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相似文献
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1.
陈建  曹福祥  魏小玲 《生物学通报》2013,(10):14-17,F0003
使用单因素筛选和均匀设计实验建立并优化了观光木ISSR—PCtL的最佳反应体系.从100条ISSR引物中筛选出8条多态性好、扩增稳定的ISSR引物,106份材料共扩增出12l条条带,其中109条呈现多态性,多态位点百分率(PPB)达90.08%。扩增片段为250~2000bp,平均每个引物扩增出15条片段.说明观光木种群间存在丰富的遗传多样性。观光木种群间的Nei’s基因多样性指数(He)=0.3557,Shannon信息指数(I)=0.5276,种群间的分化系数(Gst)=0.6480,而种群内的He=0.1261,I=0.1939,Gst=0.3520,说明观光木种群间的遗传多样性是观光木遗传变异的主要来源。  相似文献   

2.
采用筛选的8条ISSR引物对濒危植物观光木13个野生种群的遗传多样性及遗传结构进行分析,结果显示:物种和种群水平上多态性位点百分率分别为79.67%和46.84%,Shannon表型多样性指数分别为0.3880和0.2192,与木兰科其他近缘植物相比,遗传多样性水平较高;分子方差分析表明,观光木野生种群间遗传分化系数为0.3752,种群间存在显著的遗传距离;STRUCTURE分析和UPGMA聚类表明,参试的13个野生种群可分为3大类群;相关性分析表明,种群间遗传距离与其地理距离呈显著正相关。南昆山、笔架山、弄相山种群的遗传多样性最丰富,建议优先加以保护。  相似文献   

3.
木荷种群在演替系列群落中的遗传多样性   总被引:2,自引:2,他引:0  
利用ISSR分子标记对木荷种群在3个演替系列群落中的遗传多样性进行了研究。12个随机引物共检测到203个可重复的位点,其中多态位点183个,总多态位点百分率(P)为90.15%,平均多态位点百分率为82.27%。Shannon信息指数(I)估算的总遗传多样性为0.524 4,平均为0.477 8。Nei指数(h)计算的总基因多样性为0.358 7,平均为0.326 5。3个种群的P、I、h大小顺序均为针叶林>针阔混交林>常绿阔叶林。AMOVA分子变异显示91.56%变异来源于种群内,8.44%变异来源于种群间。种群间的遗传分化系数(GST)为0.089 7,基因流(Nm)为5.073 1。种群间的遗传相似度平均为0.928 4,遗传距离平均为0.074 4,针叶林种群与针阔混交林种群遗传相似度最高。  相似文献   

4.
中国特有种四合木种群遗传多样性的RAPD   总被引:4,自引:0,他引:4  
张颖娟  杨持 《生态学报》2002,22(11):1917-1922
采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术检测了西鄂尔多斯高原特有种四合木种群5个斑块的遗传多样性。22个扩增引物产生ll6条带,Shannon信息指数和Nei指数对RAPD数据的分析表明:四合木种群存在较高的遗传多样氓,其中千里山斑块的遗传多样性和多态位点比例较高,石嘴山斑块的最低。遗传多样性的86.5%存在于斑块内,斑块间的遗传变异为13.5%。遗传距离与地理距离无直接相关关系。这些结果说明,遗传多样性反映了四合木种群基因组DNA存在较高的变异性;同时各斑块间存在一定的基因流,四合木各斑块可看成是处于同一种群的半隔离状态(meta—种群),对四合木应注意保护遗传多样性丰富的meta—种群。  相似文献   

5.
利用微卫星(SSR)标记对来自山西和陕西两省的7个翅果油树(Elaeagnus mollisDiels)种群进行遗传多样性和遗传结构研究。10对SSR标记共检测到126个位点,其中多态位点114个。在物种水平上,平均多态位点百分率为90.79%,有效等位基因数(Ne)、Nei基因多样性指数(H)和Shannon多样性指数(I)分别为1.6072、0.3166、0.4603;在种群水平上,多态位点百分率为61.99%,有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样性指数(H)、Shannon多样性指数(I)分别为1.5445、0.2683、0.3815。遗传分化系数GST为0.2074,表明了翅果油树种群的遗传变异主要存在于种群内。基因流Nm为1.9111〉1,说明种群间基因交流可以阻止由于遗传漂变导致的遗传分化。聚类结果表明,翅果油树种群间的遗传距离与地理距离有一定的相关性,经Mantel检验,种群的地理距离与遗传距离之间呈正相关,但未达到显著水平(p〉0.05)。结果表明,遗传多样性水平与物种本身特性和不同干扰生境有关,濒危植物并不一定表现为遗传变异水平的降低。  相似文献   

6.
蜡梅种质资源遗传多样性的ISSR分析   总被引:3,自引:0,他引:3  
赵冰  张启翔 《植物研究》2008,28(3):315-320
利用ISSR分子标记技术,对蜡梅种质资源7个野生种群和2个栽培种群的遗传多样性进行了研究。用11条引物,共扩增出124条谱带,其中110条多态带,多态位点占88.70%。用POPEGEN1.31版软件对数据进行分析,结果显示:种群总的Nei’s基因多样性指数为0.272 6,Shannon信息多态性指数为0.411 7,蜡梅总的遗传多样性水平较高。蜡梅不同种群遗传多样性水平差异较大,种群多态位点百分率在52.94%~90.00%之间,Nei’s基因多样性指数为0.143 4~0.378 2,Shannon信息多态性指数为0.232 2~0.546 6。神农架种群(SN)和保康种群(BK)的遗传多样性水平较高。种群间的基因分化系数为0.353 6,种群内的遗传变异大于种群间的遗传变异。用NTSYS2.01版软件对样品进行UPGMA聚类分析,结果9个种群并没有按地理距离进行聚类。种群间的地理距离和遗传距离之间没有显著的相关性(r=0.437 1,P=0.921 3)。  相似文献   

7.
不同海拔高度木荷种群遗传多样性的ISSR分析   总被引:4,自引:0,他引:4  
利用ISSR分子标记技术分析了浙江天台山不同海拔高度木荷种群的遗传多样性和遗传分化.用12个引物对4个木荷种群共80个样品进行扩增,共检测到170个位点,其中多态位点154个,多态位点百分率(P)为90.59%.木荷总的Shannon信息指数(I)为0.5033,Nei指数(h)为0.3408,表明种水平的遗传多样性较高.而种群水平的遗传多样性比种水平低,P平均为63.68%,I平均为0.3789,h平均为0.2608.AMOVA分子差异分析表明,在总的遗传变异中,29.56%的变异存在于种群间,70.44%的变异存在于种群内,种群间的基因分化系数(Gst)为0.2348.木荷种群间的基因流为1.6293,4个种群间的平均遗传距离为0.1500.  相似文献   

8.
采用ISSR分子标记对分布于山东省长岛县南部的北长山、南长山、大黑山和小黑山4个岛屿上的藜天然种群共81个个体进行了遗传多样性及遗传结构的研究。13个引物共检测到157个可重复的位点。遗传多样性研究结果表明:种内的多态位点比率为66.24%,具有较高的遗传多样性(Shannon(I)指数在物种水平上为0.332 0);种群间有一定的遗传分化,根据Gst值,种群间的遗传多样性占总群体的9.27%。遗传距离分析表明,XHS种群和NCS种群的遗传一致度最高,与地理距离无相关性。  相似文献   

9.
应用ISSR-PCR分析蒙古栎种群的遗传多样性   总被引:7,自引:0,他引:7  
本研究应用ISSR标记技术对东北地区的优势树种蒙古栎(Quercus mongolica)的25个种群遗传多样性进行了分析,目的是为蒙古栎早期选择提供依据。从60条ISSR引物中筛选出10个特异性强、稳定性好的引物进行ISSR分析。共获得位点数71个,其中多态位点数56个,多态位点百分率为78.87%。PopGene分析结果表明:种群的平均多态位点百分率为45.2%,Shannon表型多样性指数(I)平均值为0.25,具有较高的遗传多样性,种群间存在一定程度的基因流(^0为1.3818)和遗传分化(Nei’s信息多样性指数平均值为0.1068,Gst平均值为0.2657),种群内的基因多样度占总种群的73.43%,种群间占26.57%,表明蒙古栎种群的变异主要来源于种群内。结合聚类分析和地理变异规律把种群划分为两个大的种群组:小兴安岭种群组和长白山种群组。以上结果可为栎属种质资源的保护和利用以及物种分化研究提供基础资料。  相似文献   

10.
应用ISSR分子标记技术对本溪草河口林场的红松(Pinus koraiensis)人工林两个种群的60个个体进行遗传多样性分析。14个ISSR引物共检测到90个位点,其中多态位点65个,多态位点比率0.722 2。Nei指数统计结果表明,红松人工林的遗传多样性喜鹊沟种群(0.278 9)大于烈士墓种群(0.271 2),Shannon指数统计结果与Nei指数相同。研究证实草河口林场红松人工林保存了较多的遗传多样性。  相似文献   

11.
记述采自中国海南、贵州、广东的短象蜡蝉属Dictyopharina Melichar(半翅目,蜡蝉总科,象蜡蝉科,象蜡蝉亚科)1新种,即六突短象蜡蝉D.hexasaca sp.nov.。编制了短象蜡蝉属分种检索表,提供了新种的鉴别特征图。新种模式标本保存于贵州大学昆虫研究所。  相似文献   

12.
Amplified fragment length polymorphism (AFLP) was used to determine the genetic diversity among 38 populations of Jatropha curcas L. grown in a seed source trial in Hainan Province of China. The populations studied consisted of one source from Indonesia and 37 sources from the main cultivating areas of jatropha in China, viz. Guangdong (1), Guangxi (10), Guizhou (4), Hainan (6), Sichuan (8) and Yunnan (8). Nine AFLP primer combinations were used to generate a total of 246 fragments, of which 72 (26.99%) were polymorphic. Three-marker attributes: polymorphism information content (PIC), marker index (MI) and resolving power (RP), were all found to be reliable to determine the discriminatory power of the nine primer combinations. The Jaccard’s similarity coefficient showed a high similarity range from 0.866 to 0.977, suggesting a low genetic diversity among the 38 populations. The UPGMA-based dendrogram and biplot of a principal component analysis did not reveal a clear pattern of groupings by geographic locations of the seed sources; populations from across different provinces were mixing in the same groups. The low genetic diversity and a lack of variation pattern among the populations in China suggest that it is necessary to import new germplasm preferably from the species’ natural distribution range to broaden the genetic base for improvement program.  相似文献   

13.
濒危植物南方红豆杉遗传多样性的RAPD分析   总被引:5,自引:2,他引:3  
采用RAPD技术检测了山西南部南方红豆杉8个种群的遗传多样性。利用21个10聚寡核苷酸引物共检测出134个位点,其中多态性位点123个,占91.79%,8个种群的遗传多态位点百分率分别为67.16%(红豆峡)、67.91%(凤凰谷)、66.42%(小梯河)、66.42%(蟒河)、50.75%(历山西峡)、43.28%(云蒙山)、78.36%(长治宾馆)、50.75%(磨河)。南方红豆杉的遗传多样性分析结果显示:Shannon指数为2.180,其中31.7%的遗传多样性来自种群间,68.3%来自种群内;Nei指数为0.571,种群间的遗传分化系数(Gst)为0.181。8个种群间的遗传相似性分析结果显示:壶关红豆峡和陵川凤凰谷种群间的遗传距离最小(0.109 2),壶关红豆峡和陵川蟒河种群间遗传距离最大(0.55)。本研究结果揭示,南方红豆杉自然种群具有较高的遗传多样性,其遗传多样性不是导致该种群濒危的主要原因,导致南方红豆杉种群濒危的原因可能与南方红豆杉自然种群及群落所在生境的直接破坏及其本身生物学和生态学特性所导致的自然更新不良有着密切的联系。  相似文献   

14.
孑遗植物桫椤种群遗传变异的RAPD分析   总被引:16,自引:2,他引:14  
应用 RAPD标记分析了桫椤分布在海南尖峰岭及霸王岭 ,广东塘朗山、黑石顶及大西山孑遗种群的遗传变异。 2 8个引物共检测到 1 1 8个位点 ,其中多态位点 33个 ,多态位点比率 2 7.97%。Shannon多样性、Nei遗传分化和分子方差分析 ( AMOVA)结果一致显示尖峰岭种群遗传多样性最大 ,霸王岭种群次之、塘郎山种群第三 ,黑石顶种群第四 ,而大西山种群最小。种群的遗传变异主要发生在种群间 ;Shannon指数测出的种群间遗传多样性所占比率为 79.1 0 % (基于表型频率 )和 77.85 % (基于基因频率 ) ,Nei基因分化系数 ( Gst)达 80 .69% ,分子方差分析也表明种群分化极为显著 ( Φst=0 .82 86,P<0 .0 0 1 )。桫椤的种内遗传多样性水平很低 ,种内 Shannon多样性仅为 0 .0 641 (基于表型频率 )和 0 .1 1 2 4 (基于基因频率 ) ,总基因多样性只有 0 .0 770。另外 ,Jaccard相似性系数的 UPGMA分析结果显示 5个种群分为两个分支 :尖峰岭种群和霸王岭种群组成一分支 ;黑石顶、塘郎山和大西山种群组成另一分支 ,并且三者中前两者的遗传关系更为密切。聚类分析结果还得到主成分分析的支持。根据桫椤种群的遗传变异特点 ,初步探讨了保护策略。  相似文献   

15.
Wang T  Su YJ  Li XY  Zheng B  Chen GP  Zeng QL 《Hereditas》2004,140(1):8-17
RAPD markers and sequences of chloroplast DNA (cpDNA) atpB-rbcL intergenic spacers were used to characterize the pattern of genetic variation and the phylogenetic relationships of the relict populations of Alsophila spinulosa located in Jian Feng Ling (JFL) and Diao Luo Shan (DLS), Hainan, and Tang Lang Shan (TLS), Ding Hu Shan (DHS), and Da Xi Shan (DXS), Guangdong, of southern China. 28 random primers generated 118 bands, out of which 26 (22.03%) were polymorphic loci, distinguishing 17 different RAPD phenotypes. Percentage of polymorphic loci, Shannon phenotypic diversity and Nei's gene diversity comprehensively indicated that JFL possessed the highest diversity, TLS and DHS in intermediate and DLS or DXS the least; the corresponding values of the population appeared correlated with the population size. Differentiation was detected among populations of A. spinulosa (1-Hpop/Hsp=0.7453, GST=0.7763, and phist=0.8145). AMOVA showed that 47.44% of the variance was partitioned among regions (Hainan and Guangdong), 34.01% attributed among populations within regions, whereas only 18.55% occurring within populations. Low level of intra-specific diversity was maintained in A. spinulosa with Shannon diversity and gene diversity merely 0.0560 and 0.0590, repectively. Sequence length of atpB-rbcL intergenic spacer varied from 724 bp to 730 bp. Base composition was with A+T content between 63.17% and 63.70%. 13 haplotypes of atpB-rbcL noncoding spacers were identified. UPGMA dendrogram of RAPD phenotypes, principal components analysis based on RAPD patterns, minimum spanning network and neighbour-joining (NJ) tree established on atpB-rbcL haplotypes consistently suggested the geographical subdivision of populations of A. spinulosa between Hainan and Guangdong. Breeding system and conservation strategy of A. spinulosa was discussed based on the information of population genetic structure and variation.  相似文献   

16.
报道了广东省始兴县车八岭国家级自然保护区及其邻近地区木兰科植物种群特点及保护现状。木兰科植物通常位于人为破坏较轻 ,林相保存较好 ,以壳斗科、樟科、茶科为主要建群种的中亚热带常绿阔叶林中。共设置了 9个面积为 4 0 0 m2的样方。在样方中共记录了 3种木兰科植物 :观光木 ( Tsoongiodendron odor-um Chun)、深山含笑 ( Michelia maudiae Dunn)和金叶含笑 ( M.foveolata Merr.ex Dandy)。其中 ,深山含笑的种群较大 ,呈稳定结构 ,但主要局限于保护区内保护较好的地域 ;金叶含笑种群面临濒危 ,种群小 ,在保护区呈零星分布 ;观光木的分布区域相对较广 ,在保护区内外均见分布 ,但种群较小 ,特别是在保护区外的种群 ,由于人为的干扰 ,种群在急剧减少。大多数木兰科植物的种群在原生境均表现出自然更新不良 ,必须加以保护。分析了影响车八岭及其邻近地区木兰科植物种群及其群落发展的主要限制因素 ,建议加强自然保护知识的宣传和木兰科植物的人工保育 ,促进该区域木兰科植物资源的管理和发展  相似文献   

17.
为研究其种群遗传变异和亲缘地理格局,分析了107尾采自华南西部和海南岛的12条水系的美丽小条鳅(Micronoema-cheilus pulcher Nichols)控制区934-938 bp的序列,其中有79个核苷酸变异位点。分子变异分析(AMOVA)表明,种群间的遗传变异占46.88%,种群内的遗传变异占55.06%。基于36个单倍型的系统树显示,12条水系的种群聚成两支。其中,广西沿海诸独立水系(防城河、峒中河、北仑河、南流江)和西江水系与广东漠阳江和潭江水系关系密切,而海南岛万泉河和南渡江与广东鉴江水系关系密切。根据嵌套进化枝系地理分析(NCPA)推测,防城河周边地区可能是美丽小条鳅的扩散中心,该物种可由此区域通过两条途径扩散:(1)沿西江水系向广西沿海独立水系至广东漠阳江和潭江水系扩散;(2)向海南岛诸水系再至雷州半岛的鉴江水系扩散。在演化过程中,曾发生片断化事件、长距离建群和持续的分布区扩张。  相似文献   

18.
In order to determine the genetic diversity and genetic structure of populations in common wild rice Oryza rufipogon, an endangered species, allozyme diversity was analyzed using 22 loci in 607 individuals of 21 natural populations from the Guangxi, Guangdong, Hainan, Yunnan, Hunan, Jiangxi and Fujian provinces in China. The populations studied showed a moderate allozyme variability (A=1.33, P=22.7%, Ho=0.033 and He=0.068), which was relatively high for the genus Oryza. The levels of genetic diversity for Guangxi and Guangdong were significantly higher than those for the other regions, and thus South China appeared to be the center of genetic diversity of O. rufipogon in China. A moderate genetic differentiation (FST=0.310, I=0.964) was found among the populations studied. Interestingly, the pattern of population differentiation does not correspond to geographic distance. An estimate of the outcrossing rate (t=0.324) suggests that the species has a typical mixed-mating system. The deficit of heterozygotes (F=0.511) indicates that some inbreeding may have taken place in outcrossing asexual populations because of intra-clone outcrossing events and ”isolation by distance” as a result of human disturbance. In order to predict the long-term genetic survival of fragmented populations, further studies on gene flow among the remaining populations and the genetic effects of fragmentation are proposed. Finally, some implications for the conservation of endangered species are suggested. Received: 22 June 1999 / Accepted: 20 December 1999  相似文献   

19.
Praxelis clematidea (Asteraceae), a plant species native to South America, is a noxious weed in southern China. We examined the genetic variation and population structure of 12 populations (76 individuals) of P. clematidea from Fujian, Guangdong, and Hainan Provinces in China using inter-simple sequence repeat (ISSR) analysis. From an initial set of 69 ISSR primers, 10 were selected which yielded 80 reproducible bands. Polymorphic bands (P) were 100%, Shannon's information index (I) was 0.4226, and Nei's gene diversity (H) was 0.2791. We infer that the high levels of genetic diversity exhibited by P. clematidea may have contributed to its invasiveness. Gene flow among populations was 2.4930, which has led to homogenization. The coefficient of population differentiation (Gst = 0.1671) indicated low levels of genetic variation among populations and high levels of genetic polymorphism within populations. There was a negative correlation between population elevation and genetic diversity, while there was a significant positive correlation between genetic distance and geographic distance based on a Mantel test (r = 0.5820, P < 0.01). Some populations from different provinces clustered together in principal coordinate and UPGMA analyses indicating that human-mediated events may have contributed to the dispersal of the species.  相似文献   

20.
企鹅珍珠贝不同地理群体遗传多样性的fAFLP分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
为阐明企鹅珍珠贝(Pteria penguin)不同地理种群的遗传多样性机制, 采用荧光标记扩增片段长度多态性(fAFLP)技术分析了企鹅珍珠贝广西涠洲岛、广东流沙湾和海南黎安 3 个不同地理群体的遗传多样性。选取 7 对引物组合对 90 个个体(每个群体 30 个)进行 fAFLP 扩增, 结果发现每个个体均能扩增出清晰的、可重复的扩增条带, 每对引物的扩增位点数在 100—163 之间, 共得到 895 个扩增位点, 多态位点数为 865 个; 涠洲岛、流沙湾和黎安群体的多态位点比例分别为 70.73%、63.13%、66.82%。Nei 遗传多样性指数为 0.1634、0.1558、0.1783, Shannon 遗传多样性指数为 0.2635、0.2474、0.2932。3 个群体间遗传相似度在 0.9722—0.9824之间, 遗传距离在 0.0177—0.0282 之间。根据遗传距离绘制 UPGMA 聚类图, 但 Mantel 检验结果显示企鹅珍珠贝三群体间的遗传距离与地理距离之间无显著相关。Shannon 遗传多样性指数和 AMOVA 分析, 结果均显示企鹅珍珠贝的遗传变异主要来源于群体内个体间, 7.91%的遗传变异来自群体间, 92.09%的遗传变异来自群体内。分析群体的显性基因型频率分布和基因流 Nm发现 3 个群体有基本相同的遗传结构, 有明显的基因交流。研究结果表明北海涠洲岛群体、湛江流沙湾群体和海南黎安群体的企鹅珍珠贝种质有较高的多态位点比例, 但未发生显著地理分化。这一结果为我国企鹅珍珠贝的良种选育以及种质资源保护措施的制定提供了参考依据。  相似文献   

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