氨基酸的置换数与生物大分子进化改变量的测度

以蛋白质分子的氨基酸置换数或核酸分子的核苷酸置换数为衡量尺度 ,说明生物大分子随时间的改变 (即分子进化速率 )保持相对恒定     

原始生物大分子动态的数学模型及其进化意义

本文应用生态学上关于种群增长及种间竞争的逻辑斯缔方程,提出原始生物大分子动态的数学模型,对从该模型推导得的几种可能结果进行了分析,得出在生命起源初期的原始生物圈的生物多样性是很低的结论,即原始生物圈中较大量存在的只是一些种类单一的,可复制的原始生物大分子,因此,可以认为生物进化就是建立在这样的一个基础上,并沿着生物多样性不断提高的途径演化,该模型还有助于对广泛存在于现代生物基因组中的重复序列的起源的认识。     

生物大分子与生命功能

生物大分子是生物体的重要组成成份,不但有生物功能,而且分子量较大,其结构也比较复杂。在生物大分子中除主要的蛋白质与核酸外,另外还有糖、脂类和它们相互结合的产物。如糖蛋白、脂蛋白、核蛋白等。它们的分子量往往比一般的无机盐类大百倍或千倍以上。蛋白质的分子量在一万至数万左右,核酸的分子量有的竟达上百万。这些生物大分子的复杂结构决定了它们的特殊性质,它们在体内的运动和变化体现着重要的生命功能。如进行新陈代谢供给维持生命需要的能量与物质、传递遗传信息、控制胚胎分化、促进生长发育、产生免疫功能等等。     

氨基酸残基可及性与蛋白质家族成员结构的保守性

本文在细胞色素ｃ族蛋白和免疫球蛋白家族中一些蛋白质片段的序列比较和分析的基础上,通过计算其氨基酸残基的可及性,对残基可及性与蛋白质序列及其三维结构的保守性之间的关系进行了分析和探讨。结果表明,序列中凡是保守的残基,其可及性都较低,而且这些低可及性的保守性残基与维持蛋白质特有的三维结构相关。作者认为,同一家族的蛋白质中,在进化上相距较远的各成员之间,结构的保守性主要是体现在其三维结构上;序列中的保守     

生物大分子相互作用

生物大分子相互作用祁国荣编者按中国科学院为深化体制改革,进行结构性调整,决定组建中国科学院上海生命科学研究中心。于１９９４年４月１９日至２１日在上海正式召开了专家论证会,并获得论证通过,送中国科学院审批。这次论证会上,有五位专家对四个生命科学中的重要...     

生物大分子的类型

生物大分子是细胞的基本结构和功能单位,也是研究生命现象中的物质基础。生物体内的分子组成如何?哪些分子才算生物大分子?这些大分子有没有分子量的下限?     

生物大分子起源问题的讨论

关于生命在地球上的起源与进化问题,历来是一个颇多争论的学术领域。显然,人们无法目睹三十几亿年前地球上曾经发出的事情,也难以用实验的方法来重温这一漫长的历史过程,而只能凭借地球留给我们的某些蛛丝马迹去推想,去研究,去探索。伴随着科学技术的发展,有关生命起源的     

贝类生物矿化中的生物大分子与分子识别

综述了贝类生物矿化相关的生物大分子性质及其分子识别过程的最新研究进展.生物矿化原理为仿生材料科学和分子构造学提供了崭新的思路.贝类生物矿化过程是生物大分子指导无机晶体的晶核形成、定向及生长的过程,是有机相-无机相、无机相-无机相界面分子识别的过程.     

生物大分子的结构与功能的相互关系和演化过程

介绍近年来在生物大分子内部结构与功能方面研究的新成果，分别对蛋白质在空间构型、断裂基因、分子驱动和整体ＤＮＡ进行例证说明，讨论生物分子内部发生在结构与功能之间的动态平衡。对于了解生命现象的本质和生物进化的机制有一定的参考价值，更有助于正确地理解生命体的结构与功能相互统一的基本原理。     

生物大分子的非放射性标记

无论是克隆植物基因还是研究基因表达都离不开探针的标记和检测。历来所用的放射性同位素标记方法存在一些缺点。一是要预防核辐射对人体的损伤,操作不方便;二是为防止污染环境,必须谨慎地处置放射性废弃物;三是放射性标记的探针使用时间短,例如最常用的~(32)P半衰期仅14.3天,标记的探针要随时标记随时使用,放置不用则放射性随时间指数下降。为     

Efficient Methods for Estimating Amino Acid Replacement Rates

Replacement rate matrices describe the process of evolution at one position in a protein and are used in many applications where proteins are studied with an evolutionary perspective. Several general matrices have been suggested and have proved to be good approximations of the real process. However, there are data for which general matrices are inappropriate, for example, special protein families, certain lineages in the tree of life, or particular parts of proteins. Analysis of such data could benefit from adaption of a data-specific rate matrix. This paper suggests two new methods for estimating replacement rate matrices from independent pairwise protein sequence alignments and also carefully studies Müller-Vingron’s resolvent method. Comprehensive tests on synthetic datasets show that both new methods perform better than the resolvent method in a variety of settings. The best method is furthermore demonstrated to be robust on small datasets as well as practical on very large datasets of real data. Neither short nor divergent sequence pairs have to be discarded, making the method economical with data. A generalization to multialignment data is suggested and used in a test on protein-domain family phylogenies, where it is shown that the method offers family-specific rate matrices that often have a significantly better likelihood than a general matrix. [Reviewing Editor: Dr. Nicolas Galtier]     

氨基酸酰胺类化合物的合成

阐述了氨基酸氨基保护的常用方法和试剂,氨基酸酰胺类化合物合成的基本原理和方法以及在合成中需要注意的问题。重点阐述了氨基酸酰胺类化合物的合成机理和合成方法。展望了氨基酸酰胺类衍生物的合成方向。     

氨基酸代谢与肝性脑病

肝性脑病 (HepaticEncephalopathy)又称肝昏迷 ,即由于严重肝病引起的中枢神经系统功能紊乱 ,患者出现一系列神经精神病状 ,直至进入昏迷。在此仅从氨基酸代谢异常的角度叙述与肝性脑病的关系。     

氨基酸分析仪测定饲料添加剂——叶酸的方法

用６ｍｏｌ／Ｌ盐酸于１１０℃条件下水解饲料添加剂——叶酸,使之游离出谷氨酸,用氢氧化钠中和调节ｐＨ到２,氨基酸分析仪测定谷氨酸含量,经与标准叶酸水解样品比较,计算出叶酸的纯度。该方法重现性好,变异系数ＣＶ＝０．０８％,平均回收率为９８．３４％,浓度与峰面积呈线性相关,相关系数ｒ＝０．９９８７,可随氨基酸分析同时进行,不需改变任何分析条件。     

赤眼鳟肉质氨基酸成分研究初报

测定了赤眼鳟肉氨基酸组成。结果表明 ,赤眼鳟肉含有 17种氨基酸 ,其中赖氨酸含量最高 ,总氨基酸中的必须氨基酸的质量分数为 5 7.8%。     

复合氨基酸铜螯合物的研究

以废弃鸡毛的硫酸水解液作为复合氨基酸的来源 ,将其与CuSO4 ·5H2 O螯合 ,采用有机溶剂沉淀法制取了高纯度的氨基酸铜螯合物 ,并用化学分析和红外光谱分析对其进行了研究 ;同时 ,提出了一种根据直接测定螯合态微量元素的含量来测定螯合率的新方法 ,为螯合率的测定提供了一条新的途径     

不同产地天麻氨基酸的含量测定

氨基酸用途广泛,人们对氨基酸质量和品种的要求也越来越高.我国氨基酸从无到有,到现在的大市场份额,经历了五十多年的发展历程,其中包括谷氨酸、赖氨酸、苏氨酸和蛋氨酸在内的大品种氨基酸已经发展成为全球的主要供应品种,部分小品种氨基酸已形成自己的优势.绿色制造和现代生物技术的应用将成为氨基酸行业发展的主流.本文重点论述了我国氨基酸品种的现状、水平以及未来发展方向.     

氨基酸为显色剂比色法测定京尼平的含量

建立了一种京尼平含量的快速测定方法。研究了京尼平与氨基酸的显色反应条件,京尼平(0.0768mg·mL1)与氨基酸溶液(0.2mg·mL1)体积比为1:1,100℃下显色反应10min,检测波长590nm。该方法检测线性范围为0.76～30.73·g·mL1,线性回归方程为Y=0.2409X 0.0036,相关系数为0.9998,最低检测限为0.38μg·mL1,精密度为1.6%。本方法操作简便、快速,且结果准确可靠。     

蛋白质氨基酸网络研究进展

氨基酸网络是运用复杂网络工具对蛋白质结构-功能关系研究的新方法。本文回顾了氨基酸网络中常用网络参量的计算方法,如：度分布,聚集系数,平均最短路径等。结合本研究小组的工作,介绍了常用的网络构建和分析方法,并总结了氨基酸网络在蛋白质折叠以及蛋白质分子对接问题中的应用。最后,分析了氨基酸网络研究目前存在的主要问题,并对未来的工作进行了展望。