不同经济类型高粱的RAPD分析

对四种不同经济类型高粱采用ＤＮＡ随机扩增多态技术（ＲＡＰＤ）进行了比较研究。１８种引物扩增后共得到５４个ＲＡＰＤ标记,其中２３个标记在进行４种高粱成对比较时呈多态。根据计算出的遗传距离值可以发现虽然不同种高粱之间差异虽然较小,但仍具有丰富的遗传多样性。     

香蕉33个品种的RAPD研究

利用RAPD技术对香蕉（Musa nana Lour.)33个品种的遗传变异进行了研究,从249个随机引物中筛选出18个有效引物,用它们共扩增出192条DNA带,其中183条为多态性带,占95．31％,平均每个引物扩增的DNA带数为10．67条,利用18个有效引物扩增的192条DNA带对香蕉33个品种间的亲缘关系进行UPGMA聚类分析,计算出33个品种间的平均遗传距离为0．3412。在此基础上建立了香蕉33个品种的DNA分子系统树状图。该系统将香蕉33个品种划归A,B,C和D4个群,其中A群20个品种,B群5个品种,C群2个品种,D群6个品种;A群又可以分为3个亚群。对香蕉遗传多样性分子基础进行了探讨。     

乌羊和小香羊的RAPD分析

用40条多态引物对乌羊、小香羊、南江黄羊、黑山羊、川东白山羊、波尔山羊和马头山羊7个品种（或群体）进行RAPD分析,其中28条引物扩增出多态性普带,并用于进一步对12只乌羊个体和12只小香羊个体基因组进行扩增。扩增产物以1．5％琼脂糖凝胶（含0．5μg/ml溴化乙锭）电泳分离。Nei氏计算品种间的遗传距离指数和品种内的遗传相似指数。NJ法构建系统聚类图。结果表明：乌羊和川东白山羊间的遗传距离最小,亲缘关系较近,而小香羊与品种间的遗传距离都较大,亲缘关系较远。乌羊群体及小香羊品种都具有一定的遗传稳定性。     

7个地方山羊品种遗传多样性及遗传结构分析

检测了7个地方山羊群体在15个微卫星位点的遗传多样性和遗传结构,旨为地方山羊群体的保护利用奠定基础。采集燕山绒山羊、辽宁绒山羊、承德无角山羊、济宁青山羊、太行山羊、武安山羊血液样品及内蒙古绒山羊的耳组织,利用微卫星方法分析遗传多样性及遗传结构。结果表明,7个山羊群体的平均有效等位基因数为4.235 8、平均期望杂合度为0.718 8、平均多态信息含量为0.706 8,均具有高度的遗传多样性;总群体平均近交系数为0.088 3,平均遗传分化系数为0.544 2,平均基因流为0.209 4。武安山羊和承德无角山羊的遗传距离最近,太行山羊和燕山绒山羊的遗传距离最远。系统进化树聚类分析表明,燕山绒山羊与辽宁绒山羊聚为一类,济宁青山羊、承德无角山羊、武安山羊、内蒙古绒山羊和太行山羊聚为一类。综上,7个地方山羊群体遗传多样性丰富,群体间遗传分化程度大,基因交流少,受近交程度影响小,具有较高的利用价值和潜力。     

新疆石榴品种的RAPD分析

利用RAPD技术对23个石榴品种进行亲缘关系鉴定和品种分类研究.从50条10 bp随机引物中筛选出7条扩增效果较好的引物进行扩增,共扩增出88条带,其中多态性带为61条,多态率达69%.根据扩增结果进行UPGMA聚类分析,聚类结果将23个品种分为5大类群,第1类包括库尔勒市甜石榴与喀什市大籽甜石榴等甜石榴品种;第2类是阿图什市酸石榴;第3类包括喀什市阿奇克阿娜尔、叶城酸石榴等酸石榴品种;第4类包括吐鲁番市甜石榴、库车酸甜石榴等种间杂交和来源不详品种;第5类包括皮亚曼石榴和策勒1号等新疆优质石榴品种.研究结果表明:石榴品种间的遗传多态性有明显差异,即使父母本相同的品种也能区别.     

亚麻遗传多样性的RAPD分析

从600个随机引物筛选出28个扩增稳定性较好的引物,对18份来自不同国家和地区的亚麻资源遗传多态性进行RAPD分析。结果表明：共扩增出条带529,其中多态性条带201,总的多态性百分率（PPB）为38．0%。用NTSYSpc（2．10）软件进行UPGMA聚类分析,18个亚麻品种遗传距离为0．0469～0．1332之间,可分3大类,其中红木5号与匈牙利5号亲缘关系最近,ABYSSINIA（BROWN）和匈牙利5号遗传距离相差最显著,达到0．1332。     

甘肃六个地区掌叶大黄的RAPD分析

目的:探讨甘肃6个地区掌叶大黄的遗传多样性.方法:采用改良CTAB法提取6个地区样品的基因组DNA,应用RAPD( Randomly amplified polymorphic DNA)技术对电泳结果进行聚类分析,得出聚合树状图.结果:10条多态性引物共扩增得到51条电泳条带,大小在250 ～1 600bp之间,其中33条为多态性条带,多态性比率为64.7％.结论:聚类分析结果表明:甘肃6个地区掌叶大黄的亲缘关系与地理距离有一定的相关性.     

河南地方山羊品种的遗传多样性

采用18个微卫星位点对河南省5个地方山羊品种（牛腿山羊、槐山羊、河南奶山羊、太行黑山羊和伏牛白山羊）的遗传多样性进行了评价.结果表明：18个微卫星位点在5个山羊品种均为高度多态;5个山羊品种的多态信息含量、群体杂合度、有效等位基因数值较高,说明其遗传多样性和各品种内的遗传变异比较丰富;聚类分析显示,牛腿山羊与太行黑山羊的关系较近,与河南奶山羊的关系较远.群体遗传分化系数和群体遗传距离表明,河南省地方山羊的变异主要存在于品种内,品种间的变异相对较小.结合5个山羊品种的实际生态地理分布,提出了避免近交,并有选择地进行品种间杂交的保种模式.     

利用RAPD对稻蝗属昆虫亲缘关系的研究

通过20个随机引物的PCR扩增,得到了日本主要稻蝗的随机扩增多态性DNA（RAPD）图谱,根据扩增结果,计算了种间相似系数和遗传距离,建立了UPGMA系统树。结果表明,分布没有重叠、种间容易交配、能产生杂种的中华稻蝗台湾亚种与小翅稻蝗的亲缘关系最近;分布重叠的日本稻蝗与中华稻蝗台湾亚种、日本稻蝗和小翅稻蝗的亲缘关系较近。小稻蝗与其它3种稻蝗的亲缘关系较远。     

14个板栗品种遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD分子标记手段,研究板栗品种的遗传多样性。采用从100个随机引物筛选的20个引物对14个板栗品种的基因组DNA进行扩增,通过对140条谱带的聚类,分析了供试板栗品种的系统发育;运用特殊谱带,建立了板栗品种的分子检索表,结合扩增的特殊位点,提出了重点保存的板栗品种。     

波尔山羊杂交后代及其亲本随机扩增多态DNA研究

利用随机扩增多态DNA技术研究了波尔山羊、唐山奶山羊、青龙本地山羊以及波尔山羊与这两个山羊群体杂交后代共计128个山羊个体的随机扩增多态DNA。结果表明：（1）总群体平均遗传多样性指数（Hsp）为0.6974,群体遗传分化指数为0.9706,山羊群体间平均遗传距离指数（0.1314～0.2052）明显大于群体内的相应值（0.0582～0.1440）,上述结果说明,所研究山羊群体不仅具有较为丰富的遗传多样性,而且其核基因组遗传变异主要存在于群体间。（2）山羊群体间的分子聚类关系与各群体间的亲缘关系基本一致。Abstract:The random amplified polymorphic DNA（RAPD）of 128 individuals was studied,which were from Boer goat, Tangshan dairy goat,Qinglong native goat and their hybrids crossbred with Boer goat.The average index of genetic polymorphism for whole population（Hsp）and the index of genetic differentiation were 0.6974 and 0.9706,respectively.The average index of genetic distance between populations（0.1314～0.2052）was significantly higher than that within populations（0.0582～0.1440）.All of these indicated that the genetic polymorphism was not only abundant,but also the genetic variation was mainly existed between goat populations.The molecular dendrogram among goat populations was in accord with their genetic relationship.     

缢蛏遗传多样性的RAPD分析

用RAPD(Random amplified polymorphic DNA)技术对大连的养殖缢蛏(Sinonovaeula constrict)群体35个个体的遗传多样性进行了分析。结果表明,14个随机引物,平均每个引物扩增出6条带;共检测到的86个位点,其中多态位点数为43个(占50.0%);个体间遗传距离在0.1503～0.3768之间,平均遗传距离为0.2107;16号和25号缢蛏个体聚类成一大类,另33个缢蛏个体聚成一大类。     

中国红树科7种红树植物遗传多样性分析

以红树、红海榄、秋茄、角果木、木榄、海莲、尖瓣海莲等7种红树科植物为材料,采用改进的CTAB法获得了纯度较高、得率高、片段完整的基因组DNA。通过筛选出的15个有效引物进行RAPD分析,探讨了7种树植物间的亲缘关系。15个有效引物共扩增出617条DNA带,其中多态性条带415条,占总扩增条带的67.26%。利用Nei指数法得出7个分类群间的遗传一致度和遗传距离,并运用UPGMA法进行聚类分析。7个分类群分为A、B两个大组,平均遗传距离为0.41。将得出的7个分类群的DNA分子分类系统图,与传统的分类进行比较,发现结果相符。同时获得一个OPG05－900的差异片段可作为区分海莲和尖瓣海莲的分子标记。     

广东省平胸龟遗传多样性的RAPD分析

由于栖息地的破坏和人为的滥杀滥捕,平胸龟野外资源数量急剧下降,现已处于濒危状态。将13条可重复的、扩增图谱清晰的RAPD引物用于广东省内20个平胸龟个体的遗传多样性分析。扩增所得的条带显示,多态性位点含量为60.71%,Nei’s基因多样性指数为0.1196,Shannon’s多样性信息指数为0.1966,表明平胸龟遗传多样性仍较丰富。同时,计算20个个体间遗传距离为0.0507-0.2925,并采用UPGAM方法绘制聚类分析树状图,20个个体聚类较分散,主要聚为1个大群体,表明广东省内的野生平胸龟并没有形成明显的种群的分化。了解平胸龟的遗传现状、种群结构,可为该物种的种质资源保护、野生资源恢复与利用提供理论依据。     

甘草亲缘关系的RAPD鉴定

以不同地区的3种15组甘草(Glycyrrhiza uralensis、G．infleta、G．glebra)种子为材料,探讨RAPD分子标记在研究、鉴定甘草亲缘关系中的可行性。从50个随机引物中筛选出9个有效引物,9个引物共扩增出961条DNA带,其中多态性条带811条,占总扩增条带的84．4％。对扩增出来的961条DNA带进行分析,结果表明：15组甘草植物的平均遗传距离为0．41,其中采自甘肃民勤野生甘草与采自新疆布尔津乌拉尔野生甘草遗传距离最小,为0．26;而采自内蒙古杭锦旗上海升袖的野生甘草与采自青海贵德的乌拉尔野生甘草遗传距离最大,为0．63。由RAPD聚类分析结果得出15组甘草植物之间的亲缘关系与形态学分类结果存在差异。     

中国水仙与欧洲水仙品种RAPD指纹的研究

利用随机多态性DNA(RAPD)技术对中国水仙和欧洲红口水仙共6个品种进行了分析。选用了12个10bp引物共扩增出119条DNA片段。计算各样本间的相似性系数和遗传距离,并采用UPGMA法对遗传距离进行了聚类分析。结果表明：中国水仙3个品种亲缘关系十分密切,红口水仙3个品种亲缘关系较近,而中国水仙与红口水仙3个品种间的亲缘关系较远。建立的水仙RAPD技术体系可帮助育种亲本的选配及水仙品种的鉴定。     

Genetic variability and bottleneck studies in Zalawadi, Gohilwadi and Surti goat breeds of Gujarat (India) using microsatellites

Indian goat breeds are recognized as an invaluable component of the world's goat genetic resources. Microsatellite pairs were chosen from the list suggested by International Society for Animal Genetics (ISAG) and amplified in two multiplexes (Set-I: 7 microsatellites and Set-II: 11 microsatellites) for automated fluorescence genotyping to assess bottleneck and analyze genetic variability and genetic distances within and between three goat breeds viz. Zalawadi, Gohilwadi and Surti. The observed number of alleles ranged from 4 (Oar JMP-29) to 15 (ILSTS-030 and -034) with a total of 178 alleles and mean of 9.89 alleles across the three breeds. The overall heterozygosity, PIC and Shannon index values were 0.61, 0.60 and 1.50 indicating high genetic diversity. The maximum observed heterozygosity was found in Gohilwadi and minimum in Surti goat breed. The Nei's standard genetic distance was minimum between Zalawadi and Gohilwadi, and maximum between Gohilwadi and Surti. Non-significant heterozygote excess on the basis of IAM, TPM and SMM models, as revealed from Wilcoxon sign-rank tests, along with a normal ‘L’-shaped distribution of mode-shift test, indicated no bottleneck in Zalawadi and Gohilwadi goat populations, whereas mild bottleneck in the recent past for Surti breed. This research on goat genetic diversity in Gujarat state provides valuable information on Zalawadi, Gohilwadi and Surti goat genetic resources, and will assist in developing a national plan for the conservation and utilization of indigenous goat breeds.     

洞庭湖四种黄颡鱼基因组DNA遗传多样性的RAPD分析

以洞庭湖瓦氏黄颡鱼、光泽黄颡鱼、长须黄颡鱼、普通黄颡鱼的基因组DNA为材料对 4种黄颡鱼进行了遗传多样性随机扩增多态性DNA(RAPD)分析。通过筛选的 90个引物对 4种黄颡鱼基因组DNA的扩增 ,获得了 36个有效引物 ,并计算出了 4种黄颡鱼群体间的遗传相似系数和遗传距离 ,遗传距离最大的为普通黄颡鱼和瓦氏黄颡鱼 (D =0 9895 ) ,遗传距离最小的为普通黄颡鱼和光泽黄颡鱼 (D =0 672 0 )。同时运用聚类分析 (UPGMA)的方法建立了 4种黄颡鱼的聚类图。     

Genetic fingerprinting of pigeonpea [Cajanus cajan (L.) Millsp.] and its wild relatives using RAPD markers

Randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) markers were used for the identification of pigeonpea [Cajanus cajan (L.) Millsp.] cultivars and their related wild species. The use of single primers of arbitrary nucleotide sequence resulted in the selective amplification of DNA fragments that were unique to individual accessions. The level of polymorphism among the wild species was extremely high, while little polymorphism was detected within Cajanus cajan accessions. All of the cultivars and wild species under study could be easily distinguished with the help of different primers, thereby indicating the immense potential of RAPD in the genetic fingerprinting of pigeonpea. On the basis of our data the genetic relationship between pigeonpea cultivars and its wild species could be established.NCL Communication No. 6062     

The utility of RAPD markers for the determination of genetic variation in oil palm (Elaeis guineensis)

The genetic variation among different accessions of oil-palm germplasm collected from Africa was estimated using random primers and the polymerase chain reaction. The present study revealed high levels of genetic variation in these accessions. Electrophoresis of the amplification products indicated that nine out of 20 primers were able to generate polymorphic products ranging in length from 0.2 kb to 2.3 kb. No individual palm or population-specific products were observed. Greatest diversity was seen in Zaire population 5 and the least in Zaire population 2.