从聚类分析的结果可以看到,外部形态比较相似的种类在基因组DNA上表现出较大的相  相似文献   

10.
应用SRAP标记绘制88份南瓜属种质资源DNA指纹图谱   总被引:1,自引:0,他引:1       下载免费PDF全文
为了给南瓜属种质资源鉴定和分类提供分子生物学依据,本研究采用SRAP分子标记技术与DNAMAN指纹图谱绘制软件对88份南瓜属种质资源(包含美洲南瓜、中国南瓜、印度南瓜)进行分子指纹图谱绘制。结果表明:35对SRAP多态性引物共扩增出499条清晰条带,其中多态性条带438条,多态性条带比率高达87.8%。根据扩增出的条带成功绘制出88份南瓜属种质资源的DNA指纹图谱,每一份种质都具有其独特的分子身份证,使得每份种质均可被区别开来。其中,多态性最好的引物是E5EM8,可以同时绘制72份南瓜属种质资源的指纹图谱。所有供试材料用5对多态性SRAP引物即可全部区别开来。研究表明,SRAP分子标记技术可成功地绘制南瓜属种质资源DNA指纹图谱。本研究对南瓜属种质资源鉴别、分子数据库构建及品种权保护具有较重要的意义。  相似文献   

11.
金针菇Flammulina filiformis是我国产量最高的工厂化栽培食用菌.为提高优良工厂化栽培金针菇种质的育种效率,本研究以国内外收集的105份金针菇种质为材料,开展体细胞不亲和评价,并采用SSR分子标记的方法对所有种质进行遗传多样性分析和聚类分析.20对SSR引物在105份种质中共扩增得到209个等位基因位点...  相似文献   

12.
    
The phylogenetic relationships of 13 snapper species from the South China Sea have been established using the combined DNA sequences of three full-length mitochondrial genes (COI, COII and CYTB) and two partial nuclear genes (RAG1, RAG2). The 13 species (genus Lutjanus) were selected after DNA barcoding 72 individuals, representing 20 species. Our study suggests that although DNA barcoding aims to develop species identification systems, it may also be useful in the construction of phylogenies by aiding the selection of taxa. Combined mitochondrial and nuclear gene data has an advantage over an individual dataset because of its higher resolving power.  相似文献   

13.
目的:利用rbcL-a序列对13种苔藓植物进行亲缘关系分析。方法:以毛地钱为外类群,利用ClustalX2.0和MEGA4.1软件对13种苔藓植物的rbcL-a基因序列进行比对和分析,构建分子系统树。结果:13种苔藓植物的rbcL-a序列长度在643bp~656bp之间,排序后总长度为661bp,其中变异位点54个,信息位点91个。遗传距离在0.019~0.144之间,平均遗传距离为0.073。利用MP法建立的系统树显示,13种苔藓植物分为3组。结论:序列分析结果与形态学结果一致,rbcL-a序列可用于苔藓植物的亲缘关系分析。  相似文献   

14.
以11种限制性内切酶对新疆荒漠中的9种束颈蝗和与其近缘的细距蝗Leptopternis gracilis,旋跳蝗Helioscirtus moseri moseri 及远缘的意大利蝗Calliptamus italicus italicus,红翅瘤蝗Dericorys roseipennis的线粒体DNA进行了长度片段多态性的研究。根据所得的酶切类型,计算了种间每核苷酸位点的平均碱基取代值P(遗传距离)。用UPGMA法构建分子系统树。结果表明,束颈蝗属种间的P值约为 0.099~0.146,与近缘种属间约0.100~0.205,与远缘种属间约为0.113~0.206。估算出束颈蝗属种间的分歧年代约在1000~1500万年前,处于中新世中期,将实验结果与形态演化比较分析,探讨束颈蝗的系统进化。  相似文献   

15.
A rapid method, using 12 restriction enzymes, was employed to analyze variations in ribosomal DNA (rDNA) spacers in a study of phylogenetic relationships betweenHomo sapiens and related species. We mapped restriction sites in the external and internal spacer regions and compared the arrangements of sites. The estimated sequence divergence betweenHomo sapiens andPan troglodytes, Pan paniscus, Gorilla gorilla, Pongo pygmaeus, Hylobates lar, H. agilis, andMacaca fuscata was 2.7, 2.3, 3.8, 7.3, 6.8, 7.8, and 14.1%, respectively. The genetic relationships inferred from these distances generally correspond to those inferred from analyses of other molecular markers in the literature. The divergence betweenH. lar andH. agilis and betweenH. lar andH. syndactylus was 0.34 and 2.4%, respectively.This study was supported in part by Grants-in-Aid for Scientific Research from the Ministry of Education, Science and Culture, Japan, and also by the Cooperative Research Program of the Primate Research Institute, Kyoto University.  相似文献   

16.
马尾松毛虫空间格局的地学统计学分析   总被引:25,自引:9,他引:25  
应用地学统计学方法分析了湿地松 马尾松 火炬松林中马尾松毛虫越冬代蛹、第一代卵块和低龄幼虫的空间格局 .结果表明 ,蛹在 0°、45°、90°、1 35°4个方向上的半变异函数曲线为球形 ,在 90°方向上的空间连续性大于其他方向 ;卵块和低龄幼虫的为指数形 ,在各方向上无差异 .蛹、卵块和幼虫在全方向上的半变异函数曲线均为球形 ,呈聚集型的空间格局 ,聚集强度以蛹最高 ,依次是幼虫和卵块 .分别拟合了蛹、卵块和幼虫的半变异函数模型 ,估算了样地各处的密度 ,绘制了密度等值线图  相似文献   

17.
七种蟋蟀基因组DNA的RAPD多态性研究(直翅目:蟋蟀总科)   总被引:14,自引:6,他引:14  
应用10种随机引物,对西北地区常见的3属7种蟋蟀进行RAPD多态性检测,共筛选出2种引物S142,S8可以对7个种扩增出清晰稳定的多态性片段,多态性片段共计58条,相对分子质量在320bp-2400bp之间。应用UPGMA(非加权配对算术平均法)对多态性片段进行聚类分析,构建树状图,推测系统发生关系。每一种蟋蟀均先各自聚为一类,棺头蟋属与油葫芦属间的遗传距离最小,亲缘关系最近,斗蟋属4个种间的亲缘关系较为复杂,明显分为2个支系,与传统分类并不一致。  相似文献   

18.
五种品系猪亲缘关系的RAPD分析   总被引:12,自引:4,他引:12       下载免费PDF全文
应用190个RAPD引物对贵州小型猪,巴马小型猪、西双版纳近交系小耳猪JB和JS亚系、荣昌猪Ⅰ系、长白猪的亲缘关系进行了初步分析,其中39个引物的扩增结果具有非常明显的品系间多态性,将其扩增结果以RAPDistance package Version 1?04程序进行分析,计算相对遗传距离指数1-F,再用NJ法进行聚类分析,构建系统树。结果表明,三种小型猪相互间亲缘关系较近,尤以贵州小型猪与巴马小型猪更近。荣昌猪Ⅰ系和长白猪关系较近,但与小型猪关系较远。关键词:随机扩增多态DNA;小型猪;亲缘关系The phylogenetic relationship of five species of pigs including Guizhou miniature pig,Bama pig,Xisuangbanna inbred pig,Rongchang Pig and Landrance was studied by RAPD analysis.Thirty-nine single polymorphic primers were selected out of 190 primers.The amplified fragments of thirty-nine primers were analysed by the RAPDistance package version 1.04 and the phylogenetic tree was constructed using NJ method.The results indicated as the following: three strains of miniature pigs have close phylogenetic relationship and the phylogenetic relationship between Guizhou miniature pig and Bama miniature pig was much closer.Landrance and Rongchang pig have close phylogenetic relationship too,but their phylogenetic relationship is far from the three strains of miniature pigs.  相似文献   

19.
The mitochondrial DNA control region of Siniperca chuatsi, S. kneri, S. scherzeri, S. obscura, S. undulata, Coreosiniperca roulei and Coreoperca whiteheadi were amplified by PCR amplification and directly sequenced. The mtDNA control region of the sinipercine fishes could be separated into three domains, namely, the terminal associated sequence domain, the central conserved sequence domain and the conserved sequence block domain. The extended terminal associated sequence (ETAS), three conserved sequence blocks (CSB-F, CSB-E, CSB-D) in the central conserved sequence domain and three conserved sequence blocks (CSB1, CSB2, CSB3) in the conserved sequence block domain were also identified. The phylogenetic relationships among these sinipercine fishes were constructed through neighbor-joining and maximum parsimony methods using Percidae and Serranidae as outgroups. Results showed that sinipercine fishes were a monophyletic group, with Siniperca forming one group, and Coreoperca forming another group. Coreosiniperca roulei did not form an independent group but was merged into the genus Siniperca. Thus it should be renamed as Siniperca roulei.  相似文献   

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