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广西壮族自治区HIV-1流行毒株的基因序列测定和亚型分析 总被引:12,自引:0,他引:12
使用PCR技术对14份广西HIV-1阳性感染者外周血单核细胞(PBMCs)样品进行扩增,获得HIV-1膜蛋白(env)基因的核酸片段,并对其C2-V3及邻区350-450个核苷酸序列进行了测定和分析。结果表明,14份样品中9份为泰国B(B′)亚型,5份为E亚型毒株。其中B′亚型毒株的基因离散率为4.2%,与A-E参考亚型及部分B亚型代表株序列相比较,与包括泰国、缅甸及云南德宏在内的B亚型毒株序列十分接近,相互之间基因离散率在3.0%-4.4%的范围内;而E亚型毒株的基因离散率为2.1%,与国际E亚型毒株的基因离散率最近,为5.6%,与其它国际参考亚型基因离散率很远,在21.1%-27.3%。根据以上数据及其它资料提示,广西存在B′和E两种亚型的HIV-1的流行,且其B′亚型毒株的传入,与流行在云南德宏州的相同亚型HIV-1毒株密切相关,而E亚型毒株则可能是由泰国经越南传入广西的 相似文献
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广西壮族自治区HIV—1流行毒株的基因序列测定和亚型分析 总被引:6,自引:0,他引:6
使用PCR技术对14份广西HIV-1阳性感染者外周血单核细胞(PBMCs)样品进行扩增,获得HIV-1膜蛋白(env)基因的核酸片段,并对其C2-V3及邻区350 ̄450个核苷酸序列进行了测定和分析。结果表明,14份样品中9份为泰国B(B')亚型,5份为E亚型毒株。其中B'亚型毒株的基因离散率为4.2%,与A-E参考亚型及部分B亚型代表株序列相比较,与包括泰国、缅甸及云南德宏在内的B亚型毒株序列十 相似文献
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HIV—1 SF2株env基因(120)在大肠杆菌中的表达 总被引:3,自引:0,他引:3
运用基因重组技术,将HIV-1 SF2株编码外膜蛋白gp120的env基因片段与原核载体pBV220进行重组,构建成质粒pBVSF2env,并在大肠杆菌(E.CoilDH10b)中获得表达,经Westemblot反应证实,该重组蛋白与来自HIV-1感染者的血清(含多克隆抗体)发生特异性反应。 相似文献
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人类免疫缺陷病毒膜蛋白基因(env)F亚型毒株在中国的首例发现 总被引:19,自引:0,他引:19
1998年广东某戒毒所HIV阳性感染者的血样,经PCR扩增未培养细胞内HIV前病毒基因并对C2-V3区进行测序和分析,发现两例感染者与巴西F亚型毒株BZ163的基因离散率小于4%;Neighbor-joining系统树表明,它们与F亚型聚在一起;通过异源双链泳动技术分析法(HMA)分析,这两例感染者与F亚型形成明显的异源二聚体。上述各项研究结果表明,F亚型HIV-1已传入我国。 相似文献
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应用异源双链泳动分析法快速确定(HIV-1)基因亚型 总被引:10,自引:0,他引:10
应用异源双链泳动分析法(Heterouduplex mobility assay,HMA),对来自我国云南、四川、新疆、浙江、广东、福建、天津7省市73份HIV感染者样品,进行了HIV-1膜蛋白(env)基因片段亚型分析。通过HMA能确定亚的有70份,占样品总数的95.89%(70/72)。其中A亚型2.86%(2/70),F亚型2.86%(2/70),泰国B亚型18.58%(13/70),欧美B 相似文献
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以鸡传染性法氏囊病病毒内蒙古毒株(IBDV-NM)dsRNA为模板,用RT-PCR法扩增其主要寄主保护抗原VP2基因的全长cDNA,克隆于pUC19的XbaI/KpnI位点,进行了全序列分析。序列比较发现IBDV-NM毒株VP2基因与已报道的其它7个IBDVCJ801bkf、Cu1、PBG98、52/70、002—73、STC及VariantE毒株之间高度同源,其核苷酸序列的同源率为91.6%~96.2%,推测的氨基酸序列的同源率为96.2%~98.6%。IBDV-NM毒株VP2高变异区的第一个亲水区氨基酸序列与CJ801bkf、Cu1、PBG98、52/70、STC、002—73比较,有一个氨基酸差异,第二个亲水区氨基酸序列与上述6个毒株完全相同。而与VariantE比较,两个亲水区内各有两个氨基酸差异。此外,IBDV-NM毒株VP2具有强毒株所特有的7肽保守区:SWSASGS。这些结果表明,IBDV-NM毒株为标准血清Ⅰ型IBDV强毒株。 相似文献
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为了解HIV抗体阳性血浆中的HIV1病毒基因亚型的情况,应用逆转录PCR和DNA序列测定技术,对6份获自高危人群的抗HIV1阳性血浆进行序列分析和基因亚型分型的研究,结果表明均属HIV1B亚型。V3环氨基酸序列分析指出这些HIV1B亚型病毒株与泰国HIV1B亚型病毒株核苷酸和氨基酸序列相似;同时发现HIV1cDNA和氨基酸序列均相同,推测这6份标本可能来自同时感染同一株HIV病毒的感染者。本研究对了解高危人群中HIV1流行的遗传变异和HIV1亚型病毒株的分子流行病分析具有一定的意义。 相似文献
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人免疫缺陷病毒1型Rev单链抗体细胞内免疫抗病毒基因治疗研究 总被引:2,自引:0,他引:2
应用抗HIV-1Rev单链抗体细胞内免疫方法,研究在人T细胞和周围血淋巴单核细胞内抗病毒复制的效果,探讨细胞内免疫抗HIV-1基因治疗的可行性。克隆抗HIV-1Rev单链抗抗体(sFv)基因,以逆转录病毒为基因载体,将名装后的含靶基因的逆转录病毒转导至人CD4阳性T-细胞株CEM和SupT1,以及HIV-1阴性自愿者的周围血淋巴单核细胞(PBMC),再分别用不同剂量(MOI)的HIV-1病毒株PN 相似文献