杜氏藻属四个种的核型分析

采用染色体分带方法对杜氏藻属（Dun>0.25aliella）4个种的核型进行分析。经过25℃12hd（-1）的光周期诱导,杜氏藻属4个种出现同步化生长。用0.05％秋水仙素处理,再经低渗、固定和高位（60cm）滴片,获得杜氏藻属4个种的核型。结果表明:杜氏藻属4个种都是单倍体,其染色体大多为短杆状、极小。染色体数分别是:D.salina n=13,D primolecta n=20,D.bardawil n=10,D.parvan=16。它们大都可见较明显的初级缢痕,且都在染色体的中部。     

4种红豆杉属植物遗传多样性和遗传关系的RAPD分析

采用RAPD标记研究了分属于4种红豆杉属(Taxus Linn.)植物的68个单株的遗传多样性,并采用UPGMA方法分析68个单株的遗传关系.结果表明:12条RAPD引物共扩增出109条带,其中多态性条带108条,多态性条带百分率为99.1％;平均每条引物扩增出9.1条带.南方红豆杉[T.wallichiana var.mairei (Lemée et Lévl)L.K.Fu et Nan Li.]种内的多态性条带百分率和观察等位基因数均最高;欧洲红豆杉(T.baccata Linn.)种内的有效等位基因数、Nei's基因多样度和Shannon's信息指数均最高;须弥红豆杉(T.wallichiana Zucc.)种内的各项遗传多样性指数均最低.供试4种植物的种内遗传多样度、种间遗传多样度、基因流和种间遗传分化系数分别为0.1745、0.358 6、0.401 7和0.554 5,表明55.45％的遗传变异发生在种间.南方红豆杉和须弥红豆杉遗传距离最近;曼地亚红豆杉(Taxus×media Rehd.)和须弥红豆杉的遗传距离最远.通过聚类分析可将68个单株分为3组,欧洲红豆杉的18个单株和曼地亚红豆杉的18个单株分别各自聚为1组;须弥红豆杉的16个单株和南方红豆杉的16个单株聚为1组,其中须弥红豆杉的16个单株和南方红豆杉的16个单株又各自聚为1个亚组,且南方红豆杉的雌、雄单株也分别聚在同一分支上,表明须弥红豆杉和南方红豆杉遗传关系较近,而欧洲红豆杉与其他3种植物的遗传关系较远.     

应用RAPD标记分析黑麦属品种的遗传多样性

四川农业大学小麦研究所侯永翠、郑有良、魏育明等研究人员对黑麦遗传多样性课题作了研究。他们采用随机扩增多态性DNA(RAPD)标记 ,对黑麦属 (SecaleL) 7个品种共 1 2份材料进行了遗传多样性检测 ,发现被检测材料间RAPD标记多态性较高 ,在 4 0个随机引物中 ,有 2 5个引物约占整个的 6 2 .5 %的扩增产物具有多态性。这 2 5个中共扩增出 1 6 7条带 ,其中 89条带约占 5 3.2 %具有多态性 ,每个引物可扩增出 1～ 1 0条多态性带 ,平均为 3～ 6条。RAPD标记遗传距离GD变异范围为 0 .1 382～ 0 .4 5 1 2 ,平均为 0 .2 71 2。通过聚类分析表…     

桃遗传多样性的RAPD分析

采用RAPD技术,利用200个引物筛选的22个10碱基随机引物对桃182个变种,类型,品种进行DNA扩增。对扩增位点上的带型分析,观察到有的引的在某一位点上明显有带的分离,且S65,S459,S167,S60引物在这一位点可以包含一个类群或几个类群全部的供试品种,变种或类型,但各类群都没有各自独特的特征带。聚类图分析表明,来源无性系的品种遗传一致度最大达0．990;有的品种也表现出较大遗传一致度的为0．985;也有的品种的遗传一致度较低,范围在0．686－0．831之间。对桃的分类,以水蜜桃,寿星桃,垂枝桃作为类群划分较明晰,其它品种的类群划分则较困难,从而也说明了原产中国的桃种质资源的遗传多样性丰富。     

应用RAPD指纹探讨黄麻属种间遗传多样性及其亲缘关系

采用RAPD标记构建了黄麻属(Corchorus)植物10个种27份材料的指纹图谱,从119个随机引物中筛选出清晰且多态性高的25个引物,共扩增出329条：DNA片段,分子量在0．3～3．0kb之间,其中294条谱带具有遗传多态性,多态比率(PPB)为89．36％,平均每个引物扩增出13．16条带。用Biol D^ 数据分析软件,计算Nei氏相似性系数,建立了UPCMA聚类图。结果表明：(1)供试黄麻属15份野生种和12份栽培种具有丰富的遗传多样性,遗传相似系数在0．49～0．98;(2)在聚类分析中,当L1聚值水平D=0．785时,可将两个栽培种及其近缘野生种(C．capsulris和C．olititorius)与原始黄麻野生种划分为3个不同类群。反映出栽培种及其近缘野生种与原始野生种间有明显的遗传差异;(3)当L2取值水平D=0．850时,可将供试27份材料划分为10个以物种为单元的亚类群或个类,①即假黄麻C．aestuans(3份),②三齿种C．tridens,③梭状种C．fascicularis,④假长果种C．psendo-olitorius,⑤假圆果种C．pseudo-capsularis,⑥三室种C．tilacularis,⑦甜麻(新种未定名),⑧圆果种C．capsularis(9份),⑨长果种C．olitorius(7份),⑩荨麻叶种C．uriticifolius,结果与10个种的经典分类相吻合,揭示了种间的遗传差异性。其中圆果种C．cap—sularis与长果种C．olitorius两个种亲缘关系较近,与荨麻叶种C．uriticifolius种间亲缘关系较远;(4)非洲荨麻叶种C．uriticifolius和中国的甜麻(新种)、假黄麻C．aestuans3个种与其他种间的遗传差异较大,处在分子聚类树较基础的地位,为较原始的黄麻野生种;(5)非洲的三室种21C为三室种一个生态型亚种;采集于中国的黄麻野生种河南南阳的粘粘菜、福建漳浦的麻菜,云南开远的猪菜为3个不同生态类型的假黄麻;海南野生圆果为圆果黄麻栽培种的近缘野生种;漳浦野生长果、河南野生长果、马里野生长果为长果栽培种的近缘野生种,种内不同材料间遗传相似性较高,亲缘关系较密切;(6)在两个栽培种中,品种基因型相似性系数圆果栽培种高于长果栽培种。     

乌龟遗传多样性的RAPD分析

运用RAPD技术对乌龟的遗传多样性进行了分析。用20个随机引物对24个个体的基因组DNA进行了PCR扩增,一共扩增出3288条DNA片段,平均每个个体扩增出137条带。在检测到的137个位点中,多态位点数为119个,占869%,标记的分子量在0.2kb-3kb之间。个体间最大的遗传距离为0467,个体间最小的遗传距离为0168。24个个体的平均遗传距离为0324+00631。表明乌龟的遗传多样性水平较高。采用类平均聚类法(NJTREE)构建了24个个体相互关系的分支图。24个个体被分为几个类群,显示种内遗传差异较大,可能存在不同种群。本研究为乌龟的种质保护、合理开发利用以及选择育种提供了新的分析参数。     

利用RAPD标记分析北美鹅掌楸与鹅掌楸种间遗传多样性

利用ＲＡＰＤ标记技术对鹅掌楸属（Ｌｉｒｉｏｄｅｎｄｒｏｎ Ｌ．）２个现存种鹅掌楸（Ｌｉｒｉｏｄｅｎｄｒｏｎ ｃｈｉｎｅｎｓｅ （Ｈｅｍｓｌ．）Ｓａｒｇ）和北美鹅掌楸（Ｌｉｒｉｏｄｅｎｄｒｏｎ ｔｕｌｉｐｉｆｅｒａ ｌｉｎｎ．）的遗传多样性进行分析,结果表明：２个种都有较高的遗传多样性,但北美鹅掌楸的遗传多样性水平高于鹅掌楸;鹅掌楸的遗传变异主要来自地理种源内,而北美鹅掌楸的遗传变异主要来自地理种源     

满江红鱼腥藻与其宿主的遗传多样性和协同性的RAPD分析

从16个代表不同种属或地域来源的满江红样本中分离出共生藻并通过处理获得无藻的满江红宿主,对二者同步进行了RAPD扩增,分别得到了大量DNA多态片段。通过建立满江红鱼腥藻及其宿主的UPGMA聚类关系图,看出二者在遗传分支上存在着一定程度的协同对应关系。但在种内的不同品系间,这种协同性有所减少,发现有的品系的共生藻发生了明显的变异。Abstract:Symbiotic Anabeana azollae and its host plant Anabeana-free Azolla were isolated from 16 Azolla accessions representing different Azolla species or geographic origins.DNA polymorphic fragments were obtained by simultaneous RAPD amplification of both symbiont and host.The UPGMA clusters of Anabeana azollae and its host Azolla were established separately based on Dice coefficient caculation and a coordinated relationship was shown between Anabeana azollae and its Azolla host along both individual genetic divergence,but this genetic homology was reduced among different strains within Azolla species while the obvious mutants of Anabeana azollae were detected in some Azolla tested strains collected from different geographic area in the same host species.     

高大山羊草（Aegilops longissima Schweinf.and Muschl.）遗传多样性的RAPD分析

通过70个RAPD引物对高大山羊草15份材料进行扩增,共扩增出766条带,其中无多态性（即相同带）的带115条,占总带数的15％,有多态性的带651条,占总带数的85％。通过分析,发现高大山羊草的Y315、Y316、Y317与其它12份材料差异很大,这3份材料的特异带有253条,占整个多态性带数的38．9％。经NTSYS系统聚类表明,高大山羊草Y315、Y316、Y317这3份材料为一个类群,而其余12份材料为另一类群;这2个类群中任何一份山羊草与另一类群中任何一份山羊草的遗传距离均很大,变幅为1.38-1.58,是它们各自类群内遗传距离的3倍以上。鉴于这两类材料在分子水平的RAPD扩增产物上差异很大,并考虑到这两个类群在形态上也确实存在明显差异,因而建议将高大山羊草分为两个亚种,当然这一观点还有待收集更多的材料做进一步的研究。     

缢蛏遗传多样性的RAPD分析

用RAPD(Random amplified polymorphic DNA)技术对大连的养殖缢蛏(Sinonovaeula constrict)群体35个个体的遗传多样性进行了分析。结果表明,14个随机引物,平均每个引物扩增出6条带;共检测到的86个位点,其中多态位点数为43个(占50.0%);个体间遗传距离在0.1503～0.3768之间,平均遗传距离为0.2107;16号和25号缢蛏个体聚类成一大类,另33个缢蛏个体聚成一大类。     

基于RAPD分析的中国野桑蚕和家蚕遗传多样性和系统发育关系研究

对具代表性的中国11个地区的野桑蚕Bombyx mandarina进行了随机引物扩增多态性DNA(RAPD)分析;结果表明:不同地区的野桑蚕的遗传距离较大;最大为0.465(安康-镇江);最小的也有0.209(武汉-合肥);同一地区不同个体野桑蚕的遗传距离也较大;最大为0.318;最小的为0.144。它们均远大于家蚕B.mori品种内个体间的遗传距离(最大为0.068、最小为0.015);甚至超过了家蚕品种间的遗传距离(最大为0.258、最小为0.197)。这表明中国野桑蚕是一个十分混杂的、遗传多样性非常丰富的群体。另外;在大多数情况下野桑蚕的遗传距离表现出与空间距离正相关。遗传距离和系统发育分析结果显示陕西一带的野桑蚕成分复杂;有重要的演化意义。     

Estimation of Genetic Variability in Plantago ovata Cultivars

Five cultivars of Plantago ovata Forsk. (medicinal plant) have been developed by different agricultural universities in India. Genetic variability of these cultivars was estimated using RAPD markers. The data were correlated to morphological characters and a dendrogram was obtained from Jaccard's coefficient. This revised version was published online in July 2006 with corrections to the Cover Date.     

盐藻RAPD反应条件的优化

从盐藻中提取基因组DNA作为模板进行RAPD反应的优化试验 ,获得PCR扩增反应的最佳条件 :随机引物为CPS32 0 (5′ GGCTCATGTG 3′) ;2 0 μl体系中Mg2 2 .0mmol/L ,退火温度 35℃ ;Taq酶活性值 0 .8U。     

稻蝗属部分种类RAPD及其分子系统学关系

用经筛选的8个随机引物对稻蝗属(Oxya Audient-Serville)中的中华稻蝗(Oxya chinensis)、日本稻蝗(Oxyajaponica)、山稻蝗(0xya agaxisa)、短翅稻蝗(Oxya brachyptera)和小稻蝗(Oxya intricata)等5个种41个个体进行扩增,均扩增出特异性产物,在96条清晰稳定的扩增片段中,多态性片段为95条,种间共有片段1条(引物S362扩增的约850 bp的片段),所获片段的长度大小为200—2500bP,单个引物扩增的条带数在8-16之间,平均为12。根据扩增结果,应用SPSS软件包中的Between-groups linkage法进行聚类分析,得到5种稻蝗的分子系统树。结果显示：中华稻蝗与短翅稻蝗关系密切,日本稻蝗与山稻蝗关系较近,而小稻蝗与它们的亲缘关系较远。聚类图所呈现的种间关系与传统的形态及细胞分类学结果基本一致,5种稻蝗亲缘关系的远近程度得以清楚显示,说明RAPD技术在稻蝗属种间分子系统学研究中具有很好的适用性。     

家蚕不同地理品种分子系统学研

利用随机引物扩增多态性DNA(RAPD)标志,在DNA分子水平上对不同系统、化性和眠性共六类59个家蚕Bombyx mori品种及野蚕且mandarina之间的遗传差异进行了研究。在34个随机引物中有12个(35.29%)引物出现稳定的扩增带,扩增总带数为103条,其中86条具多态性,占83.5%,平均每个引物7.2条。利用单匹配相似系数和UPGMA聚类法对结果进行分析,发现其RAPD不但具有品种特异性,而且具有系统特异性,证明中国一化性四眠种为最早从野蚕中分化出来的系统,中国一化性三眠种与中国一化性四眠种在进化上属有显著差异的两个类群。     

泡桐属七种植物的RAPD分析

利用 1 3个 1 0 mer的随机引物对中国泡桐属的 7个种进行了 RAPD分析 ,对扩增形成的谱带进行了对比 ,发现 7个种间存在较丰富的多态性带纹。经用 UPGMA法聚类结果说明可把研究的 7个种分成 2个类群。其中白花泡桐与川泡桐亲缘关系最近 ,二者与揪叶泡桐、南方泡桐、山明泡桐归为 1个类群。毛泡桐与兰考泡桐亲缘关系也较近 ,二者在系统演化上比较原始 ,归为 1个类群。     

四个齿爪鳃金龟类群分类地位的RAPD分析

本应用RAPD技术对齿爪鳃金龟属（Holotrichia)的四个类群进行了分类地位的研究,结果表明,不同类群间的平均遗传距离分别为：华北大黑鳃金龟的登种群与南京种群间为0．346,登种群与东北大黑锶金龟间为0．375,南京种群与东北大黑鳃金龟间为0．359,矮臂锶金龟与登种群,南京种群和东北大黑鳃金龟间分别为0．552,0．545和0．534。对RAPD指纹图谱进行UPGMA聚类分析,系统发育树将以上四个类群分为了差异显的两大类,综合各项研究指标,东北大黑鳃金龟与华北大黑鳃金龟之间的差异为种群水平的变化,东北大黑鳃金龟与华北大黑鳃金龟属同种昆虫,按照动物命名法规,东北大黑鳃金龟应为华北大黑鳃金龟的同物异名。     

Morphological and molecular characterisation and differentiation of <Emphasis Type="Italic">Sargassum baccularia</Emphasis> and <Emphasis Type="Italic">S. polycystum</Emphasis> (Phaeophyta)

Two Sargassum species (S. baccularia and S. polycystum) collected from Teluk Kemang and Cape Rachado, Port Dickson, Negeri Sembilan, Malaysia, which are alike in morphology except for the rhizoidal system and vesicles, were characterised using random amplified polymorphism DNA (RAPD). The genomic DNA of both species was isolated from the leaves using a modified CTAB method. Four random primers, that is, OPA2, OPA3, OPA4 and OPA13, successfully amplified the DNA. The polymorphisms generated by these four primers were analysed using the Dice Coefficient of Similarity and cluster analysis was carried out using GelCompar II Version 2.0 (Applied Maths, Kortrijk, Belgium) based on UPGMA. DNA analysis showed that three primers were able to differentiate the two species. Morphological analysis using Principal Components Analysis (PCA) and discriminant function analysis supported the molecular data. Both species are characterised by heavily muricate main branches, oblong-lanceolate leaves with dentate margins and discoid holdfasts and spherical vesicles; both are dioecious. The only difference is that S. polycystum has secondary holdfasts transformed into stolons. This last characteristic is therefore a very important criterion and may contribute to the difference shown by DNA analysis.     

利用RAPD技术对木耳属菌株进行分类鉴定的研究

利用ＲＡＰＤ技术对木耳属不同种和种内不同菌株进行了分子鉴定。结果表明,在供试的２６个随机引物中,有１０个引物可扩增出清晰、稳定的ＤＮＡ带型,其中引物Ｓ４和Ｓ６与供试木耳属菌株的基因组ＤＮＡ结合位点少而保守,扩增图谱具有种的特异性,可用于种的快速准确鉴定;其综随机引物的扩增ＤＮＡ多态性较强,可用于种内不同菌株的鉴定;聚类分析表明,在７５％相似水平下,可将供试的木耳属菌株分成四大类,其中有三大类各代表一个形态鉴定的种。研究结果表明了ＲＡＰＤ技术可有效地用于木耳属种或菌株的快速准确鉴定。