塔里木盆地荒漠盐碱生境土壤放线菌的初步研究

采用常规方法研究了新疆塔里木盆地荒漠盐碱生境土壤放线菌区系、放线菌的耐盐、碱性及对植物病原真菌的拮抗性。结果表明:土壤放线菌区系较单一,仅分离到链霉菌属和拟诺卡氏菌属,其中以链霉菌属为主(98.57%),链霉菌可分10个类群,以白孢类群为优势类群。土壤含盐量愈高,链霉菌组成愈简单。放线菌的最适生长盐浓度多集中在6%~8%,最适生长pH集中在7~8。24株供试放线菌中,有4株中度嗜盐放线菌对供试靶标菌有拮抗性,占供试菌的16.67%。     

盐碱土壤与非盐碱土壤微生物的抗盐碱特性

为了比较分析盐碱土壤与非盐碱土壤微生物资源抗盐碱性差异,本研究利用含有不同浓度Na2CO3、NaHCO3和pH的培养基对盐碱土壤和非盐碱土壤细菌进行培养计数.结果显示:非盐碱土壤出菌数量随Na2CO3、pH和NaHCO3浓度升高而下降,盐碱土壤细菌出菌数量随着Na2CO3、pH和NaHCO3浓度升高先是升高然后下降,最高值分别出现在200 mmol/L NaHCO3、50 mmol/L Na2CO3和pH 9.0的分离平板上.此外,高Na2CO3、pH和NaHCO3浓度的平板中盐碱土壤出菌数量远高于非盐碱土壤;以上结果可见,耐盐碱细菌资源主要集中分布在盐碱土壤中,在非盐碱土壤中虽有分布,但是仅占有很少一部分.     

嗜盐碱球菌湛江新种的系统分类鉴定

根据经典微生物划线纯培养方法从湛江一个盐田泥样中分离获得1个嗜盐碱古菌菌株SCSIOCD13T,通过形态、细胞化学分类及分子发育等对其进行系统分类鉴定研究。经鉴定该菌细胞球形,好氧,革兰染色不定,在最适pH 8.5和37℃培养条件下,能够耐受2.5～5.5 mol/L盐浓度生长。16S rRNA基因序列比对分析显示,该菌株与嗜盐碱古菌Natronococcus属成员N.jeotgali B1T(99.2%),N.occultus NCMB 2192T(96.8%)和N.amylolyticus Ah-36T(95.8%)最相近,且系统发育树和细胞化学特征与Natronococcus属相一致。然而,系统发育树上显示该菌株与最相似菌种形成单独分支,且生理学特性显示出与最相似的3个物种具有明显的差异,包括盐浓度、pH耐受,镁离子需求,H2S产生,淀粉、明胶水解,抗生素敏感性等。另外,杂交结果显示,菌株SCSIO CD13T与最相似菌种Natronococcus jeotgali B1T的杂交值为23%;综合多相分类结果,菌株SCSIO CD13T应为Natronococcus属的一个新成员,将其命名为湛江嗜盐碱球菌新种(Natronococcus zhanjian-gensis),典型菌株SCSIO CD13T。     

新疆罗布泊地区可培养嗜盐细菌多样性

采用纯培养方法从新疆罗布泊盐湖中分离得到168株嗜盐细菌, 采用核糖体DNA扩增片段限制性酶切分析(ARDRA)研究了罗布泊嗜盐细菌的群落结构和多样性。通过限制性内切酶HinfI对108个菌株的16S rDNA进行酶切分型, 根据ARDRA的酶切图谱, 将其划分为12个操作分类单元。16S rDNA序列测定和系统发育分析结果显示, 分离菌株分布于喜盐芽孢杆菌属(Halobacillus)、芽孢杆菌属(Bacillus)、短杆菌属(Brevibacterium)、嗜盐单胞菌属(Halomonas)、色盐杆菌属(Chromohalobacter)、盐水球菌属(Salinicoccus)、库克菌属(Kocuria)、葡萄球菌属(Staphylococcus)、微球菌属(Micrococcus)等9个属及1个可能的新分类单元。其中Halomonas为优势菌群, Chromohalobacter、Halobacillus为次优势菌群。采用ERIC-PCR分析优势菌群Halomonas各菌株的基因组特征, 显示出有21种指纹图谱。研究结果揭示, 罗布泊嗜盐细菌不仅具有丰富的多样性, 还蕴藏着具有地域特点的新菌种资源。     

24株深海链霉菌耐(嗜)盐性及抗MRSA活性的初步研究

对24深海链霉菌的耐(嗜)盐性及抗MRSA活性筛选,结果显示,耐NaCl盐浓度在10%以上的有23株,中等嗜盐菌2株,16株具有抗MRSA活性,占66.7%.表明深海链霉普遍能耐受10%以上的NaCl浓度,而且大多在高盐浓度下代谢抗MRSA活性物质.     

嗜盐碱古生菌新种的系统分类学研究

从内蒙古乌都淖咸性盐湖分离到嗜盐碱菌菌株Y21。其形态为杆状,能运动,红色菌落,通过生理生化、极性脂成分、基于16SrRNA序列的系统发育学分析和DNADNA杂交同源性比较,发现菌株Y21是Natrilba属中一个与其它成员不同的新种,命名为Natrilbawudunaoensissp.nov.。     

一种嗜热厌氧纤维素降解细菌的分离纯化方法

根据纤维素降解细菌对不溶性纤维素底部的粘附作用,利用Ｈｕｎｇａｔｅ厌氧操作技术直接以不溶性纤维素粉为基质进行滚管,分离和纯化获得嗜热厌氧纤维素降解细菌。     

中度嗜盐菌的研究进展

地球上存在着多种多样的盐域环境,这类环境中有自然形成的,如死海,美国的大盐湖等水环境,还有盐土环境;人工形成的如盐场、盐池等;另外,还有很多盐腌制的食品。自然界的高盐环境由于形成过程和所处地质情况的不同其离子组成和盐浓度有很大差异。生活在这些高盐环境中的动、植物物种较为有限,而以处于不同类群的微生物,如绿藻、嗜盐古菌及嗜盐和耐盐的细菌等为主要生命形式。根据微生物对盐浓度的反应可分为不同的种(如表1[1])。     

嗜盐碱性淀粉酶产生条件和性质的初步研究

从我国内蒙古自治区察汗淖碱湖分离到一株能产胞外嗜盐碱性淀粉酶的极端嗜盐嗜碱杆菌(Natronobacterium sp.)C-212,该菌产酶的最适pH和NaCl浓度分别为9.5和20%,最适碳源为可溶性淀粉,氮源为复合蛋白胨.酶反应最适温度为50℃,pH为8.5,NaCl浓度为2.6mol/L,该酶在pH9.5最稳定,NaCl可增加酶的热稳定性,酶降解可溶性淀粉的主要产物为葡萄糖、麦芽糖、麦芽三糖及其他寡糖.     

可培养盐碱菌多样性的研究进展

存在于高盐强碱极端环境的微生物因其独特的生命方式,引起了广泛的关注。根据盐碱环境所含的可溶性盐成分,可分为\"NaCl型\"和\"苏打型(Na_2CO_3/NaHCO_3)\"两大类,前者的碱性pH值较低而后者碱性pH值较高。本文总结了盐碱菌适宜生长条件在盐度0.5 mol/L和碱性pH 9.0之上且有效发表的标准菌株,并对这些菌株的生物多样性及生理特性进行了阐述;可培养盐碱细菌的数量及其多样性远远大于盐碱古菌,但是盐碱细菌对高盐度和强碱性p H依赖程度相对较低。盐碱细菌主要组成依次为芽孢杆菌纲(Bacilli,占总数约40%)、γ-变形菌纲(γ-Proteobacteria,30%)、梭菌纲(Clostridia,11%)、δ-变形菌纲(δ-Proteobacteria,6%)和放线菌纲(Actinobacteria,6%),而盐碱古菌主要组成为盐古菌纲(Halobacteria,92%)和甲烷微菌纲(Methanomicrobia,8%)。这些极端微生物在生物地球化学过程中或生态循环中扮演着重要的角色和功能,挖掘和利用盐碱菌具有重要意义。     

耐盐碱石油烃降解菌的筛选、鉴定及其耐盐碱性研究

从大港油田区石油污染盐碱化土壤和油泥中筛选得到10株耐盐碱石油烃降解菌,通过形态特征、生理生化特征和16S r RNA序列分析确定这些菌株为苍白杆菌属、葡萄球菌属、迪茨菌属、棒状杆菌属、无色杆菌属、微杆菌属、芽孢杆菌属。通过液体培养试验,研究了10株菌的耐盐碱能力。结果表明,除B07仅能耐受3%盐度外,其他菌株均能耐受5%或者更高的盐度环境,其中B02和B05在盐度高达11%时仍具有较高的生长活性;10株菌均能耐受p H为9的碱度环境,B01、B03、B04、B06、B09能耐受p H为10的环境,其中,B03和B04在p H为11时仍具有较高的生长活性。研究表明石油烃降解菌在不同微生物种属中广泛存在,并具有较好的耐盐碱特性,有望在石油污染盐碱化土壤修复中广泛应用。     

Effect of media composition,including gelling agents,on isolation of previously uncultured rumen bacteria

The aim of this study was to develop novel anaerobic media using gellan gum for the isolation of previously uncultured rumen bacteria. Four anaerobic media, a basal liquid medium (BM) with agar (A‐BM), a modified BM (MBM) with agar (A‐MBM), an MBM with phytagel (P‐MBM) and an MBM with gelrite (G‐MBM) were used for the isolation of rumen bacteria and evaluated for the growth of previously uncultured rumen bacteria. Of the 214 isolates composed of 144 OTUs, 103 isolates (83 OTUs) were previously uncultured rumen bacteria. Most of the previously uncultured strains were obtained from A‐MBM, G‐MBM and P‐MBM, but the predominant cultural members, isolated from each medium, differed. A‐MBM and G‐MBM showed significantly higher numbers of different OTUs derived from isolates than A‐BM (P < 0·05). The Shannon index indicated that the isolates of A‐MBM showed the highest diversity (H′ = 3·89) compared with those of G‐MBM, P‐MBM and A‐BM (H′ = 3·59, 3·23 and 3·39, respectively). Although previously uncultured rumen bacteria were isolated from all media used, the ratio of previously uncultured bacteria to total isolates was increased in A‐MBM, P‐MBM and G‐MBM.     

人肠道产柚苷酶菌株分离、鉴定及其对柚皮苷的转化特性

【目的】从健康人肠道微生物菌群中分离能将柚皮苷高效转化为柚皮素的特定细菌菌株,对分离得到的菌株进行菌种鉴定并研究菌株对柚皮苷转化特性,目的是为柚皮素的高效生物合成提供新细菌资源。【方法】取健康人新鲜粪样,在厌氧工作站内培养24 h后进行梯度稀释并涂板,从板上挑取单菌落与底物柚皮苷进行厌氧培养,用高效液相色谱检测底物被转化情况。根据16S rDNA序列及相关生理生化特性分析,对所分离的柚皮苷转化菌进行菌种鉴定,并测定转化菌株对底物柚皮苷的转化动态和转化能力。【结果】从人肠道菌群中分离得到4株能将柚皮苷转化为柚皮素的细菌菌株,分别命名为AUH-JLD3、AUH-JLD7、AUHJLD104和AUH-JLD109。根据16S rDNA序列分析,结合形态学及相关生理生化特性等,将其分别鉴定为布劳特氏菌(Blautia sp.AUH-JLD3)、肠球菌(Enterococcus sp.AUH-JLD7)、拟杆菌(Bacteroides sp.AUHJLD104)和巴氏链球菌(Streptococcus pasteurianus subsp.AUH-JLD109)。转化动态研究结果表明,所分离的4株细菌菌株均能在12 h内将0.2 mmol/L底物柚皮苷转化为柚皮素;转化能力测定结果显示,菌株AUHJLD3、AUH-JLD7、AUH-JLD104及AUH-JLD109能够高效转化底物柚皮苷的最大浓度分别为0.2 mmol/L(平均转化率66.67%)、0.8 mmol/L(平均转化率86.49%)、0.2 mmol/L(平均转化率73.68%)以及1.6 mmol/L(平均转化率93.20%)。【结论】本研究首次从人肠道菌群中分离得到4株能将柚皮苷转化为柚皮素的细菌菌株,其中巴氏链球菌AUH-JLD109对底物柚皮苷转化能力最强。     

A comparison of thiosulphate-citrate-bile salts-sucrose (TCBS) agar and thiosulphate-chloride-iodide (TCI) agar for the isolation of Vibrio species from estuarine environments

AIMS: The purpose of this study was to compare a recently described medium, thiosulphate-chloride-iodide (TCI), for the isolation of estuarine vibrios with thiosulphate-citrate-bile salts-sucrose (TCBS). METHODS: A total of 492 colonies which developed on these media from estuarine water samples taken monthly over a 10-month period were examined. RESULTS: A much larger number of colonies developed on TCBS than TCI, and minimal taxonomic criteria indicated that a higher percentage (61%) of TCBS colonies could be identified as Vibrio spp. when compared with TCI (46%). SIGNIFICANCE: This study suggests that TCBS is a superior medium when compared with TCI for the isolation of Vibrio spp. from estuarine waters. Because of the public health risk presented by V. vulnificus, V. parahaemolyticus, V. cholerae and other vibrios, the selection of the most appropriate medium for their isolation is extremely important.     

吡虫啉降解菌群结构解析及菌株资源挖掘

新疆地区为控制棉花连作引发的棉蚜等害虫规模性爆发,长期大量使用了吡虫啉等农药,为获得适合当地气候土壤环境条件下,降解吡虫啉的微生物资源,以吡虫啉为唯一碳源从新疆棉花长期连作土壤中富集降解菌群,通过高通量测序分析其结构组成,利用多种常规培养基和通过高通量测序结果设计的培养基从吡虫啉降解菌群(BCL)中挖掘细菌资源.结果表...     

复合微生态菌剂对黄瓜根际土壤微生物数量及酶活的影响

采用盆栽试验的方法,研究黄瓜移苗时施入复合微生态菌剂对黄瓜不同生育时期根际土壤中微生物数量和土壤酶活动态变化的影响,结果显示复合微生态菌剂施入前期可提高土壤中细菌和放线菌的数量,随生育时期的延长效果变弱,于生育后期可有效降低真菌和尖孢镰刀菌的数量;复合微生态菌剂处理可提高土壤脲酶、过氧化氢酶、蔗糖酶和中性磷酸酶的活性,但随生育时期的延长,对中性磷酸酶和脲酶的效果减弱。可见复合土壤微生态菌剂的施入应该于适宜时期补施,才能保证其积极的功效。     

短小芽胞杆菌Bacillus pumilus HR10增殖扩繁培养基组分优化

短小芽胞杆菌Bacillus pumilus HR10是1株优良的菌根辅助细菌(Mycorrhiza Helper Bacteria,MHB),无论单独接种或与外生菌根真菌(Ectomycorrhizal Fungi,EMF)黄色须腹菌(Rhizopogen luteous)互作,都能显著促进马尾松(Pinus massoniana)的生长。应规模应用需要,从10种碳源、8种氮源及8种无机盐中以单因素试验初步筛选出主要组分,在此基础上采用正交试验及响应面分析法优化短小芽胞杆菌HR10增殖扩繁的培养基成分。结果表明,该菌株增殖扩繁培养基最佳组分配比为黄豆粉10.332 g/L,玉米粉7.296 g/L,蛋白胨10.718 g/L,KCl 2.5 g/L,KH2PO42.5 g/L。研究结果为菌根辅助细菌短小芽胞杆菌B.pumilus HR10菌剂开发应用提供了参考依据。