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相似文献
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1.
三品系小型猪35个微卫星基因座的遗传学研究   总被引:35,自引:5,他引:30  
利用35个微卫星基因座对中国三个品系的小型猪(贵州小型香猪、广西巴马小型猪、版纳小耳猪近交系)进行了遗传检测。计算出三个小型猪品系个体样本在35个微卫星基因座的纯合率,并对其进行t检验。计算出各品系的平均杂合度,多态信息含量(PIC)及品系间的遗传距离,并进行了系统聚类。结果表明三个品系的小型猪其基因纯合率均较高,其中版纳小耳猪近交系的基因纯合率最高;PIC和平均杂合度均较低;贵州小型香猪和广西巴马小型猪亲缘关系较近,并均与版纳小耳猪近交系的亲缘关系略远。 Abstract:The polymorphism of 35 microsatellites in the three miniature pig breeds in China(Guizhou miniature pig, Guangxi Bama miniature pig, Banna miniature pig inbred) was analysed. Rates of homozygote for 35 microsatellite loci in three miniature pig breeds were calculated,and t-test for them were performed. Mean heterozygosity and polymorphism information content(PIC) were calculated for all breeds, and genetic distances between these breeds were estimated. The dendrograms were obtained based on genetic distances. The results suggest that rates of homozygote in the three breeds are all high, and that is the highest in Banna miniature pig inbred. The results also suggest that polymorphism information content and mean heterozygosity in all the three breeds are low, and the genetic relationship between Guizhou miniature pig and Guangxi Bama miniature pig is closer than their relationship with Banna miniature pig inbred.  相似文献   

2.
巴马小型猪与贵州小型香猪遗传多样性的RAPD分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
应用经过筛选的31条引物对巴马小型猪和贵州小型香猪的基因组DNA进行RAPD扩增,分析二品系实验用小型猪的遗传多样性.两品系实验用小型猪品系内及品系间多态性位点的百分数分别为30.9%和25.7%,品系间及品系内的平均遗传距离分别为0.120、0.072和0.067.结果表明,两品系实验用小型猪品系间及品系内遗传多样性贫乏,遗传变异较小.  相似文献   

3.
目的了解西藏小型猪的群体遗传结构。方法针对所优选出的40个微卫星位点设计引物,对35头南方医科大学饲养的西藏小型猪样本进行PCR扩增,扩增产物采用STR扫描技术进行测定,分析西藏小型猪的群体遗传结构。结果西藏小型猪群体平均有效等位基因数为4.6187,平均杂合度为0.7576,平均多态性信息含量0.7463。结论西藏小型猪群体具有丰富的遗传多样性,符合封闭群动物遗传特性。  相似文献   

4.
三种小型猪线粒体DNA控制区的比较研究   总被引:2,自引:1,他引:1  
目的分析五指山小型猪、巴马小型猪和贵州香猪线粒体DNA控制区碱基序列,比较研究不同猪种的遗传标志。方法应用PCR技术分别对这三种小型猪的血液总DNA样品中线粒体DNA D-loop区进行扩增,测序比对。结果猪的线粒体DNA D-loop区分三个区域。I区(靠近5’端区域)704bp,五指山小型猪在此区共有6个变异位点,通过6个变异位点中归纳出3个单倍体,而巴马小型猪在此区有9个变异位点,通过9个变异位点归纳出4个单倍体,贵州香猪在此区共有6个变异位点,通过6个变异位点归纳出3个单倍体。Ⅱ区(串联重复序列区),五指山小型猪、巴马小型猪和贵州香猪序列相同。Ⅲ区(靠近3’端区域)三种小型猪的序列几乎相同。结论五指山小型猪、巴马小型猪和贵州香猪三种小型猪之间线粒体DNA碱基序列变异位点较少,五指山小型猪和巴马小型猪亲缘关系较近。  相似文献   

5.
贵州白香猪两品系微卫星座位的遗传分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
采用24个微卫星标记对贵州白香猪2个品系的遗传变异进行了检测.试验结果表明,2个品系在24个微卫星基因座的平均等位基因、平均期望杂合度、平均多态信息含量和平均近交系数分别为2.1667、2.0417,0.4074、0.4188,0.3436、0.3249和0.5377、0.5605.结果 提示贵州白香猪具有一定的遗传稳定性,已成为一个稳定的遗传群体,符合封闭群动物的遗传特征.  相似文献   

6.
西藏小型猪细胞色素b基因序列的比较   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的对西藏小型猪Cyt b-基因序列进行分析,研究其遗传背景及其与国内家猪的亲缘关系。方法提取西藏小型猪和巴马小型猪、贵州香猪、五指山猪的全基因组DNA,设计引物扩增Cyt b基因,测序后进行碱基序列比对,建立亲缘关系树,分析西藏小型猪的遗传背景。结果西藏小型猪等国内部分品种猪的Cyt b基因序列与欧洲猪相比有14个变异位点;但是西藏小型猪与国内品种猪相比存在两个特殊碱基位点即在420位点T→C转换的同时在883位点存在G→A转换。结论西藏小型猪与巴马小型猪、贵州香猪、五指山猪等国内家猪有很近的亲缘关系。同时进一步证实西藏小型猪群体内存在一定的遗传分化。  相似文献   

7.
目的筛选用于封闭群小型猪遗传检测的微卫星位点。方法从资料和GenBank中选取扩增效果好、等位基因多、均匀分布于小型猪18条常染色体和X染色体上的100个微卫星位点,合成引物,对封闭群小型猪基因组进行PCR扩增及条件优化。PCR产物采用琼脂糖凝胶电泳、聚丙烯酰胺凝胶电泳和STR扫描技术进行分析和比较,选择多态性好的位点。结果筛选出32个分布于不同染色体且等位基因多的微卫星位点。结论筛选出了应用于封闭群小型猪遗传检测的微卫星位点。  相似文献   

8.
目的分析五指山小型猪、巴马小型猪和贵州香猪线粒体DNA控制区碱基序列,比较研究不同猪种的遗传标志。方法应用PCR技术分别对这三种小型猪的血液总DNA样品中线粒体DNA D-loop区进行扩增,测序比对。结果猪的线粒体DNA D-loop区分3个区域。Ⅰ区(靠近5′端区域)704 bp,五指山小型猪在此区共有6个变异位点,通过6个变异位点中归纳出3个单倍体,而巴马小型猪在此区有9个变异位点,通过9个变异位点归纳出4个单倍体,贵州香猪在此区共有6个变异位点,通过6个变异位点归纳出3个单倍体。  相似文献   

9.
利用微卫星标记分析七品种(类群)小型猪的遗传多样性   总被引:9,自引:0,他引:9  
姚绍宽  张勤  孙飞舟  刘培琼 《遗传》2006,28(4):407-412
采用世界粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)推荐的27个微卫星,对久仰香猪、剑白香猪、从江香猪、环江香猪、黑香猪(贵州省种猪场)、五指山猪和滇南小耳猪等我国7小型猪种(类群)及杜洛克、长白和大白等3个外来猪种的群内遗传变异性和群间遗传差异进行了分析。结果表明,7个小型猪品种(类群)均有较高的群内遗传变异,但久仰、剑白、从江和环江4个香猪类群的群内遗传变异(平均多态信息含量(PIC)为0.61~0.64)显著低于其他3个小型猪种(平均PIC为0.80~0.84)。久仰、剑白、从江和环江4个香猪类群彼此间的遗传差异较小(奈氏标准遗传距离为0.12~0.22),但它们与其他3个小型猪种有较大的遗传差异(奈氏标准遗传距离为1.61~1.96),与3个外来猪种的遗传差异更大(奈氏标准遗传距离为1.99~3.30)。通过聚类分析,可将这些猪种清晰地分为3大类,久仰、剑白、从江和环江4个香猪类群紧密地聚为一类,其他3个小型猪种聚为一类,3个外来猪种聚为另一类。这一结果基本符合这些猪种的地理分布和品种来源。
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10.
版纳小耳猪近交系5家系35个微卫星座位的遗传分析   总被引:27,自引:2,他引:25  
利用35个微卫星座位对版纳小耳猪近交系5个家系进行了遗传检测。统计各家系的等位基因组成,计算各家系的平均基因纯合率,利用基因频率计算出各家系的平均杂合度及品系间的遗传距离,并进行系统聚类。结果表明各家系的平均基因纯合度均较高,其151家系达到88.79%;PIC(多态信息含量)和平均杂合度均较普通商品猪低;各家系等位基因组成差别较大;各家系间亲缘关系与其近交过程一致,据此认为版纳小耳猪近交系5家系均具有较高的近交程度;其基因多态性和遗传多样性较普通商品猪低;各家系均已构成独立遗传群体。  相似文献   

11.
中国三种实验用小型猪线粒体DNAD-loop多态性分析   总被引:6,自引:3,他引:3  
刘中禄  魏泓  曾养志  王爱德  甘世祥 《遗传》2001,23(2):123-127
分析中国三种实验用小型猪线粒体DNA(mtDNA)D-loop的多态性,建立各品种品系猪的遗传标记,为各品种、品系猪的鉴别提供依据。应用PCR技术分别对西双版纳近交系小耳猪、广西巴马小型猪、贵州小型香猪和长白猪的血液总DNA样品中mtDNAD-loop进行扩增,用23种限制性内切酶消化,观察其酶切多态。PCR扩增其mtDNAD-loop5′端227bp高变区域,应用PCR?SSCP和PCR直接测序分析,观察其单链构象多态和序列多态。结果显示:三种小型猪之间未见酶切长度多态、单链构象多态和序列多态。与长白猪之间表现出单链构象多态和序列多态。本研究认为:三种实验用小型猪之间mtDNA多态性贫乏,证明其亲源关系很近,在母系起源和进化上有一致性,应用PCR RFLP、PCR SSCP和PCR直接测序分析,尚不能作为三种实验用小型猪品种、品系鉴定的依据,但与长白猪等欧系猪比较有一定差异。 Abstract:the present study is to analyze the polymorphism of the mtDNA D-loop in three breeds of laboratory miniature pigs in China , and to establish its cytoplasmic DNA markers to distinguish among them . The polymorphism of mtDNA D-loop and its 5′-end high variable regions were detected by PCR-RFLP , PCR-SSCP and PCR-direct sequencing on Xishuangbanna Small-ear inbred pig, Guizhou miniature Xiang pig , Guangxi Bama miniature pig and Landrace.There was no polymorphism obtained among or within three breeds of Chinese laboratory miniature pigs besides Landrace. It is concluded that the polymorphism of mtDNA D-loop within the three breeds of Chinese laboratory miniature pigs is poor , These methods cannot be used to distinguish among them , but it can be used to distinguish them from Landrace.  相似文献   

12.
目的对西藏小型猪和广西巴马小型猪生长激素基因(GH基因)部分序列的多态性进行分析。方法采用内切酶ApaI和Hin6I对西藏小型猪(108头)和广西巴马小型猪(132头)GH基因-119 bp~+486 bp之间的区域进行PCR-RFLPs分析。结果 (1)从ApaI酶切产生的结果来看,ApaI酶切产生A(449 bp+101 bp+55bp),B(316 bp+133 bp+101 bp+55 bp)两种等位基因。等位基因A的频率高于等位基因B,等位基因A为优势基因。AA基因型频率高于AB和BB基因型频率;(2)从Hin6I酶切产生的结果来看,Hin6I酶切产生G1(605bp)、G2(498 bp+107 bp)、G3(449 bp+156 bp)、G4(449 bp+107 bp+49 bp)四种等位基因。等位基因G4的频率高于等位基因G1、G2、G3。等位基因G1频率很低。基因型G2G3、G2G4、G3G4、G4G4的频率较高。(3)由酶切产生的基因和基因型多态性,发现西藏小型猪与广西巴马小型猪在该基因部分序列差异不显著(P〉0.05)。结论国内的优质实验用小型猪,如西藏小型猪和广西巴马小型猪等位基因A频率均较高。  相似文献   

13.
五指山猪是我国著名的珍稀畜种,体型小、性成熟早、遗传稳定、近交程度高,可用于医学、药学和生物材料等方面。作者利用多重PCR和基因扫描技术对五指山猪13个家系的32个微卫星基因座进行遗传检测。统计各家系的等位基因组成,计算各家系的平均杂合度和多态信息含量(PIC);结果,各家系32基因座的平均等位基因数为13.66个,平均PIC为0.731,平均杂合度为0.559。表明海南五指山猪具有丰富的遗传多样性。这些结果对于海南五指山猪的保种、定向选育、开发利用都具有重要的指导意义。  相似文献   

14.
王昕  陈宏  曹红鹤 《遗传》2006,28(10):1229-1232
利用微卫星标记估计了中国10个地方猪种的群体近交系数。结果表明: 在随机交配群体中, 贵州小型香猪的近交系数最高为0.1992, 汉中黑猪的近交系数最低为0.0727。F检验表明, 品种间近交系数的差异不显著(P>0.05)。在近交群体中, 贵州小型香猪近交系和巴马香猪近交系的近交系数分别为0.5907和0.4761。  相似文献   

15.
The IGF-1 gene has been implicated as a candidate gene for the regulation of pig growth traits. We analyzed exons 3 and 4 of IGF-1 gene polymorphisms of the Banna mini-pig (28), the Tibetan mini-pig (30), the Junmu pig (55), and L. Yorkshire species (50) using PCR-SSCP. Three genotypes in exon 3 and 6 genotypes in exon 4 were observed, among which, one single nucleotide polymorphism, G201A, on exon 3 and two single nucleotide polymorphisms, A440G and T455C, on exon 4 were found. Statistical analysis of genotype frequencies revealed that the A allele was dominant in the large pig at the G201A locus (PIC = 0.20-0.34), and the AT alleles were dominant in the large pig at the A440G and T455C loci (PIC = 0.30-0.60). The genotype distribution between the various groups was significantly different (P< 0.01), with the highest heterozygosity seen in Junmu pigs at 0.223 and the lowest seen in L. Yorkshire at 0.098. The genetic distance of the Junmu pig from the L. Yorkshire is the smallest, the distance from the Tibetan miniature pigs is larger, and the distance from the Banna mini-pig is the largest. The IGF-1 gene polymorphism and heterozygosity results from various pig breeds indicate that IGF-1 is substantially polymorphic with significant difference of the polymorphic distribution and expression levels among various pig breeds. This information provides a theoretical basis for the genetic background of miniature pigs but also provides means to breed improved pig varieties.  相似文献   

16.
湖北省三品种猪27个微卫星座位的遗传变异   总被引:43,自引:2,他引:41  
采用国际动物遗传学会(ISAG)和联合国粮农组织(FAO)共同推荐的27个微卫星标记,对湖北省3个主要地方猪种(通城猪、清平猪和阳新猪)的遗传变异进行了检测。计算出各个品种的基因杂合度、各个座位的多态信息含量及品种间的遗传距离。结果表明,3个地方猪种的平均基因杂合度分别为0.7489、0.6987和0.6273,遗传多样性比较丰富;通城猪和清平猪亲缘关系较近,而两者与阳新猪亲缘关系略远。  相似文献   

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