从血液中提取总RNA的一种快速高效方法

血液中含有大量的RNA酶 ,可引起RNA的降解 .防止RNA酶的降解 ,是保证所得RNA片段完整的关键 .目前提取RNA的方法较多 ,但有些方法尚不能完全防止RNA降解 .将TRIZOL方法稍加改进 ,将TRIZOL与异硫氰酸胍联用提取血液淋巴细胞总RNA .琼脂糖凝胶电泳结果表明 ,其 2 8SRNA与 18SRNA的比值为 2∶1,优于单独使用其中任何一种试剂者 .此方法同样适用于从其它细胞中提取RNA .     

芍药花瓣总RNA的提取

用TRIzol法和改良的热硼酸盐法从芍药幼嫩花瓣中提取总RNA,总RNA的D260nm／D280nm值分别为1．803、1．974。琼脂糖电泳表明,用TRIzol法提取的RNA只有28S、18S2条带,带的亮度差,说明RNA有些降解;而用改良的热硼酸盐法提取的总RNA有28S、18S、5S3条带,带的亮度强,且28S是18S宽度的2倍左右,说明提取的RNA完整、未降解,可用于后续实验。改良的热硼酸盐法更适于从芍药花瓣中提取总RNA。     

一种适用于RT-PCR的石榴籽粒总RNA提取方法

为从石榴籽粒中提取高质量的RNA,以便进行后续分子生物学研究,针对石榴籽粒富含次生代谢物的特点,采用CTAB法并进行了改良,利用氯仿/异戊醇替代其他方法中的"异硫氰酸胍"和"Trizol试剂"进行反复抽提去除蛋白,无水乙醇去除多糖,LiCl消化DNA。结果显示:改良CTAB法提取的石榴籽粒总RNA的28S rRNA、18SrRNA条带清晰,完整性较好;OD260 nm/OD280 nm比值为1.9960,纯度较高。在此基础上通过反转录、PCR扩增出符合预期大小的Actin基因片段,表明该方法提取的RNA可满足后续RT-PCR等分子生物学试验研究。     

小鼠腹水瘤病毒(SRSV)及其核糖核酸的纯化和某些性质的研究

从感染NIH3T3小鼠成纤维细胞上清液中分离小鼠腹水瘤病毒,用蔗糖密度梯度离心法纯化。从新鲜病毒中取小鼠腹水瘤病毒RNA,并用酚-氯仿抽提和蔗糖梯度分离。各组分的沉降系数(S)和分子量通过超速离心凝胶电泳分析测定。SRSV RNA主要由两组分组成,一是沉降系数约60～70S(热处理后约35S),还有少量18S和28S,另一是4～5S。35S组分在体外能指导无细胞蛋白的合成。     

从富含多糖和多酚的柿果中提取具转录活性RNA的方法

通过吸光比值分析 ,反转录实验比较TRIzoL法、Tris 硼酸法、异硫氰酸胍法、市售经典总RNA抽提试剂盒、FlashUNIQ 10柱离心总RNA抽提试剂盒 ,以及改进的CTAB法提取成熟期柿果中的总RNA的可行性 ,结果表明 :改进的CTAB法效果较好 ,柿果中RNA的吸光比值A2 60 A2 3 0 在 1.5～ 2 .0之间 ,A2 60 A2 80 在 1.7～ 1.9之间。采用设定的锚定引物Oligo(dT) 1 2 A分别对提取物进行反转录 ,并结合随机引物进行PCR扩增 ,琼脂糖凝胶电泳 ,结果仅有改进的CTAB法提取的成熟期柿果中的总RNA具有转录活性     

S100A8促进ox-LDL诱导的血管内皮细胞氧化损伤

该文旨在探究S100A8蛋白在ox-LDL诱导的血管内皮细胞氧化损伤中的生理功能及作用机制。通过体外建立ox-LDL诱导的HUVEC氧化损伤模型,用实时荧光定量PCR实验、蛋白质免疫印记实验分别检测S100A8的表达水平。通过转染对照siRNA和靶向S100A8的siRNA,敲低细胞中S100A8的表达,通过实时荧光定量PCR检测ICAM-1、VCAM-1和E-Selectin的m RNA表达水平来评估内皮细胞激活水平,用CCK-8实验检测细胞活性,用流式细胞术检测细胞凋亡水平和线粒体ROS积累水平。为了明确S100A8促进ox-LDL诱导的细胞氧化损伤的作用机制,用蛋白质免疫印记实验分析了敲低S100A8对SIRT6表达水平的影响,并通过RNA干扰敲低SIRT6,检测细胞活力和线粒体ROS积累情况。结果表明,在ox-LDL诱导的氧化损伤中,血管内皮细胞S100A8表达水平上调。敲低S100A8显著抑制了ox-LDL诱导的细胞的氧化损伤、细胞凋亡和线粒体活性氧积累;敲低S100A8增加了SIRT6的表达量;在细胞中同时敲低S100A8和SIRT6不能抑制ox-LDL诱导的细胞氧化损伤。...     

百合花瓣总RNA提取方法的研究

以亚洲百合品种Pollyanna和东方百合品种Sorbonne为试材,在比较异硫氰酸胍法、SDS/酚法与CTAB-L i Cl法提取总RNA效果的基础上,针对百合组织中富含多糖的特点,在Sorbonne提取RNA中加入特殊除多糖步骤,改进了CTAB- L i Cl法.结果表明,改进CTAB- L i Cl法能有效去除多糖,提取到的RNA2 8S r RNA亮度约为18S r RNA的2倍,A2 6 0 / 2 80介于1.8～2 .0之间,A2 6 0 / 2 30为2 .0 ,Pollyanna RNA产率为36 .3μL·g- 1 ,Sor-bonne RNA产率为10 .2 μL·g- 1 ,经RT- PCR获得了特异性条带,说明用改进CTAB- L i Cl法从百合花瓣中提取到的RNA质量好、产率高、完整性强,完全适合于进一步的分子生物学研究.     

一种提取高质量油菜种子和种皮RNA的方法

提取高质量的RNA是从基因表达水平上研究油菜种子和种皮发育的必要条件。现有方法因为油菜种子脂肪、多酚和多糖,难以快速获得完整、高纯度的油菜种子总RNA。本试验针对油菜种子和种皮特点,利用苯酚-氯仿抽提后用无水乙醇沉淀RNA,建立了在油菜种子和种皮中快速提取高质量总RNA的提取方法,电泳分析表明28S rRNA亮度约为18S rRNA的2倍;紫外分光光度计检测A260/A280介于1.8～2.0之间。用该法分离的RNA,已成功用于RT-PCR、Northern blot分析和基因全长的克隆等分子生物学研究。     

银杏不同组织的总RNA提取方法的改进

方法:采用改进的CTAB法高效地从富含多糖、多酚类化合物的银杏的根、茎、叶和果实四个组织中提取RNA。结果:抽提的不同组织的RNA经电泳检测,可见28S和18S两条清晰的主带,且28S rRNA在亮度上均为18S rRNA的2倍,两条带之间无弥散现象;根、茎、叶、果所提的RNA的经紫外吸收检测得到A260/A230分别为1.9、1.4、2.1、1.7,测得A260/A280分别为1.8、2.0、2.3、1.8,鲜重分别达到78μg/g、69μg/g、150μg/g、90μg/g;通过RT-PCR及凝胶检测,得到了银杏看家基因18S基因的约150bp清晰的条带,从而进一步检测提取RNA的质量。结论:提取的总RNA纯度高,质量好,足以为研究提供RNA材料。     

野生稻颖果总RNA提取方法研究

目的:比较以确定适用于野生稻总 RNA 提取的方法.方法:用改良的异硫氰酸胍法、TRIZOL 法、SDS 法和 CrAB 法分别提取云南 3 种野生稻和栽培稻滇超 6 号在灌浆期颖果的总 RNA.结果:SDS法能够提取的普通野生稻和疣粒野生稻的总 RNA 的纯度高,其A260/A260 介于1.9938～1.9267;而 TRIZOL 法只适用于栽培稻滇超 6 号,CTAB 法对于疣粒野生稻和药用野生稻提取效果一般,电泳条带不很清晰,其A260/A280 介于1.8243～1.6928;而新建立的改良的异硫氰酸胍法都能提取完整性好、高得率(浓度介于0.9358～1.2008μg/μl)和高纯度的 RNA(A260/A280 大于1.8),电泳 28S rRNA 和 18S rRNA 条带清晰,且该方法操作简单、耗时少、效率高.结论:改良的异硫氰酸胍法适合于野生稻颖果总 RNA 的提取,提取的总 RNA 完整性好、得率高.     

黄檗(Phellodendron amuranse)叶片总RNA提取方法研究

以黄檗(Phellodendron amuranseRupr.)叶片为材料,分别利用改进的盐酸胍法、Trizol法、CTAB法提取黄檗叶片总RNA,通过RNA产率、纯度、电泳图谱等分析,确立了1种从黄檗叶片中快速分离总RNA的方法。研究结果表明,改进盐酸胍法所提取的总RNA的A260/A280为1.928,28S和18S条带清晰谱图完整性好,而且具有产率高、时间短、成本低的特点,所提取的总RNA适用于mRNA分离、cDNA文库的建立、Northern杂交等分析。     

一种适用范围广的总RNA提取方法

介绍一种RNA提取方法,该方法以SDS、氯仿和Tris苯酚为主要提取试剂,以LiCl和乙醇为RNA沉淀试剂。分别以柽柳(木本植物)、星星草(草本植物)、天牛（昆虫）、酿酒酵母和白腐菌（真菌）为RNA提取材料,用该方法成功地提取出了它们的总RNA。获得的RNA条带清晰,A₂₆₀/A₂₈₀ 在1.8以上。通过对LiCl和乙醇沉淀RNA的效果分析表明,该方法可在10 min内完全沉淀RNA,同时也可以同时获得纯度较高的DNA。提取的RNA质量可满足cDNA文库构建,基因芯片探针标定和RT-PCR等对RNA质量要求较高的分子生物学操作,说明这是一种应用范围广的RNA提取方法。     

提取航天诱变向日葵种子总RNA的一种有效方法

目的:从航天诱变向日葵种子中提取高质量的总RNA.方法:采用改进的SDS法,提取缓冲液与氯仿同时作用液氮研磨材料后,用酸酚-氯仿抽提一次,经LiCl过夜沉淀、DNase I处理、1/2体积的无水乙醇沉淀多糖,最后加入1/10体积的醋酸钠和2倍体积的无水乙醇沉淀总RNA,用琼脂糖凝胶电泳与紫外分光光度法测定产量与纯度,用...     

黄檗（Phellodendron amuranse）叶片总RNA提取方法研究

以黄檗(Phellodendron amuranse Rupr.)叶片为材料,分别利用改进的盐酸胍法、Trizol法、CTAB法提取黄檗叶片总RNA,通过RNA产率、纯度、电泳图谱等分析,确立了1种从黄檗叶片中快速分离总RNA的方法。研究结果表明,改进盐酸胍法所提取的总RNA的A₂₆₀/A₂₈₀为1.928,28S和18S条带清晰谱图完整性好,而且具有产率高、时间短、成本低的特点,所提取的总RNA适用于mRNA分离、cDNA文库的建立、Northern杂交等分析。     

Isolation of RNA of high quality and yield from <Emphasis Type="BoldItalic">Ginkgo biloba</Emphasis> leaves

An improved protocol was developed to isolate total RNA in good yield and integrity from Ginkgo biloba leaves containing high levels of flavonoid glycosides, terpene lactones, carbohydrates and polyphenolic secondary metabolites. Polyvinylpolypyrrolidone at 2% and β-mercaptoethanol at 4% were added to the standard CTAB extraction buffer and, after chloroform and phenol extraction, the pellet obtained by ethanol/acetate precipitation was washed and a second phenol/chloroform extraction was introduced to remove co-precipitated polysaccharides. Both A₂₆₀/A₂₃₀ and A₂₆₀/A₂₈₀ absorbancy ratios of isolated RNA were around 2 and the yield was about 0.4 mg g^--1 fresh weight. At least seven distinct rRNA bands were detected by denaturing gel electrophoresis. Sharp hybridization signals were obtained from Northern blots with both nuclear and plastid gene probes. Two gene fragments: nuclear-encoded cab and chloroplast encoded rbcL were successfully amplified by RT-PCR, suggesting the integrity of isolated RNA. The total RNA isolated by this protocol is of sufficient quality for subsequent molecular applications.     

Simple and efficient genomic DNA extraction protocol for molecular characterisation of Phytophthora colocasiae causing taro leaf blight

Genomic DNA extraction protocol with relatively high quantity and purity is prerequisite for the successful molecular identification and characterisation of plant pathogens. Conventional DNA extraction methods are often time-consuming and yield only very poor quantity of genomic DNA for samples with higher mycelial age. In our laboratory, we have aimed at establishing an efficient DNA isolation procedure, exclusively for the oomycete pathogen Phytophthora colocasiae causing serious leaf blight disease in taro. For this a phenol free protocol was adopted, which involves SDS/Proteinase K-based inactivation of protein contaminants, extraction of nucleic acids using chloroform: isoamyl alcohol and later precipitation of genomic DNA using isopropanol and sodium acetate. The purity of the isolated DNA was analysed by A_260/280 and A_260/230 spectrophotometric readings and confirmed by restriction digestion with restriction enzyme Eco RI. In this study, a comparative assessment was done with CTAB method and the commercial genomic DNA purification kit (Thermo Fisher Scientific, Fermentas, EU). The extracted DNA was found to be suitable for further downstream applications like ITS amplification of the rDNA ITS region and PCR amplification with species-specific primers.     

小麦总RNA的快速提取

Rneasy Kits用于从小量小麦中分离总RNA。它为同时和多次制备各种生物样品提供了一种快捷而简便的方法-整个过程可以在30分钟内完成。而且Rneasy方法中不再涉及使用有毒物质,如酚类、氯仿等。通过此方法纯化的RNA可用于各种标准的下游技术,如RT-PCR、polyA^ RNA选择、差异显示技术、Northern点杂交和狭线杂交、引物延伸、cDNA合成、陈列表达分析和表达芯片分析等。使用这个盒子,我们多次成功的进行了小麦总RNA的分离,其中的三次在本文中进行了分析。OD260nm/OD280nm介于1.7-2.0之间,OD260nm/OD230nm大于2.0.说明RNA纯度很高,未被蛋白质、苯酚等物质污染。     

Rapid and Reliable Method of Extracting DNA and RNA from Sweetpotato, Ipomoea batatas (L). Lam

A quick, simple and reliable method of extracting DNA from sweetpotato (Ipomoea batatas (L.) Lam.) has been developed. The method was applied successfully for extraction of total DNA from leaves and total RNA from leaves and various tissues. The yield of DNA extracted by this procedure was high (about 1 mg/g leaf tissue). The extracted DNA was completely digested by restriction endonucleases indicating the absence of common contaminating compounds. The absorbancy ratios of A260/A230 and A260/A280 of isolated RNA were approx. 2 and the yield was about 0.2 mg/g fresh wt. CIPK and tublin genes were successfully amplified by RT-PCR, suggesting the integrity of isolated RNA. The total DNA and RNA isolated by this method was of sufficient quality for subsequent molecular analysis.