生物信息学及其研究现状

生物信息学是采用计算机技术和信息论方法研究生命科学中各种生物信息的表达、采集、储存、传递、检索、分析和解读的科学,是现代生命科学与信息科学、计算机科学、数学、统计学、物理学、化学等学科相互渗透而高度交叉形成的一门新兴前沿学科.对生物信息学的起源、研究内容、研究热点及应用等进行了综述,并展望了其今后的发展前景.     

生物信息学及其在菌物学研究上的应用

主要介绍生物信息学的基本概念、发展历程、特点、研究领域、面临的挑战以及生物信息学在菌物研究上的应用成果。分析了生物信息学在菌物研究方面的应用前景,并提出了研究和开发的建议。     

生物信息学数据库调查分析及其利用研究

从生物信息学数据库利用的角度调查分析生物信息学数据库的现状,为我国科研人员利用网上生物信息学数据库以及生物信息中心的开发提供科学依据和参考价值。研究采用网上调查的方法,对法国生物信息中心Infobiogen建立维护的生物信息学数据库目录DBcat中收录的511个数据库进行调查统计,分析其类型分布、国家分布、更新频率和获取方式;在此基础上。进一步利用欧洲分子生物学信息网(EMBnet)中30个成员国节点对生物信息学数据库利用现状进行统计分析。     

癌症研究的生物信息学资源

随着癌症研究的发展,生物信息学成为癌症研究的一个非常重要的方法和手段,本文从微阵列芯片数据管理和分析软件、微阵列数据仓库、蛋白质功能预测工具和蛋白质结构预测工具等四个方面介绍癌症研究的生物信息学资源信息,以给相关研究提供帮助.     

生物信息学及其在蛋白质组学中的应用

随着基因组学和蛋白质组学的发展,生物信息学在数据处理中的应用已经越来越广泛。作为数据处理中越来越重要的分析手段,蛋白质组学数据库是蛋白质组学的主要内容之一。本文分别从生物信息学的蛋白质双向电泳数据库和基于蛋白质质谱结果的数据库两个方面,概述了发展中的蛋白质数据库的最新动态和有关信息,同时对主要的热门蛋白质组学数据库站点和资源进行了评价和分析。     

肽类毒素生物信息学

有毒动物可产生大量的药学活性成分。当前,NCBI等数据库中已汇集了大量的毒素序列和结构数据,但关于功能方面的介绍却非常少。新的毒素数据的增长对数据管理提出了更高的要求,毒素生物信息学作为一种辅助手段,可显著降低实验的工作量,其利用系统的生物信息学方法将整理过的毒素数据归类储存在各数据库中,并整合进可对毒素进行结构和功能分析的生物信息学工具。以海螺、蝎子和蛇等来源的蛋白类毒素为例,对生物信息学在毒素数据管理和构效关系研究等方面的应用进行了综述。     

生物信息学技术进展

生物信息学是一门对生物信息进行采集、储存、传递、检索、分析和解读的学科,它已经渗透于现代生物学、数学、信息学、计算科学、统计学、物理、化学各个方面。本概述和分析了生物信息学研究中的一些方法。     

生物信息学在生物学研究领域的应用

综合叙述了生物信息学对生物学科研工作的影响,介绍了生物信息学在生物技术、生物医学、农业、食品、环境、能源等研究领域的应用概况,阐述了生物信息学为生物科研工作服务的意义。     

生物信息学

生物信息学是采用计算机技术和信息论方法研究生命科学中各种生物信息的表达;采集,储存,传递,检索,分析和解读的科学,是现代生命科学与信息科学,计算机科学,数学,统计学,物理学,化学等学科相互渗透和高度交叉形成的学科,本文简要介绍了现代生物信息学的主要研究领域。     

Inoculation with arbuscular mycorrhizal fungi: the status quo in Japan and the future prospects

Inoculation of arbuscular mycorrhizal (AM) fungi has potential benefits in not only sustainable crop production but also environmental conservation. However, the difficulty of inoculum production due to the obligate biotrophic nature of AM fungi has been the biggest obstacle to putting inoculation into practice. Nevertheless, several companies have sought to produce inoculum of AM fungi. Firstly in this review, the present status of inoculum production and its use in Japan is described. Secondly, although the effectiveness of inoculation is primarily limited by environmental and biological factors, some possible ways to improve inoculation performance are discussed. Approaches include use of chemicals to increase spore germination and colonization and soil application of charcoal to provide a microhabitat for AM fungi to colonize and survive.     

生物技术药物的研究开发与产业化现状及前景

本综述了近年来国内外生物技术药物的研究、开发和产业化现状,讨论了我国医药生物技术产业存在的主要问题。提出中国医药生物技术产业发展应遵循自主开发与技术引进相结合及政府引导与市场机制相结合的原则,政府、企业和科技界应发挥各自不同的作用;展望了我国生物药物产业的发展方向和生物技术药物的市场前景。     

ProteomeWeb: a web-based interface for the display and interrogation of proteomes

The analysis of proteomes, i.e., the proteins expressed by biological organisms under a given set of conditions at a given time, requires separating complex protein mixtures into discrete protein components, measuring their relative abundances, and identifying the individual protein components. Many types of data are generated during the course of proteome analysis, including graphic images of the protein profiles, flat files containing numeric data, spreadsheets for assimilating numeric data, and relational database tables for integrating data from multiple experiments. As part of a project to describe the proteomes of microbes of interest to the U.S. Department of Energy, a World-Wide Web-based interface has been developed for the display of protein profiles generated by two-dimensional gel electrophoresis. The web interface is capable of obtaining protein identifications on the fly, interrogating the quantitative data in the context of available genome sequence information, and relating the proteome data to existing metabolic pathway databases. Analysis of protein expression profiles is expedited, providing the capability to efficiently determine the gene locations for proteins modulated in abundance in response to different growth conditions and to locate the positions of the proteins within specific metabolic pathways. The proteome of the archaeon Methanococcus jannaschii, a microbe for which the complete genome sequence is available, is used to demonstrate the capabilities of this evolving web interface (http://proteomeweb.anl.gov).     

数据挖掘在生物信息学中的应用

借助各种应用数学和计算机技术 ,将大量积累并急需处理的生物信息数据利用起来 ,探索生物信息中的规律 ,是当前国内国际生物信息学研究的热点和重点。其中数据挖掘技术在生物信息研究中发挥着巨大的作用。     

Web resources for the carbohydrate chemist

Bioinformatics has played a pivotal role in advancing genetics and protein sciences. The large amount of information generated by genomics, and now proteomics, has been a driving force. By comparison, glycobiology still generates small amounts of data. The need to organize our knowledge about carbohydrates is however growing constantly and has given rise to an increasing number of public databases and freely available tools. This review gives an overview of the carbohydrate-oriented resources currently available on the Internet. Many of the resources are seldom referred to in the literature and difficult to find, in part because of the constant flux of the net itself, but also because many efforts have been lead by a single individual. As the World Wide Web has matured the number of 'permanent' resources, maintained by organizations rather than individuals, has increased. In this paper, we present some of the more useful and accessible public tools and databases. There are also a few commercial initiatives but these have not been reviewed.     

我国转基因植物研发形势及发展战略

当前,发达国家及跨国种业集团在功能基因组学、转基因技术和转基因产品研发方面进展显著,转基因产业发展势头强劲,已成为近年来持续保持高速增长的新兴产业。我国高度重视转基因植物研发及产业化,整体水平领先于发展中国家,但与国际转基因生物产业快速发展和我国衣业发展对转基因产品的需求相比,在转基因技术和产品创新、产业化机制以及支撑条件等方面尚存在较多制约因素。基于系统比较分析,建议我国进一步加强转基因植物研发能力建设,夯实转基因育种基础,突破转基因核心技术,培育转基因植物新品种,加强产学研紧密结合,培育具有自主创新能力和市场竞争力的大型企业,与此同时加强科普宣传,营造良好的社会氛围,推进我国生物育种战略性新兴产业的快速发展。     

生物信息学中途径研究进展

叙述了生物信息学中途径的研究背景;综述了近几年来相关途径及生物化学数据库及其特点;介绍了有关的途径分析方法.同时对于途径研究应用作了展望.