穿刺巴斯德芽菌基因组DNA提取方法优化

穿刺巴斯德芽菌(Pasteuria penetrans)是一类形态特殊的革兰氏阳性细菌,其芽胞结构比其他芽胞杆菌属芽胞复杂。本研究以穿刺巴斯德芽菌芽胞为实验对象,探索芽胞破碎条件;并通过比较不同的基因组DNA提取方法,优化穿刺巴斯德芽菌基因组DNA提取方法。实验结果表明,在破碎条件为速率6 m/s时间40 s时,选用粒径为0.1 mm石英砂,芽胞破碎效果最好;利用FG Kit提取的基因组DNA浓度最高(38.30±1.71)ng/μL,可用于后续的巴斯德芽菌基因组学研究。     

水稻种子内生泛菌(Pantoea spp.)系统发育多样性及其促生功能

【目的】Pantoea菌株是广泛分布在自然界中的一类功能多样的细菌。本研究对分离自水稻种子内生的Pantoea菌株进行系统发育分析及功能评价,从而确定分类地位、种类多样性、分布特征及功能特性。【方法】采用乙醇-次氯酸钠联合灭菌方法进行水稻种子的表面灭菌,进行内生细菌的分离与纯化;其次将纯化后的菌株进行16Sr RNA基因PCR扩增及序列分析,通过MEGA7软件构建系统发育树;将分离得到的菌株进行功能实验检测,如溶磷、产IAA、产铁载体、拮抗病原真菌等特性,最后检测菌株的溶血性;水稻分型采用SSR方法,并对水稻农学性状如分蘖数、株高、植株重及产量进行调查。【结果】本研究对分离自8个不同基因型水稻种子中的146株内生Pantoea菌株进行系统发育分析及功能评价,结果发现所分离到的泛菌菌株主要属于Pantoea dispersa、Pantoea agglomerans、Pantoea cypripedii以及Pantoea brenneri四个种,其中P. dispersa的菌株数量最多,分布最广,并且存在于所有的8个水稻种子样品中。对其中66株菌进行功能检测,发现86.3%和69.7%的菌株具有溶磷和产IAA能力,有7株菌具有产铁载体能力,未发现对真菌病害Fusarium moniliforme有拮抗作用的菌株,并发现3株菌具有溶血性;本实验未发现泛菌组成与水稻系统发育及农学性状存在明显的相关性。【结论】本研究首次对水稻种子中泛菌的多样性及其功能进行报道,发现不同基因型的水稻种子所含Pantoea种类及组成存在差异,种子选择性地积累了Pantoea类群,大部分菌株具有一定的促生特性。该研究结果有助于进一步探究微生物与植物的共进化、种子微生物的传播途径及作用方式。     

苏云金芽胞杆菌基因组研究

苏云金芽胞杆菌制剂是目前世界上产量最大、使用最广的微生物杀虫剂.近年来,国内外研究人员在苏云金芽胞杆菌的功能基因组学领域开展了深入的研究,取得了丰硕的研究成果.本文拟就苏云金芽胞杆菌的基因组、转录组、蛋白质组及代谢组研究进展进行简要论述.     

云南两种地衣茶:白雪茶(Thamnolia spp.)和红雪茶(Lethariella spp.)的营养成分分析

“红雪茶”和“白雪茶”是滇西北少数民族传统饮用的地衣保健茶;其中,“红雪茶”混杂了梅衣科(Parmeliaceae)金丝属(Lethariella)中的4个地衣种:金丝绣球(Lethariellacashmeriana),金丝刷(L.cladonioides),柔金丝(L.sernanderi)和金丝带(L.zahlbruckneria);“白雪茶”包含了雪茶属(Thamnolia)中的两个种,即:雪茶和雪地茶(Thamnoliavermicularis&T.subuliforms)。利用常规方法测定了两种地衣茶的主要营养成分,并与常见饮茶进行比较,测定结果显示:红雪茶和白雪茶含有多种营养成分,红雪茶粗蛋白质含量为2.69g/100g·DW,粗脂肪3.42g/100g·DW,总糖、可溶性糖、灰分含量分别为5.04g/100g、0.35g/100g、1.74g/100g·DW;白雪茶的粗蛋白质含量为2.81g/100g·DW,粗脂肪2.91g/100g·DW,总糖、可溶性糖、灰分含量分别为0.99g/100g、0.27g/100g、4.18g/100g·DW;两种地衣茶均含有17种氨基酸和多种矿物元素,具有一定营养价值;而两种地衣营养成分的含量存在差异。     

三种金钢钻(Earias spp.)的鉴别

金钢钻是棉花上的重要害虫,在云南分布有三种:棉斑实蛾(Earias insulana Boisd.),翠纹金钢钻(E.fabia Stall.),金钢钻(E.cupreoviridis Walk.)。过去国内都未有较详细的记载,特别是前一种更少,这样就不可能很好地将几种金钢钻的幼虫分开,为此,把我们的初步记述整理,供有关同志参考和不     

稗类(Echinochloa spp.)植物的开花生物学特性

对稗类（Echinochloa spp.）常见种类[稗Echinochloa crusgalli(L.)Beauv.;无芒稗 E.crusgalli var.mitis(Pursh)Peterm.;西来稗E.crusgalli var.zelayensis(H.B.K.)Hitchc.;细叶旱稗E.crusgalli var.praticola Ohwi;旱稗E.hispidula(Retz.)Nees和光头稗E.colonum(L.)Link]的开花过程和节律,温度、光周期、晴天和阴雨天对其中部分稗类植物开花的影响以及套袋条件下无芒稗和旱稗的结实率进行了研究。结果表明,不同稗类植物的开花的过程基本相似,从颖壳微微张口到闭合大约需20－30min,但花约伸出颖壳后,散落花粉的过程很快,颖壳闭合后柱头外露率达100％。稗类植物每穗开花持续时间较长,一般为20－25d,随种类的不同略有变化;稗类植物每穗每天开花数量的变化趋势基本呈抛物线状,每天的开花比例变化较平缓,即使在开花高峰期,开花数也只占总数的10％－15％,开花高峰期因稗草种类的不同略有变化,但都在始花后11－15d左右。每日的开花节律为70％－80％的颖花在7：00之前开,15％－20％在7：00－8：30开,8：30之后零星开花,10：30尚未见开花。温度、光周期、晴天和阴雨天对开花都有一定的影响。不同条件下的结实率没有明显差异。     

苏云金芽孢杆菌基因组研究概况

迄今为止,全球已有2个Bt株菌株完成了全基因组测序,1个Bt菌株正在拼接中,15个Bt菌株正在进行测序中.已有22个Bt质粒完成了全序列测定.Bt是作为生物农药使用最广泛的微生物菌株,也是最为成功地将其杀虫晶体蛋白基因应用于植物转基因的微生物.在基因组进化、新基因发现、基因表达调控等方面一直是科学家研究的热点,并取得了相当多的成果.本文概述了苏云金芽孢杆菌基因组测序现状、基因组特征及比较基因学等方面的研究进展.     

华南地区人口压力增长对猕猴(Macaca spp.)分布的影响

通过研究本世纪初和现今两个历史时期华南地区猕猴分布、人口和耕地变化发现,猕猴在本世纪初为随机分布,现今已为聚集分布。在现今生产力水平下,180人·km^-2是猕猴分布限量。本世纪初区内有猴分布的县(市)为61%,现今仅为23.47%.21世纪30年代前后预计尚余15.2%县(市)仍有猴分布,主要分布在湘西北、桂西及湘、桂、粤交界的南岭一带,琼西南尚余少数。     

大肠埃希菌基因组研究

大肠埃希菌是最早启动全基因组测序的细菌之一,但是对于大肠埃希菌作为共生菌存在于人类和动物肠内的生物学本质尚不清楚。目前,研究人员正在对大肠埃希菌基因组中每个必需基因的功能进行研究,以期能进一步了解大肠埃希菌的生物学特性。本文就大肠埃希菌基因组研究现状、研究方法及其后基因组研究等方面进行综述。     

鼠疫耶尔森菌基因组研究进展

鼠疫耶尔森菌的全基因组序列已测定完成,在染色体上有4000多个编码序列和149个假基因,并含有大量的插入序列,3个毒性质粒上也含有诸多与致病性有关的基因,本主要就鼠疫耶尔森菌的染色体及质粒pYV/pCD1,pFra/pMT1和PST／pPCP1的基因结构,组成特征和已知的毒性基因定位等方面的研究作一综述。     

Can different species of medicinal leeches (Hirudo spp.) interbreed?

Abstract. Since the 18th century, the medicinal leech Hirudo medicinalis has been thought to comprise a single species with several different color morphs, but recently some of these color morphs have been assigned to separate species based on morphology, geographical distribution, and molecular sequence data. This research was aimed at testing the ability of three of these species, H. medicinalis, Hirudo verbana, and Hirudo orientalis, to interbreed. We found that in the laboratory, all three species were able to mate with each other and produce hybrid offspring. This suggests that the reproductive isolation is not strong among these species of the genus Hirudo. However, fewer offspring were produced from interspecific crosses compared with intraspecific crosses. This decrease of fecundity (and in some cases, offspring viability) indicates some degree of reproductive isolation between H. medicinalis, H. verbana, and H. orientalis.     

美国能源部资助的微生物基因组研究概况

自 1 995年 1 2月完成第一个微生物 (流感嗜血杆菌 )全基因组测序以来[1] ,微生物基因组学策略和技术提高很快 ,促进了其他生命形式 (包括人类 )的基因组学发展 ,开创了生物基因组计划新时代[2 ] 。短短几年内 ,互联网数据库中各种生物基因组数据迅速增长。 1 998年 2月 2 0日美国Ｓｃｉｅｎｃｅ杂志评选的当年世界十大科技进展 ,将微生物基因组图谱的构建列为其中第六项 ,同年 3月 2 7日Ｓｃｉｅｎｃｅ杂志编者指出 :生物基因组革命可以同工业革命和计算机革命所带来的变化相比 ,是“第三次技术革命”[3 ] 。微生物全基因组测序 ,不仅是人…     

谷子(Setaria italica(L.) P. Beauv.)作为功能基因组研究模式植物的发展现状及趋势

模式植物对遗传学和分子生物学前沿理论探索和实践研究至关重要。玉米、拟南芥和水稻等主要的模式植物,在植物遗传学发展的不同时期发挥了不可替代的作用,但随着研究的深入和细化,迫切需要更多别具特色的物种成为模式植物。谷子(Setaria italia)及其野生种青狗尾草(S.viridis)因具备C_4光合途径和特殊的抗旱耐逆性备受关注,谷子也因其较小的二倍体基因组、自花授粉、高繁殖系数、较小的株高和易于操作的栽培方法,以及生育周期短、易于快速繁殖等特点,非常适合作为分子遗传学研究的模式植物,近年来作为C4和抗旱耐逆研究的模式系统越来越受到国际植物遗传学界的关注。谷子是起源于中国的古老农作物,我国拥有最丰富的遗传资源,并在遗传育种研究上处于领先。现简述我国谷子的研究基础,综述近年来谷子和青狗尾草作为模式作物的研究进展,讨论相关研究存在的问题,并对谷子遗传研究的发展趋势进行展望。     

秦巴山区野生百合(Lilium spp.)的育种应用研究

为探索秦巴山区野生百合资源在百合育种中的应用方向及途径, 获得具有其独特遗传背景的育种材料,将秦巴山区野生百合的抗病毒及独特观赏特性等优良遗传性状逐渐渗到栽培品种中去。该研究借助切割柱头杂交及胚抢救技术,选取6种秦巴山区野生百合［岷江百合(Lilium gegale)、宜昌百合(L. leucanthum)、山丹（L. pumilum）、野百合（L. brownii）、宝兴百合（L. duchartrei）、川百合（L. davidii）］以及亚洲百合（Asiatic hybrids,AA）品种‘Elite’、东方百合（Oriental hybrids,OO）品种‘Sorbonne’、‘Siberia’和‘Marlon’、OT百合（Oriental × Trumpet hybrids,OT）品种‘Yelloween’、‘Serano’、‘Corel′door’进行了32组共计263朵花的（品）种间杂交,并针对膨大变软的果实剥离可供离体培养的胚及胚囊进行胚抢救。结果表明：（1）不同杂交组合坐果率、胚获得及萌发率呈现出较大差异,综合坐果率为11.4%,对30个膨大的果实中共计38个可供离体培养的胚及胚囊进行胚抢救,有7株最终萌发。（2）以野生百合为父母本的12组杂交组合中,6组获得了膨大果实,得到6株杂交后代。（3）栽培百合做母本,野生百合做父本的20组杂交组合中,共9组获得了膨大果实,除‘Elite’ × 山丹可直接收获种子外,共得到1株杂交后代。（4）以岷江百合及宜昌百合为亲本的远缘杂交TT × AA及回交OT × TT成功获得杂种后代。（5）秦巴山区6种野生百合在远缘杂交中获得育种后代的几率存在较大差异,宜昌百合和岷江百合获得后代几率较高,宝兴百合获得后代几率较低,野百合未获得后代。以上结果表明,岷江百合和宜昌百合为母本的TT × AA杂交和宝兴百合为父本的TT × AA杂交以及岷江百合和宜昌百合为父本的OT回交,为三种百合的育种利用提供了新途径,野百合的育种应用途径需要继续探索。     

柽柳(Tamarix spp.)和梭梭(Haloxylonammodendron)的"肥岛"效应

灌丛"肥岛"是全球干旱生态系统中的普遍现象,其发生和发展对干旱灌木、草原生态系统的结构和功能都具有重要影响,但其物种效应容易得到忽视.对准噶尔盆地南缘柽柳(Tamarix spp.)和梭梭(Haloxylon ammodendron)这两种不同地表形态灌木的冠下、冠缘和灌丛间地3种生境的土壤进行了采样、分析,结果表明:(1)柽柳和梭梭都存在"肥岛"现象,主要表现在土壤表层,其土壤性状与"岛"外土壤的差异随土壤深度增加而减弱;(2)生物性限制土壤养分由"岛"内向外梯度递减,而非生物性限制土壤要素可能高于、也可能低于"岛"外土壤,或者两者无显著差异;(3)从"肥岛"的空间尺度来看,柽柳"肥岛"的水平范围可能超出了本身冠幅覆盖区,而梭梭"肥岛"要小于本身冠幅覆盖区,其深度亦小于柽柳"肥岛";(4)相对于不同土壤要素而言,即使是同一物种,其"肥岛"也具有不同的空间范围.总的来看,研究区灌丛"肥岛"的发育具有明显的物种效应,相对梭梭而言,柽柳"肥岛"发育更广、更深,养分聚集更明显,其原因主要是柽柳的半球型树冠更利于保护和捕获凋落物,而较多的凋落物输入与土壤结构和土壤养分间的正反馈机制使柽柳冠下加速的生物地球化学循环能达到更广、更深的范围.灌丛"肥岛"的发育是干旱景观中生物过程与物理过程交互作用的产物,全面揭示其形成机理,探讨其对干旱生态系统结构、功能与动态的影响,需要更系统的研究.     

坪用狗牙根(Cynodon spp.)优良品种(选系)的抗寒性初步鉴定

以狗牙根属(CynodonRich.)的18个优良品种(选系)为试验材料,以我国草坪生产上广泛应用的普通狗牙根〔C.dactylon(L.)Pers.〕品种'Common'和杂交狗牙根(C.dactylon×C.transvaalensis)品种'Tifdwarf'与'Tifway'为对照,用电解质渗透法进行了抗寒性的初步鉴定。结果表明:与对照'Common'相比,除'OKc95 1'的LT50与'Common'接近,其他的普通狗牙根品种(选系)的LT50均低于对照,尤其是C174的LT50为-5.2℃,比对照低4.6℃;杂交狗牙根中,与'Tifdwarf'和'Tifway'相比,'TifgreenⅡ'、'TifwayⅡ'和'Midfield'3品种的LT50显著低于对照,其LT50分别是-7.5℃、-8.8℃和-6.0℃,'Tifeagle'、'Tifsport'和'Tiflawn'的LT50则都高于两个对照品种。     

Mitochondrial phylogeography of baboons (Papio spp.) – Indication for introgressive hybridization?

Background  

Baboons of the genus Papio are distributed over wide ranges of Africa and even colonized parts of the Arabian Peninsula. Traditionally, five phenotypically distinct species are recognized, but recent molecular studies were not able to resolve their phylogenetic relationships. Moreover, these studies revealed para- and polyphyletic (hereafter paraphyletic) mitochondrial clades for baboons from eastern Africa, and it was hypothesized that introgressive hybridization might have contributed substantially to their evolutionary history. To further elucidate the phylogenetic relationships among baboons, we extended earlier studies by analysing the complete mitochondrial cytochrome b gene and the 'Brown region' from 67 specimens collected at 53 sites, which represent all species and which cover most of the baboons' range.     

Cryopreservation of Grapevine (Vitis spp.) Embryogenic Cell Suspensions by Encapsulation–Vitrification

Embryogenic cell suspensions of two grapevine rootstocks: 110 Ritcher (V. berlandieri × V. rupestris), 41B (V. vinifera × V. berlandieri) and several table grape and wine cultivars (Vitis vinifera) were successfully cryopreserved by the encapsulation–vitrification method. Embryogenic cell suspensions were precultured for 3 days in liquid MGN medium supplemented with daily increasing sucrose concentrations of 0.25, 0.5, 0.75 M. Precultured cells were encapsulated and directly dehydrated with a highly concentrated vitrification solution prior to immersion in liquid nitrogen for 1 h. After rewarming at 40 °C for 3 min, cryopreserved cells were post-cultured on solid MGN medium supplemented with 2.5 g l^–1 activated charcoal. Surviving cells were transferred to solid MGN medium for regrowth or solid MG medium for embryo development and then to solid WPM for plant regeneration. Optimal viability was 42–76% of cryopreserved cells when cell suspensions were precultured with a final sucrose concentration of 0.75 M and dehydrated with PVS2 at 0 °C for 270 min. Biochemical analysis showed that sucrose preculture caused changes in levels of total soluble protein and sugars in cell suspensions. Although the increase in fresh weight was significantly lower in cryopreserved cells than in control cells, the growth pattern of the cryopreserved cells and control cells was the same after two subcultures, following re-establishment in cell suspensions. Protocol developed in this study suggests a universal and highly efficient cryopreservation system suitable for several genetically diversed Vitis species.     

中国结缕草属植物( Zoysia spp.)地上部分形态类型多样性

通过对结缕草属 (ZoysiaWilld .)植物地上部分 18个形态性状的的聚类分析 ,将产于中国的 78份结缕草种质划分为 6组 ,结缕草 (Z .japonicaSteud .)和中华结缕草 (Z .sinicaHance)具有较典型的特征而各自成组 ,细叶结缕草(Z .tenuifoliaWilld .)和沟叶结缕草〔Z .matrella (L .)Merr.〕为一组、大穗结缕草 (Z .macrostachyaFranch .)和长花结缕草 (Z .sinicavar.nipponicaOhwi)为一组 ,另有两组为比较独特的类型。结缕草属植物叶表面被毛、叶长、叶宽等营养性状和生殖枝高度、小穗密度、小穗数量等生殖性状都有较大的变异 ,变异系数 13.75 %～ 5 8.74 % ,其中中华结缕草内部存在更大的变异 ,表明在中华结缕草种内选育更加容易获得优良种质或品种。主成分分析表明 ,小穗数、小穗长、小穗密度、小穗长宽比以及叶片宽度和叶片被毛发达情况是结缕草属形态分类的重要依据 ,其中叶片被毛发达情况可以作为区分结缕草和中华结缕草的简单依据 ;而生殖枝高度、穗长、叶长、花序柄长度 (1)和叶长宽比可作为研究结缕草属下种内分异的主要依据     

裸鼠巴斯德氏菌病的诊断

目的对某实验动物中心裸鼠发病死亡的原因进行诊断。方法对发病裸鼠进行病理组织学和细菌学检查以及血清学试验。结果根据临床症状、病理剖检、细菌分离培养、生化鉴定和血清凝集试验,确诊为嗜肺巴斯德氏菌感染导致的细菌性疾病。药敏试验结果表明,分离菌株对阿莫西林／克拉维酸、阿奇霉素、复方新诺明敏感,而对红霉素已经产生耐药性。结论为巴斯德氏菌病原鉴定与疾病诊断提供了科学依据。