蛋白质氨基酸网络研究进展

氨基酸网络是运用复杂网络工具对蛋白质结构-功能关系研究的新方法。本文回顾了氨基酸网络中常用网络参量的计算方法,如：度分布,聚集系数,平均最短路径等。结合本研究小组的工作,介绍了常用的网络构建和分析方法,并总结了氨基酸网络在蛋白质折叠以及蛋白质分子对接问题中的应用。最后,分析了氨基酸网络研究目前存在的主要问题,并对未来的工作进行了展望。     

海藻非蛋白质氨基酸的研究进展

海藻非蛋白质氨基酸是海藻中一类重要的生物活性物质,大多具有清热、解毒、驱虫、降血压、防癫痫等功能,本文主要对海藻非蛋白质氨基酸的概念、分类、生物合成、生物功能及其应用、检测分析、分离提取等做一概述,为更好的开发利用这类生物活性物质提供参考.     

贵州四种植物种子蛋白质的氨基酸研究

本文根据贵州所产四种植物种子或种仁,进行了蛋白质的氨基酸测定,采用氨基酸分析仪对它们进行定量。根据分析结果,本文主要讨论了四种植物种子蛋白质的氨基酸含量、种类及利用。     

香菇蛋白质氨基酸的分析

分析结果表明,香菇的菌柄与菌盖中蛋白质氨基酸均为18种,缺少谷氨酰胺(Gln)和天冬酰胺(Asn),其中,含量最高的是谷氨酸(菌柄为11.03 mg/gDW,菌盖为12.57 mg/gDW)。菌盖与菌柄均含必需氨基酸、半必需氨基酸10种,其中精氨酸含量(菌柄为10.73 mg/gDW,菌盖为11.84 mg/gDW)。必需氨基酸的含量十分接近于非必需氨基酸的含量(比率为1.00∶1.04),无论总氨基酸含量还是必需氨基酸含量,菌盖中的皆略高于菌柄中的。     

海南产螺旋藻粉蛋白质氨基酸

采用Tecator自动定氮仪和Waters PICO-TAG氨基酸自动分析仪测定了海南螺旋藻粉中蛋白质含量和17种氨基酸含量。结果显示海南螺旋藻粉中蛋白质含量达63.3%,总氨基酸含量达60.88%,其中必需氨基酸含量超过40%,比例平衡,符合FA0标准,可与国外产品媲美。     

蛋白质表面氨基酸特性研究进展

分布在蛋白质分子表面的暴露于溶剂的氨基酸所具有的一些特性对蛋白质的折叠和聚合过程、蛋白质一蛋白质相互作用以及蛋白质的功能具有重要影响。本文分析了蛋白质表面氨基酸在疏水性、保守性、静电势及结构方面的一些特性,阐述了近年来国际上利用这些特性对蛋白质一蛋白质相互作用界面进行预测的方法,最后介绍了几款预测蛋白质表面氨基酸的软件。     

蛋白质表面氨基酸特性研究进展

分布在蛋白质分子表面的暴露于溶剂的氨基酸所具有的一些特性对蛋白质的折叠和聚合过程、蛋白质-蛋白质相互作用以及蛋白质的功能具有重要影响。本文分析了蛋白质表面氨基酸在疏水性、保守性、静电势及结构方面的一些特性,阐述了近年来国际上利用这些特性对蛋白质-蛋白质相互作用界面进行预测的方法,最后介绍了几款预测蛋白质表面氨基酸的软件。     

虫草不同部位氨基酸和蛋白质的分布研究

本文对云南丽江地区出产虫草不同部位的蛋白质、氨基酸的组成进行定量分析,从中找出虫草中蛋白质及水解氨基酸的组成和分布的定量规律。     

蛋白质相互作用网络进化分析研究进展

近年来,随着高通量实验技术的发展和广泛应用,越来越多可利用的蛋白质相互作用网络数据开始出现．这些数据为进化研究提供了新的视角．从蛋白质、蛋白质相互作用、模体、模块直到整个网络五个层次,综述了近年来蛋白质相互作用网络进化研究领域的主要进展,侧重于探讨蛋白质相互作用、模体、模块直到整个网络对蛋白质进化的约束作用,以及蛋白质相互作用网络不同于随机网络特性的起源和进化等问题．总结了前人工作给学术界的启示,探讨了该领域未来可能的发展方向．     

复合氨基酸铜螯合物的研究

以废弃鸡毛的硫酸水解液作为复合氨基酸的来源 ,将其与CuSO4 ·5H2 O螯合 ,采用有机溶剂沉淀法制取了高纯度的氨基酸铜螯合物 ,并用化学分析和红外光谱分析对其进行了研究 ;同时 ,提出了一种根据直接测定螯合态微量元素的含量来测定螯合率的新方法 ,为螯合率的测定提供了一条新的途径     

氮素对不同类型玉米籽粒氨基酸、蛋白质含量及其组分变化的影响

以普通玉米掖单22和高油玉米高油115为材料,研究了不同供氮条件下玉米籽粒中蛋白质及其组分的含量、清蛋白和球蛋白含量、醇溶蛋白和谷蛋白含量、籽粒氨基酸总鼍以及氨基酸组分含量的品种差异。结果表明。氮素供应水平对两种类型玉米灌浆期间籽粒蛋白质含量变化作用相同,前期逐渐下降,至成熟期略有升高;籽粒清蛋白和球蛋白、醇溶蛋白和符蛋白含量变化动态各处理基本一致,两种类型玉米籽粒清蛋白含量随时间的推移逐渐降低。球蛋门含量的变化动态旱单峰曲线,峰值出现在授粉后30d。醇溶蛋白含量均呈“V”型变化,以授粉30d后最低。谷蛋白的含量则均呈上升趋势。氮素供应水平对两种类型玉米籽粒中各蛋白质组分禽量的变化的影响作用有所不同。对高油115籽粒中球蛋白含量的影响较小;施氮水平并不改变两种类型玉米籽粒氨基酸总量的变化趋势。但两种类型玉米籽粒中氨基酸组分的含量变化较大。     

Hind leg muscle amino acid balances in cold-exposed rats

The changes in hind leg tissue (muscle and skin) amono acid pool size and arteriovenous balance were measured in rats subjected to 0–90 min of cold exposure (4°C). Tissue free amino acid pools presented a different composition pattern from protein amino acids. Muscle rapidly reacted to cold exposure by releasing small amounts of some amino acids (alanine, aspartate), with only small changes in pool size during the first 30 min. Amino acid oxidation was very limited during the whole period of cold exposure, since at all times tested there was either nil ammonia efflux or net absorption of ammonia and glutamine; i.e. the muscle was in positive nitrogen balance throughout the period studied. Thus most of the amino acid nitrogen taken up from the blood and not found in the free amino pools must have been incorporated into protein, since it was not oxidized, as shown by the glutamine and ammonia blance. The data on amino acid incorporation into proteins indicate that hind leg protein turnover is rapidly and widely modulated from a low initial setting upon cold exposure to a higher protein synthesis rate immediately afterwards, suggesting that protein turnover may have an important role in short-term events in cold-exposed muscle, in addition to its influence in long-term adaptation.     

2S,4R-carboxy-2-acetylamino-4-piperidine dans les feuilles de Calliandra haematocephala

A new naturally occurring pipecolic acid derivative has been isolated from leaves of the legume Calliandra haematocephala. Its structure was shown to be 2S,4R-carboxy-2-acetylamino-4-piperidine by chemical and spectrosopic methods.     

A universal evolutionary index for amino acid changes

Different nonsynonymous changes may be under different selective pressure during evolution. Of the 190 possible interchanges among the 20 amino acids, only 75 can be attained by a single-base substitution. An evolutionary index (EI) can be empirically computed for each of the 75 elementary changes as the likelihood of substitutions, relative to that of synonymous changes. We used 280, 1,306, 2,488, and 309 orthologous genes from primates (human versus Old World monkey), rodents (mouse versus rat), yeast (S. cerevisiae versus S. paradoxus), and Drosophila (D. melanogaster versus D. simulans), respectively, to estimate the EIs. In each data set, EI varies more than 10-fold, and the correlation coefficients of EIs from the pairwise comparisons are high (e.g., r = 0.91 between rodent and yeast). The high correlations suggest that the amino acid properties are strong determinants of protein evolution, irrespective of the identities of the proteins or the taxa of interest. However, these properties are not well captured in conventional measures of amino acid exchangeability. We, therefore, propose a universal index of exchange (U): for any large data set, its EI can be expressed as U*R, where R is the average Ka/Ks for that data set. The codon-based, empirically determined EI (i.e., U*R) makes much better predictions on protein evolution than do previous methods.     

由铬革屑制备可溶性蛋白及氨基酸的研究

成品铬革屑中蛋白质含量在 70 %以上 ,处理成小颗粒后与水、Ca(OH) 2 按 1∶4 0∶0 .4的比例混合 ,90℃反应 5h ,可溶性蛋白转化率近 6 0 % ,且在升温后加入Ca(OH) 2 有利于退鞣。以 6mol/L盐酸水解皮革蛋白粉制备复合氨基酸 ,水解 14h ,水解液以HD -I树脂脱色 ,氨基酸损失较少 ,且动态脱色效率明显高于静态脱色 ,采用 717树脂脱酸可获得pH4 .5 - 5的复合氨基酸溶液 ,总得率为 6 0 .1%。     

A comparison of fluorescamine and o-phthaldialdehyde as effective blocking reagents in protein sequence analyses by the Beckman sequencer

Use of o-phthaldialdehyde to chemically reduce the newly generated amino termini responsible for the progressively increasing background during an extended amino acid sequence analysis in a liquid phase sequencer has been described. The results have been compared with Fluram blocking using apomyoglobin and rabbit C-reactive protein as standard and unknown samples, respectively.