龙里瘰螈与织金瘰螈的核型

用常规涂片法对贵州产龙里瘰螈Paramesotriton longliensis与织金瘰螈P. zhijinensis的染色体核型进行了研究。结果显示,龙里瘰螈的核型为2n=24=16m+8sm,染色体臂数NF=48,其中No.7、10、11、12为亚中着丝粒染色体(sm),其余均为中着丝粒染色体(m);织金瘰螈的核型为2n=24=20m+4sm,NF=48,其中No.9、11为sm,其余均为m。2种瘰螈的核型存在差异,可为2个物种的成立提供细胞遗传学佐证。     

从线粒体Cyt b基因探讨红瘰疣螈物种地位的有效性

疣螈属的红瘰疣螈(Tylototriton shanjing)和棕黑疣螈(T.verrucosus)的物种界限一直不清楚。测定了来自中国西南地区14个地点的T.shanjing和T.verrucosus共40只标本的线粒体DNACytb基因(753bp)。结果表明:(1)用邻接法、最大简约法和贝叶斯法等3种系统发育分析法分别重建棕黑疣螈种组系统发育树的拓扑结构不支持T.shanjing是单系群;(2)T.shanjing与T.verrucsus的mtDNA Cytb序列差异平均值仅为1.2%,未达到种级水平。因此,全部T.shanjing样品都属于同一个物种,即T.verrucosus,不支持T.shanjing的物种地位,T.shanjing为T.verrucosus的同物异名,并建议恢复T.verrucosus的中文名红瘰疣螈。根据基于40个样品Cyt b基因序列的系统发育树和遗传变异以及地理分布,这些红瘰疣螈(T.verrucosus)样品聚为3支,即中国西南地区的红瘰疣螈可分为片马、滇中滇西和滇东南3个地理居群。     

从线粒体Cyt b基因探讨红瘰疣螈物种地位的有效性

疣螈属的红瘰疣螈（Tylototriton shanjing）和棕黑疣螈(T. verrucosus) 的物种界限一直不清楚。测定了来自中国西南地区14个地点的T. shanjing和T. verrucosus共40只标本的线粒体DNA Cyt b基因(753 bp)。结果表明：（1）用邻接法、最大简约法和贝叶斯法等3种系统发育分析法分别重建棕黑疣螈种组系统发育树的拓扑结构不支持T. shanjing是单系群;（2） T. shanjing与T. verrucsus的mtDNA Cyt b序列差异平均值仅为1. 2％, 未达到种级水平。因此, 全部T. shanjing样品都属于同一个物种, 即T. verrucosus, 不支持T. shanjing的物种地位, T. shanjing为T. verrucosus的同物异名,并建议恢复T. verrucosus的中文名红瘰疣螈。根据基于40个样品Cyt b基因序列的系统发育树和遗传变异以及地理分布, 这些红瘰疣螈（T. verrucosus）样品聚为3 支, 即中国西南地区的红瘰疣螈可分为片马、滇中滇西和滇东南3个地理居群。     

富钟瘰螈与广西瘰螈消化系统和呼吸系统的比较解剖

富钟瘰螈的舌和齿比广西瘰螈的略发达,雄性消化道远长于雌性的,个体的两肺长度差异也较后者大。     

富钟瘰螈和广西瘰螈骨骼系统的比较研究

采用硬骨-软骨双染色技术,研究我国广西产的富钟瘰螈和广西瘰螈骨骼系统,包括头骨、脊柱和附肢骨骼,并对各骨块的形状、位置以及与邻近骨块的关系都作了详细的描述;同时,比较了富钟瘰螈和广西瘰螈骨骼特征的差异,并将富钟瘰螈、广西瘰螈与有斑肥螈、贵州疣螈和东方蝾螈骨骼系统进行了比较,为揭示瘰螈属种间演化关系和蝾螈科属间演化关系提供一定的依据.     

瘰螈属(有尾目,蝾螈科)一新种

基于形态学差异、核POMC和线粒体序列分子数据,把分布于武陵山系的尾斑瘰螈种群定名为1新种,武陵瘰螈Paramesotriton wulingensis,其区别于尾斑瘰螈雷山种群(地模标本)鉴别特征为:1)新种体色较深,呈黑褐色,体背面疣粒较大,背脊隆起较低,尾斑瘰螈雷山地模标本体色较浅,呈棕黄色,体背面疣粒较小,背脊隆起较高;2)新种鼻突中间骨缝较深,尾斑瘰螈雷山地模标本鼻突中间骨缝较浅;3)新种前额骨与鼻骨相连的骨缝线呈波浪型,尾斑瘰螈雷山地模标本前额骨与鼻骨相连的骨缝线左右两侧呈明显“A”型;4)新种额鳞弧鳞骨直立前伸且背面观前粗后细,尾斑瘰螈雷山地模标本额鳞弧鳞骨水平前伸且背面观弧前后粗细一致;5)新种翼骨前枝较长达到上颌骨后缘,尾斑瘰螈雷山地模标翼骨前枝较短不到上颌骨后缘.     

基于线粒体细胞色素b基因序列的版纳鱼螈四个种群遗传多样性与遗传结构研究

版纳鱼螈Ichthyophis bannanicus 是蚓螈类在我国分布的唯一物种,目前已知分布在云南、广西和广东的部分地区.本研究获得4个版纳鱼螈种群的87个个体的线粒体DNA细胞色素6基因1 000 bp序列,对序列变异、遗传多样性、种群结构和种群动态进行了分析.经比对后87个序列发现39个(3.9%)多态性位点,共定义了22个单倍型.序列分析结果显示版纳鱼螈种群单倍型多样性和核苷酸多样性与其它两栖动物接近,说明版纳鱼螈各种群仍保持一定的遗传多样性水平.单倍型网络关系图和系统发生分析均显示来自云南和两广地区的版纳鱼螈分歧明显,已形成了不同的进化谱系.种群遗传结构分析也显示来自云南的勐腊种群与两广各种群之间显著的遗传差异,这提示分布在云南与两广地区的版纳鱼螈应作为不同的管理单元(MU)进行保护.综合两种中性检验(Fu's Fs=9.44,P=0;Tajima's D=1.88,P=0.013)和种群增长指数(g=5415.03±297.55)分析的结果表明,两广地区的版纳鱼螈可能经历近期的种群扩张事件.     

使用分子遗传学方法对版纳鱼螈分布、起源及扩散的初步研究

版纳鱼螈Ichthyophis bannanicus是蚓螈目Gymnophiona在我国分布的唯一物种.由于长期以来缺乏对版纳鱼螈的分布范围及演化历史等信息的了解,本研究通过分子遗传学的方法,就其分布、起源及扩散等内容进行了探讨.结果发现,我国境内的版纳鱼螈均属同一物种,尚未出现种的分化.研究中明确证实了版纳鱼螈在泰国和越南的分布,提示了版纳鱼螈在中南半岛广为分布,甚至可能达到马来西亚境内.结果还提示水系对版纳鱼螈的分布具有较大的影响,尤其在湄公河水系中表现的最为明显.现有的信息提示版纳鱼螈有可能起源于中南半岛,并沿着澜沧江-湄公河水系、红河-珠江水系、克拉地峡-马来半岛3个方向扩散.我国境内的版纳鱼螈主要分布在云南南部地区和两广丘陵以南,来自这两大分布区的个体之间的遗传差异明显,应属于不同的进化显著单元.     

尾斑瘰螈的核型和C带研究

用常规Giemsa染色和BSG技术研究了尾斑瘰螈的核型和C带。该螈的染色体数为2n=24,包括9对中部着丝粒染色体和3对亚中部着丝粒染色体(Nos. 7、10、11);BSG显带处理后全部染色体都显示了弱的着丝粒带,同时还显示了46条近着丝粒区插入带; 其核型和C带均不同于已研究过的国内蝾螈科动物,未发现与性别有关的异形色体。     

四川鹿属动物的线粒体DNA差异和系统进化关系研究

用聚合酶链反应,从水鹿,坡鹿,梅花鹿和马鹿等四种鹿属动物中分别扩增出线粒体ＤＮＡＲ的细胞色素ｂ基因片段,并测定得到了３６７ｂｐ的碱基序列,它们之间的序列差异在４．０９％￣７．０８％之间。     

国产樟科一新种—香港油果樟

报道樟科油果樟属一新种,香港油果樟Syndielis hongkongensis N．H．Xia,Y．F．Deng ＆ K．L．Yip。它以小枝红褐色,花被片6,能育雄蕊6,无腺体,而明显区别于近缘种油果樟S.chinensis Allen。     

蜂猴线粒体细胞色素b基因变异特点及系统发育分析

测定了蜂猴属（Nycticebus)1个蜂猴（N.coucang)和2个矮蜂猴（N,pygmaseus)个体的线粒体细胞色素b(cyt-b)基因全序列,比较现有的司猴科其他种序列,分析了核苷酸序列差异和碱基替换特点,以指猴为外群重建了系统发育树,结果表明,在所研究的个体中,2个蜂猴物种碱基组成具有哺乳动物的共同特点,它们之间转换比（特别是密码子第3位）是颠换比的6倍多,大于其他种间比较;低的Ka/Ks值（＜0．1）,说明懒猴科cyt-b基因的异义突位点受到强的选择压力作用。由cyt-b基因构建的系统发育树符合懒猴科化石记录和形态学分类观点,根据化石记录和与分化时间有一定线性关系的第3位颠换和同义突变速率,估算蜂猴与倭蜂猴种间,蜂猴与蜂属间可能的分化时间分别为300和600万年。     

DNA甲基化分析中重亚硫酸盐处理DNA转化效率的评估方法

为建立一种评估重亚硫酸盐处理DNA样本后胞嘧啶转化效率的有效方法,以两组不同的TaqMan qPCR检测梯度稀释的重亚硫酸盐处理和未处理的DNA标准品,建立转化与未转化的DNA Ct值以及对应的DNA拷贝数的标准曲线。使用相同的探针定量检测重亚硫酸盐处理后的DNA样本评估转化效率。结果显示该方法应用两组探针,根据相应的标准曲线,精确评估样本经重亚硫酸盐处理的转化效率。使用已知转化和未转化拷贝数的混合DNA作为模板,证实了该方法的可靠性。同时也对不同重亚硫酸盐试剂盒处理DNA的转化效率进行了评估,结果显示,该方法能够有效地评估DNA样品重亚硫酸盐的转化效率,为DNA甲基化准确分析提供了可靠快捷的方法。     

Isolation of Laribacter hongkongensis, a novel bacterium associated with gastroenteritis, from drinking water reservoirs in Hong Kong

AIMS: Freshwater fish has been found to be the reservoir of Laribacter hongkongensis, a recently discovered bacterium associated with community-acquired gastroenteritis. However, little is known about the ecology of this bacterium in the aquatic environment. We carried out a surveillance study to investigate the presence of L. hongkongensis in water and freshwater fish from 10 drinking water reservoirs in Hong Kong. METHODS AND RESULTS: Using membrane filtration, L. hongkongensis was isolated from the waters of six reservoirs, with numbers ranging from 1 to 12 CFU l(-1). Higher recovery rates were observed in summer and during days of higher water and ambient temperatures. Of 27 freshwater fish collected from the reservoirs, L. hongkongensis was recovered from the intestines of two fish, a Goldfish and a Nile tilapia. Overall, 35 different pulsed-field gel electrophoresis patterns are found among the 59 isolates recovered from water and the two isolates from freshwater fish. CONCLUSIONS: The present report represents the first to demonstrate the presence of L. hongkongensis in natural water environments. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: Although it is unlikely that treated, drinking water is an important source of L. hongkongensis-associated gastroenteritis, one should be aware of the possibility of other contaminated water as a source of human infection.     

几种鳄分子系统发生的探讨

百年来关于扬子鳄的分类学位置存在着很多争议,本测得扬子鳄、暹罗鳄和湾鳄的mtDNA ND4和Cytb基因,并从GenBank中获得密西西比鳄和海龟的DN4基因和Cytb基因相应片段。用Clustal X1.8进行对位排列,以海龟为外群构建分子进化系统树。结果显示,在鳄类动物中,扬子鳄与密西西比鳄的亲缘关系最近,两ND4基因序列碱基差异的20．68％,而Cytb基因序列碱基差异为14．43％,但扬子鳄与密西西相比与鳄的分类问题仍将有待进一步探讨。     

游离线粒体拷贝数检测方法建立及应用

摘要 目的：线粒体在生理和病理过程中都起着重要作用,线粒体破碎后形成的游离线粒体与一系列疾病密切相关。然而,人体内游离线粒体的含量较低很难被稳定抽提且易降解等因素导致游离线粒体拷贝数检测具有极大挑战。本研究拟建立一种快速、准确检测外周血游离线粒体拷贝数定量PCR技术。方法：通过多重荧光定量PCR技术在SLAN?-96S全自动医用PCR分析系统上检测人外周血游离线粒体拷贝数,构建新的游离线粒体检测方案。游离核基因在人体外周血中的稳定性远大于游离线粒体,因此使用多拷贝参考基因YH-1（300拷贝）检测游离核基因作为对照组。结果：成功建立了核基因标准曲线和线粒体标准曲线,并筛选游离线粒体拷贝数检测最佳引物扩增片段长度为82bp、血清有效分离时间在2h内、血清最佳分离方案为1600 r/min 离心10 min再16000 r/min 离心10 min、磁珠法游离核酸抽提试剂盒抽提游离核酸得率最高的新流程。利用新方案对100 例不同年龄段的随机人群外周血抽提游离线粒体拷贝数进行检测,结果显示30-79岁游离线粒体拷贝数与年龄之间的相关性参数为｜R｜= 0.18、P value = 0.077,游离线粒体拷贝数与性别之间的相关性参数为｜R｜= 0.27、P value = 0.061即游离线粒体拷贝数与年龄和性别均无显著相关性,研究结果与报道一致。结论：表明优化后的方案可稳定检测游离线粒体拷贝数,提供了一种快速、准确检测游离线粒体拷贝数的方法。     

基于多变量形态度量学和线粒体Cytb序列的鲈属鱼类分类探讨

鲈属鱼类的分类在学术界尚存在很多争议。本文通过鲈属鱼类32个多变量形态学参数和1134bp的线粒体DNA细胞色素b序列的比较,对鲈属鱼类分类问题做了探讨。结果显示河鲈和伊犁鲈之间的形态距离为0.15,黄金鲈和伊犁鲈为0.14,河鲈和黄金鲈为0.09,在形态上黄金鲈和河鲈较接近,而伊犁鲈与前两者差异明显;主成分2(16.09%)对主成分1(21.71%)作图结果显示黄金鲈和河鲈有重叠区,而伊犁鲈与其它二种鲈有较大差距;细胞色素b同源序列差异百分比为河鲈与伊犁鲈13.08%、黄金鲈与伊犁鲈10.68%、黄金鲈与河鲈11.47%,鲈属鱼类间的碱基差异属于种间的遗传差异。MP、NJ和ML三种系统发育树在河鲈、黄金鲈和伊犁鲈三个种或亚种之间的拓扑结构一致,显示黄金鲈与伊犁鲈的演化关系较河鲈为近。根据20个样本的细胞色素b基因序列的遗传差异和系统发育树以及地理分布上的繁殖隔离,我们进一步认定黄金鲈和河鲈是不同的种,鲈属鱼类包括伊犁鲈、河鲈和黄金鲈三个种。