|
1.
|
云南普通野生稻遗传多样性和亲缘关系
|
|
|
|
|
|
|
晏慧君 付坚 李俊 黄兴奇 王玲仙 程在全《植物学报》,2006年第23卷第6期
|
|
|
野生稻(Oryza rufipogon)是稻属的重要组成部分, 具有许多优良性状, 是水稻遗传改良的天然基因库。本研究通过对形态学性状的观测, 及ISSR和RAPD UPGMA聚类分析, 将云南普通野生稻划分为4个类型, 即元江类型、景洪紫杆直立型、景洪绿杆直立型和景洪匍匐型。在供试材料中筛选到具有多态性的ISSR和RAPD引物各11个, ISSR引物扩增出多态带113条, 多态性条带比率(PPB)为82.26%, RAPD引物共扩增出多态性条带76条, PPB值为76.77%, 两种分子标记的分析结果呈极显著正相关(r = 0.951)。此外UPGMA聚类结果表明, 云南普通野生稻不同类型与其它地区普通野生稻之间的遗传亲缘关系差异明显。
|
|
2.
|
云南普通野生稻遗传多样性和亲缘关系 被引次数：4
|
|
|
|
|
|
|
晏慧君 付坚 李俊 黄兴奇 王玲仙 程在全《植物学通报》,2006年第23卷第6期
|
|
|
野生稻（Oryza rufipogon）是稻属的重要组成部分，具有许多优良性状，是水稻遗传改良的天然基因库。本研究通过对形态学性状的观测，及ISSR和RAPDUPGMA聚类分析，将云南普通野生稻划分为4个类型，即元江类型、景洪紫杆直立型、景洪绿杆直立型和景洪匍匐型。在供试材料中筛选到具有多态性的ISSR和RAPD引物各11个，ISSR引物扩增出多态带113条，多态性条带比率（PPB）为82．26％，RAPD引物共扩增出多态性条带76条，PPB值为76．77％，两种分子标记的分析结果呈极显著正相关（r=0.951）。此外UPGMA聚类结果表明，云南普通野生稻不同类型与其它地区普通野生稻之间的遗传亲缘关系差异明显。
|
|
3.
|
65份野生油茶种质遗传多样性的ISSR和RAPD标记分析
|
|
|
|
|
|
|
考安都 王述贵 王艳芹 徐 洲 周永红 丁春邦《广西植物》,2014年第3期
|
|
|
利用ISSR和RAPD标记,对名邛台地野生油茶种质进行遗传多样性分析。从60条简单重复序列引物中筛选出16条引物,在65份样品中共扩增出213条带,其中多态位点为203个,多态位点百分率为95.31%;从30条寡居核苷酸引物中筛选出8条引物,共扩增出105条带,其中多态性位点94个,多态位点百分率为89.52%。结果表明:名邛台地野生油茶种质具有较丰富的遗传多样性,ISSR和RAPD标记可以应用于油茶种质遗传多样性分析。
|
|
4.
|
利用RAPD和ISSR标记分析青麻种质遗传多样性 被引次数：4
|
|
|
|
|
|
|
王利群 戴雄泽 李雪峰 粟建光 白占兵《植物遗传资源学报》,2009年第10卷第1期
|
|
|
利用RAPD和ISSR分子标记检测来自全国11个省(市)的48份青麻种质资源的遗传多样性,为青麻资源利用和育种提供分子生物学依据.在48份青麻种质资源中,17条RAPD引物扩增出191条带,多态条带比率为87.43%;9条ISSR引物扩增出82条带,多态条带比率为88.89%,扩增产物片段大小都在0.1～3.0kb之间.两种分子标记的结果呈显著正相关(r=0.80).基于UPGMA聚类,野生种和栽培种各自聚为相应的类别.
|
|
5.
|
应用RAPD和ISSR标记对24份花生栽培种材料进行遗传多样性分析
|
|
|
|
|
|
|
闫苗苗 魏光成 谭秀华 王传堂《广西植物》,2011年第31卷第5期
|
|
|
利用RAPD引物和ISSR引物分析我国24份花生栽培种材料的遗传多样性。结果表明:所选的RAPD引物和ISSR引物中分别有13条引物和10条引物扩增出了清晰并可重复的条带,共扩增出123条带和87条带,平均每条引物扩增出9.5条带和8.7条带,其中多态性带分别占条带总数的47.15%和57.47%,平均每条引物扩增出4.7条和5.7条多态性带。在此基础上,根据Nei-Li系数采用UPGMA法进行了聚类分析,可将24份花生材料分成4类:四粒红、汕油523、冀花2号、花育16和粤油7号等5个品种聚为一类;花育20、中花8号聚为一类;黑花生单独为一类;其余的花生聚为一类。RAPD和ISSR标记能够揭示花生栽培种的遗传多样性,在种质鉴定和遗传作图等方面具有一定应用潜力。
|
|
6.
|
利用RAPD和ISSR分子标记分析怀地黄种质遗传多样性 被引次数：42
|
|
|
|
|
|
|
周延清 景建洲 李振勇 张宝华 贾敬芬《遗传》,2004年第26卷第6期
|
|
|
用RAPD与ISSR技术对怀地黄的8个品种和2个脱毒品系进行了种质遗传多样性分析。分别从80条RAPD引物和44条ISSR引物中筛选出适合怀地黄种质分析的17条RAPD引物和10条ISSR引物，用于RAPD和ISSR分析。17条RAPD引物共扩增出177条带, 多态性位点数为109; 多态性位点比率为61.58%;平均多样性指数(I)为0.3135；每个位点的有效等位基因数（Ne）是1.3641; 10条ISSR引物共扩增出110条带. 多态性位点数为79; 多态性位点比率为71.58%;平均多样性指数(I)为0.3577；每个位点的有效等位基因数（Ne）是1.4037。 基于扩增条带数据库建立了各自的Jaccard遗传相关系数矩阵，构建了相似的分子树状图，将10个供试材料分为2类:一类群含组培85.5、大田85.5、组培9302、大田9302、金状元和金白6个材料；另一类群含北京1号、大红袍、地黄9104和野生地黄4个材料。两种分子标记的分析结果呈极显著正相关(r＝0.649)。结果表明，RAPD与ISSR标记适合于怀地黄种质遗传多样性分析，ISSR标记技术是一种多态性和重复性优于RAPD技术的实用技术。
|
|
7.
|
利用RAPD和ISSR分子标记分析地黄种质遗传多样性 被引次数：6
|
|
|
|
|
|
|
周延清 景建洲 李振勇 张宝华 贾敬芬《遗传》,2004年第26卷第6期
|
|
|
用RAPD与ISSR技术对地黄的8个品种和2个脱毒品系进行了种质遗传多样性分析.分别从80条RAPD引物和44条ISSR引物中筛选出适合地黄种质分析的17条RAPD引物和10条ISSR引物用于RAPD和ISSR分析.17条RAPD引物共扩增出177条带, 多态性位点数为109; 多态性位点比率为61.58%;平均多样性指数(I)为0.3135;每个位点的有效等位基因数(Ne)是1.3641; 10条ISSR引物共扩增出110条带. 多态性位点数为79; 多态性位点比率为71.58%;平均多样性指数(I)为0.3577;每个位点的有效等位基因数(Ne)是1.4037. 基于扩增条带数据库建立了各自的Jaccard遗传相关系数矩阵,构建了相似的分子树状图,将10个供试材料分为2类:一类群含组培85.5、大田85.5、组培9302、大田9302、金状元和金白6个材料;另一类群含北京1号、大红袍、地黄9104和野生地黄4个材料.两种分子标记的分析结果呈极显著正相关(r＝0.649).结果表明,RAPD与ISSR标记适合于地黄种质遗传多样性分析,ISSR标记技术是一种多态性和重复性优于RAPD技术的实用技术.
|
|
8.
|
鸢尾属植物遗传多样性的 RAPD和ISSR分析 被引次数：8
|
|
|
|
|
|
|
张敏 黄苏珍 仇硕 孙延东《植物资源与环境学报》,2007年第16卷第2期
|
|
|
应用RAPD和ISSR标记技术,对来自不同产地的鸢尾属(IrisL.)4个野生种的遗传多样性进行了分析。结果表明,12个RAPD和ISSR引物分别扩增出225和196条带,多态性条带分别为215和196条,多态性条带百分率分别为95.56%和100.00%;种间总基因多样度分别为0.368 9和0.357 5、种内基因多样度分别为0.107 7和0.138 0,表明鸢尾属种间遗传多样性较高,且种间变异大于种内变异。4个野生种中,蝴蝶花(I.japonicaThunb.)的遗传组成较为丰富。此外,种内遗传关系与地理分布和环境差异有一定的相关性。
|
|
9.
|
松花型花椰菜主要品种鉴定的分子标记分析 被引次数：3
|
|
|
|
|
|
|
马二磊 王燕 刘莉 龚义勤 宋立君 柳李旺《植物遗传资源学报》,2010年第11卷第5期
|
|
|
利用RAPD、ISSR和SRAP 3种分子标记对我国南方地区松花型花椰菜主栽品种进行鉴定,分析了品种间的遗传多样性。3种标记共产生370条扩增带,238条为多态性条带,其多态率为64.32%。其中只有SRAP标记的引物m e1/em1可将20个品种全部鉴别。遗传相似系数分析表明,松花型花椰菜品种之间的亲缘关系较近,遗传背景比较狭窄。聚类分析表明品种间的亲缘关系与熟性、地理分布相关。研究表明,分子标记能有效地应用于花椰菜品种鉴定,且综合多种分子标记分析品种间的遗传多样性将更加准确可靠。
|
|
10.
|
布氏田鼠封闭群遗传结构的随机扩增多态DNA分析
|
|
|
|
|
|
|
施海霞 潘思丹 梁虹 宋铭晶《中国实验动物学杂志》,2010年第7期
|
|
|
目的使用随机扩增多态DNA标记建立标准化的布氏田鼠封闭群遗传质量控制分子标记库。方法使用高盐沉淀法从鼠尾中提取布氏田鼠基因组DNA。采用40条PRAD引物对布氏田鼠封闭群进行PCR扩增,琼脂糖电泳分离条带,参考标准分子量标记计算条带大小,并使用多态位点数、单态位点数以及多态位点比率评价种群的遗传多样性。结果筛选出8个能获得清晰稳定扩增条带的RAPD标记。这8个RAPD标记检测到的多态位点数存在明显差异。8个引物得到的遗传多态位点的数据之和能揭示种群的遗传结构。结论本实验建立了检测布氏田鼠封闭群遗传结构的RAPD标记。
|
|
11.
|
AFLP和RAPD标记技术在栉孔扇贝遗传多样性研究中的应用比较 被引次数：13
|
|
|
|
|
|
|
王玲玲 宋林生 李红蕾 胥炜 李俊强 常亚青《动物学杂志》,2003年第38卷第4期
|
|
|
AFLP和RAPD标记技术是近年来发展最快的基于PCR基础上的两种DNA标记技术，本文比较了两种标记技术在我国栉孔扇贝群体遗传多样性研究中的应用。共筛选20个RAPD引物和7个AFLP引物组合，检测到AFLP标记的有效等位基因数和平均多态信息量稍低于RAPD标记，但AFLP标记在每单位分析中扩增到的野生和养殖群体的多态性条带数(23．8，24．8)分别高于RAPD标记(5．6，5．6)，AFLP多态性检测效率显著高于RAPD标记。AFLP和RAPD两种标记技术所揭示的野生种群与养殖群体间的近交系数、遗传距离两项指标均表明，我国栉孔扇贝养殖群体和野生种群之间尚未出现明显的遗传分化。研究结果表明：RAPD和AFLP这两种标记技术均可用于栉孔扇贝遗传多样性的分析，其分析结果是一致的。
|
|
12.
|
观赏南瓜及葫芦种质资源遗传多样性分子评价 被引次数：1
|
|
|
|
|
|
|
汤青林 宋明 肖祖梅 王志敏《植物遗传资源学报》,2012年第13卷第3期
|
|
|
利用RAPD和ISSR标记对28份观赏南瓜及葫芦种质资源进行遗传多样性分子评价。结果表明:12个RAPD引物和13个ISSR引物分别扩增出89条和93条清晰谱带,平均每个引物分别扩增出6.1条和6.2条多态性谱带,多态性比率分别为82%和86%。RAPD和ISSR标记检测供试材料的遗传相似性系数(GS)范围分别为0.31～0.99和0.33～0.99,ISSR(平均GS值0.68)检测多态性效果高于RAPD(平均GS值0.73)。利用UPGMA法基于RAPD与ISSR混合聚类,将28份观赏南瓜及葫芦种质分为3类,类群的划分与果实形状明显相关:第Ⅰ类群包括15份种质,为扁圆形、卵圆形、圆球形或圆筒状的早熟或晚熟果实;第Ⅱ类群包括11份种质,为汤匙形、梨形、扁球形或皇冠形的早中熟果实;第Ⅲ类群包括2份种质,为葫芦形的晚熟果实。
|
|
13.
|
海南主要普通野生稻的调查及利用RAPD技术进行鉴别分析 被引次数：2
|
|
|
|
|
|
|
王晓玲 郭安平 孔 华 刘恩平 贺立卡《广西植物》,2008年第28卷第6期
|
|
|
通过对海南现存的主要普通野生稻资源进行考察,报道了海南主要普通野生稻的最新生存状况;并用RAPD技术对其进行分析。从供试材料中筛选出具有多态性的RAPD引物13条,共扩增出155条带,其中多态性条带120条,多态性条带比率(PPB)值为77.42%。UPGMA聚类结果表明:海南主要普通野生稻之间遗传关系较复杂、差异较明显,并将海南主要普通野生稻资源划分为5个小类群,可以很好地将海南本地野生稻与收集保存的野生稻鉴别开来,为海南普通野生稻资源的合理利用与有效保护提供了重要依据。
|
|
14.
|
不同地域野生欧李及其近缘植物亲缘关系的RAPD分析
|
|
|
|
|
|
|
王鹏飞 李利锋 杜俊杰 纪薇 穆霄鹏 张建成 曹琴《植物遗传资源学报》,2015年第16卷第1期
|
|
|
利用RAPD分子标记技术对21个不同地域欧李及其近缘种属植物(桃、杏、李、樱桃)进行了遗传亲缘关系及分类研究。结果表明,用于不同地域野生欧李分析的25条引物中,共扩增出441个清晰可用的DNA片段,其中多态性位点366个,多态性比为82.99%。在遗传相似系数为0.71时,可将中国野生欧李资源划分为3个大的区域,分别为东北分布群、华北华东分布群与中西部分布群。用于欧李及其近缘种属植物分析的20条引物中,共扩出多态性带683条,多态性比率为98.99%。聚类分析表明,在遗传相似系数为0.61时,欧李与其近缘种属植物分为3大类;欧李与麦李的亲缘关系最近,与桃亲缘关系最远。
|
|
15.
|
基于ISSR分子标记技术的稻水象甲遗传多样性研究
|
|
|
|
|
|
|
柳青 李燕 王德海 罗嵘 土小佳 黄钰淼 傅杨 陈国华《环境昆虫学报》,2016年第1期
|
|
|
稻水象甲Lissorhoptrus oryzophilus Kuschel是一种世界性的水稻害虫,已侵入我国23个省市区,发生面积近千万亩.为弄清我国不同地区稻水象甲的遗传多样性水平、居群间的遗传分化及可能的扩散路线,本研究采用ISSR分子标记技术分析了我国13个省28个地区稻水象甲样本的遗传多样性.利用15条ISSR引物共扩增得到258条带,其中247条为多态性条带.在物种水平上,稻水象甲的多态位点百分率(PPB)为95.73％,Nei's基因多样性(H)为0.3578,Shannon信息多样性指数(I)为0.5330;在居群水平上,以上3项指标的平均值分别为46.28％、0.1768、0.2620.Nei's基因分化系数Gst为0.5059,表明有50.59％的遗传变异存在于居群间,49.41％的遗传变异存在于居群内,居群间表现出较高水平的遗传分化.通过UPGMA聚类可将稻水象甲28个居群分成2大支系:安徽池州、安徽合肥、云南嵩明、云南曲靖、江西南昌、四川盐亭、辽宁盘锦、辽宁东港、山西太原、山东东营、天津蓟县、陕西城固、河北唐山、云南寻甸等14个居群聚成第一个分支;贵州、贵州开阳、贵州龙里、贵州贵阳、贵州修文、四川隆昌、四川泸州、湖北武当山、湖北荆门、湖北利川、湖南宁乡、湖南双峰、湖南邵阳、天津宝坻等聚成第二个分支.
|
|
16.
|
云南黑籽南瓜种质遗传多样性的RAPD和ISSR分析 被引次数：2
|
|
|
|
|
|
|
杨正安 孟平红 代贤 杨立芳 张兴国《植物遗传资源学报》,2011年第12卷第6期
|
|
|
摘要: 采用RAPD和ISSR分子标记技术对来源于云南省6个地州13份的黑籽南瓜种质进行遗传多样性分析。结果表明：6个RAPD和6个ISSR引物分别扩增出43条和41条带，多态性比率分别为90.70%和51.21%；RAPD和ISSR标记检测供试材的遗传相似性系数(Gs)范围，分别为0.340-0.895和0.162-0.941，ISSR(平均GS值0.698)检测多态性效果高于RAPD(平均GS值0.481)。RAPD标记聚类分析将供试种质分为3个类群5组；ISSR标记聚类分析将供试种质分为4个类群6组，RAPD和ISSR标记的遗传相似性系数呈显著相关(r=0.536)。基于UPGMA聚类结果，可为黑籽南瓜的引种栽培或品种改良提供参考。
|
|
17.
|
番木瓜两性基因的RAPD标记 被引次数：12
|
|
|
|
|
|
|
周国辉 李华平 张曙光 范怀忠《热带亚热带植物学报》,2001年第9卷第3期
|
|
|
应用混合分离群体分析法，在205个10碱基随机引物中，寻找番木瓜两性基因（M2）的RAPD标记，发现两个多态性RAPD条带：OPQ－07 1800和OPE－06 1050。它们仅能在两性DNA池中扩增到，而不能在雌性DNA池中扩增到，用上述两引物检测了210株番木瓜单株DNA，结果表明，OPQ－07 1800和OPE－061050与M2基因紧密连锁，它们位于M2基因的两侧，其遗传距离分别为4．5和1．9cM。
|
|
18.
|
水貂自咬症病因RAPD遗传分析
|
|
|
|
|
|
|
李玉梅 姚纪元 马丽娜 李志伟 白秀娟《微生物学报》,2008年第24卷第4期
|
|
|
自咬症是危害笼养水貂的一种慢性疾病, 造成水貂自咬创伤而影响其生长发育和毛皮质量。文中从遗传基因角度探讨水貂自咬症的发病原因在国内外尚属首次, 采用RAPD 技术分别对正常水貂和自咬水貂样本进行了分子水平的遗传结构分析。从100 个随机引物中筛选出26个重复性好的标记引物, 对60只水貂群体(健康与患病)进行随机扩增多态DNA(RAPD)标记研究。结果表明, 26个引物扩增出105条带, 其中29条带呈现多态, 多态率为27.62%。不同引物扩增出的DNA 片段在健康与患病水貂群体中的分布频率不同。水貂群体间相似系数为0.8471, 遗传距离(变异)指数为0.1529。引物S356(序列为CTGCTTAGGG)扩增出健康与患病水貂互不相同的条带, 如在患病水貂群体中扩增出的1000 bp左右的DNA 片段, 可初步作为区分健康和患病水貂群体的分子遗传标记, 逐渐剔除自咬水貂个体, 达到净化水貂群的目的, 减少水貂饲养业的经济损失, 为今后水貂的分子育种及其疾病的预防提供一定的理论依据。
|
|
19.
|
水貂自咬症病因RAPD遗传分析 被引次数：1
|
|
|
|
|
|
|
李玉梅 姚纪元 马丽娜 李志伟 白秀娟《生物工程学报》,2008年第24卷第4期
|
|
|
自咬症是危害笼养水貂的一种慢性疾病, 造成水貂自咬创伤而影响其生长发育和毛皮质量。文中从遗传基因角度探讨水貂自咬症的发病原因在国内外尚属首次, 采用RAPD 技术分别对正常水貂和自咬水貂样本进行了分子水平的遗传结构分析。从100 个随机引物中筛选出26个重复性好的标记引物, 对60只水貂群体(健康与患病)进行随机扩增多态DNA(RAPD)标记研究。结果表明, 26个引物扩增出105条带, 其中29条带呈现多态, 多态率为27.62%。不同引物扩增出的DNA 片段在健康与患病水貂群体中的分布频率不同。水貂群体间相似系数为0.8471, 遗传距离(变异)指数为0.1529。引物S356(序列为CTGCTTAGGG)扩增出健康与患病水貂互不相同的条带, 如在患病水貂群体中扩增出的1000 bp左右的DNA 片段, 可初步作为区分健康和患病水貂群体的分子遗传标记, 逐渐剔除自咬水貂个体, 达到净化水貂群的目的, 减少水貂饲养业的经济损失, 为今后水貂的分子育种及其疾病的预防提供一定的理论依据。
|
|
20.
|
中国卵叶海桑遗传多样性的ISSR研究 被引次数：6
|
|
|
|
|
|
|
李海生 陈桂珠《广西植物》,2004年第24卷第1期
|
|
|
卵叶海桑 (Sonneratiaovata)是海桑科濒危红树植物 ,在我国仅分布于海南文昌清澜自然保护区内。采用简单序列重复区间扩增 (ISSR)分子标记技术对该天然居群和东寨港红树林自然保护区引种的人工居群共 3个居群 3 9个个体进行了遗传变异分析。 1 1个引物共扩增出 1 85条带 ,其中 1 2 7条具多态性 ,多态位点百分率为 68.65 %。在居群水平上相对较低 ,多态位点百分率 3 6.76%～ 5 4.5 9% ,平均值为 47.2 1 %。Nei的基因多样性、Shannon信息指数在物种水平上分别为 0 .1 41 1和 0 .2 2 92 ;在居群水平上平均值分别为 0 .1 2 0 9和0 .1 91 0。Nei的遗传分化系数Gst表明 :87.5 8%遗传变异分布在居群内 ,1 2 .42 %的遗传变异分布在居群间。居群间的遗传一致度达 0 .970 7。东寨港迁地保护的人工居群有效地保护了卵叶海桑的遗传多样性。
|
