蒙古沙葱萤叶甲种群遗传多样性的微卫星分析

【目的】沙葱萤叶甲 Galeruca daurica (Joannis)是一种近年来在内蒙古草原上猖獗成灾的新害虫,本研究旨在明确内蒙古沙葱萤叶甲不同地理种群间的遗传分化和基因交流程度。【方法】应用5对微卫星引物分析了沙葱萤叶甲8个地理种群的遗传多样性、基因流和遗传分化。【结果】5个位点等位基因数为10~18,有效等位基因数为9.2796~16.0388,多态信息含量值为0.6760~0.8985,期望杂合度为0.3430~0.5284,说明所选5个微卫星位点均为高度多态性位点。8个种群的期望杂合度为0.2216~0.3701,平均值为0.2680;种群间遗传分化系数为0.1244~0.4116,平均值为0.2521;种群间基因流为0.3574~1.7596,平均值为0.9622。8个地理种群根据遗传距离聚为3个分支,遗传距离与地理距离呈显著的正相关关系 (r=0.4854,P=0.0180)。【结论】沙葱萤叶甲种群遗传多样性低,不同地理种群之间基因流较小,遗传分化程度高;沙葱萤叶甲迁移能力弱和地理阻碍可能是限制其基因交流和导致遗传高度分化的主要原因。     

高原鼠兔四个地理种群的遗传多样性与遗传分化

采用7个多态微卫星DNA标记分析了4个高原鼠兔地理种群（海晏种群、西大滩东种群、西大滩西种群和昆仑山种群）的遗传多样性和遗传分化.采用多态信息含量（PIC）、期望杂合度（He）、观测杂合度（Ho）、基因流（Nm）和基因分化系数（Fst）对种群及物种的遗传多样性水平进行分析;计算各种群间的遗传距离（GD）、遗传相似度（GI）以及遗传距离与地理距离的相关系数,并进行UPGMA聚类分析.研究结果显示,高原鼠兔的遗传多样性在小哺乳动物中处于较高水平,其He和Ho的平均值分别为0.5332和0.6003,其Fst为0.0975,即有9.75%的变异存在于种群之间,即变异主要存在于种群内部.4个种群间的杂合度与多态信息含量均无显著差异,说明它们的遗传多样性水平基本相当.海晏种群与其余3个种群的遗传分化均达到了中度分化水平（Fst= 0.1043）,而另3个种群间几乎没有分化（Fst=0.0253）.Mantel test结果表明地理距离与遗传距离间没有显著的相关性.     

基于微卫星标记的中国东北地区灰飞虱遗传变异及种群遗传结构分析

【目的】本研究旨在明确我国东北地区灰飞虱Laodelphax striatellus种群遗传变异及种群遗传结构,阐明种群间遗传分化与基因流。【方法】利用9对微卫星引物对采自我国东北地区15个地理种群的375头灰飞虱样品进行测序与分析;利用GeneAlex6.51,GENEPOP4.0.9和STRUCTURE 2.3.4等软件分析灰飞虱地理种群间的遗传多样性、遗传分化、基因流及种群遗传结构。【结果】在所分析的375头灰飞虱个体中,各位点平均有效等位基因数Na=6.898;总体上,灰飞虱不同地理种群遗传多样性较高(平均观测杂合度Ho=0.548;平均期望杂合度He=0.582),各种群间基因流较低(Nm=0.660)。UPGMA聚类树、PCoA及STRCTURE分析结果表明,东北地区灰飞虱种群分为两分支:吉林(JL)和沈阳(SY2012,SY2013和SY2014)种群聚为一支;其余种群聚为一支。AMOVA分析结果表明,灰飞虱遗传变异主要来自种群内(87%),种群间变异水平较低(13%)。【结论】中国东北地区灰飞虱遗传多样性较高,不同地理种群存在一定程度的遗传分化,且基因交流较低,存在一定的种群遗传结构。     

毛茛叶报春的遗传多样性及遗传结构

毛茛叶报春(Primula ranunculoides)是我国特有的珍稀濒危花卉,具较好的园艺开发潜力,其野生种群已十分稀少。本文利用9对微卫星引物对7个自然种群共222个个体的遗传多样性和遗传结构进行了研究。结果表明,与近缘种相比,毛茛叶报春具较低的遗传多样性,种群间分化明显。种群的平均观察杂合度为0.286,期望杂合度为0.330,种群遗传多样性与植株密度有显著的正相关性,而与种群大小和面积无显著相关性。种群间的平均基因流Nm=0.730。AMOVA分析表明毛茛叶报春有48.08%的变异存在于种群间,51.92%出现在种群内。毛茛叶报春种下的遗传结构与地形关系密切,山脉间的两湖平原(江汉平原和洞庭湖平原)及武宁和修水低洼农耕区等异质生境是其主要的基因流屏障。建议将毛茛叶报春划分为九岭山、幕阜山、七姊妹山和银炉4个单元进行遗传多样性管理。     

西南地区麻疯树天然种群遗传多样性的等位酶变异

为了揭示麻疯树(Jatropha curcas)天然种群的遗传多样性和遗传结构, 采用聚苯烯酰胺凝胶垂直平板电泳技术, 对采自四川、云南、贵州3个省的10个麻疯树天然种群的叶片样本进行了同工酶分析。7个酶系统10个位点的检测结果表明: 麻疯树种群水平上的遗传多样性较高, 每位点平均等位基因数为2.428 6, 多态位点百分率为97.14%, 平均期望杂合度为0.396 4。种群间遗传分化系数为0.041 3, 种群间总的基因流较高, 为5.808 9, 种群间遗传一致度较高(Shannon信息指数为0.921 7- 0.995 3)。非加权类平均法(UPGMA)聚类结果显示, 10个种群的遗传距离与地理距离相关性不显著。麻疯树天然种群具有较低程度的遗传分化、较高的基因流, 种内及种群内多样性丰富, 这为麻疯树优良品种的选育提供了良好的遗传基础。     

海南粗榧(Cephalotaxus mannii Hk.f.) 5个种群遗传多样性及分化研究

采用垂直板型聚丙烯酰胺凝胶电泳测定了海南粗榧5个种群遗传多样性和遗分化程度。结果表明：海南粗榧种群遗传多样性水平较低,多态位点比率P＝0．33,等位基因平均数A＝1．33,平均期望杂合度为He=0．135,观察杂合度为Ho＝0139。种群间遗传分化程度较低,基因分化系数Gst=0.123,种群间遗传一致度和遗传距离的均值分别为0．9719、9．0288。黎母山种群与其它种群分化最大,其原因可能与传粉时盛行的风向有关。     

内蒙古亚洲小车蝗种群遗传多样性的微卫星分析

亚洲小车蝗Oedaleus asiaticus Bei-Bienko是我国北方草原和农牧交错区主要的害虫之一。为了从分子水平评价内蒙古地区亚洲小车蝗种群的遗传多样性和种群间遗传分化, 本文采用8对微卫星引物对内蒙古15个地点的亚洲小车蝗种群进行遗传多样性分析。结果表明： 各位点有效等位基因数为3.4517~13.2881, 多态信息含量值为0.5601~0.8563, Shannon氏多样性指数在0.7018~4.1789之间。15个种群的平均期望杂合度为0.6836, Nei氏期望杂合度为0.5303~0.6513, 群体遗传距离为0.1092~0.4235, 群体分化率Fst平均值为0.1612, 基因流Nm平均值为1.6164。8个微卫星位点均具有较高的多态性, 各种群间的遗传分化水平较大, 基因交流程度中等, 个体间的遗传变异大于种群间的遗传变异。15个不同地点的亚洲小车蝗种群根据遗传距离共聚为6支。种群间遗传分化与地理距离呈正相关关系。高山和沙漠对不同地区亚洲小车蝗种群的迁移具有阻碍作用, 可能是形成遗传分化的主要原因。研究结果从分子水平探索不同地区亚洲小车蝗种群间的内在联系, 为制定亚洲小车蝗的综合治理策略提供了分子生物学的基础资料。     

华东地区中华蜜蜂六地理种群的遗传多样性及遗传分化

目的】利用23对微卫星标记对来自于南昌、黄山、桐庐、费县、宜兴、武夷山6个华东地区的中华蜜蜂Apis cerana cerana种群进行遗传多样性及遗传分化分析。【方法】通过计算多态信息含量、平均杂合度、等位基因数、遗传距离、基因流、F 统计量等参数, 评估各中蜂种群遗传多样性和各种群间遗传分化。【结果】各座位的等位基因数为5（A014）至30（AP043）。所有种群均显示较高水平的期望杂合度, 其中, 武夷山中蜂最低, 为0.4280; 南昌中蜂最高, 为0.6329。各中蜂种群间存在极显著的遗传分化, 平均分化系数(Fst)为0.344。基于Nei氏遗传距离运用NJ聚类法将6个中蜂种群划分为3类。【结论】华东6个中蜂种群的遗传多样性较高, 遗传分化显著; 分析遗传分化与地理距离的关系发现, 华东6个中蜂种群间的遗传分化与地理距离不存在显著相关。     

内蒙古沙葱萤叶甲种群遗传多样性的微卫星分析

【目的】沙葱萤叶甲Galeruca daurica(Joannis)是一种近年来在内蒙古草原上猖獗成灾的新害虫,本研究旨在明确内蒙古沙葱萤叶甲不同地理种群间的遗传分化和基因交流程度。【方法】应用5对微卫星引物分析了沙葱萤叶甲8个地理种群的遗传多样性、基因流和遗传分化。【结果】5个位点等位基因数为10~18,有效等位基因数为9.2796~16.0388,多态信息含量值为0.6760~0.8985,期望杂合度为0.3430~0.5284,说明所选5个微卫星位点均为高度多态性位点。8个种群的期望杂合度为0.2216~0.3701,平均值为0.2680;种群间遗传分化系数为0.1244~0.4116,平均值为0.2521;种群间基因流为0.3574~1.7596,平均值为0.9622。8个地理种群根据遗传距离聚为3个分支,遗传距离与地理距离呈显著的正相关关系(r=0.4854,P=0.0180)。【结论】沙葱萤叶甲种群遗传多样性低,不同地理种群之间基因流较小,遗传分化程度高;沙葱萤叶甲迁移能力弱和地理阻碍可能是限制其基因交流和导致遗传高度分化的主要原因。     

青海省东部地区喜马拉雅旱獭种群遗传结构

本研究利用11个微卫星标记对采自青海省东部地区的13个喜马拉雅旱獭（Marmota himalayana）种群149个个体进行了基因分型,并运用种群遗传学方法对其遗传多样性和遗传结构进行分析。结果显示,11个微卫星标记位点共计检测到97个等位基因,各种群的平均观测杂合度和期望杂合度范围分别为0.58~0.82和0.60~0.79,种群遗传多样性水平相对较高;遗传结构分析表明,青海省东部地区的喜马拉雅旱獭种群具有显著的遗传结构,13个地理种群形成了3个遗传聚类群,且3个遗传聚类群与湟水河和黄河上游干流所划分出的地理单元完全一致,因此我们认为湟水河和黄河上游干流是阻碍该地区喜马拉雅旱獭种群进行迁移扩散和基因交流的天然屏障。同时,STRUCTURE分析结果还显示3个遗传聚类群间仍有明显的基因流,AMOVA分析也显示3个聚类群间变异百分比为6.60%,仅略高于聚类群内种群间的变异（4.51%）,而远低于种群内变异水平（88.90%）,表明三个聚类群间的分化程度并不是很深。这说明喜马拉雅旱獭可能通过桥梁或在枯水期等穿越河流进行基因交流。以上结果为该地区的旱獭种群监控和鼠疫防控提供了科学的理论基础。     

栗属中国特有种居群的遗传多样性及地域差异

采用超薄平板聚丙烯酰胺等电聚焦技术对栗属（Ｃａｓｔａｎｅａ（Ｔｏｕｒｎ．）Ｌ．）３个中国特有种即中国板栗（Ｃ．ｍｏｌｉｓｉｍａＢＬ．）、茅栗（Ｃ．ｓｅｇｕｉｎｉＤｏｄｅ．）和锥栗（Ｃ．ｈｅｎｒｙｉ（Ｓｋａｎ）Ｒｅｈｄ．ｅｔＷｉｌｓ．）的３０个居群,１２个酶系统的２０个位点进行了遗传多样性与遗传结构分析。结果表明：中国板栗在种和居群水平都具有较茅栗、锥栗高的遗传多样性（Ｐ分别为９０．０％和８４．７％,Ｈｅ分别为０．３１１和０．２９５）,尤以长江流域居群表现显著,揭示了长江流域的神农架及周边地区为中国板栗的遗传多样性中心。Ｎｅｉ的遗传一致度测量结果显示中国板栗和茅栗的亲缘关系最近,并且地理距离和遗传距离有一定的相关性。中国板栗、茅栗和锥栗的遗传分化程度逐渐增大,Ｇｓｔ分别为７．５％、１０．９％和２２．１％;基因流（Ｎｍ）分别为３．２０、２．０５和０．８８。研究结果为探明栗属起源、系统进化及制定保育策略提供了科学依据。     

都支杜鹃遗传多样性的ISSR分析

通过ISSR分子标记对都支杜鹃(Rhododendron shanii)5个居群114个个体的遗传多样性进行了分析。8个引物共检测到69个位点,其中多态位点36个,多态位点百分率 （P） 为52.17%;物种水平的Shannon多样性指数（I）为0.2536,Nei指数（H）为0.1659;居群水平的P、I和H分别平均为32.46%、0.1955和0.1344;Nei’s基因分化系数GST=0.1845,基因流Nm=2.2104;遗传结构的AMOVA分析显示,总的遗传变异中88.3%存在于居群内,11.7%存在于居群间;PCA分析和Splite Tree构建的NJ树均显示居群间分化小;遗传距离与地理距离显著相关。较强的基因流、多年生木本及异交与分布区狭窄等可能是导致都支杜鹃遗传多样性较低的主要原因。目前该种的保护应以就地保护为主,尤其要注意对大居群的保护。     

八面山银杉林的遗传多样性和群体分化

采用水平淀粉凝胶电泳技术对分布于湖南八面山的濒危植物银杉(cathaya argyrophylla Chun etKuang)的遗传多样性和群体分化进行了初步研究。对13个酶系统25个等位酶位点的检测表明,该地区的银杉林群体遗传变异水平很低,多态位点比率 P=0.28,等位基因平均数 A=1.36,平均期望杂合度He=0.100;但3个小群体间存在着明显的遗传分化,基因分化系数高达G_ST=0.26,明显不同于其它裸子植物的报道。八面山银杉林低水平的遗传变异和明显的群体分化,一方面反映了银杉的古老性和残遗性,另一方面也说明在银杉的进化过程中可能发生了严重的遗传漂变,而且群体之间的基因流明显受阻。     

我国盾叶薯蓣居群遗传结构分析

利用随机扩增多态DNA(RAPD)标记,分析研究了中国11个盾叶薯蓣居群82个个体的遗传多样性与遗传结构,15个寡聚核苷酸引物扩增共得到108条带,其中96条为多态带,占88．89％。Shannon多样性指数(I)为0．3093,居群水平的变异从0．1564到0．3098,物种水平的Nei基因多样度(h)为0．2499,居群水平的变化范围为0．1607到0．2137。遗传变异分析表明,物种水平的基因分化系数Gst为0．3415,居群间的基因流Nm为0．9641,居群间遗传交换小。分子方差分析(AMOVA)表明,居群内变异为68．96％,地区间变异为19．45％,居群问变异为11．58％。聚类结果以长江为界,将盾叶薯蓣分为南北两个大类群。研究结果对盾叶薯蓣种质的迁地保护有重要意义。     

Genetic structure of brown trout, salmo trutta l., at the southern limit of the distribution range of the anadromous form

Genetic variation at 33 protein loci was investigated in 41 wild brown trout populations from four river basins in Galicia (northwest Spain) to analyse the amount and distribution of genetic diversity in a marginal area, located in the distribution limit of the anadromous form of this species. The genetic diversity detected within populations (H between 0 and 6%) lies within the range quoted for this species in previous reports. The Mino, the most southern river basin analysed, showed a significantly lower genetic diversity and the highest genetic differentiation among the river basins studied. The hierarchical gene diversity analysis showed high population differentiation in a restricted area (GST = 27%), mostly due to differences among populations within basins (GSC = 22%). The reduction of GST observed when the isolated samples were excluded from the analysis (GST = 17%) showed the importance of habitat fragmentation on the heterogeneity detected. Gene flow among populations was comparatively evaluated by three indirect methods, which in general revealed low figures of absolute number of migrants per generation, slightly higher than 1. The gene flow among basins reflected a positive relationship with geographical distance. This trend was confirmed by the significant correlation observed between geographical and genetic distances, including all population pairs, which suggests a component of isolation by distance in brown trout genetic structure. Nevertheless, the nonsignificant intrabasin correlation demonstrates the complexity of genetic relationships among populations in this species. The model of genetic structure in brown trout is discussed in the light of the results obtained.     

Genetic diversity and differentiation in Dalbergia sissoo (Fabaceae) as revealed by RAPD

Dalbergia sissoo, a wind-dispersed tropical tree, is one of the most preferred timber tree species of South Asia. Genetic diversity and differentiation among natural populations of D. sissoo were examined for the first time. We found a relatively high level of genetic diversity in D. sissoo, both at the species level (percentage of polymorphic bands = 89.11%; H = 0.2730; I = 0.4180) and the population level (percentage of polymorphic bands = 68.7%; H = 0.239; I = 0.358), along with a relatively low degree of differentiation among populations (GST = 0.1311; AMOVA = 14.69%). Strong gene flow among populations was estimated, N(m) = 3.3125. The Mantel test suggested that genetic distances between populations were weakly correlated with geographic distances (R = 0.3702, P = 0.1236). The high level of genetic diversity, low degree of differentiation, strong gene flow, and weak correlation between genetic and geographic distances can be explained by its biological character and wide-spread planting. This information will be useful for the introduction, conservation and further studies of D. sissoo and related species.     

喜马拉雅-横断山区钟花报春居群遗传多样性及遗传分化

应用简单序列重复区间(ISSR,Inter-simple sequence repeat)分子标记,对喜马拉雅．横断山区钟花报春(Primula sikkimensis)进行居群遗传分析。用10个ISSR引物对13个居群的254个个体进行扩增,共检出91条扩增片段,全部为多态带,总的多态位点百分率为100％。Shannon多样性指数(Ho)从0．2293到0．4016,居群水平上平均值(HPCP)为0．3211,物种水平上(Hsp)为0．5576。利用分子方差(AMOVA)软件分析,其结果为：在总的遗传变异中,有50．28％的遗传变异属于居群之间;用POPGENE计算出的遗传分化系数GST=0．4127,即居群间的分化变异占居群总遗传变异的41．27％,比AMOVA分析所得的结果偏低。居群间遗传距离变化范围从0．0780到0．4748,遗传一致度(I)的变化范围从0．6220到0．9250。居群间的基因流Nm=0．7114,相对低的基因流可能是维持钟花报春居群遗传分化的原因。这表明,喜马拉雅．横断山区钟花报春的13个居群具有很高的遗传多样性,并且居群间的分化也很大。     

滇东南硬叶兜兰核心种质区群体遗传结构

本研究选取国内主要种质采集区-滇东南石灰岩地区7个不同干扰居群为研究对象,旨在对其居群内和居群间遗传变异进行比较研究,以期对其保护措施的提出提供理论依据。通过利用SRAP标记对167个体的遗传多样性和遗传结构研究,结果表明：10对SRAP引物共扩增出288个位点,多态位点比率（PPB）达81.25%,香侬指数（I）为0.3709,在种水平上的具有较高遗传多样性;而居群水平上的多态位点比率仅为47.92%, 香侬指数为0.2348, 居群间平均Nei’s遗传距离为0.1268。经分子遗传变异方差分析（AMOVA）表明,有66.27%的遗传变异来源于居群内,居群间变异占总变异33.73%,此结果与遗传分化系数（Gst=0.3568）结果吻合,居群间基因流（Nm）为0.902, 不同地区间硬叶兜兰居群存在较高的遗传分化; 7个居群的UPGMA聚类在遗传相似性系数达0.863,聚为两支;经Mantel检测（r =0.298, P＞0.05）,表明居群间遗传距离与地理距离无显著相关性。居群当前较高的遗传分化与其交配系统有关,其次,外在因素：人为采集、生境破坏和片断化造成居群内遗传多样性的丧失,加剧居群间的遗传分化,再次,遗传漂变也是另一重要影响因素;此外,适应性进化亦可能加剧了居群间的遗传分化,而基因流对遗传分化的影响不大。     

Genetic differentiation in Philippine bats of the genera Cynopterus and Haplonycteris

Genetic variation and differentiation in six island populations of two species ( Cynopterus brachyotis Müller and Haplonycteris fischeri Lawrence) of Philippine fruit bats (Chiroptera, Pteropodidae) were analysed using allozyme electrophoresis. Cynopterus is eurytopic and widespread in southeast Asia; Haplonycteris is stenotopic and endemic to the Philippines. Genetic variability within populations is consistently higher in Cynopterus , but differentiation between populations is much more pronounced in Haplonycteris. Genetic variation is not significantly correlated with island size in either species, but a positive trend is present in both. Levels of gene flow are sufficiently low to allow differentiation by genetic drift alone in Haplonycteris ( Nm = 0.05), but not in Cynopterus ( Nm = 7.5). There is no significant association between genetic distance and distance between sampling sites; however, between-population differentiation is positively related to degree of geographic isolation during Pleistocene periods of low sea level and to vagility and consequent levels of gene flow among populations. Significant effects of population size on genetic differentiation were not found. Genetic distance matrices for the two species share a common structure that is similar to patterns of mammalian faunal similarity for the Philippines as a whole, suggesting similar effects of geographic and/or environmental factors.