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1.
缙云山川鄂连蕊茶在不同群落类型中的RAPD分析   总被引:7,自引:2,他引:5  
操国兴  钟章成  谢德体  刘芸  龙云 《生态学报》2003,23(8):1583-1589
采用随机扩增多态性DNA(RAPD)对常绿阔叶林灌木层广布种川鄂连蕊茶(Camellia rosthorniana)在缙云山3个群落类型(毛竹林、针阔混交林和常绿阔叶林)中的遗传结构和DNA多样性进行了研究。10个引物共扩增出138个产物,其中115个是多态性的,多态位点比率为83.33%。Shannon指数估算的3个种群的遗传多样性为常绿阔叶林0.3345,毛竹林0.3148,针阔混交林0.3085,遗传分化为8.12%;Nei指数计算的3个种群的基因多样性为常绿阔叶林0.2095,毛竹林0.1981,针阔混交林0.1934,遗传分化为7.51%。种群间遗传距离在0.0177~0.0393之间。川鄂连蕊茶在3个群落中的种群大小和生长状况不同,各种群遗传多样性的高低可能是对所处群落生境的适应。  相似文献   

2.
欧洲中部刺槐种源群体等位酶变异研究   总被引:8,自引:1,他引:7  
从欧洲中部及美国收集了18个刺槐种源种子,以2年生苗木为材料,采用水平切片淀粉凝胶电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳对11个酶系统进行了检测,共发现20个酶位点,其中14个为多态位点,多态性位点百分数为70%。在参加计算的7个酶系统的12个多态性位点中,平均每个位点的等位基因数(A)和平均每位点等位基因有效数(Ae)为2.733和1.794,平均每个位点的实际杂合度(Ho)和预期杂合度(He)为0.368和0.400,固定指数(F)为0.080,绝大多数位点固定指数为正值。各基因位点遗传参数与12个位点平均值进行相关分析表明,Fe-6和Lap-a的大部分群体遗传参数(A、Ae、Ho、He等)与平均值存在紧密的相关关系,其他位点各项遗传参数和总平均值相关不明显,这些位点的重要性可能比相关性较好的位点更大。德国8个种源群体间遗传距离变化在0.09-0.26之间,来自匈牙利的6个种源之间遗传距离很小,绝大部分均在0.11以下;德国的8个种源与匈牙利和斯洛伐克的8个种源之间的遗传距离变化在0.09-0.24之间;来自美国的2个种源,与欧洲的种源间的遗传距离在0.09-0.23之间,这一距离没有超出欧洲种源之间的差异。匈牙利和斯洛伐克的8个种源群体的各项遗传参数均高于德国种源,表明这两个国家的遗传多样性水平较高。同时来自这两个国家的种源群体间变异系数变化在2.92%-9.97%,说明群体之间的遗传差别很小。德国的8个种源群体各项遗传参数相对较低,但群体间变异系数较高,群体间遗传差别较大。以各个国家为群体单位,4个群体间各项遗传参数的变异均较小,变异系数变化在3.861%-5.139%,表明刺槐种源间地理变异模式不明显。  相似文献   

3.
中国东亚飞蝗两个种群遗传分化的研究   总被引:3,自引:0,他引:3  
李春选  马恩波  郭亚平 《遗传学报》2003,30(11):1027-1033
采用水平淀粉凝胶电泳技术,分析了我国河北平山、辽宁葫芦岛两个蝗区东亚飞蝗自然种群的遗传结构。在酶谱分析的19个位点中,多数位点的等位基因数目较少,而位点Aat—l、Pgi和Mdh—2的等位基因数目相对较多。由于杂合子数目较少而使每个基因位点的平均杂合度降低(Ho=0.024和0.028)。对每个位点的各基因型进行x^2检验,绝大多数位点的基因型频率偏离Hardy—Weinberg平衡。较低的Fst值(Fst=0.021)表明两个种群的遗传分化程度不高。两个种群间较高的遗传一致度(I=0.991)和较小的遗传距离(D=0.092)也证实了上述结果。由此推测,该蝗虫较强的迁飞能力有可能增强种群间的基因交流,降低种群间的遗传分化。然而,在一些等位酶指标如位点Ao-2、Fbp—l、Mdh—2的等位基因频率分布、每个位点的平均等位基因数(A=2.5和2.7)和多态位点百分率(P=52.6%和57.9%)等,两个种群之间呈现出明显的差异。这也许与两个种群之间不同的生态环境条件和较远的地理距离有关。  相似文献   

4.
华北2蝗区东亚飞蝗种群遗传结构的比较研究   总被引:11,自引:4,他引:7  
利用水平淀粉凝胶电泳对采自天津北大港和河北黄骅两个相临蝗区的东亚飞蝗(Locusta migratoria manilensis)种群进行等位酶基因频率分析,比较了这两个种群的遗传结构,等位酶酶谱分析表明,19个基因座中4个基因座(Mdh-l,Pgm,Adk,G3pd)的等位基因频率变化很小,常见等位基因的频率均高于0.95,其他基因座有2-4个等位基因,但是两个种群的等位基因频率除两个基因座(Fbp,Got-2)外都很相似,多态位点的27个χ2检验表明,由于常见等位基因纯合子的高频率的和相应杂合子的缺乏,仅有北大港种群的2个基因座(Pgi,Got-1)符合Hardy-Weinberg平衡,在每个种群内的蝗虫存在明显的遗传变异,但在种群间遗传结构极为相似,多态位点的百分数P分别为73.7%和78.9%,每个基因座的平均等位基因数A为2.9和3.1,平均每个基因座的实际杂合度几乎相等(约为0.138),F-统计量(FST=0.053)也表明了两个种群间的遗传 一致性,遗传相似性系数(I)高达0.938,这些结果提示,这两个种群可能属于1 个大种群,在两个种群的一定位点上的遗传多态性和分化可能都与迁飞因素有关,因为东亚飞蝗的高度扩散能力有利于遗传结构的连续分布,高度的迁飞能力也导致个体暴露于各种不同的环境,而在种群水平上的遗传为异能增强种群在各种生态条件生存和繁殖能力,因此,迁飞有利于维持东亚飞蝗种群的遗传多态性的动态平衡。  相似文献   

5.
加拿大披碱草与野大麦 2个四倍体多年生禾草杂交产生的属间杂种F1为三倍体 (2n =3x =2 1) ,丢失了与亲本染色体基数相同的 7条染色体。为查明该杂种F1的染色体构成 ,应用基因组分子原位杂交方法 ,将父本(♂ )野大麦基因组 (H1H1H2 H2 )DNA用荧光生物素标记作为探针 ,以母本 (♀ )加拿大披碱草基因组 (SSHCHC)DNA作为封组 ,对杂种F1根尖细胞有丝分裂中期的染色体DNA进行原位杂交。结果表明 :三倍体杂种F12 1条染色体中 ,有 14条出现偏黄色荧光信号 ,来自父本 (♂ )野大麦H1H2 基因组有 7条出现橙红色荧光信号 ,来自母本 (♀ )加拿大披碱草S基因组、加拿大披碱草HC 基因组的 7条染色体丢失。  相似文献   

6.
冷蒿种群在放牧干扰下遗传多样性的变化   总被引:17,自引:2,他引:15  
王静  杨持  尹俊  王铁娟  刘朋涛 《生态学报》2004,24(11):2465-2471
通过随机扩增多态性 DNA(RAPD)方法检测了放牧干扰下冷蒿种群遗传多样性的变化。 17条 (组 )引物进行 RAPD分析 ,扩增共产生 2 5 4条带 ,其中 2 4 0条为多态性带 ,多态位点百分率达 94 .4 9%。随着放牧强度的增加 ,冷蒿种群多态位点百分数 ,Nei遗传多样性指数、Shannon信息指数均下降 ,种群内个体平均遗传一致度增加。放牧梯度上 4个冷蒿种群 H t=0 .2 116 ,Hs=0 .170 0 ,Dst=0 .0 4 16 ,种群间基因分化系数 Gst=0 .196 5 ,基因流 N*m=2 .0 4 5 1;同时随着放牧强度的增加 ,种群间的 Dst、Gst增加 ,N*m 降低。说明放牧限制了种群间的基因交流 ,使种群发生遗传分化。放牧梯度上的 4个冷蒿种群的遗传距离很小 ,但是随着放牧强度的增加 ,遗传距离在缓慢的增加 ,种群间的遗传一致度降低。根据遗传距离所构建的 U PGMA聚类图中冷蒿 4个种群随着牧压的增加 ,逐级聚在一起。这表明冷蒿种群的遗传分化与放牧强度的关系  相似文献   

7.
采用SSR技术对黄淮麦区以1B/1R类品种为抗源育成的38个小麦品种进行聚类分析。39个SSR引物共扩增出186条谱带,其中143务为多态性条带,占76.9%。每个引物可扩增出1~9条多态性条带,平均3.7条。位点多态性信息含量PIC变幅为0.320-0.857,平均为0.634。聚类分析表明,在遗传距离GD值0.32水平上38个小麦品种可聚成六大类。品种间遗传距离GD变幅为0.10769~0.48571。SSR标记揭示出这38个具有黑麦血缘的小麦品种遗传变异较小,遗传基础比较狭窄。  相似文献   

8.
采用水平淀粉凝胶电泳技术及应用等位酶分析方法,研究我国河北黄骅、辽宁葫芦岛宽翅曲背蝗两个自然种群的遗传多样性和遗传分化。在检测的11种酶15个酶基因座位中,Adk-I、Fbp-I、Mdh-2和G3pd-I基因座位的等位基因少,而Fbp-2、Mdh-I和Me-I基因座位的等位基因多。对每个基因座位的各基因型进行χ^2检验,除Mdh-I在辽宁葫芦岛种群、Adk-I在河北黄骅种群分别符合Hardy-Weinberg平衡外,其余绝大多数基因座位的基因型频率显著偏离Hardy-Weinberg平衡。两个种群之间存在明显的遗传多样性和分化:多态位点百分率分别为100%和93.3%,等位基因平均数分别为3.1和2.5,平均杂合度观测值分别为0.086和0.061。与其他非迁飞性蝗虫如中华稻蝗(Oxya chinensis)比较,这种蝗虫种群的平均杂合度较低但遗传多态性较高。结果表明:该蝗虫较强的跳跃能力可使个体暴露于各种不同环境,有利于维持种内遗传多态性的动态平衡,而种群保持较高的遗传多态性能增强该物种在不同栖息地的生存和繁殖能力。F-统计量表明两个种群之间的遗传分化相对较小,但这种分化显著高于迁飞性蝗虫如东亚飞蝗(Locusta migratoria manilensis)。Nei的遗传一致度(I)和Roger的遗传距离(D)的结果分析揭示了两个种群之间较高的遗传一致度(I=0.904)和较小的遗传距离(D=0.256)。然而,在一些酶基因座位如Aep-I(Fst=0.462)和Pgi-I(Fst=0.182),F-统计值相对较大,遗传分化比较明显。  相似文献   

9.
利用筛选的24个随机引物,对日本白鲫(Carassius Curatus Cuvieri)(♀)×德国镜鲤(Cyprinus carpio var specularis Lacepede)(♂)杂种一代及双亲进行RAPD分析。结果表明:在德国镜鲤、日本白鲫、F1中检测到的位点数分别为200、207、218,其中多态性位点数分别为63、66、72,多态位点比例分别为31.5%、31.9%、33%。F1多态位点高于父母本,表明它的遗传多样性和变异水平最高。3个群体间的遗传距离分别为0.3068(德国镜鲤和日本白鲫)、0.2041(德国镜鲤和F1)、0.1961(日本白鲫和F1)。德国镜鲤和日本白鲫的遗传距离最大,表明它们之间具有最大的杂交潜力,F1与父本遗传距离大于F1与母本遗传距离,表明F1与母本亲缘关系更近。从扩增谱带中找到了1个引物(S21)的特异性带是德国镜鲤区分日本白鲫和F1的分子标记,找到4个引物(S79、S114、S331、S333)扩增出的特异性谱带是日本自鲫区分德国镜鲤和F1的特异标记,还有1个引物(S106)扩增的特异性谱带可以作为F1区分父母本的遗传标记。在3个群体所有个体的UPGMP分支图中,所有个体分别成3个群分支,清晰地反映出个体间的相互关系。  相似文献   

10.
实验兔三个封闭群微卫星DNA多态性遗传分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的 对日本大耳白兔、青紫蓝兔、新西兰兔三个封闭群体开展群体遗传学分析.方法 利用10个微卫星位点,进行Hardy-Weinberg平衡(HWE)检验,统计三个种群的基因频率、观测杂合度、期望杂合度、F值和遗传距离.结果 青紫蓝品种在12L1E11位点,新西兰品种在INRACCDDV0087位点与INRACCDDV0203位点,日本大耳白兔在Sat12位点与INRACCDDV0203,P<0.05,显著偏离HWE,多数表现为杂合子缺陷;三个群体在Sat13、So144、6L1F10、7L1F1、12L4A1、INRACCDDV0016点上均符合HWE;各位点平均等位基因数5.9,种群整体基因频率差别较大,其范围为0 -0.9060;三个种群的平均观测杂合度为0.6204,平均期望杂合度为0.6178;群体间分化系数(Fst)平均为0.0750,日本大耳白兔和青紫蓝兔遗传距离最近为0.1223,青紫蓝兔与新西兰兔遗传距离最远为0.1934.结论 三个种群的遗传结构均表现出遗传稳定性和均一性,在10个微卫星位点上呈现高度多态性,种群间遗传分化明显.  相似文献   

11.
利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对小麦族披碱草属、鹅观草属和猬草属3个属的模式种进行了基因组DNA多态性分析。42个引物产物的290条谱带中,257条(88.62%)表现出多态性,说明披碱草属、鹅观草属和猬草属3个属的模式种间具有丰富的遗传多样性。利用290个RAPD标记,计算材料间Nei氏遗传相似性系和遗传距离,在NTSYS程序中利用UPGMA进行聚类。结果表明,Elymus sibiricus种不同居群间的遗传差异较小,遗传距离在0.097-0.180之间。E.sibiricus,Roegneria caucasica和Hystrix patula的种间遗传差异明显,遗传距离在0.458-0.605之间。H.patula与E.sibiricus的亲缘关系较近。R.caucasica与E.sibiricus的亲缘关系较远。  相似文献   

12.
垂穗披碱草(Elymus nutans)和老芒麦(Elymus sibiricus)皆为花序下垂类披碱草属物种,高海拔地区的E.sibiricus的部分变异类型也具有小穗紧密排列等特征,与E.nutans在形态学性状上具有较多的交叉,造成野外种质资源采集时进行直接的田间鉴定存在困难。本研究利用12对小麦族SSR引物对8份垂穗披碱草和10份老芒麦种质进行遗传变异和物种鉴定分析,UPGMA聚类分析表明供试材料明显可依据物种差异划分成两大类,主向量分析(PCo A)与聚类分析的结果保持一致。种质间遗传相似系数分析和分子方差分析(AMOVA)也表明种间变异远高于种内。另外,本研究筛选出3对引物,ESGS79和ESGS155能够在垂穗披碱草材料中扩增出特异性条带,Xgwm311能够在老芒麦材料中扩增出特异性条带,这3对引物能够作为区分垂穗披碱草和老芒麦的依据,为野外种质资源的收集以及田间育种工作提供指导。  相似文献   

13.
Genetic diversity of Elymus sibiricus (Poaceae) was examined in eight populations from the southeast Qinghai-Tibet Plateau. We detected 291 RAPD polymorphic loci in 93 samples. The percentage of polymorphic bands (PPB) was 79%. Genetic diversity (H(E)) was 0.264, effective number of alleles (N(E)) was 1.444, Shannon's information index (H(O)) was 0.398, and expected Bayesian heterozygosity (H(B)) was 0.371. At the population level, PPB = 51%, N(E) = 1.306, H(E) = 0.176, I = 0.263, and H(B) = 0.247. A high level of genetic differentiation was detected based on Nei's genetic diversity analysis (G(ST) = 32.0%), Shannon's index analysis (33.7%), and the Bayesian method (θ(B) = 33.5%). The partitioning of molecular variance by AMOVA demonstrated significant genetic differentiation within populations (60%) and among populations (40%). The average number of individuals exchanged between populations per generation (N(m)) was 1.06. The populations were found to share high levels of genetic identity. No significant correlation was found between geographic distance and pairwise genetic distance (r = 0.7539, P = 0.9996). Correlation analysis revealed a significant correlation (r = 0.762) between RAPD H(E) found in this study and ISSR H(E) values from a previous study.  相似文献   

14.
根据形态和叶片微形态特征讨论无芒披碱草的归并   总被引:1,自引:0,他引:1  
苏旭 《西北植物学报》2008,28(7):1333-1338
通过形态学观测和叶片解剖特征分析,比较了无芒披碱草、短芒披碱草及老芒麦3个近缘种的主要性状差异,以探讨无芒披碱草的系统分类归属.结果表明,在外部形态上无芒披碱草与短芒披碱草差异甚小,难以进行区分,但与老芒麦差异明显,是典型的种间关系;在叶片解剖上,无芒披碱草的绝大多数特征与短芒披碱草的一致或类同,可与老芒麦的却存在明显间断.故研究认为:无芒披碱草与短芒披碱草是同一个种,无芒披碱草应作为短芒披碱草的异名.  相似文献   

15.
Random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers were used to determine the levels and pattern of molecular variation in four populations of Elymus trachycaulus, and to estimate genetic similarity among different populations of E. trachycaulus from British Columbia and the Northwest Territories and one population of Elymus alaskanus from the Northwest Territories. Based on 124 RAPD bands (loci), mean percent polymorphic loci for E. trachycaulus (PP) was 67.4% (a range 41.2% to 86.3%), and mean gene diversity (He) for E. trachycaulus species was 0.23 (range 0.18 to 0.27). The total genetic diversity was 0.32. Differentiation among populations was 31% (FST = 0.31) with most of the genetic variation found within populations (69%). This pattern of genetic variation was different from that reported for inbred species in general.The authors are very grateful to Michael Bond for excellent Laboratory assistance, to Dr. Mary Barkworth for her encouragement. This study was supported by a Natural Science and Engineering Research Council (NSERC) discovery grant and by a Saint Marys University Internal grant to G.S.  相似文献   

16.
老芒麦遗传多样性及育种研究进展   总被引:2,自引:0,他引:2  
老芒麦(Elymus sibiricus)的研究对我国北方草原及青藏高原高寒草甸的退化草地改良、发展草地畜牧业具有重要意义。本文综述了老芒麦在形态学、细胞学、蛋白质和DNA分子水平上的遗传多样性研究概况,并总结了国内老芒麦的育种研究进展。目前国内外专门针对不同老芒麦种质材料(accession)或居群(populations)遗传多样性的研究鲜见报道,相关研究主要集中在与披碱草属(Elymus)及其近缘小麦族物种的系统进化研究方面;其次,我国仅有6个老芒麦国家审定品种,且育种手段较单一、落后,育成品种优势集中在产量和适应性上,缺乏对抗逆性种质的筛选培育。  相似文献   

17.
老芒麦(Elymus sibiricus)种群地上生物量空间分布格局研究   总被引:3,自引:0,他引:3  
采用分形几何学的方法对老芒麦(Elymus sibiricus)种群地上生物量空间分布格局进行了研究,结果表明:1)在某一时刻老芒麦不同植株地上生物量的空间分布格局具有相似性,7月6日的分形维数最大,为1.5054;6月16日、7月31日以及8月10日的分形维数较小,分别为0.7001、0.4675和0.3428。2)虽然在整个生长季内,老芒麦地上生物量与株高的对数值之间存在线性关系,但仍然存在许多细节问题,3)老芒麦株高在20-59cm尺度范围内,双对数半方差图存在明显的2个线性区域,反映出生物量空间分布格局的异质性。4)高度间隔为4cm以下的分形维数为1.63465,高度间隔大于4cm时的分形维数为1.0407。  相似文献   

18.
分析了老芒麦和垂穗披碱草rDNA-ITS序列,为这两个种的鉴别提供分子指纹图谱,为系统发育提供分子生物学依据。结果表明,22份材料的ITS、ITS1、5.8S、ITS2序列长度均相同,依次为604bp、222bp、164bp、218bp,GC含量依次为62.25%~63.08%,62.16%~63.06%,59.76%,64.22%~65.60%。除5.8S外,碱基位点都有不同程度的变化,一些变异位点有明显的种性变异规律,可作为老芒麦和垂穗披碱草种质DNA指纹特异鉴别位点。7个ITS序列的同源性98.7%~99.8%,遗传分歧0.2~1.3,具有保守性,为非近期分化类群。系统发育分析表明不同来源地的同种材料,差异主要表现在DNA变化快慢及碱基替换数,但相同的种归为一类,进一步反映了种内的遗传稳定性。  相似文献   

19.
Genome constitution and genetic relationships between six Elymus species were assessed by physical mapping of different repetitive sequences using a technique of sequential fluorescence in situ hybridization and genomic in situ hybridization.The six Elymus species are all naturally growing species in northwest China,namely,E.sibiricus,E.nutans,E.barystachyus,E.xiningensis,E.excelsus,and E.dahuricus.An StStHH genome constitution was revealed for E.sibiricus and StStHHYY for the remainder species.Each chromosome could be clearly characterized by physical mapping with 18S-26S rDNA,5S rDNA,Afa-family,and AAG repeats,and be allocated to a certain genome by genomic in situ hybridization.Two 5S rDNA sites,each in the H and St genomes,and three 18S-26S rDNA sites,two in the St genome and one in the Y genome,were uncovered in most of the species.The strong Afa-family hybridization signals discriminated the H genome from the St and Y genomes.The H and Y genome carried more AAG repeats than St.A common non-Robertsonian reciprocal translocation between the H and Y genomes was revealed in E.barystachyus,E.xiningensis,E.excelsus and E.dahuricus.Comparison of molecular karyotypes strongly suggests that they can be classified into three groups,namely,E.sibiricus,E.nutans,and others.  相似文献   

20.
 To gain information on the extent and nature of genetic variation in Elymus alaskanus, levels and distribution of genetic variation were assessed within and among 13 populations originating from Iceland, Norway, Sweden and Russia using allozymes. The results showed that four (30.7%) of the 13 loci were polymorphic within the species, while the mean percentage of polymorphic loci within the populations was 1.9%. The mean number of alleles per locus for the species was 1.8 and 1.02 across the populations. Genetic diversity at the species level was low (H es=0.135), and mean population diversity was notably lower (H ep=0.005). A high degree of genetic differentiation was observed among populations. The salient points emerging from this study are: (1) statistically significant differences were found in allele frequencies among populations for every polymorphic locus (P<0.001), (2) the high mean coefficient of gene differentiation (G ST) showed that 95% of the total allozyme variation was attributable to differences among populations, and (3) relatively high genetic distances between the populations were obtained (mean D=0.16). The Norwegian populations had the highest genetic diversity as compared with the other populations. Geographical comparisons revealed three different groups of populations clearly differentiated, i.e. Scandinavia (Norway and Sweden), Iceland and Russia. Cluster and principal coordinates analyses revealed the same genetic patterns of relationships among populations. Generally, this study indicates that E. alaskanus contains low allozymic variation in its populations. The implications of these results for the conservation of the species are discussed. Received: 23 October 1998 / Accepted: 19 December 1998  相似文献   

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