应用CRISPR/Cas9系统下调长链非编码RNA HOTAIR

近来CRISPR/Cas9系统作为一种成熟的基因编辑工具,被广泛应用。然而由于长链非编码RNA特殊的结构,该系统针对其研究的报道并不多见。选取与肿瘤生成、发展密切相关的长链非编码RNA HOTAIR为研究对象,通过构建Cas9核酸酶稳定遗传表达细胞株,建立pg RNA文库,对其进行基因敲除。q RT-PCR结果显示,pg RNA/Cas9系统靶向HOTAIR基因可使其表达下调60%。MTT增殖检测及细胞划痕实验结果表明:此系统介导的HOTAIR下调可明显抑制He La细胞的增殖与迁移。同时,肿瘤抑制因子p21、p53、p RB和DLC1转录水平的变化也暗示,HOTAIR对细胞功能的影响与其调控相关肿瘤抑制因子之间存在紧密联系。因此,利用Cas9技术抑制HOTAIR的表达对全面了解其功能具有重要意义。     

基因组印记中的长非编码RNA

长非编码RNA(lnc RNA)是长度大于200 bp的一类非编码蛋白的RNA,因其在基因组中含量巨大以及重要的生物学功能引起了学术界的广泛关注.基因组印记是一种表观遗传现象,lnc RNAs通过建立靶基因的印记而发挥重要的生物功能.基因组印记可以用来研究lnc RNAs在转录和转录后水平调控基因表达的分子机制.本文选取6个印记机制研究比较透彻的印记区域,包括Kcnq1/Cdkn1c、Igf2r/Airn、Prader-Willi(PWS)/Angelman(AS)、Snurf/Snrpn、Dlk1-Dio3和H19/Igf2.通过介绍包括基因间lnc RNAs(H19、Ipw和Meg3)、反义lnc RNAs(Kcnq1ot1、Airn、Ube3a-ATS)和增强子lnc RNAs(IG-DMR e RNAs)在内的3种类型lnc RNAs在印记调控中的作用,从而了解lnc RNAs通过顺式或(/和)反式作用多种机制调控亲本特异性靶基因的表达.了解印记基因簇中lnc RNAs的作用方式将有助于我们揭示lnc RNAs在整个基因组中的作用机制.     

长链非编码RNA与肿瘤和干细胞

人类基因组包含20 000多种蛋白质编码基因,只占总基因的2%左右,而90%以上的转录子是长链非编码RNA(Long non-coding RNAs,lnc RNAs)。lnc RNAs是广泛存在于哺乳动物基因组中的长度在200-100 000 nt之间,且不具有蛋白质编码功能的转录本。研究发现其在许多类型的肿瘤中存在异常表达,具有潜在的致癌或抑癌作用,并作为重要的调控分子参与各种生物学过程,与肿瘤的发生、发展密不可分。此外,lnc RNAs在维持干细胞全能性、调控干细胞基因表达、调节干细胞自我更新和分化等方面发挥了至关重要的作用,是继micro RNA后肿瘤研究的新热点。针对lnc RNAs在肿瘤和干细胞生物学中的功能及相关机制作一综述,旨在为肿瘤的诊断、治疗、预后等方面提供新思路。     

胃癌中长非编码RNA调节网络的研究进展

长非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)是一类长度大于200 nt、因缺少完整的阅读编码框而不编码蛋白质的功能性RNA分子。胃癌是我国常见的恶性肿瘤之一,其发病率仅次于肺癌,居我国第二位。越来越多的证据表明,lnc RNA在转录、转录后和表观遗传水平调控基因的表达及稳定性,参与肿瘤的发生和发展,对于评估癌前病变的发生、判断化疗的疗效和胃癌的预后具有重要意义。该文就近年来关于lnc RNA调节网络对胃癌发生发展机制的作用研究进展作一综述。     

宫颈癌组织LncRNA HOTAIR、miR-17-5p表达与增殖基因、临床病理特征和预后的关系分析

目的：探讨宫颈癌组织长链非编码核糖核酸（LncRNA）HOX转录反义RNA(HOTAIR)、微小核糖核酸（mi R）-17-5p表达与增殖基因、临床病理特征和预后的关系。方法：选择2014年1月-2018年1月新疆医科大学第一附属医院收治的157例宫颈癌患者,取手术切除的宫颈癌组织和癌旁组织,实时荧光定量聚合酶链反应（RT-PCR）法检测LncRNA HOTAIR、mi R-17-5p及宫颈癌相关增殖基因PRDX4、NEK2、FHIT、BLCAP转录水平表达。Pearson分析宫颈癌组织LncRNA HOTAIR、mi R-17-5p表达与增殖基因表达的相关性,Kaplan-Meier法分析不同LncRNA HOTAIR、mi R-17-5p表达宫颈癌患者的5年生存率差异。结果：宫颈癌组织LncRNA HOTAIR、mi R-17-5p、PRDX4、NEK2、FHIT、BLCAP转录水平表达均高于癌旁组织（P<0.05）。宫颈癌组织LncRNA HOTAIR、mi R-17-5p表达与PRDX4、NEK2、FHIT、BLCAP转录水平表达均呈正相关（P<0.05）,LncR...     

LncRNA:一种新型调控细胞自噬的分子

细胞自噬(autophagy)与肿瘤、病原体感染、神经退行性疾病等密切相关。长链非编码RNA(long noncoding RNA,lnc RNA)是一组长度超过200 nt、无蛋白质编码功能的转录本。lnc RNA可作为一种新型调控细胞自噬的分子,深入了解lnc RNA在细胞自噬过程中的调控作用,对细胞自噬相关疾病的治疗与预防都具有重要的意义。现介绍近期lnc RNA对细胞自噬调控研究的新进展。     

EZH2在卵巢癌中的研究进展

果蝇zeste基因增强子人类同源2(enhancer of zeste homolog 2,EZH2)是近年来肿瘤领域研究的热门靶点基因,其在卵巢恶性肿瘤中表达增高,与卵巢癌的发生发展及预后密切相关。EZH2作为一种重要的负性表观遗传调控蛋白,可通过催化组蛋白3赖氨酸27三甲基化(H3K27me3)和调控新型钙黏蛋白分子CD13等影响卵巢细胞的增殖、迁移和侵袭,对EZH2的深入研究将为治疗卵巢恶性肿瘤提供新的分子靶点。本文就该领域的最新研究进展作一简要综述。     

长非编码RNA HOTAIR调控胃癌细胞SGC-7901来源肿瘤干细胞样细胞

肿瘤干细胞样细胞具有自我更新、无限增殖和多向分化能力,且受到长非编码RNA（long non-coding RNAs, lncRNAs）的调控。长非编码RNA HOTAIR在人胃癌细胞中表达升高,且具有调控功能。但目前对其在胃癌干细胞样细胞中的功能尚无研究。本研究的目的是探讨胃癌肿瘤干细胞中HOTAIR对肿瘤恶性行为的调控作用。本研究采用无血清培养基在补充细胞因子条件下培养SGC-7901细胞,获得悬浮生长的肿瘤干细胞样细胞微球,检测微球细胞的表面特征因子CD44、CD24及HOTAIR的表达量变化;并通过CCK-8、流式细胞分析及ELISA等技术探讨了HOTAIR对肿瘤干细胞样细胞功能调控作用。结果表明,无血清培养基中获得的肿瘤干细胞样细胞具有自我更新能力,其可连续传代细胞微球的比率为4.75%±0.76%;RT-qPCR检测显示,相对于SGC-7901细胞,肿瘤干细胞样细胞中的HOTAIR表达量明显升高;通过慢病毒干扰技术发现,HOTAIR干扰抑制了HLA-G蛋白分泌、促进肿瘤干细胞样细胞的细胞周期推进、细胞增殖和自我更新能力维持。本研究提示,胃癌细胞系SGC-7901中的肿瘤干细胞样细胞中HOTAIR表达量升高,并可能通过促进肿瘤干细胞样细胞干性调控肿瘤恶性行为。     

LncRNA HOTAIR regulates the expression of E-cadherin to affect nasopharyngeal carcinoma progression by recruiting histone methylase EZH2 to mediate H3K27 trimethylation

Background/AimThere has been increasing evidence for the function of long non-coding RNA (lncRNA) in nasopharyngeal carcinoma (NPC). We aim to delve into the position of lncRNA HOX antisense intergenic RNA (HOTAIR), together with enhancer of zeste homolog 2 (EZH2), E-cadherin and trimethylation of lysine 27 on histone H3 (H3K27me3) in NPC.MethodsHOTAIR, EZH2, and E-cadherin expression in NPC tissues and cells were tested. NPC cell biological functions were examined through gain-of and loss-of function assays. The mechanism of lncRNA HOTAIR/E-cadherin/EZH2/H3K27 axis in NPC was decoded.ResultsLncRNA HOTAIR and EZH2 were highly expressed in NPC, and E-cadherin was lowly expressed. Down-regulation of HOTAIR or EZH2 inhibited NPC cell progression and tumor growth. HOTAIR recruited histone methylase EZH2 to mediate trimethylation of H3K27 and regulated E-cadherin expression.ConclusionHOTAIR inhibits E-cadherin by stimulating the trimethylation of H3K27 to promote NPC cell progression through recruiting histone methylase EZH2.     

Dampening HOTAIR sensitizes the gastric cancer cells to oxaliplatin through miR-195-5p and ABCG2 pathway

Long non-coding RNAs (lncRNA) have an extensive role in the progression and chemoresistance of gastric cancer (GC). Deeply study the regulatory role of lncRNAs could provide potential therapeutic targets. The aim of this study is to explore the regulatory role of HOTAIR in the progression and oxaliplatin resistance of GC. The expression of HOTAIR in GC and cell lines were detected by using qRT-PCR. Cell proliferation and apoptosis were analysed by CCK-8, EdU incorporation and flow cytometry. Luciferase reporter assay was used to identify the interaction between HOTAIR and ABCG2 (ATP-binding cassette (ABC) superfamily G member 2, ABCG2) via miR-195-5p. The regulatory functions were verified by using molecular biology experiments. HOTAIR was significantly overexpressed in GC and associated with poor prognosis. Knock-down of HOTAIR inhibited the GC cells proliferation and oxaliplatin resistance, while overexpression of HOTAIR showed opposite functions. Further studies found that HOTAIR acted as a competing endogenous RNA (ceRNA) to absorb miR-195-5p and elevated the expression of ABCG2, which leads to resistance of GC cells to oxaliplatin. Taken together, our findings demonstrated that HOTAIR regulates ABCG2 induced resistance of GC to oxaliplatin through miR-195-5p signalling and illustrate the great potential of developing new therapeutic targets for GC patients.