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1.
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新疆甜瓜地方品种资源核心种质构建
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张永兵 伊鸿平 马新力 李寐华 吴明珠《植物遗传资源学报》,2013年第14卷第1期
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新疆甜瓜地方种质资源具有丰富的遗传多样性,是新疆哈密瓜遗传改良的重要基因库。以121份新疆甜瓜地方品种为研究对象,结合按来源分组和系统聚类选择的方法,通过多重比较29个表型性状数据确定适宜的取样比例,筛选出25份地方品种为初选核心种质。在初选核心种质取样量上,人工定向补充5份优异种质和极值材料确定了核心种质,约占地方品种总数量的25%。对表型保留比例、遗传多样性指数、变异系数、表型频率方差、极差符合率、均值符合率、标准差符合率等检验参数进行了检验和评价。结果表明:调整后的核心种质除标准差符合率降低外,其余参数均优于或等于初选核心种质,更能代表原始样品;所构建的核心种质很好地保留了所有地方品种资源的遗传多样性和变异幅度。
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2.
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葡萄种质资源初级核心群的构建 被引次数：3
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刘鑫铭 刘崇怀 樊秀彩 郭大龙 张国海 孙海生《植物遗传资源学报》,2012年第13卷第1期
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以国家果树种质郑州葡萄圃保存的867份栽培种质为材料,对47项表型性状进行了主成分分析。采用欧氏遗传距离、离差平方和法进行种质初选。采用分组和逐步聚类法,分别以15%、20%、25%和30%的比例抽样,依次获得124、170、205和252份种质。通过对初选种质的遗传多样性指数、表型保留比例的分析,检验初级核心群的构建效果。结果表明,按种质类型分组,组内采用平方根策略、15%抽样比例获得的124份初选种质的表型保留比例和遗传多样性代表性均达到96%,表明构建的初级核心群对原始种质具有很好的代表性。
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3.
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利用SSR分子标记检测黄淮夏大豆(Glycine max)初选核心样本的代表性 被引次数：17
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崔艳华 邱丽娟 常汝镇 吕文河《植物遗传资源学报》,2003年第4卷第1期
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作物核心种质是用最小的样本代表其全部遗传资源的最大遗传多样性。为了检测大豆初选核心样本取样的代表性，本研究从黄淮夏大豆初选核心样本中，随机选取两个类群，其材料数分别为20份和14份；从保留种质的相应奥群中，分别随机选取6份和5份，共计45份材料，进行14个农艺性状和20对SSR引物的分析。对两组材料进行农艺性状聚类．保菌种质与初选核心种质聚在了一起；利用SSR分子标记数据聚类，也得到了相同的结果。初选核心样本两个类群材料的等位变异数分别为129个，136个；保留种质相应类群材料的等位变异分别为76个，71个；初选核心种质两个类群材料分别包合了整个资源86.00％和86．62％的遗传多样性。本研究为大豆核心种质构建及检测提供分子水平的依据。
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4.
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利用SSR标记构建江西稻种资源核心种质库的研究
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黎毛毛《植物遗传资源学报》,2012年第13卷第6期
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以3187份江西地方稻种资源为材料,依据籼粳、早中晚、粘糯、糙米色和谷粒形状等5个质量性状进行分组,组内按8个稻作区再分为不同的亚组。利用SSR标记对各亚组和组内种质资源进行遗传多样性和聚类分析,建立了包括296份种质的江西地方稻种资源核心种质库,占资源总数的9.28%。
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5.
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基于表型数据的辣椒核心种质构建研究
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雷 刚 周坤华 方 荣 吴 茵 陈学军《西北植物学报》,2016年第36卷第4期
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以收集保存的603份辣椒种质为材料，根据果形指数大小将其分成5组。基于28个性状的表型数据，采用简单比例、平方根比例、对数比例及遗传多样性指数比例法计算各组内取样份数，比较4种组内取样比例法、6种总体取样规模和2种取样方法在构建辣椒核心种质中的作用和效果。结果表明：（1）简单比例、平方根比例、对数比例、遗传多样性指数比例法入选的材料份数占预选核心种质份数依次为24.2%、22.2%、21.1%、17.8%，说明遗传多样性指数比例法对各组取样数量的修正能力最强，使取样更加均衡。（2）当总体取样规模为15%时，遗传多样性指数比例法构建的预选核心种质遗传多样性指数（I）达到最大，表型保留比例（RPR）超过98%；当总体取样规模超过20%时，RPR值、变异系数（CV）和极差符合率（CR）虽然平缓增加，但I值反而减小；说明15%为合适的总体取样规模。（3）利用对数比例法和多样性比例法，在15%的总体取样规模下，聚类取样构建的核心种质I值、RPR值、CV值及CR值均高于随机取样。（4）该研究根据所获得的优化方案最终在表型水平建立了包含91份种质的辣椒核心种质。
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6.
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中国芒(Miscanthus sinensis)初级核心种质的构建
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肖亮 易自力 蒋建雄 刘树玲 覃静萍 伊俊奇 杨塞《植物遗传资源学报》,2014年第15卷第6期
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以555份芒(Miscanthus sinensis)种质资源为研究对象,根据26个表型性状数据,按地理来源、植物区系和单一性状进行分组,分别采用简单比例法、平方根法和多样性指数法确定组内取样数,再根据聚类和随机2种方法进行组内个体选择。依照上述方案共构建出19个具有代表性的芒初选核心种质样本库。通过平均相似系数、性状符合度、数量性状变异系数和遗传多样性指数等4项检测指标对上述19种构建方案进行比较,最终确定了按"植物区划分组+多样性指数确定取样数+聚类选择个体"为芒初级核心种质构建的最佳方案。通过此方法建立起的芒初级核心种质资源共83份,占总资源的14.95%,且新构建的初级种质资源与总资源性状符合度达到100%。
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7.
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长江春大豆核心种质构建及分析 被引次数：35
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王丽侠 李英慧 李伟 朱莉 关媛 宁学成 关荣霞 刘章雄 常汝镇 邱丽娟《生物多样性》,2004年第12卷第6期
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利用长江春大豆初选核心种质SSR(simple sequence repeat）标记和农艺性状表型等基础数据，对用不同个体取样方法以及不同数据类型建立的核心种质进行评价，目的是确定中国大豆（Glycine max）核心种质的最佳取样策略提供依据，结果表明，根据SSR分子数据聚类，采用类内随机取样，类内以遗传相似性系数取样以及仅依据遗传相似性系数取样都可用于大豆核心种质构建，但是综合不同评价参数发现，以类内随机取样最佳，类内按遗传相似性系数取样次之，单独以遗传相似性系数取样较差。分析不同SSR等位变异保留比例的遗传多样性指数发现，当保留90%和80%的SSR等位变异时，核心种质具有更高的遗传多样性，由于与SSR分子数据种质遗传关系评价的不一致性，农艺性状等基础数据虽然可用来构建核心种质，但其SSR分子水平代表性相对较低，本研究结果还表明，用不同方法或同一方法不同重复次数取样建立的核心种质具有异质性，且这种异质性随核心种质取样比例的降低而增大，因此，虽然可依据不同数据类型确定相应的方法建立核心种质，但综合表型和分子数据建立的核心种质更具有代表性。
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8.
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灰楸形态多样性分析及核心种质初步构建
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李秀兰《植物遗传资源学报》,2013年第14卷第2期
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根据对267个灰楸的15个相关性状的方差和主成分等统计分析结果,评价灰楸种质资源的形态多样性。并且将种质资源按地理流域进行分组,以欧氏距离结合离差平方和的方法进行系统聚类,以生产或育种过程中起过重要作用的品种为必选材料,初步构建了63份核心种质,占总种质的23.6%。63份核心种质和总种质遗传多样性t检验未达到显著水平,表明初步构建的灰楸核心种质能代表总体资源的遗传多样性。
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9.
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中国普通菜豆种质资源朊蛋白变异及多样性分析
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雷蕾 王兰芬 武晶 姜奇彦 王述民《植物遗传资源学报》,2017年第18卷第6期
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朊蛋白是研究普通菜豆遗传多样性的一种重要且有效的生化标记.本试验通过SDS-PAEG凝胶电泳检测中国普通菜豆种质资源的朊蛋白变异类型,分析中国普通菜豆种质资源的遗传多样性及组成特点.来自中国13个省(自治区)的445份供试材料共检测到S、Sb、Sd、B、C、CA、T、PA、To、H、H1、CH 12种朊蛋白类型,表明中国普通菜豆种质朊蛋白变异类型丰富,遗传多样性水平较高.其中,Sb型朊蛋白种质最多,占比29.0％;T型其次,占比28.1％.依据朊蛋白类型在不同基因库的特异性,将研究材料明显地区分为中美基因库和安第斯基因库两大类.研究还发现中国普通菜豆种质资源中地方种质朊蛋白类型变异丰富,多样性明显高于现代育成品种或品系.最后,对种质朊蛋白类型与百粒重、子粒颜色、粒型进行相关性分析,结果表明朊蛋白类型与百粒重呈极显著正相关,而朊蛋白类型与子粒颜色、粒型2个性状之间无明显相关性.本研究结果将为普通菜豆种质资源的保护及有效地挖掘优质种质资源提供理论依据.
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10.
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中国茶树初选核心种质遗传多样性的RAPD分析 被引次数：5
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李娟 江昌俊 王朝霞《遗传》,2005年第27卷第5期
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以中国茶树初选核心种质中的69份种质为实验材料，采用改良的SDS法提取它们的基因组DNA，并运用优化的RAPD分析体系对基因组DNA进行分子标记遗传差异研究。从50个随机引物中筛选出32个扩增效果好的引物,对全部试验材料进行了RAPD扩增共得到348条有效带,其中多态性带为328条(占94.3%)，它们之间的遗传距离为0.223～0.723。研究结果表明中国茶树初选核心种质的遗传结构、遗传多样性和遗传距离基本上能较好的代表中国的茶树种质资源。同时，指出结合形态标记和DNA分子标记是构建茶树核心种质较好的选择。
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11.
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华南地方稻种资源初级核心种质构建 被引次数：2
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陈雨 潘大建 刘斌 范芝兰 曲延英 陈建酉 李晨《植物遗传资源学报》,2008年第9卷第3期
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根据核心种质理论，以表型调查数据为基础，按照丁颖水稻分类体系与系统聚类取样相结合的方法，并通过多重比较确定了适宜的取样规模，最终从4020份华南地方稻种中筛选出436份材料构建了初级核心种质，中选比例10.8％。利用表型保留比例、多样性指数、表型频率方差和变异系数等重要参数对初级核心样品代表性进行检验。结果表明，所选初级核心样品很好地代表了原种质的遗传多样性和变异幅度。
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12.
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基于农艺性状的山西普通菜豆初级核心种质构建
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郝晓鹏 王燕 田翔 郜欣 畅建武《植物遗传资源学报》,2016年第17卷第5期
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利用663份山西省普通菜豆资源基于14个农艺性状,采用比较不同分组原则、取样比例和总体取样量不同组合的取样方法,确定了“地理来源+平方根比例+20％总体取样量”为山西省初级核心种质构建的方法.同时,在此基础上对663份资源中一些具有极端性状的资源进行选择,最终确定152份普通菜豆可作为山西省普通菜豆初级核心种质.通过总体与初级核心种质资源多样性分析,数量性状均值比较,数量性状极值、变幅和标准差比较,性状多样性的差异性分析和各性状总体分布的x2检验,最终得出:152份普通菜豆资源能够代表山西省普通菜豆资源的总体,可作为山西省普通菜豆评价和创新利用的优先样品集.
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13.
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植物遗传资源学报 第四卷总目录
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《植物遗传资源学报》,2003年第4期
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创刊词 ( 1)封 2…………………………………………………………中国普通小麦初选核心种质的产生董玉琛等 ( 1) 1…………………利用SSR分子标记检测黄淮夏大豆 (Glycinemax)初选核心样本的代表性崔艳华等 ( 1) 9…………………………菜用大豆感官品质性状遗传变异及品质育种目标性状分析韩立德等 ( 1) 16……………………………………………………加工型马铃薯品种多酚氧化酶活性的变化规律王 清等 ( 1) 2 1……云南芋种质资源遗传多样性的RAPD分析沈 镝等 ( 1) 2 7…………小麦蛋白质含量的配合力和遗传力研究李世平等 ( 1) 3 2………
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14.
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基于形态性状的甘薯核心种质取样策略研究 被引次数：1
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李慧峰 陈天渊 黄咏梅 吴翠荣 李彦青 卢森权 陈雄庭《植物遗传资源学报》,2013年第14卷第1期
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选取15%的总体取样比例,采用2种分组方法、3种组内取样量比例和2种组内个体选择方法,分析了476份广西甘薯种质资源的18个农艺性状数据,构建出13个甘薯初级核心种质样本。为确定这些样本的代表性,分别与总体进行了5个指标的比较,包括表型保留比例、表型频率方差、遗传多样性指数、变异系数、极差符合率。结果表明,按资源类型分组优于按来源地分组;组内取样量以对数法代表性最好,简单比例法的代表性其次,平方根法最差;在个体选择中,最小距离逐步取样法优于随机法。因此,按资源类型分组,再按对数比例法确定组内取样量,通过最小距离逐步取样法选择个体是甘薯核心种质构建的最佳取样策略。
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15.
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利用表型数据构建陆地棉核心种质
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代攀虹 孙君灵 贾银华 杜雄明 王谧《植物遗传资源学报》,2016年第17卷第6期
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以5963份陆地棉种质资源为材料,根据品种主要突变性状和品种类型分组成11组群,在分组的基础上利用21个表型性状,用非加权类平均聚类分析法,构建了281份陆地棉核心种质,占全部种质资源总量的4.71％.利用不同性状的均值t测验、方差F测验、变异系数、多样性指数t检验、均值、极差、表型方差、变异系数、均值差异百分率、方差差异百分率、极差符合率、变异系数变化率、主成分分析等参数进行核心种质代表性检验和评价.结果表明,所构建的陆地棉核心种质可以代表全部种质的遗传多样性.
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16.
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中国花生核心种质的建立 被引次数：3
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姜慧芳 任小平 廖伯寿 黄家权 陈本银《武汉植物学研究》,2007年第25卷第3期
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以中国花生种质资源数据库中记录的6390份花生资源为材料,以其基本数据、特征数据和评价数据为信息,采用分层、层内分组聚类以及随机取样与必选资源相结合的方法,构建了由576份资源组成的花生核心种质,占基础收集品的9.01%。对核心种质的植物学类型组成和遗传多样性指数的分析,以及对各性状特征值、符合率和包含的主要抗病资源抗性等级及重要农艺性状资源的检测结果表明,本研究建立的核心种质是有效的。基础收集品中各种性状的遗传变异在核心种质中均存在,所用15个性状的各种特征值符合率均在90%以上,其中绝大部分性状的符合率达96%以上。
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17.
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中国普通菜豆形态性状分析及分类 被引次数：4
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张晓艳 王坤 王述民《植物遗传资源学报》,2007年第8卷第4期
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对129份中国普通菜豆地方品种的形态性状进行分析,结果表明,8个性状共检测到35个变异类型,平均变异类型为4.375个,平均多态信息含量为0.5638。中国普通菜豆包括安第斯和中美两个基因库种质,中美洲基因库资源在参试资源中比重较大,但安第斯基因库资源遗传多样性水平高于中美基因库材料。由中美基因库向安第斯基因库渗透的天然杂交种质可为普通菜豆高产、优质、抗逆育种提供有价值的桥梁品种。
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18.
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黄瓜多样性固定核心样本集的构建与评价
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张微 李斯更 沈镝 李锡香《植物遗传资源学报》,2016年第17卷第3期
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利用149对具有多态性的InDel引物对473份黄瓜初选核心种质自交系进行遗传多样性分析.采用3种方法12种取样比例对该初级遗传多样性固定群体进行抽样获得候选多样性固定核心样本集(GDFCC),使用等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Shannon's信息指数(Ⅰ)、基因多样性指数(gene diversity)、多态性信息含量(PIC)、总等位位点数(total number of loci)、等位位点保留百分率(retention rate of loci)评价候选多样性固定核心样本集的多样性和代表性,结果表明,采用逐级聚类+稀有基因优先取样法并按照15％取样比例构建出的多样性固定核心样本集的效果较好.比较发现,该核心样本集的Ne、I、基因多样性指数和PIC值均接近或高于初级遗传多样性固定群体,且对原始群体的等位位点的保留百分率为99.68％.入选多样性固定核心样本集的材料来自15个国家和国内18个省市.该研究为今后黄瓜优异基因资源的挖掘利用提供了代表性强、覆盖度广、遗传稳定的研究群体,将有利于黄瓜种质资源的高效研究利用.
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19.
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广西普通野生稻群体结构解析与核心种质构建
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潘英华 徐志健 梁云涛《植物遗传资源学报》,2018年第3期
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利用覆盖水稻12条染色体的64个分子标记,对广西境内已发现的283个野生稻自然居群按居群取样原则采集4173份代表性样本进行遗传结构分析并构建核心种质。结果显示,64个标记位点共检测出1180个等位变异,平均等位变异数为18.4375,Shannon指数为1.7367,Nei's多样性指数0.7182,表明广西普通野生稻资源遗传多样性十分丰富。同时,基于广西普通野生稻群体结构,构建了包含351份种质的广西普通野生稻核心种质,占原样本数的8.41%。广西普通野生稻核心种质,代表广西普通野生稻的多样性和特异性,为野生稻遗传资源的深入研究提供基础,从而为水稻育种提供应用信息。
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20.
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中国甘薯地方种质资源遗传多样性分析 被引次数：3
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赵冬兰 唐君 曹清河 周志林 张安《植物遗传资源学报》,2015年第16卷第5期
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利用形态农艺性状标记对来自17个省份的176份中国甘薯地方种质资源进行遗传多样性分析，结果表明形态标记并未按照这些地方种质的来源地聚类，176种质可以划分为5大类群，发现了复份保存的2对种质材料。对其中133份地方品种资源的品质特征进行比较和统计分析，筛选到高干物率、高淀粉种质11份，其中广东的爆皮王的干物率和鲜薯淀粉含量最高，分别为34.87%和23.32%；鲜薯可溶性糖≥4.00%的材料11份，其中来自云南的腾冲本地种可溶性糖含量最高，为5.22%；筛选到高蛋白材料2份。同时利用品质性状标记可将133份地方种质划分为5大类群，第Ⅰ类群主要为可溶性糖含量较高、干物率和粗蛋白含量较低的28份种质；第Ⅱ类群主要为干物率、淀粉含量和粗蛋白含量低，可溶性糖含量高的14份种质；第Ⅳ类群由可溶性糖含量最高的腾冲本地种1份种质构成；第Ⅴ类群由薯块干物率及鲜薯淀粉含量都很的4份广东品种构成；剩余的86份种质组成第Ⅲ类群，它们的各项表现不等。通过对我国甘薯地方种质资源遗传多样性的探索，以期为甘薯育种选配亲本提供参考，同时促进我国甘薯种质资源研究利用和种质创新。
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