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UniProt(https://www.uniprot.org/)是国际知名蛋白质数据库,主要包括UniProtKB知识库、UniParc归档库和UniRef参考序列集三部分。UniProtKB知识库是UniProt的核心,除蛋白质序列数据外,还包括大量注释信息。UniProtKB知识库分Swiss-Prot和TrEMBL两个子库。Swiss-Prot子库中50多万条序列均由人工审阅和注释,而TrEMBL子库中1.4亿多条序列是由核酸序列数据库EMBL中的蛋白质编码序列翻译所得,并由计算机根据一定规则进行注释。UniParc归档库将存放于不同数据库中的同一个蛋白质归并到一个记录中以避免冗余,并赋予序列唯一性特定标识符。UniRef参考序列集按相似性程度将UniProtKB和UniParc中的序列分为UniRef100、UniRef90和UniRef50三个数据集。UniProt网站为用户提供了高效实用的高级检索系统和大量帮助文档。UniProt数据库每4周发布新版的同时也发布统计报表,用户可通过统计报表了解该数据库的数据量及更新情况、数据类别和物种分布等基本信息,查看常规注释信息、序列特征注释信息和数据库交叉链接等统计数据。UniProt是目前国际上序列数据最完整、注释信息最丰富的非冗余蛋白质序列数据库,自本世纪初创建以来,为生命科学领域提供了宝贵资源。 相似文献
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生物信息学涉及生物、化学、物理、数学、计算机和互联网应用等多方面知识,要从事这个领域的研究工作,必须掌握更多的各方面知识。目前该领域的很多资料和文献在网上以电子文档的形式存在。电子文档能够包含比常规的文档包含更广泛,更丰富的内容,对电子文档的收编整理发能大大节省文档的搜索时间,并能提供更专业,更有效的检索结果,为科研工作服务。本文论述了建立包括电子文档的收集,标注,优化检索的一个方案,检索结果按照文档和检索条件的相似程度分级列出。实践证明,该系统能够有效的提供生物信息学专业信息的管理和检索。 相似文献
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研究蛋白质和配体相互作用的结构和亲和力,不仅有助于了解蛋白质的功能,而且对药物研发以及药物作用机制的研究,也具有十
分重要的意义。目前,人们通过人工检索和半自动检索的方式,从文献和蛋白质数据库(Protein Data Bank,PDB)中获得了许多蛋白质-
配体亲和力信息和生物相关配体信息,并构建了许多蛋白质-配体相互作用的信息数据库。对3 个蛋白质-配体亲和力数据库和6 个蛋白质
晶体结构-配体生物相关性数据库进行介绍,并对其主要应用进行简述,希望能为实现高效准确地筛选和设计药物提供一定的帮助。 相似文献
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本文阐述了把办公自动化应用于文书档案管理工作中的原因,应用办公自动化进行文书档案管理有哪些局限性,如何运用办公自动化,提高文档办理的工作质量和效率。 相似文献
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世界水生植物科属检索系统的设计与建立 总被引:7,自引:1,他引:6
生物分类学涉及海量数据 ,而且随着研究的不断深入 ,各类相关信息还在以惊人的速度增长 ,这为利用传统方法和管理模式处理复杂的数据带来了很大困难。随着计算机技术的发展 ,其特有的高效性、稳定性等特点为大量生物信息的处理带来了革命性的变化。利用计算机技术管理生物信息不仅可以大幅度提高工作效率 ,而且对充分发挥其管理信息的作用具有重要的意义。人们已经在分类学方面进行了许多工作 ,也取得了不少成绩。例如英国的国立植被分类系统 ( Na-tional Vegetation Classification) ,它全面系统地总结了整个英国的植被类型 ,其支撑系统… 相似文献
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结合国内外对绒山羊的分子生物学研究,利用已有的遗传多态、基因序列和结构、功能等方 面的数据,以计算机网络为载体,参考国际通用数据库的格式,建立一个简洁、友好、通用而且专用 性强的绒山羊分子生物学数据库。该数据库主要由文献索引库,基因组学库及绒山羊知识库组成。 数据库的建立为绒山羊的分子生物学研究提供一个良好的数据平台,为从事绒山羊遗传多态、遗传 进化、分子育种、绒毛生长机理等方面的理论和应用研究的工作者提供方便和帮助,并为探索其他 草食家畜分子生物学数据库的构建积累经验。 相似文献
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生物多样性数据集成模式初探 总被引:1,自引:0,他引:1
本文以生物多样性研究发展现状的分析为基础,为生物多样性保护政策的制定提供可靠的数据支持为目标,通过对国内外几个著名的生物多样性数据库建设情况的分析,从相关学者的需求出发,提出了设计一个多层次多角度并带有一定人工智能的生物多样性集成数据库的构想。该系统基于都柏林核心(Dublin Core)的数据规范,并符合基于开放文献预研的元数据互操作协议(The Open Archixles Initiative Protocol for Metadata Hatvesting,OAIPMH)的标准,是一个集文字、图件、图片、声音、影像为一体的,能够在网上和硬件载体(如光盘)上同时进行发布的分布式数据库平台。其网上数据库系统的子系统之间以及子系统和硬件载体之间可以通过元数据获取的开放档案倡议协议互相交换数据。 相似文献
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通过资源调查,实地拍摄,全面收集长白山野生经济植物的相关资料,用现代信息发展的数据管理技术,研究设计软件,组织构建整个检索系统,为研究长白山植物提供了第一手材料,对合理开发利用长白山资源,保护生态环境和植物物种基因起到了重要作用。 相似文献