ACETYLCHOLINESTERASE DU MUSCLE, DE LA MOELLE EPINIERE ET DU CERVEAU DE GYMNOTE

Résumé— Dans le but d'étudier la localisation cytologique de I'AChE dans divers tissus de Gymnote, nous avons préparé un antisérum anti-AChE en utilisant une préparation commerciale partiellement purifiée, contenant une forme globulaire de l'AChE G _p. Cet antisérum réagit dans le test de double diffusion avec l'enzyme purifié G _p, mais également avec la forme globulaire spontanée G _b, ainsi qu'avec les trois espèces 'natives' asymétriques A , C et D . Nous avons mis en évidence l'existence de ces quatres formes G _b, A , C et D dans des extraits de cerveau, de moelle épinière et de muscle de Gymnote. La forme globulaire G _b est particulièrement abondante dans la moelle épinière et à un moindre degré, dans le cerveau. La distribution des espèes est identique dans le muscle et l'organe électrique. Grâce à notre antisérum, nous avom Iocalisé par immunofluorescence indirecte l'AChE dans les terminaisons nerveuses sur le muscle, dans le cytoplasme de certains neurones situés dans le centre moteur de la décharge (moelle épinière) et au voisinage du noyau central de la décharge (cerveau).     

REGULAR ARTICLES

Marginal Analysis of Correlated Failure Time Data with Informative Cluster Sizes
Nous nous intéressons à la modélisation de données de survie corrélées quand la connaissance de la taille des strates peut fournir une information sur le critère de jugement. Celle-ci est basée sur une approche de ré-échantillonnage au sein des strates et sur une méthode de fonction de score pondérée. Nous déterminons les propriétés asymptotiques pour les estimateurs de ré-échantillonnage au sein des strates dans le cadre d'un modèle à risques proportionnel de Cox. Nous établissons la convergence et la normalité asymptotique des estimateurs des coefficients de régression et la propriété de convergence faible des estimateurs de la fonction de base du risque cumulé. La méthode de fonction du score pondérée consiste à prendre l'inverse de la taille des strates comme poids dans la fonction de score. Nous procédons à des études de simulations pour déterminer et comparer le comportement des estimateurs pour des échantillons finis et appliquons les méthodes proposées à une étude dentaire.     

Estimating larger carnivore numbers from track counts and measurements

Résumé Avoir conscience de l'abondance des grands carnivores est très important pour la gestion de leur conservation. Cependant, l'évaluation directe des nombres de carnivores est souvent difficile, nècessitant beaucoup d'argent et de temps, ce qui importe que l'échantillonnage indirect est une alternative fiable et valable. Les techniques de recensement à distance se sont montrèes économiques, renouvelables, et objectives. Nous avons donc estimé le nombre de grands carnivores de six espèces dans une superficie assez petite au nord de l'Afrique du Sud, en comparant trois méthodes d'échantillonnage basèes sur des décomptes des traces et mesures: (i) une approche qualitative, où les individus furent identifiés de manière subjective en étudiant les différences dans les mesures des traces; (ii) une approche quantitative qui se sert de la forte corrélation linéaire de la densité des traces à la densité des carnivores démontrée dans d'autres études; et (iii) une approche quantitative qui impliquent des analyses répétées de la variance et des post-enquêtes sur les mesures des traces afin de disposer des données statistiques pour identifier les différences entre des services des traces. Les trois méthodes fournirent des résultats comparables qui semblent raisonnables et qui peuvent être une bonne indication du vrai nombre de grands carnivores dans la zone de l'étude. Les rèsultats étayent la fiabilité des estimations indirectes de l'abondance de grands carnivores basés sur les données des traces, et sont prometteurs pour des futures recherches et pour la conservation de ces animaux.     

Etude Ultrastructurale de la Sporulation de Paramarteilia orchestiae gen. n., sp. n., Parasite de l'Amphipode Orchestia gammarellus (Pallas)

RESUME. L'individualisation de 2 spores bicellulaires à partir d'un měme pansporoblaste caractérise la sporulation du parasite de l'Amphipode Orchestia gammarellus (Pallas) précédemment décrit sous le nom de Marteilia sp. Cette sporulation le distingue des espèces du měme genre parasite d'Hutres qui sont toutes caractérisées par la production de spores tricellulaires. Les conditions semblables dans lesquelles les pansporoblastes paraissent se differencier à partir d'une cellule souche dans laquelle ils poursuivent leur évolution vers la sporogenèse ainsi que divers caractères cytologiques communs, nous incitent à maintenir tous ces parasites dans une měme famille mais à placer celui de l'Amphipode dans un genre différent. Nous proposons de le nommer Paramarteilia orchestiae gen. n., sp. n.
Ces parasites ne peuvent ětre maintenus dans les Protozoaires en raison de leur évolution vers la pluricellularité et de l'individualisation de ces éléments somatiques que représentent la cellule souche primaire, les pansporoblastes et cellules sporales (à l'exception des sporoplasmes). Il semble logique de les inclure dans l'embranchement des Myxozoaires créé par Grassé pour les Myxosporidies et Actinomyxidies qui différencient également des spores pluricellulaires et des éléments somatiques. Les centrioles à 9 singlets de P. orchestiae ainsi que les cellules primaires uninucléées, quel que soit le nombre de pansporoblastes qu'elles contiennent, peuvent ětre considérés comme des caractères résiduels d'Unicellulaires.     

L'ACÉTYLCHOLINE ET L'ADRÉNALINE CHEZ LES INVERTÉBRÉS

1^o. Le tableau 2 résume ce que l'on sait sur la présence ďacétylcholine et de cholinestérase chez les Invertébrés, ainsi que sur la sensibilityé. des tissus àľacétylcholine et aux poisons qui paralysent ľaction de cette substance.
2^o. La présence de nerfs cholinergiques est démontrée chez les Annélides ( Armicolu, Aphrodite, Lumbricus, Hirudo ), et les Siponculiens ( Sipuncuh ), chez les 1 Iolot huries, chez un seul mollusque ( Venus mercenaria ).
3^o. Ľexistence de nerfs cholinergiques est inconcevable chez les Cœntérés.
4^o. Chez les Arthropodes (Crustacés, Insectes et Arachnomorphes) tout porte à croire que les nerfs ne transmettent pas ľ'excitation par ľintermédiaire ľacétykholine.
5^o. Chez leo Mollusques, àľexception de Venus mercenaria , tous, les essais de démonstration de nerfs cholinergiques ont échoué.
6^o. Ľexistence de nerfs adrénergiques chez les Annélides est très probable, mais non encore certaine; de tels nerfs existent vraisemblablement chez les Céphalopodes et chez ľaplysie.
7^o. Le cmur et les tissus des Invertébrés manifestent pour ľadrénaline et les amines syrnpathicomimétiques une sensibilityé non spécifique, le plus souvent faibie.     

REGULAR ARTICLES

Marginalized Models for Moderate to Long Series of Longitudinal Binary Response Data
Les modèles marginalisés (Heagerty, 1999) permettent l'inférence basée sur la vraisemblance lorsqu'on s'intéresse à des modèles marginaux de régression pour des données longitudinales binaires. Deux modèles de ce type sont le modèle de transition marginalisée, et le modèle à variable latente marginalisée. Le premier reflète la dépendance sérielle intra-sujet au sein des mesures répétées avec des termes de transition dans le modèle, tandis que le deuxième suppose l'échangeabilité ou la non-décroissance de la dépendance de la réponse avec des intercepts aléatoires. Dans cet article, nous étendons la classe des modèles marginalisés en proposant un modèle simple unifié décrivant à la fois la dépendance sérielle et la dépendance au long terme. Ce modèle est particulièrement utile dans des analyses longitudinales avec un nombre de mesures répétées par sujet modéré ou large, où aussi bien les formes sérielles et échangeables de la corrélation de la réponse peuvent être identifiées. Nous décrivons des approches bayésiennes et au maximum de vraisemblance pour l'estimation des paramètres et pour l'inférence, et nous étudions les caractéristiques opérationnelles pour de grands échantillons, sous deux types de mauvaise spécification du modèle de dépendance. On analyse les données de l'étude longitudinale de schizophrénie de Madras (Thara, 1994).     

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The DNA Database Search Controversy Revisited: Bridging the Bayesian--Frequentist Gap
Deux quantités différentes ont été proposées pour mesurer l'évidence dans les cas où un suspect est identifiéà partir d'une base de données de profils ADN. Le rapport de vraisemblance, habituellement développé dans le cadre bayésien, est préféré par de nombreux experts du domaine. La règle dite np a été suggérée sur des arguments fréquentistes par l'American National Research council (NRC) et Stockmarr (1999). Ces deux quantités différent considérablement et sont à la source d'une controverse sérieuse sur l'utilisation des bases d'ADN. Bien que plusieurs auteurs aient critiqué ces différentes approches, une explication claire sur le pourquoi de ces différences observées n'a jamais été proposée. Dans cet article, nous montrons que le degré de signification P dans un contexte fréquentiste est approximativement égal au résultat de la règle np . Nous soutenons cependant qu'une procédure plus raisonnable consiste à utiliser une stratégie de test conditionnel qui génère un P directement lié aux probabilités a posteriori ainsi qu'un rapport de vraisemblance. Cette façon d'aborder le problème construit un pont entre les approches bayésienne et fréquentiste et indique également que la règle np ne doit pas être utilisée pour quantifier l'évidence.     

Economies of affect

Cet article développe le concept des «économies de l'affect>> pour attirer l'attention des anthropologues sur le rôle de l'affect dans la facilitation des transformations économiques. Il s'appuie sur les résultats de deux projets de terrain ethnographiques, l'un au Mexique et l'autre en Indonésie, pour montrer comment l'affect a été mobilisé pour créer des sujets pouvant être appréhendés selon les normes néolibérales. Les auteurs montrent comment l'étreinte, les pleurs et les discours sur l'amour et le chagrin ont été associés à des transformations impliquant la cessation de prestations de l'État et l'application des lois du marché. En faisant de l'affect et de son articulation avec le changement économique un objet d'étude anthropologique, l'article affirme l'utilité d'une notion d'affect se démarquant d'autres approches qui mettent l'accent sur l'émotion. Les auteurs affirment que l'affect est utile parce qu'il est, par nature, réflexif et intersubjectif. L'affect renvoie aux relations pratiquées entre les individus, à la différence de l'émotion, toujours marquée par le spectre d'un individualisme psychologique.     

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A Simple Local Sensitivity Analysis Tool for Nonignorable Coarsening: Application to Dependent Censoring
Les données censurées à droite ou sur certains intervalles de temps sont des cas particuliers fréquents de données dégradées (Heitjan et Rubin, 1991). Comme avec les données manquantes, les méthodes statistiques courantes qui ignorent la nature aléatoire du mécanisme de dégradation peuvent conduire à des inférences incorrectes. Nous généralisons un outil simple d'analyse de sensibilité, l'indice de sensibilité locale à la non-ignorabilité (Troxel et al., 2004), à un modèle général de dégradation. En transformant cet indice en un simple graphique on peut facilement établir la sensibilité des inférences-clés à une dégradation non ignorable. Nous illustrons la validité de la méthode sur un exemple simulé, et l'appliquons à des observations de transplantation cardiaque censurées à droite, et à un essai clinique dans la maladie HIV où le temps nécessaire pour atteindre une charge virale détectable est censuré sur certains intervalles.     

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Determining the Effective Sample Size of a Parametric Prior
Nous présentons une définition de la taille d'échantillon efficace d'une loi a priori paramétrique dans un modèle bayésien, et proposons des méthodes pour calculer la taille efficace d'échantillon dans différents cas. Notre approche construit en premier une loi a priori choisie pour être vague dans un sens convenable, et met à jour cette loi a priori pour obtenir une suite de lois a posteriori correspondant à chacune des gammes de tailles d'échantillon. Nous calculons ensuite une distance entre chaque distribution a posteriori et la distribution a priori paramétrique, définie en terme de courbure du logarithme de chaque distribution, et la loi a posteriori minimisant la distance définit la taille d'échantillon efficace pour la loi a priori. Pour les cas où la distance ne peut pas être calculée de façon analytique, nous fournissons une approximation numérique basée sur une simulation de Monte Carlo. Nous fournissons en général des lignes de conduite pour l'application, illustrons la méthode dans plusieurs cas standards où la réponse est évidente et l'appliquons dans quelques cas moins standards.     

DISCUSSION PAPER

R. L. Prentice, M. Pettinger, and G. L. Anderson          899
Statistical Issues Arising in the Women's Health Initiative
Nous proposons un bref panorama du plan de l'essai clinique et de l'étude observationnelle de la WHI, ainsi qu'un résumé des résultats obtenus à partir de la partie de l'essai clinique dévolue à la thérapeutique hormonale post-ménopause. Depuis son démarrage en 1992, la WHI a été confrontée à plusieurs questions de nature statistique pour lesquelles de plus amples développements méthodologiques étaient nécessaires. Parmi ceux-ci, la modélisation des erreurs de mesure, et des méthodes d'analyse pour l'évaluation de la diététique et de l'activité physique; des méthodes de surveillance d'essai clinique lorsque les traitements peuvent concerner plusieurs champs cliniques aussi bien en bénéfice qu'en réaction adverse; le plan d'étude et les procédures d'analyse pour des données génomiques et protéiques de dimension élevée; et aussi des procédures d'analyse de données de durée lorsque les rapports de risque dépendent du temps. Ce dernier point apparaît important pour comprendre les différences entre les résultats de l'essai clinique et ceux de l'étude observationnelle en ce qui concerne le traitement hormonal postménopause et la pathologie cardio-vasculaire.     

Ormieresia carcini gen. n., sp. n., Microsporidie du Crabe Méditerranéan, Carcinus mediterraneus Czerniavsky, 1884: Cycle Évolutif et Étude Ultrastructurale

RÉSUMÉ. Une nouvelle microsporidie, Ormieresia carcini gen. n., sp. n., est trouvée dans Carcinus mediterraneus Czerniavsky, 1884. Son évolution et ses ultrastructures sont étudiees.
Le cycle débute par un méronte limité par une membrane unitaire et possédant un diplocaryon. Toute la sporogonie se déroule dans la musculature de l'höte. Les stades sporogoniaux sont enveloppés dans une membrane pansporoblastique persistante. Dans chaque pansporoblaste, la sporoblastogenése (donnant naissance à 8 sporoblastes) est particulière; un plasmode sporogonial octonucléé manque. Au cours des divisions schizogoniques et sporogoniques, chaque centre cinétique est formé de 2 plaques, une incluse dans l'enveloppe nucléaire, l'autre occupant une position extranucléaire. Les sporontes en division et les sporoblastes sécrètent des substances métaboliques (granules, tubes) qui sont déposées dans l'espace pansporoblastique.
La spore uninucléée est longue et cylindrique (19,1 × 2,4 μm). Un manubrium rectiligne traverse la spore. Son extrémité postérieure se rétrécit brusquement en un filament polaire décrlvant 4 ou 5 tours de spire. L'extrémité antérieure du manubrium est attachée au capuchon polaire lui-même comprimé par un double anneau. La partie antérieure du manubrium est entourée par un polaroplaste formé d'une zone spongieuse et d'une zone lamellaire.     

Shamanism and ritual in South America: an inquiry into Amerindian shape-shifting

Using ethnographic material on the Chachi, an Amerindian group in Northwest Ecuador, this article attempts to develop a renewed understanding of shamanism and ritual among so-called 'indigenous peoples' in South America, in both lowland and highland areas. I show that the human domain and that of spirits are always equivalent. It is also suggested that shamanic curing and many other forms of ritual can fruitfully be understood as instances of metamorphosis. In order to explore this argument I develop the notion of 'shape-shifting'.  

Résumé

Utilisant des matériaux ethnographiques sur les Chachi, groupe amérindien de la côte pacifique équatorienne, cet article tente de développer une compréhension renouvelée du chamanisme et des rituels des peuples indigènes de l'Amérique du Sud, à la fois dans les basses terres et dans les Andes. L'auteur explique pourquoi le domaine de l'humain et celui des esprits sont toujours équivalents. Il suggère ensuite que l'on gagne à comprendre les thérapies chamaniques et beaucoup d'autres formes rituelles comme des faits de métamorphose. Pour étayer cet argument, il développe la notion de « changement de forme >>.     

Composition du liquide seminal de Sparus aurata au cours d'une saison de spermiation

Résumé Du sperme de daurade Sparus aurata est prélevéà diffkrentes dates de la saison de spermiation. La composition biochimique du plasma séminal est analyské.
La concentration des éléments dosés est généralement plus importante que chez les espèces d'eau douce. La teneur en protéines reste constante au cours du temps. La quantité de glucose accuse une diminution à partir de la mi-décembre. Les triglycérides et le cholesterol atteignent des valeurs relativement elevees aux dates limites de la période d'échantillonnage, tandis que le taux de calcium est minimal à la fin de la saison de spermiation.     

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Time-Varying Coefficient Models for the Analysis of Air Pollution and Health Outcome Data
Nous présentons un modèle à coefficient dépendant du temps pour étudier la relation entre exposition aiguë (à court terme) à la pollution atmosphérique et altérations de la santé. Ce modèle permet au risque relatif de varier en fonction du temps comme cela peut se produire en cas d'interaction avec la température ou de modification de la composition en polluants, par exemple en particules solides. Le modèle fournit une estimation lissée de ces effets dépendant du temps sans qu'il soit nécessaire de spécifier une forme paramétrique particulière. Cette forme est estimée à partir des données à l'aide de fonctions spline cubiques pénalisées. Nous développons des modèles de régression de Poisson dont les coefficients sont estimés soit en maximisant une quasi-vraisemblance par une procédure itérative de moindres carrés repondérés, soit par une approche bayésienne utilisant une méthode de Monte Carlo par chaîne de Markov (MCMC). L'efficacité de ces approches pour estimer différents effets dépendant du temps est évaluée par simulations et les modèles sont appliqués aux données recueillies dans quatre villes pour l'enquête NMMAPS (Enquête Nationale Morbidité, Mortalité et Pollution Atmosphérique).     

BIOMETRIC PRACTICE

The Skill Plot: A Graphical Technique for Evaluating Continuous Diagnostic Tests
Nous présentons ici le ≪ Skill Plot ≫ (graphe d'aptitude), une méthode d'aide à la décision, immédiatement exploitable, conçue pour les tests diagnostiques. Contrairement aux courbes ROC, une telle courbe d'aptitude permet un examen visuel aisé du seuil ou de la règle de décision optimal pour un test diagnostique. Le ≪ Skill Plot ≫ et le test qui lui est associé permettent également de juger si les diagnostics basés sur le seuil ainsi obtenu sont meilleurs qu'une imputation naïve (diagnostics tous estimés positifs ou tous négatifs). La mesure d'aptitude facilite ici la comparaison directe de l'utilité prédictive de deux classifications, comme l'aire sous la courbe est la statistique d'intérêt dans l'analyse ROC. Nous démontrons par ailleurs que le seuil issu du ≪ Skill Plot ≫ est équivalent au seuil obtenu par optimisation des rapports de cotes a posteriori dans le cadre de la théorie bayésienne de la décision. Enfin, nous présentons et discutons brièvement une méthode permettant de construire l'intervalle de confiance de ce seuil optimal.     

Hunters, ritual, and freedom: dozo sacrifice as a technology of the self in the Benkadi movement of Côte d'Ivoire

L'article affirme que dans les années 1990, les chasseurs dozo de Côte-d'Ivoire ont utilisé le sacrifice pour se constituer en police officieuse au sein d'un groupement de sécurité qu'ils ont appelé Benkadi . Les chercheurs ont noté une évolution similaire par laquelle d'autres chasseurs d'Afrique de l'Ouest devenaient soldats, garde-chasse ou agents de développement, dans le contexte des changements politiques, économiques et écologiques. Bien que ces changements aient créé les conditions dans lesquelles les dozo s se sont chargés de fonctions de sûreté nationale, ces conditions ne suffisent pas à expliquer comment ils en sont venus à constituer une force de l'ordre. L'auteur explore le sacrifice des dozos comme une «technologie de soi>>, selon les termes de Foucault, pour avancer qu'ils ont librement endossé des rôles de sûreté impliquant des responsabilités éthiques proches de celles implicitement contenues dans leurs chasses et leurs pratiques occultes. Il invoque Frankl et Laidlaw pour expliquer les aspects émotionnels et pratiques de cet auto-façonnage. L'analyse culturelle des rituels des dozos éclaircit la manière dont ils ont agi pour donner forme aux effets de l'économie et de l'écologie politiques sur leurs pratiques.     

REGULAR ARTICLES

Dans ce papier, nous proposons un modèle hiérarchique bayésien prenant simultanément en compte les effets liés au support (i.e. la puce) pour détecter les gènes différentiellement exprimés. Nous montrons comment interpréter et utiliser les informations obtenues pour définir la liste des gènes nécessitant des investigations supplémentaires. Nous montrons empiriquement que la prise en compte des effets de support influençant les niveaux d'expression est nécessaire et nous explorons différentes fonctions non linéaires dans notre approche modèle-dépendante de normalisation des données. Notre modèle inclus des variances gène-spécifiques mais impose des contraintes relatives à la structure hiérarchique. La validité du modèle est discutée sur la base de contrôles prédictifs a posteriori. Modéliser les effets de support (la normalisation) simultanément avec les niveaux d'expression conduit à moins de résultats faussement positifs. Pour optimiser le choix de la liste de gènes d'intérêt, nous proposons de combiner plusieurs critères (par exemple la variation relative et l'expression totale) dans une variable indicatrice pour chaque gène. La distribution a posteriori de ces variables indicatrices est utilisée pour définir la liste de gènes d'intérêt, prenant ainsi en compte l'incertitude sur l'estimation des paramètres. Dans une application sur des données de souris invalidées, les annotations de Gene Ontology sur- et sous-représentées parmi les gènes de la liste choisie sont en accord avec les prévisions biologiques.     

READER REACTION

A Note on Testing Separability in Spatial-Temporal Marked Point Processes
Dans l'analyse du risqué environnemental, il est usuel de supposer l'indépendance stochastique (ou séparabilité) entre les traces associées aux événements aléatoires d'un processus spatio-temporel. Schoenberg (2004, Biometrics 60, 471–481) a proposé plusieurs tests statistiques de cette hypothèse, et a utilisé des données simulées pour en évaluer la performance. Il a obtenu un test de type Cramer-Von Mises, puissant pour détecter des écarts graduels à la séparabilité, mais non uniformément puissant sur une classe large de modèles alternatifs. Nous présentons une approche semi-paramétrique pour modéliser les hypothèses alternatives de séparabilité, et obtenons une statistique de score test. Nous montrons une relation entre ce score test et certaines des statistiques proposées par Schoenberg. Plus précisément, toutes sont des versions différentes des statistiques pondérées de Cramer-Von Mises. Ceci éclaire les causes des ressemblances et des différences entre les performances des tests. Nous insistons également sur certaines difficultés au contrôle du risque d'erreur de première espèce dans le test des résidus de Schoenberg.